GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 676 - 700 of 1070 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-5
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf5
  • Fgf7a
  • Fgf8
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr3
  • Plcg1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • FGF15
  • FGF6
  • Fgf-1
  • Fgf-2
  • Fgf-9
  • Fgf1
  • Fgf16
  • Fgf17
  • Fgf18
  • Fgf19
  • Fgf2
  • Fgf20
  • Fgf23
  • Fgf4
  • Fgf6
  • Fgf7a
  • Fgf7b
  • Fgf8
  • Fgf8a
  • Fgf9
  • Fgfa
  • Fgfr4
  • Klb
  • Plcg1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • AABR07044416.1
  • Arrb2-ps
  • Cbp
  • Cd247
  • Cd3d
  • Cd3e
  • Cd3g
  • Cd4
  • Csk
  • DA1
  • Db2
  • ENSRNOG00000065769
  • ENSRNOG00000065908
  • ENSRNOG00000065955
  • ENSRNOG00000070909
  • H2-Ea
  • Hla-dma
  • Hla-dmb
  • LOC100911800
  • Lck
  • Pag
  • Pag1
  • Psmb9
  • Ptpn22
  • Ptprc
  • Ptprj
  • RT1-Ba
  • RT1-Bb
  • RT1-DOb
  • RT1-Da
  • RT1-Db1
  • RT1-Db2
  • RT1-Ha
  • RT1-Hb-ps1
  • T3d
  • Tap1
  • Tap2
  • Tesb
  • Trbv16
Rattus norvegicus (Norway rat)
Phosphorylation of the APC/C
  • Anapc1
  • Anapc15
  • Anapc16
  • Anapc2
  • Anapc4
  • Anapc5
  • Anapc7
  • Ccnb1
  • Cdc16
  • Cdc2
  • Cdc23
  • Cdc26
  • Cdc27
  • Cdc2a
  • Cdk1
  • Cdkn1
  • LOC100366017
  • Plk
  • Plk1
  • Ube2c
  • Ube2d1
  • Ube2e1
  • Ube2s
Rattus norvegicus (Norway rat)
Physiological factors
  • Ces1d
  • Ces3
  • Cnp
  • Corin
  • Mme
  • Nppa
  • Nppc
  • Npr1
  • Npr2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Platelet Aggregation (Plug Formation)
  • F2
  • Gp1ba
  • Gp1bb
  • Gp5
  • Gp9
Rattus norvegicus (Norway rat)
Platelet degranulation
  • A1bg
  • A2m
  • A2m1
  • A4
  • AD1
  • APPL2
  • Abcc4
  • Actg
  • Actg1
  • Actn1
  • Actn2
  • Actn4
  • Adn
  • Ahsg
  • Alb
  • Aldoa
  • Anx5
  • Anxa5
  • Aplp2
  • Apoa1
  • Apoh
  • Apool
  • App
  • Armet
  • Brpf3
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Cd109
  • Cd36
  • Cd63
  • Cd9
  • Cdc37l1
  • Cfd
  • Chid1
  • Clec3b
  • Clu
  • Cxcl4
  • Cyb5r1
  • Cyrib
  • Df
  • Ecm1
  • Egf
  • Endod1
  • F13a
  • F13a1
  • F8
  • Fam3c
  • Fat
  • Fermt3
  • Fetua
  • Fga
  • Fgb
  • Fgg
  • Figf
  • Flna
  • Fn1
  • G6f
  • Gas6
  • Gtpbp2
  • Habp4
  • Hgf
  • Hrg
  • Hrg1
  • Igf-1
  • Igf-2
  • Igf1
  • Igf2
  • Ilei
  • Islr
  • Itga2b
  • Itgb3
  • Itih3
  • Itih4
  • Kng
