GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 276 - 300 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Deactivation of the beta-catenin transactivating complex
  • Akt1
  • Akt2
  • Apc
  • Api3
  • Bars
  • Birc4
  • Btrc
  • Catnb
  • Cby
  • Cby1
  • Chd8
  • Crm1
  • Ctbp1
  • Ctbp3
  • Ctnnb1
  • Ctnnbip1
  • Esp2
  • Esp3
  • Grg4
  • Hdac1
  • LOC100360645
  • Lef1
  • Msfs1
  • Pgea1
  • Rps27a
  • Sox-6
  • Sox13
  • Sox17
  • Sox2
  • Sox3
  • Sox4
  • Sox6
  • Sox7
  • Sox9
  • Tcf7
  • Tcf7l1
  • Tcf7l2
  • Tle1
  • Tle2
  • Tle3
  • Tle4
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Xiap
  • Xpo1
  • Ywhaz
Rattus norvegicus (Norway rat)
PKA activation
  • Adcy1
  • Adcy2
  • Adcy3
  • Adcy4
  • Adcy5
  • Adcy6
  • Adcy7
  • Adcy8
  • Adcy9
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
Rattus norvegicus (Norway rat)
p53-Dependent G1 DNA Damage Response
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Ccne
  • Ccne1
  • Ccne2
  • Cdk2
  • Cdkn1a
  • Cdkn1b
  • Cdkn2
  • p27Kip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Apoptosis induced DNA fragmentation
  • Cad
  • Casp3
  • Cpp32
  • Dffa
  • Dffb
  • H1-0
  • H1-1
  • H1-4
  • H1-5
  • H1f0
  • H1f2
  • H1f4
  • H1f5
  • HIf5
  • Hist1h1a
  • Hist1h1b
  • Hmg-1
  • Hmg1
  • Hmg2
  • Hmgb1
  • Hmgb1-ps33
  • Hmgb1-ps4
  • Hmgb1l1
  • Hmgb1l2
  • Hmgb1l3
  • Hmgb1l5
  • Hmgb2
  • Kpna1
  • Kpnb1
  • LOC108349189
  • LOC108350839
Rattus norvegicus (Norway rat)
Heme biosynthesis
  • Abcg2
  • Alad
  • Alas1
  • Alas2
  • Alase
  • Alb
  • Bcrp1
  • Cox10
  • Cox15
  • Cpo
  • Cpox
  • Fech
  • Hmbs
  • LOC100911779
  • Ppox
  • Urod
  • Uros
Rattus norvegicus (Norway rat)
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha
  • Ajuba
  • Cul2
  • Egln1
  • Egln2
  • Egln3
  • Elob
  • Eloc
  • Epas1
  • Hif1a
  • Hif2a
  • Hif3a
  • Jub
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Limd1
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Rbx1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sm20
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Tceb1
  • Tceb2
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubc4
  • Ubcep1
  • Ubch4
  • Ubch5b
  • Ubcl1
  • Ube2d1
  • Ube2d2
  • Ube2d3
  • Vhl
  • Wtip
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of bile acids and bile salts via 27-hydroxycholesterol
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Akr1d1
  • Bar
  • Cca2
  • Cyp27
  • Cyp27a1
  • Cyp7
  • Cyp7a1
  • Cyp7b1
  • Cyp8
  • Cyp8b1
  • Fxr
  • Hsd17b5
  • Hsd3b7
  • Ncoa1
  • Ncoa2
  • Nr1h4
  • Nr2b1
  • Ptgis
  • Rip14
  • Rxra
  • Tif2
Rattus norvegicus (Norway rat)
SCF-beta-TrCP mediated degradation of Emi1
  • Btrc
  • Cdc20
  • Cul1
  • Fzr1
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Skp1
  • Skp1a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Transport and synthesis of PAPS
  • Dtdst
  • Papss1
  • Papss2
  • Sat1
  • Slc26a1
  • Slc26a2
  • Slc35b2
  • Slc35b3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures
  • Col10a1
  • Col11a1
  • Col11a2
  • Col15a1
  • Col18a1
  • Col1a1
  • Col1a2
  • Col2a1
  • Col3a1
  • Col4a1
  • Col4a2
  • Col4a3
  • Col4a4
  • Col4a5
  • Col5a1
  • Col5a2
  • Col5a3
  • Col8a1
  • Col8a2
  • Cts7l2
  • Ctsb
  • Ctsl
  • Ctsl1
  • Ctsll3
  • Ctss
  • LOC100909752
  • LOC100911572
  • Mmp-7
  • Mmp13
  • Mmp20
  • Mmp3
  • Mmp7
  • Mmp9
  • RGD1308751
Rattus norvegicus (Norway rat)
