GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 876 - 900 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
A tetrasaccharide linker sequence is required for GAG synthesis
  • Agrin
  • Agrn
  • B3galt6
  • B3gat1
  • B3gat2
  • B4galt7
  • Bcan
  • Behab
  • Bgn
  • Caleb
  • Cspg2
  • Cspg3
  • Cspg4
  • Cspg5
  • Dcn
  • Glcats
  • Gpc1
  • Gpc2
  • Gpc3
  • Gpc4
  • Gpc5
  • Gpc6
  • Hspg1
  • Ncan
  • Ng2
  • Ngc
  • Sdc1
  • Sdc2
  • Sdc3
  • Sdc4
  • Synd1
  • Synd2
  • Synd3
  • Synd4
  • Vcan
  • Xylt1
  • Xylt2
Rattus norvegicus (Norway rat)
GABA B receptor activation
  • Gabbr1
  • Gabbr2
  • Gpr51
Rattus norvegicus (Norway rat)
MAPK6/MAPK4 signaling
  • Aib1
  • Borg1
  • Ccnd3
  • Cdc10
  • Cdc14a
  • Cdc14b
  • Cdc2
  • Cdc2a
  • Cdc42
  • Cdc42ep2
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • Cep2
  • Crm1
  • Dnajb1
  • Duo
  • Erk3
  • Etv4
  • Foxo1
  • Foxo1a
  • Foxo3
  • Hapip
  • Hsp27
  • Hspb1
  • Kalrn
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mapk4
  • Mapk6
  • Mapkapk5
  • Mecl1
  • Mss1
  • Ncoa3
  • Pak1
  • Pak2
  • Pak3
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkm4
  • Prkm6
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rac
  • Rac1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sept7
  • Septin7
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Xpo1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of glycosylphosphatidylinositol (GPI)
  • Dpm2
  • Piga
  • Pigb
  • Pigc
  • Pigf
  • Pigg
  • Pigh
  • Pigl
  • Pigm
  • Pign
  • Pigp
  • Pigq
  • Pigv
  • Pigw
  • Pigx
Rattus norvegicus (Norway rat)
Biotin transport and metabolism
  • Acac
  • Acaca
  • Acacb
  • Btd
  • Hlcs
  • Mcca
  • Mccc1
  • Mccc2
  • Pc
  • Pcca
  • Pccb
  • Pdzd11
  • Slc5a6
  • Smvt
Rattus norvegicus (Norway rat)
Miscellaneous transport and binding events
  • Add1
  • Add2
  • Add3
  • Ank
  • Ankh
  • Azgp1
  • Ctns
  • Dmtn
  • Iag2
  • Lrrc5
  • Lrrc8
  • Lrrc8a
  • Lrrc8b
  • Lrrc8c
  • Lrrc8d
  • Lrrc8e
  • Magt1
  • Mrs2
  • Mrs2l
  • Nipa1
  • Nipa2
  • Nipal1
  • Nipal2
  • Nipal3
  • Nipal4
  • Pip
  • Pqlc2
  • Rpt
  • Slc66a1
  • Tusc3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Acyl chain remodelling of PS
  • Cpla2
  • Grcc3f
  • H-rev107
  • Hrasls3
  • Hrev107
  • Lpcat3
  • Lpcat4
  • Mboat1
  • Mboat5
  • Oact5
  • Osbpl10
  • Osbpl5
  • Osbpl8
  • Pla1a
  • Pla2g10
  • Pla2g12a
  • Pla2g16
  • Pla2g1b
  • Pla2g2a
  • Pla2g2d
  • Pla2g2f
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g4b
  • Pla2g4d
  • Pla2g4e
  • Pla2g4f
  • Pla2g5
  • Pla2r1
  • Plaat3
  • Pspla1
  • Rlp-3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cyclin E associated events during G1/S transition
  • Akt1
  • Akt2
  • Akt3
  • Cables1
  • Cak
  • Cak1
  • Ccne
  • Ccne1
  • Ccne2
  • Ccnh
  • Cdc25a
  • Cdk2
  • Cdk7
  • Cdkn1a
  • Cdkn1b
  • Cdkn2
  • Mnat1
  • Mo15
  • Rb-1
  • Rb1
  • Wee1
  • p27Kip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Interferon gamma signaling
  • Camk2a
  • Camk2b
  • Camk2d
  • Camk2g
  • Cish3
  • Erk1
  • Erk2
  • Ifng
  • Ifngr1
  • Ifngr2
  • Jak1
  • Jak2
  • Mapk
  • Mapk1
  • Mapk3
  • Pkcd
  • Prkcd
  • Prkm1
  • Prkm3
  • Ptph6
  • Ptpn6
  • Socs1
  • Socs3
  • Stat1
  • Stat4
  • Yb1
  • Ybx1
Rattus norvegicus (Norway rat)
