GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1426 - 1450 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Interleukin-18 signaling
  • ALOX5
  • FIL1Z
  • IGIF
  • IL13
  • IL18
  • IL18BP
  • IL18R1
  • IL18RAP
  • IL1F4
  • IL1F7
  • IL1H4
  • IL1R7
  • IL1RP1
  • IL1RRP
  • IL37
  • IL4
  • LOG5
  • NC30
Homo sapiens (human)
Phosphorylation of proteins involved in G1/S transition by active Cyclin E:Cdk2 complexes
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDK2
  • CDKN2
  • RB1
Homo sapiens (human)
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer
  • ALK5
  • MADH2
  • MADH3
  • MADR2
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
IRAK1 recruits IKK complex upon TLR7/8 or 9 stimulation
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • NEMO
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PRISM
  • RNF85
  • TCF16
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
Coenzyme A biosynthesis
  • C20orf48
  • COAB
  • COAC
  • COASY
  • DCAKD
  • PANK
  • PANK1
  • PANK2
  • PANK3
  • PPCDC
  • PPCS
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF
  • BRF1
  • C6orf51
  • CRCP
  • GTF2D1
  • GTF3A
  • GTF3B
  • GTF3C1
  • GTF3C2
  • GTF3C3
  • GTF3C4
  • GTF3C5
  • GTF3C6
  • KIAA0011
  • KIAA1241
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • RPC11
  • RPC8
  • TAF3B2
  • TAF3C
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
Homo sapiens (human)
CaM pathway
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
Homo sapiens (human)
CREB1 phosphorylation through the activation of CaMKII/CaMKK/CaMKIV cascasde
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-GR
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • CAMK4
  • CAMKB
  • CAMKG
  • CAMKIV
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • KIAA0787
  • KPNA2
  • RCH1
  • SRP1
Homo sapiens (human)
PCNA-Dependent Long Patch Base Excision Repair
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • CHRAC17
  • DPE2
  • FEN1
  • HAP1
  • KIAA0039
  • LIG1
  • PCNA
  • POLB
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • RAD2
  • REF1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
Homo sapiens (human)
Tat-mediated elongation of the HIV-1 transcript
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C19orf17
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCNH
  • CCNT1
  • CDC2L4
  • CDK7
  • CDK9
  • CDKN7
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • KIAA1182
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RNF66
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SSRP1
  • STK1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • TTDA
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • tat
Homo sapiens (human)
Translation of Accessory Proteins
  • 6
  • 7a
  • 8
  • 9b
Homo sapiens (human)
Dual incision in TC-NER
  • AQR
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCDC16
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CHRAC17
  • CKN1
  • CSA
  • CSB
  • CUL4A
  • CUL4B
  • CYP33
  • DDB1
  • DINB1
  • DPE2
  • ERCC1
  • ERCC11
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC4
  • ERCC5
  • ERCC6
  • ERCC8
  • ERCM2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • HAUSP
  • HCNP
  • ISY1
  • KIAA0039
  • KIAA0560
  • KIAA0695
  • KIAA1160
  • KIAA1177
  • KIAA1530
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NMP200
  • PCNA
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • POLK
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PPIE
  • PRP19
  • PRPF19
  • RBX1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RNF66
  • RNF75
  • ROC1
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPB7
  • RPS27A
  • SNEV
  • STK1
  • SYF1
  • TCEA1
  • TFIIS
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP7
  • UVSSA
  • XAB2
  • XAP1
  • XPA
  • XPAC
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • XPF
  • XPG
  • XPGC
  • ZNF830
Homo sapiens (human)
Impaired BRCA2 binding to SEM1 (DSS1)
  • BRCA2
  • C7orf76
  • DSS1
  • FACD
  • FANCD1
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
Homo sapiens (human)
Dopamine receptors
  • DRD1
  • DRD1B
  • DRD1L2
  • DRD2
  • DRD3
  • DRD4
  • DRD5
Homo sapiens (human)
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins
  • CASP3
  • CDH1
  • CDHE
  • CDHF4
  • CDHF5
  • CDHF6
  • CPP32
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSP
  • OCLN
  • PKP1
  • TJP1
  • TJP2
  • UVO
  • X104
  • ZO1
  • ZO2
Homo sapiens (human)
EPHB-mediated forward signaling
  • ACTB
