GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1101 - 1125 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Regulation of BACH1 activity
  • BACH1
  • CUL1
  • EMC19
  • FBL17
  • FBX13
  • FBXL1
  • FBXL17
  • FBXO13
  • MAFK
  • OCP2
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SKP2
  • TCEB1L
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Regulation of HMOX1 expression and activity
  • BACH1
  • H13
  • HM13
  • HMOX1
  • HO
  • HO1
  • IMP1
  • MAFK
  • NFE2L2
  • NRF2
  • PSL3
  • SPP
Homo sapiens (human)
Integration of provirus
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • KPNA1
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • RCH2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
APOBEC3G mediated resistance to HIV-1 infection
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
2-LTR circle formation
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • DFS70
  • G22P1
  • G22P2
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • LIG4
  • PSIP1
  • PSIP2
  • XRCC4
  • XRCC5
  • XRCC6
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Integration of viral DNA into host genomic DNA
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • PSIP1
  • PSIP2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Autointegration results in viral DNA circles
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • PSIP1
  • PSIP2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Nuclear Envelope Breakdown
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • EDMD
  • EMD
  • LEMD2
  • LEMD3
  • MAN1
  • STA
  • VRK1
Homo sapiens (human)
Chromatin modifying enzymes
  • BAF190A
  • BRG1
  • BRWD1
  • C21orf107
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • KIAA0994
  • PAD1
  • PAD2
  • PAD3
  • PAD4
  • PAD6
  • PADI1
  • PADI2
  • PADI3
  • PADI4
  • PADI5
  • PADI6
  • PDI1
  • PDI2
  • PDI3
  • PDI5
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
  • WDR9
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR1 in disease
  • BAG4
  • BCR
  • BCR1
  • BFGFR
  • C8orf2
  • CD245
  • CEK
  • CEP43
  • CFIM68
  • CPSF6
  • CUTL1
  • CUX1
  • D22S11
  • ERLIN2
  • FGF1
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FGFR1OP
  • FGFR1OP2
  • FIM
  • FLG
  • FLT2
  • FOP
  • FRS2
  • GAB1
  • GCF2
  • GRB1
  • HBGFR
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • KIAA0216
  • KS3
  • LRRFIP1
  • MYO18A
  • MYSPDZ
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PLC1
  • PLCG1
  • RAMP
  • RNF82
  • SODD
  • SOS1
  • SPFH2
  • TIAF1
  • TIF1
  • TIF1A
  • TRIM24
  • TRIP
  • ZMYM2
  • ZNF198
Homo sapiens (human)
Signaling by plasma membrane FGFR1 fusions
  • BAG4
  • BFGFR
  • C8orf2
  • CEK
  • ERLIN2
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • SODD
  • SPFH2
Homo sapiens (human)
Pyroptosis
  • BAK
  • BAK1
  • BAX
  • BC2
  • BCL2L4
  • BCL2L7
  • C14orf123
  • C20orf178
  • CASP1
  • CASP3
  • CASP4
  • CASP5
  • CDN1
  • CGI149
  • CGL1
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • CPP32
  • CSPB
  • CTLA1
  • CYC
  • CYCS
  • DFNA5
  • DFNA5L
  • ELA2
  • ELANE
  • GRB
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • GSDME
  • GZMB
  • HMG1
  • HMGB1
  • ICERE1
  • ICH2
  • ICH3
  • IGIF
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IL1F1
  • IL1F2
  • IL1F4
  • IRF1
  • IRF2
  • KET
  • NEDF
  • P53
  • P63
  • P73H
  • P73L
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • TP53
  • TP63
  • TP73L
  • VPS20
  • VPS24
Homo sapiens (human)
Release of apoptotic factors from the mitochondria
  • BAK
  • BAK1
  • BAX
  • BCL2L4
  • BCL2L7
  • CDN1
  • CYC
  • CYCS
  • DFNA5
  • DFNA5L
  • DIABLO
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • GSDME
  • ICERE1
  • SMAC
Homo sapiens (human)
Activation and oligomerization of BAK protein
  • BAK
  • BAK1
  • BCL2L7
  • BID
  • CDN1
Homo sapiens (human)
Digestion of dietary lipid
  • BAL
  • CEL
  • CLPS
  • LIPF
  • PLRP1
  • PLRP2
  • PNLIP
  • PNLIPRP1
  • PNLIPRP2
  • PNLIPRP3
Homo sapiens (human)
Cellular response to mitochondrial stress
  • BAP
  • DELE
  • DELE1
  • EIF2A
  • EIF2AK1
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • FTSH1
  • HRI
  • KIAA0141
  • KIAA1369
  • MPRP1
  • OMA1
  • PHB2
  • REA
  • SLP2
  • STOML2
  • YME1L
  • YME1L1
Homo sapiens (human)
SUMOylation of transcription cofactors
  • BAP1
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BING2
  • BMI1
  • CASP8AP2
  • CBP
  • CBX2
  • CBX4
  • CBX8
  • CREBBP
  • CTBP
  • CTBP1
  • CTG26
  • CXXC3
  • DAP6
  • DAXX
  • DDX17
  • DDX5
  • DDXBP1
  • DING
  • EDR1
  • EDR2
  • EDR3
  • EP300
  • FLASH
  • G17P1
  • HAP
  • HELR
  • HET
  • HIPI3
  • HIPK2
  • HLR1
  • ING1L
  • ING2
  • KAP1
  • KIAA1315
  • KIAA1438
  • LEM6
  • LUN
  • MAL
  • MBD1
  • MEL18
  • MKL1
  • MRTFA