RMTs methylate histone arginines
  • AABR07029195.1
  • Actl6a
  • Actl6b
  • Arid1a
  • Arid1b
  • Baf190a
  • Baf57
  • Baf60b
  • Brg1
  • Carm1
  • Ccnd1
  • Cdk4
  • Coprs
  • Dnmt3a
  • ENSRNOG00000062927
  • H2ac10
  • H2ac18
  • H2ac25
  • H2ac4
  • H2aj
  • H3c13
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist2h2aa3
  • Hist2h3c2
  • Hist3h2a
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Hrmt1l2
  • Hrmt1l3
  • LOC120097726
  • Mep50
  • Pbrm1
  • Prmt1
  • Prmt3
  • Prmt4
  • Prmt5
  • Prmt7
  • RGD1565675
  • Rbbp7
  • Rps2
  • Smarca2
  • Smarca4
  • Smarcb1
  • Smarcc1
  • Smarcc2
  • Smarcd1
  • Smarcd2
  • Smarcd3
  • Smarce1
  • Snf2b
  • Snf2l4
  • Wdr5
  • Wdr77
Rattus norvegicus (Norway rat)
APC/C:Cdc20 mediated degradation of Securin
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Cdc16
  • Cdc20
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • LOC100360645
  • LOC100360846
  • LOC100365869
  • LOC100366017
  • Lmp10
  • Lmp2
  • Mecl1
  • Mss1
  • Psma1
  • Psma2
  • Psma3
  • Psma4
  • Psma5
  • Psma6
  • Psma7
  • Psma8
  • Psmb1
  • Psmb10
  • Psmb2
  • Psmb3
  • Psmb4
  • Psmb5
  • Psmb6
  • Psmb6l
  • Psmb6l1
  • Psmb7
  • Psmb8
  • Psmb9
  • Psmc1
  • Psmc2
  • Psmc3
  • Psmc4
  • Psmc5
  • Psmc6
  • Psmd1
  • Psmd10
  • Psmd11
  • Psmd12
  • Psmd13
  • Psmd14
  • Psmd2
  • Psmd3
  • Psmd5
  • Psmd6
  • Psmd7
  • Psmd8
  • Psmd9
  • Psme1
  • Psme2
  • Psme4
  • Psmf1
  • Pttg
  • Pttg1
  • Ring12
  • Rps27a
  • Sug1
  • Tbp1
  • Tbp7
  • Uba80
  • Ubb
  • Ubbl1
  • Ubc
  • Ubcep1
  • Ubcl1
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2e1
  • Ube2s
Rattus norvegicus (Norway rat)
TRIF-mediated programmed cell death
  • Casp8
  • Cd14
  • Fadd
  • Ly96
  • Plin3
  • Rip3
  • Ripk1
  • Ripk3
  • Ticam1
  • Ticam2
  • Tlr4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of IFNA/IFNB signaling
  • ENSRNOG00000065554
  • If1ai1
  • If1ai2
  • If1ai3
  • Ifna1
  • Ifna12l
  • Ifna4
  • Ifna4l1
  • Ifnar1
  • Ifnar2
  • Ifnb
  • Ifnb1
  • Jak1
  • LOC100911527
  • LOC120103158
  • LOC120103159
  • LOC120103160
  • LOC120103161
  • LOC120103162
  • LOC120103163
  • LOC120103164
  • Ptph6
  • Ptpn1
  • Ptpn11
  • Ptpn6
  • RGD1560539
  • Stat1
  • Stat2
  • Stat4
  • Tyk2
  • Usp18
Rattus norvegicus (Norway rat)
Recycling of bile acids and salts
  • Abcb11
  • Abcc3
  • Acsb
  • Alb
  • Baat
  • Bar
  • Bsep
  • Cmoat2
  • Fabp6
  • Fatp5
  • Fxr
  • Ilbp
  • Illbp
  • Mlp2
  • Mrp3
  • Ncoa1
  • Ncoa2
  • Nr1h4
  • Nr2b1
  • Ntcp
  • Ntcp2
  • Oatp1a4
  • Oatp1b2
  • Oatp2
  • Rip14
  • Rxra
  • Slc10a1
  • Slc10a2
  • Slc21a10
  • Slc21a5
  • Slc27a5
  • Slc51a
  • Slc51b
  • Slco1a4
  • Slco1b2
  • Spgp
  • Stard5
  • Tif2
  • Vlacsr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Post-translational protein phosphorylation
  • 2b7
  • A4
  • AABR07058479.1
  • AD1
  • APPL2
  • Adam10
  • Afp
  • Ags
  • Ahsg
  • Alb
  • Ambn
  • Amel
  • Amelx
  • Amgx
  • Amtn
  • Ano8
  • Aplp2
  • Apoa1
  • Apoa2
  • Apoa5
  • Apob
  • Apoe
  • Apol11a
  • Apol2
  • Apol7a
  • Apol7b
  • Apol9a
  • App
  • Atgl
  • Bmp-4
  • Bmp15
  • Bmp4
  • Bpifb2
  • C3
  • C4
  • C4a
  • C4b
  • Cabp1
  • Ccn1
  • Cdh2
  • Chgb
  • Chgc
  • Chrdl1
  • Ckap4
  • Cp
  • Csf1
  • Csfm
  • Cspg2
  • Cst3
  • Cyr61
  • Dmp1
  • Dnajc3
  • Dvr-4
  • Egfl3
  • Enam
  • Erc
  • Fam20a
  • Fam20c
  • Fbn1
  • Fetua
  • Fga
  • Fgf23