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • ARC16
  • ARC20
  • ARC21
  • ARC34
  • ARC41
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGEF28
  • ARP2
  • ARP3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • CDC42
  • CFL
  • CFL1
  • DUET
  • DUO
  • FAK
  • FAK1
  • FYN
  • GAP
  • GRIN1
  • GRIN2B
  • HAPIP
  • HRAS
  • HRAS1
  • HSPG1
  • ITSN
  • ITSN1
  • JTK8
  • KALRN
  • KIAA0619
  • KIAA1998
  • LIMK
  • LIMK1
  • LIMK2
  • LYN
  • NMDAR1
  • NMDAR2B
  • PAK1
  • PTK2
  • RAC1
  • RASA
  • RASA1
  • RGNEF
  • RHO12
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SDC2
  • SH3D1A
  • SOP2L
  • TC25
  • TIAM1
  • TRAD
  • WASL
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Phosphate bond hydrolysis by NUDT proteins
  • ADPRM
  • C17orf48
  • MTH2
  • NUDIX5
  • NUDT15
  • NUDT16
  • NUDT5
Homo sapiens (human)
Phosphate bond hydrolysis by NTPDase proteins
  • CD39
  • CD39L1
  • CD39L2
  • CD39L3
  • CD39L4
  • ENTPD1
  • ENTPD2
  • ENTPD3
  • ENTPD4
  • ENTPD5
  • ENTPD6
  • ENTPD7
  • ENTPD8
  • IL6ST2
  • KIAA0392
  • LALP1
  • LALP70
  • LYSAL1
  • PCPH
Homo sapiens (human)
COPII-mediated vesicle transport
  • AAT
  • ANKRD28
  • AREG
  • AREGB
  • BET1
  • BET3
  • BET5
  • C11orf23
  • C14orf163
  • C20orf140
  • C5orf8
  • CD59
  • CNIH
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CNIL
  • COL7A1
  • CPPI
  • CSNK1D
  • CTSC
  • CTSZ
  • D3S1231E
  • EHOC1
  • ERGIC53
  • ERGL
  • F5
  • F5F8D
  • F8
  • F8C
  • FOLR
  • FOLR1
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GOLGA2
  • GOLPH5
  • GORASP1
  • GOSR2
  • GRASP65
  • GRIA1
  • GS27
  • HCKID
  • KIAA0079
  • KIAA0310
  • KIAA0379
  • KIAA0755
  • KIAA0905
  • KIAA0917
  • KIAA1115
  • KIAA1558
  • KIAA1882
  • KIAA1928
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • LZTR2
  • MCFD2
  • MIC11
  • MIN1
  • MIN2
  • MIN3
  • MSK21
  • MUM2
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NIBP
  • NSF
  • PI
  • PP6R1
  • PP6R3
  • PPP6
  • PPP6C
  • PPP6R1
  • PPP6R3
  • PREB
  • RAB1
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RGPR
  • RNP24
  • SAPL
  • SAPS1
  • SAPS3
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SBDN
  • SCFD1
  • SDGF
  • SDNSF
  • SEC12
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEC16
  • SEC16A
  • SEC16B
  • SEC16L
  • SEC16S
  • SEC22A
  • SEC22B
  • SEC22C
  • SEC22L1
  • SEC22L2
  • SEC22L3
  • SEC23A
  • SEC23IP
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SEC31L1
  • SEDL
  • SERPINA1
  • SNAPA
  • SNAPB
  • SNAPG
  • STX17
  • STX5
  • STX5A
  • STXBP1L2
  • TBC1D20
  • TFG
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TMEM1
  • TMP21
  • TRAPPC1
  • TRAPPC10
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC5
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC6B
  • TRAPPC9
  • USO1
  • VDP
  • VIPL
  • YKT6
Homo sapiens (human)
Lipophagy
  • ADFP
  • AMPK
  • AMPK2
  • AMPKG3
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • M6PRBP1
  • PLIN2
  • PLIN3
  • PRKAA2
  • PRKAB1
  • PRKAB2
  • PRKAG1
  • PRKAG2
  • PRKAG3
  • TIP47
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-1-host interactions
  • HNRNPA1
  • HNRPA1
  • N
  • NPM
  • NPM1
Homo sapiens (human)
tandutinib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
CREB3 factors activate genes
  • AIBZIP
  • BBF2H7
  • C5orf41
  • CREB3
  • CREB3L1
  • CREB3L2
  • CREB3L3
  • CREB3L4
  • CREB4
  • CREBH
  • CREBRF
  • DCSTAMP
  • JAL
  • KIAA0091
  • LZIP
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • OASIS
  • S1P
  • S2P
  • SKI1
  • TM7SF4
Homo sapiens (human)
Late endosomal microautophagy
  • ABCC7
  • ADFP
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • BC2
  • C14orf123
  • C20orf178
  • C9orf28
  • CEN1
  • CETN
  • CETN1
  • CFBP
  • CFTR
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HBB
  • HCRP1
  • HDAC6
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • IFT88
  • KIAA0402
  • KIAA0901
  • M6PRBP1
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NEDF
  • PARK7
  • PCNT
  • PCNT2
  • PLIN2
  • PLIN3
  • PML39
  • RIB1
  • RNASE1
  • RNS1
  • RPS27A
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • TG737
  • TIP47
  • TSG101
  • TTC10
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS28
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • WBSCR24
Homo sapiens (human)
Defective ABCC8 can cause hypo- and hyper-glycemias
  • ABCC8
  • HRINS
  • KCNJ11
  • SUR
  • SUR1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024