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOR2
  • NIRF
  • NPM
  • NPM1
  • NRIP1
  • P300
  • PARK7
  • PC3
  • PCGF2
  • PCGF4
  • PCM1
  • PGC1
  • PGC1A
  • PH1
  • PH2
  • PH3
  • PHC1
  • PHC2
  • PHC3
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PIASG
  • PPARGC1
  • PPARGC1A
  • RC1
  • RING1
  • RING1A
  • RING1B
  • RIP25
  • RNF1
  • RNF107
  • RNF110
  • RNF2
  • RNF51
  • RNF96
  • SAFB
  • SAFB1
  • SIN3A
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • SRC1
  • SRC2
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • TIF1B
  • TIF2
  • TOPORS
  • TP53BPL
  • TRIM28
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • UHRF2
  • ZBRK1
  • ZNF131
  • ZNF144
  • ZNF350
Homo sapiens (human)
Apoptotic execution phase
  • BAP31
  • BCAP31
  • CASP8
  • DLP1
  • DNM1L
  • DRP1
  • DXS1357E
  • MCH5
  • MST3
  • STK24
  • STK3
Homo sapiens (human)
Regulation of RUNX2 expression and activity
  • BAPX1
  • BHLHA38
  • BMP2
  • BMP2A
  • C7orf76
  • CBFB
  • CHIP
  • CUL1
  • DLX5
  • DLX6
  • DSS1
  • EMC19
  • ERR1
  • ESR
  • ESR1
  • ESRL1
  • ESRRA
  • FBXL1
  • GRL
  • GSK3B
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HIVEP3
  • HOX8
  • HSPC
  • IFI5111
  • KBP1
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA1555
  • KIAA1625
  • KRC
  • LEM6
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • MSX2
  • NKX3-2
  • NKX3B
  • NR3A1
  • NR3B1
  • NR3C1
  • NU
  • OCP2
  • PERC
  • PFAAP4
  • PGC1
  • PGC1A
  • PGC1B
  • POH1
  • PPARGC1
  • PPARGC1A
  • PPARGC1B
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RBX1
  • RING10
  • RING12
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SKP2
  • SMURF1
  • STAT1
  • STUB1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TRAP2
  • TWIST
  • TWIST1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WWP1
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
  • ZAS3
Homo sapiens (human)
Synthesis of bile acids and bile salts
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • CH25H
  • CYP7
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • FXR
  • HRR1
  • KIAA0704
  • KIAA0772
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • ORP1
  • ORP2
  • ORP3
  • ORP6
  • ORP7
  • ORP9
  • OSBP
  • OSBP1
  • OSBP3
  • OSBP4
  • OSBP8
  • OSBPL1
  • OSBPL1A
  • OSBPL1B
  • OSBPL2
  • OSBPL3
  • OSBPL6
  • OSBPL7
  • OSBPL9
  • RIP14
  • RXRA
  • SRC1
  • SRC2
  • TIF2
Homo sapiens (human)
Transcription of E2F targets under negative control by DREAM complex
  • BARA
  • BHLHD4
  • BHLHE39
  • C14orf46
  • CDC18L
  • CDC25A
  • CDC6
  • CXCDC1
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F4
  • E2F5
  • HDAC1
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MAX
  • MYC
  • PCNA
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBL1
  • RBL2
  • RPD3L1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
  • TOP2
  • TOP2A
Homo sapiens (human)
Transcription of E2F targets under negative control by p107 (RBL1) and p130 (RBL2) in complex with HDAC1
  • BARA
  • BMYB
  • C14orf46
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CXCDC1
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F4
  • E2F5
  • HDAC1
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MYBL2
  • P34CDC2
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBL1
  • RBL2
  • RPD3L1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
Homo sapiens (human)
Polo-like kinase mediated events
  • BARA
  • BMYB
  • C14orf46
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC25A
  • CDC25C
  • CENPF
  • CXCDC1
  • EP300
  • FKHL16
  • FOXM1
  • HFH11
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MPP2
  • MYBL2
  • MYT1
  • P300
  • PKMYT1
  • PLK
  • PLK1
  • RBAP48
  • RBBP4
  • TGS
  • WEE1
  • WIN
Homo sapiens (human)
G0 and Early G1
  • BARA
  • C14orf46
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDK2
  • CDKN2
  • CXCDC1
  • DP1
  • DP2
  • DYRK
  • DYRK1A
  • E2F4
  • E2F5
  • HDAC1
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MNB
  • MNBH
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBL1
  • RBL2
  • RPD3L1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
Homo sapiens (human)
G1/S-Specific Transcription
  • BARA
  • C14orf46
  • CCNA1
  • CCNE
  • CCNE1
  • CDC18L
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDC45
  • CDC45L
  • CDC45L2
  • CDC6
  • CDK1
  • CDKN1
  • CDT1
  • CXCDC1
  • DHFR
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F4
  • E2F5
  • E2F6
  • EMI1
  • FBX5
  • FBXO5
  • HDAC1
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • ORC1
  • ORC1L
  • P34CDC2
  • PARC1
  • PCNA
  • POLA
  • POLA1
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBL1
  • RBL2
  • RPD3L1
  • RR2
  • RRM2
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
  • TK1
  • TS
  • TYMS
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024