  • Fgg
  • Flrg
  • Fn1
  • Frp
  • Fstl1
  • Fstl3
  • Fuca2
  • Gas6
  • Gbp
  • Golm1
  • Gpc3
  • Grp94
  • Hcf2
  • Hrc
  • Hsp90b1
  • Hspa5bp1
  • Hspc4
  • Hspg1
  • Igfbp-1
  • Igfbp-3
  • Igfbp-4
  • Igfbp-5
  • Igfbp1
  • Igfbp10
  • Igfbp3
  • Igfbp4
  • Igfbp5
  • Igfbp7
  • Il-6
  • Il6
  • Itih2
  • Kjr
  • Kng
  • Kng1
  • Ktn1
  • LOC120093819
  • LOC503164
  • Lgals1
  • Ltbp1
  • Madm
  • Matn3
  • Mbtps1
  • Megf6
  • Meltf
  • Men1
  • Mepe
  • Mfge8
  • Mfi2
  • Mgat4a
  • Mia3
  • Mpf
  • Msln
  • Mxra8
  • Narc1
  • Ng1
  • Notum
  • Nuc
  • Nucb1
  • P4hb
  • P58ipk
  • Pcsk9
  • Pdia1
  • Pdia6
  • Penk
  • Penk-rs
  • Penk1
  • Pnpla2
  • Prkcsh
  • Proc
  • Prss23
  • Qscn6
  • Qsox1
  • RGD1309808
  • Rap3
  • Rasp1
  • Rcn1
  • S1p
  • Sc1
  • Scg-2
  • Scg2
  • Scg3
  • Sdc2
  • Serpina1
  • Serpina10
  • Serpinc1
  • Serpind1
  • Ski1
  • Sox2
  • Sparcl1
  • Spp-1
  • Spp1
  • Spp2
  • Spp24
  • Stc2
  • Synd2
  • Tf
  • Timp-1
  • Timp1
  • Tmem132a
  • Tnc
  • Tra1
  • Ttgn1
  • Txndc7
  • Vcan
  • Vgf
  • Vwa1
  • Wfs1
  • Zpi
Rattus norvegicus (Norway rat)
TP53 Regulates Transcription of Genes Involved in G1 Cell Cycle Arrest
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Ccne
  • Ccne1
  • Ccne2
  • Cdk2
  • Cdkn1a
  • Cdkn1b
  • Cdkn2
  • E2f7
  • E2f8
  • p27Kip1
Rattus norvegicus (Norway rat)
FRS-mediated FGFR1 signaling
  • Ash
  • FGF22
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf10
  • Fgf17
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf22
  • Fgf23
  • Fgf3
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf5c
  • Fgf5d
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr1
  • Flg
  • Frs2
  • Frs3
  • Grb2
  • Hras
  • Hras1
  • Kl
  • Kras
  • Kras2
  • Nras
  • Ptpn11
  • Snt2
  • Sos1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+
  • Pkca
  • Pkcb
  • Pkcc
  • Pkcg
  • Prkca
  • Prkcb
  • Prkcb1
  • Prkcc
  • Prkcg
Rattus norvegicus (Norway rat)
Synthesis of IPs in the ER lumen
  • Minpp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
GAB1 signalosome
  • Areg
  • Ash
  • Btc
  • Cbp
  • Csk
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Ereg
  • Gab1
  • Grb2
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Pag
  • Pag1
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Ptpn11
  • Pxn
  • Sdgf
  • Src
  • Tgfa
Rattus norvegicus (Norway rat)
Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion
  • Adcy5
  • Adcy6
  • Adra2a
  • Adra2c
  • Gnai-1
  • Gnai-2
  • Gnai1
  • Gnai2
  • Gnb1
  • Gnb2
  • Gnb3
  • Gnb4
  • Gnb5
  • Gng10-ps1
  • Gng11
  • Gng12
  • Gng3
  • Gng4
  • Gng5
  • Gng5-ps4
  • Gng7
  • Gng8
  • Gng9
  • Gngt1
  • Gngt11
  • Gngt5
  • Gngt7
  • Gngt9
Rattus norvegicus (Norway rat)
p130Cas linkage to MAPK signaling for integrins
  • Apbb1ip
  • Bcar1
  • Cas
  • Crk
  • Crkas
  • Crko
  • Fak
  • Fak1
  • Fga
  • Fgb
  • Fgg
  • Fn1
  • Itga2b
  • Itgb3
  • Krev1
  • Ptk2
  • Rap1a
  • Rap1b
  • Src
  • Tln1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Fibronectin matrix formation
  • Ceacam1
  • Fn1
  • Itga5
  • Itgb1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Reduction of cytosolic Ca++ levels
  • Atp2a1
  • Atp2a2
  • Atp2a3
  • Atp2b1
  • Atp2b3
  • Atp2b4
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Ncx1
  • Ncx2
  • Ncx3
  • Pmca3
  • Slc8a1
  • Slc8a2
  • Slc8a3
  • Sri
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024