ADP signalling through P2Y purinoceptor 12
  • Gnai-1
  • Gnai-2
  • Gnai-3
  • Gnai1
  • Gnai2
  • Gnai3
  • Gnat-3
  • Gnat3
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
  • P2ry12
  • P2y12
Rattus norvegicus (Norway rat)
Deadenylation of mRNA
  • Ddx48
  • Eif4a1
  • Eif4a2
  • Eif4a3
  • Eif4e
  • Eif4g1
  • PAN3
  • Pabp1
  • Pabpc1
  • Paip1
  • Pan2
  • Pan3
  • Usp52
Rattus norvegicus (Norway rat)
Metabolism of folate and pterines
  • Aldh1l1
  • Aldh1l2
  • Dhfr
  • Folr2
  • Fpgs
  • Fthfd
  • Hcp1
  • Mthfd
  • Mthfd1
  • Mthfd1l
  • Mthfd2
  • Mthfd2l
  • Mthfr
  • Mthfs
  • Pcft
  • Shmt1
  • Shmt2
  • Slc19a1
  • Slc25a32
  • Slc46a1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Formation of ATP by chemiosmotic coupling
  • Atp5a1
  • Atp5b
  • Atp5c
  • Atp5c1
  • Atp5d
  • Atp5e
  • Atp5f
  • Atp5f1
  • Atp5f1a
  • Atp5f1b
  • Atp5f1c
  • Atp5f1d
  • Atp5f1e
  • Atp5g1
  • Atp5g2
  • Atp5g3
  • Atp5h
  • Atp5i
  • Atp5j
  • Atp5j2
  • Atp5jd
  • Atp5l
  • Atp5mc1
  • Atp5mc2
  • Atp5mc3
  • Atp5me
  • Atp5mf
  • Atp5mg
  • Atp5o
  • Atp5pb
  • Atp5pd
  • Atp5pf
  • Atp5po
  • Atp5s
  • Atp6
  • Atp8
  • Atpase6
  • Atpase8
  • Dmac2l
  • Mt-atp6
  • Mt-atp8
  • Mtatp6
  • Mtatp8
Rattus norvegicus (Norway rat)
NRIF signals cell death from the nucleus
  • Aph1a
  • Cenpr
  • Itgb3bp
  • LOC100360645
  • Ncstn
  • Ngf
  • Ngfb
  • Ngfr
  • Nrif3
  • Ps2
  • Psen1
  • Psen2
  • Psenen
  • Psnl1
  • Psnl2
  • Rps27a
  • Sqstm1
  • Tnfrsf16
  • Traf6
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Zip
Rattus norvegicus (Norway rat)
Triglyceride catabolism
  • Blbp
  • FABP12
  • Fabp1
  • Fabp2
  • Fabp3
  • Fabp4
  • Fabp5
  • Fabp6
  • Fabp7
  • Fabp9
  • Fabpi
  • Gpd2
  • Ilbp
  • Illbp
  • Perf15
  • Pnpla4
  • Pnpla5
  • RGD1562200
Rattus norvegicus (Norway rat)
Reelin signalling pathway
  • Dab1
  • Fyn
  • Reln
  • Ruk
  • Seta
  • Sh3kbp1
  • Vldlr
Rattus norvegicus (Norway rat)
G alpha (z) signalling events
  • Adcy1
  • Adcy2
  • Adcy3
  • Adcy4
  • Adcy5
  • Adcy6
  • Adcy7
  • Adcy8
  • Adcy9
  • Adra2a
  • Adra2b
  • Adra2c
  • Gnaz
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
  • Rgs16
  • Rgs17
  • Rgs20
  • Rgsr
Rattus norvegicus (Norway rat)
VEGFR2 mediated cell proliferation
  • Flk1
  • Hras
  • Hras1
  • Kdr
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Pdk1
  • Pdpk1
  • Pkca
  • Pkcb
  • Pkcd
  • Pkcz
  • Plcg1
  • Prkca
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Prkcd
  • Prkcz
  • Rasa
  • Rasa1
  • Sphk1
  • Src
  • Vegf
  • Vegfa
Rattus norvegicus (Norway rat)
Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis
  • Aak1
  • Abcc7
  • Adrb2
  • Adrb2r
  • Adrbk1
  • Adrbk2
  • Adtab
  • Agfg1
  • Agfg1-ps1
  • Agtr1
  • Agtr1a
  • Ap17
  • Ap2a1
  • Ap2a2
  • Ap2b1
  • Ap2m1
  • Ap2s1
  • Apob
  • Areg
  • Arh
  • Arrb1
  • Arrb2
  • Ash
  • At1a
  • Avp
  • Avpr2
  • Btc
  • Calm
  • Cbl
  • Cd36l2
  • Cd3d
  • Cd3g
  • Cd4
  • Cftr
  • Chrm-2
  • Chrm2
  • Clapb1
  • Claps2
  • Clta
  • Cltb
  • Cltc
  • Cops1
  • Cops2
  • Cops3
  • Cops4
  • Cops5
  • Cops6
  • Cops7a
  • Cops7b
  • Cops8
  • Csn1
  • Csn2
  • Csn3
  • Csn4
  • Csn8
  • Da41
  • Dab2
  • Doc2
  • Dtr
  • Dvl2
  • Dyt1
  • Egf
  • Egfr
  • Ehsh1
  • Epn1
  • Epn2
  • Eps15
  • Eps15l1
  • Ereg
  • Fcho1
