GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1901 - 1925 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Transcription-Coupled Nucleotide Excision Repair (TC-NER)
  • AQR
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C19orf17
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCDC16
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CKN1
  • CSA
  • CSB
  • CUL4A
  • CUL4B
  • CYP33
  • DDB1
  • ELL
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC6
  • ERCC8
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • HAUSP
  • HCNP
  • ISY1
  • KIAA0560
  • KIAA0695
  • KIAA1160
  • KIAA1177
  • KIAA1530
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NMP200
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PPIE
  • PRP19
  • PRPF19
  • RBX1
  • RNF66
  • RNF75
  • ROC1
  • RPB7
  • RPS27A
  • SNEV
  • STK1
  • SYF1
  • TCEA1
  • TFIIS
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP7
  • UVSSA
  • XAB2
  • XAP1
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • ZNF830
Homo sapiens (human)
Synthesis of PA
  • ACP6
  • ACPL1
  • AGPAT1
  • AGPAT2
  • AGPAT3
  • AGPAT4
  • AGPAT5
  • AGPAT6
  • AGPAT7
  • AGPAT8
  • AGPAT9
  • ALCAT1
  • ALPI
  • AYTL2
  • AYTL3
  • C9orf54
  • CLEC13C
  • CPLA2
  • DAPAT
  • DDHD1
  • DDHD2
  • DHAPAT
  • FAM73A
  • FAM73B
  • G15
  • GNPAT
  • GPAM
  • GPAT1
  • GPAT2
  • GPAT3
  • GPAT4
  • GPD1
  • GPD1L
  • GPD2
  • KIAA0089
  • KIAA0725
  • KIAA1560
  • KIAA1705
  • LCLAT1
  • LIPH
  • LIPI
  • LPAAT3
  • LPAP
  • LPCAT1
  • LPCAT4
  • LPDL
  • LPDLR
  • LPEAT2
  • LYCAT
  • MAG1
  • MIGA1
  • MIGA2
  • MPAPLA1
  • PFAAP3
  • PLA1B
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4D
  • PLA2G5
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PLD1
  • PLD2
  • PLD6
  • PPLA2
  • RASF-A
  • SAMWD1
  • SPLASH
  • TSARG7
Homo sapiens (human)
Signaling by FGFR2 in disease
  • BEK
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR2
  • FRS2
  • GAB1
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KGFR
  • KS3
  • KSAM
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PLC1
  • PLCG1
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Selenocysteine synthesis
  • BBC1
  • C10orf89
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DXS648E
  • EC45
  • EEFSEC
  • FAU
  • FTE1
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • PSTK
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SARS
  • SARS1
  • SBP2
  • SCAR
  • SECISBP2
  • SELB
  • SEPHS2
  • SEPSECS
  • SERS
  • SPS2
  • SURF-3
  • SURF3
  • TRNP48
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Vitamin B6 activation to pyridoxal phosphate
  • AO
  • AOX1
  • C21orf124
  • C21orf97
  • PDXK
  • PKH
  • PNK
  • PNPO
Homo sapiens (human)
Inhibition of PKR
  • EIF2AK2
  • NS
  • PKR
  • PRKR
Homo sapiens (human)
Negative regulation of FGFR4 signaling
  • CBL
  • CBL2
  • ERK1
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • FRS2
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • JTK2
  • KLB
  • KS3
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • TKF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Polo-like kinase mediated events
  • BARA
  • BMYB
  • C14orf46
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC25A
  • CDC25C
  • CENPF
  • CXCDC1
  • EP300
  • FKHL16
  • FOXM1
  • HFH11
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MPP2
  • MYBL2
  • MYT1
  • P300
  • PKMYT1
  • PLK
  • PLK1
  • RBAP48
  • RBBP4
  • TGS
  • WEE1
  • WIN
Homo sapiens (human)
Calmodulin induced events
  • ADRBK1
  • BARK
  • BARK1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • GRK2
  • PKCA
  • PKCD
  • PKCG
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCG
Homo sapiens (human)
Regulation of commissural axon pathfinding by SLIT and ROBO
  • DCC
  • DUTT1
  • IGDCC1
  • KIAA0813
  • KIAA0814
  • KIAA1568
  • MEGF4
  • MEGF5
  • NELL2
  • NRP2
  • NTN1
  • NTN1L
  • ROBO1
  • ROBO2
  • SLIL1
  • SLIL2
  • SLIL3
  • SLIT1
  • SLIT2
  • SLIT3
  • SRC
  • SRC1
Homo sapiens (human)
RHO GTPases Activate Rhotekin and Rhophilins
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • KIAA1929
  • LIN7B
  • MALS2
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • RHPN1
  • RHPN2
  • ROPN1
  • ROPN1A
  • RTKN
  • RTKN1
  • TAX1BP3
  • TIP1
  • VELI2
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation
  • ECSIT
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK4
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MEKK
  • MEKK1
  • MYD88
  • RNF85
  • TLR7
  • TLR9
  • TRAF6
Homo sapiens (human)
RPIA deficiency: failed conversion of R5P to RU5P
  • RPI
  • RPIA
Homo sapiens (human)