  • Fcho2
  • Fzd4
  • Glut8
  • Glutx1
  • Gps1
  • Grb2
  • Grk2
  • Grk3
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hgs
  • Hrb
  • Hrs
  • Hrs2
  • Igf2r
  • Il7r
  • Itsn
  • Itsn1
  • Itsn2
  • LOC100360645
  • LOC100361515
  • Ldlr
  • Ldlrap1
  • Limpii
  • Lrp2
  • M6pr
  • Necap1
  • Necap2
  • Nedd8
  • Picalm
  • Plic1
  • Reps1
  • Reps2
  • Rip
  • Rps27a
  • Ruk
  • Scarb2
  • Sdgf
  • Seta
  • Sh3d2a
  • Sh3d2c1
  • Sh3gl1
  • Sh3gl2
  • Sh3gl3
  • Sh3kbp1
  • Sh3p13
  • Sh3p4
  • Sh3p8
  • Slc18a3
  • Slc2a8
  • Snap91
  • Stam
  • Stam2
  • Ston1
  • Ston2
  • Syb2
  • Syb3
  • Sybl1
  • Syt1
  • Syt11
  • Syt2
  • Syt5
  • Syt8
  • Syt9
  • T3d
  • Tac1r
  • Tacr1
  • Tf
  • Tfrc
  • Tgfa
  • Tor1a
  • Trfr
  • Trip15
  • Ttgn1
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ubqln1
  • Ubqln2
  • Vacht
  • Vamp2
  • Vamp3
  • Vamp4
  • Vamp7
  • Vamp8
  • Vat
  • Wnt-5a
  • Wnt5a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ca activated K+ channels
  • Ik1
  • Kcnma
  • Kcnma1
  • Kcnmb1
  • Kcnmb2
  • Kcnmb3
  • Kcnmb4
  • Kcnn1
  • Kcnn2
  • Kcnn3
  • Kcnn4
  • Sk1
  • Sk4
  • Smik
Rattus norvegicus (Norway rat)
Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane
  • A4
  • AD1
  • Aldh3a2
  • Aldh4
  • App
  • Cyb5
  • Cyb5a
  • Emd
  • Hmox1
  • Prn
  • Prnp
  • Prp
  • Ramp4
  • Sap
  • Sec61b
  • Sec61g
  • Serp1
  • Sgt
  • Sgt1
  • Sgta
  • Stg
  • Stx1a
  • Stx5
  • Stx5a
  • Syb2
  • Ube2j2
  • Vamp2
  • Vap33
  • Vapa
Rattus norvegicus (Norway rat)
VEGF ligand-receptor interactions
  • Figf
  • Pgf
  • Plgf
  • Vegf
  • Vegfa
  • Vegfb
  • Vegfc
  • Vegfd
  • Vrf
Rattus norvegicus (Norway rat)
SHC-mediated cascade:FGFR2
  • Ash
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-7
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr2
  • Grb2
  • Hras
  • Hras1
  • Kgf
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Shc1
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
SUMOylation of DNA damage response and repair proteins
  • Aaas
  • Adprt
  • Bam
  • Blm
  • Bmh
  • Brca1
  • Cbx2
  • Cbx4
  • Cbx8
  • Cetn2
  • Cspg6
  • Gp210
  • Herc2
  • LOC102551929
  • LOC683983
  • Mageb10
  • Mdc1
  • Miz1
  • Mms21
  • Mrnp41
  • Ndc1
  • Npap60
  • Nsmce1
  • Nsmce2
  • Nsmce4a
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup153
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup210
  • Nup214
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup42
  • Nup43
  • Nup50
  • Nup53
  • Nup54
  • Nup58
  • Nup62
  • Nup84
  • Nup85
  • Nup88
  • Nup93
  • Nup98
  • Nupl1
  • Nupl2
  • Parp1
  • Pcnt1
  • Phc1
  • Phc2
  • Phc3
  • Pias1
  • Pias2
  • Pias4
  • Piasx
  • Pml
  • Pom121
  • Pom210
  • Rad21
  • Rad52
  • Rae1
  • Ranbp2
  • Ring1
  • Ring1b
  • Rnf1
  • Rnf168
  • Rnf2
  • Rpa1
  • Scml2
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Smc1
  • Smc1a
  • Smc1l1
  • Smc3
  • Smc3l1
  • Smc5
  • Smc6
  • Smt3a
  • Smt3h2
  • Sp100
  • Stag1
  • Stag2
  • Sumo1
  • Sumo2
  • Sumo3
  • Tdg
  • Tmem48
  • Tpr
  • Ubce9
  • Ube2i
  • Xpc
  • Xrcc4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Ligand-receptor interactions
  • Cdo
  • Cdon
  • Dhh
  • Hhip
  • Ihh
  • Ptch
  • Ptch1
  • Shh
  • Vhh-1
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024