CD209 (DC-SIGN) signaling
  • CBP
  • CD209
  • CLEC4L
  • CREBBP
  • EP300
  • FYN
  • HRAS
  • HRAS1
  • ICAM2
  • ICAM3
  • JTK8
  • LYN
  • MSK1
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NRAS
  • OPHN3
  • P300
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • RAF
  • RAF1
  • RELA
  • RELB
  • RPS6KA5
Homo sapiens (human)
Assembly and cell surface presentation of NMDA receptors
  • ACTN2
  • APBA1
  • BCL8B
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CASK
  • DLG1
  • DLG2
  • DLG3
  • DLG4
  • GRIN1
  • GRIN2A
  • GRIN2B
  • GRIN2C
  • GRIN2D
  • GRIN3A
  • GRIN3B
  • GluN2D
  • KIAA0968
  • KIAA1232
  • KIAA1365
  • KIAA1405
  • KIAA1544
  • KIAA1973
  • KIF17
  • KIF3X
  • LAP1
  • LIN2
  • LIN7A
  • LIN7B
  • LIN7C
  • LRRC7
  • LYST2
  • MALS1
  • MALS2
  • MALS3
  • MINT1
  • NBEA
  • NEFL
  • NF68
  • NFL
  • NMDAR1
  • NMDAR2A
  • NMDAR2B
  • NMDAR2C
  • NMDAR2D
  • PSD95
  • VELI1
  • VELI2
  • VELI3
  • X11
Homo sapiens (human)
Interleukin-36 pathway
  • FIL1D
  • FIL1E
  • FIL1T
  • IL1E
  • IL1F10
  • IL1F5
  • IL1F6
  • IL1F8
  • IL1F9
  • IL1H1
  • IL1H2
  • IL1HY1
  • IL1HY2
  • IL1L1
  • IL1RL2
  • IL1RP2
  • IL1RP3
  • IL1RRP2
  • IL36A
  • IL36B
  • IL36G
  • IL36RN
  • IL38
Homo sapiens (human)
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors)
  • CB2A
  • CB2B
  • CHEMR23
  • CMKLR1
  • CNR
  • CNR1
  • CNR2
  • DEZ
  • EBI2
  • G2A
  • GPBAR1
  • GPCRW
  • GPR109A
  • GPR132
  • GPR18
  • GPR183
  • GPR35
  • GPR39
  • GPR4
  • GPR55
  • GPR65
  • GPR68
  • GPR80
  • GPR91
  • GPR99
  • HCA2
  • HCAR2
  • HM74A
  • MTNR1A
  • MTNR1B
  • NIACR1
  • OGR1
  • OXGR1
  • P2RY15
  • P2Y15
  • PAFR
  • PTAFR
  • SUCNR1
  • TDAG8
  • TGR5
Homo sapiens (human)
Collagen degradation
  • ADAM10
  • ADAM17
  • ADAM9
  • AGXT2L2
  • BP180
  • BPAG2
  • CLG
  • CLG1
  • CLG4A
  • CLG4B
  • COL12A1
  • COL12A1L
  • COL13A1
  • COL14A1
  • COL15A1
  • COL16A1
  • COL17A1
  • COL18A1
  • COL19A1
  • COL23A1
  • COL25A1
  • COL26A1
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • CPSB
  • CPSD
  • CSVP
  • CTSB
  • CTSD
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSO
  • CTSO2
  • ELA2
  • ELANE
  • EMID2
  • EMU2
  • FUR
  • FURIN
  • HME
  • KIAA0021
  • KUZ
  • MADM
  • MCMP
  • MDC9
  • MLTNG
  • MMP1
  • MMP10
  • MMP11
  • MMP12
  • MMP13
  • MMP14
  • MMP15
  • MMP18
  • MMP19
  • MMP2
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • MPSL1
  • PACE
  • PCSK3
  • PHYKPL
  • PRSS2
  • PUMP1
  • RASI
  • STMY1
  • STMY2
  • STMY3
  • TACE
  • TMPRSS6
  • TRY2
  • TRYP2
  • UND
Homo sapiens (human)
Post-transcriptional silencing by small RNAs
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • CAGH26
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
Homo sapiens (human)
Synthesis of IPs in the ER lumen
  • MINPP1
  • MIPP
Homo sapiens (human)
Formation of tubulin folding intermediates by CCT/TriC
  • 99D8.1
  • C21orf112
  • CCT1
  • CCT2
  • CCT3
  • CCT4
  • CCT5
  • CCT6
  • CCT6A
  • CCT6B
  • CCT7
  • CCT8
  • CCTA
  • CCTB
  • CCTD
  • CCTE
  • CCTG
  • CCTH
  • CCTQ
  • CCTZ
  • KIAA0002
  • KIAA0098
  • NIP7-1
  • SRB
  • TCP1
  • TRIC5
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA1B
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA3E
  • TUBA4
  • TUBA4A
  • TUBA4B
  • TUBA6
  • TUBA8
  • TUBAL2
  • TUBAL3
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
Homo sapiens (human)
Defective ABCB4 causes PFIC3, ICP3 and GBD1
  • ABCB4
  • MDR3
  • PGY3
Homo sapiens (human)
Transport of the SLBP independent Mature mRNA
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ALY
  • ALYREF
  • BEF
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CBP20
  • CBP80
  • CG1
  • D3S1231E
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • MP44
  • MRNP41
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • NXF1
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TAP
  • THOC4
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
Formation of the Early Elongation Complex
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CBP20
  • CBP80
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA1182
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RNF66
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • STK1
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TH1
  • TH1L
  • TTDA
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
Telomere C-strand (Lagging Strand) Synthesis
  • ACD
  • DRIP5
  • KIAA0039
  • PCNA
  • PIN2
  • PIP1
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POT1
  • PTOP
  • RAP1
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024