  • Kng1
  • LOC682714
  • LOC686539
  • Lamp-2
  • Lamp2
  • Lefty1
  • Lefty2
  • Lgals3bp
  • Lhfpl2
  • Ly6g6f
  • Maged2
  • Manf
  • Mmrn1
  • Mrp4
  • Nhlrc2
  • Ola1
  • Orm1
  • Pai1
  • Pcdh7
  • Pcyox1l
  • Pdgfa
  • Pdgfb
  • Pecam
  • Pecam1
  • Pf4
  • Pgsg
  • Phactr2
  • Planh1
  • Plek
  • Plg
  • Prg
  • Prg1
  • Pros
  • Pros1
  • Psap
  • Qscn6
  • Qsox1
  • Rab27b
  • Rarres2
  • Rpa1
  • Sccpdh
  • Scg3
  • Scyb4
  • Selenop
  • Selp
  • Sepp1
  • Serpina1
  • Serpina4
  • Serpine1
  • Serpinf2
  • Serping1
  • Sgp1
  • Sod1
  • Sox2
  • Sparc
  • Spp2
  • Spp24
  • Srgn
  • Stxbp2
  • Sytl4
  • Tagln2
  • Tex264
  • Tf
  • Tgf-b3
  • Tgfb1
  • Tgfb2
  • Tgfb3
  • Thbs1
  • Timp-1
  • Timp-3
  • Timp1
  • Timp3
  • Tln1
  • Tmsb4x
  • Tmx3
  • Tor4a
  • Tuba4
  • Tuba4a
  • Unc18b
  • Vcl
  • Vegf
  • Vegfa
  • Vegfb
  • Vegfc
  • Vegfd
  • Vrf
  • Vti1b
  • Vti1l1
  • Wdr1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Platelet homeostasis
  • P2rx1
  • P2rx2
  • P2rx3
  • P2rx4
  • P2rx5
  • P2rx6
  • P2rx7
  • P2rxl1
  • Pafah2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Platelet sensitization by LDL
  • Apob
  • Cpla2
  • Csbp1
  • Csbp2
  • Fgr
  • LOC100909468
  • Lrp8
  • Mapk14
  • Pecam
  • Pecam1
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Ppp2ca
  • Ppp2cb
  • Ppp2r1a
  • Ppp2r1b
  • Ppp2r5a
  • Ppp2r5b
  • Ppp2r5c
  • Ppp2r5d
  • Ppp2r5e
  • Ptph6
  • Ptpn11
  • Ptpn6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins
  • Akp3
  • Alpi
  • Alpl
  • Alpp
  • Art3
  • Art4
  • Bst1
  • C4.4a
  • Cd109
  • Cd52
  • Cdw52
  • Ceacam1
  • Ceacam6
  • Cgm4
  • Cntn3
  • Cntn4
  • Cntn5
  • Cpm
  • Erc
  • Fcgr3a
  • Fcgr4
  • Folr2
  • Folr4
  • Gp2
  • Gpihbp1
  • Gpld1
  • Hnt
  • Izumo1r
  • LOC100910068
  • LOC292666
  • Lamp
  • Lsamp
  • Ly6d
  • Ly6e
  • Ly6g6c
  • Ly6g6d
  • Ly6h
  • Ly6k
  • Lypd1
  • Lypd2
  • Lypd3
  • Lypd4
  • Lypd5
  • Lypd6b
  • Lypd8
  • Lypdc1
  • Mdga1
  • Meltf
  • Mfi2
  • Mpf
  • Msln
  • Negr1
  • Ngrh1
  • Nrn1
  • Nt
  • Ntm
  • Obcam
  • Opcml
  • Otoa
  • Plet1
  • Prnd
  • Prss21
  • Prss41
  • Psca
  • Psg29
  • Psgb1
  • Rb7
  • Reck
  • Rtn4rl2
  • Spaca4
  • Sprn
  • Tecta
  • Tectb
  • Tex101
  • Thy-1
  • Thy1
  • Vnn1
  • Xpnpep2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Post-translational protein phosphorylation
  • 2b7
  • A4
  • AABR07058479.1
  • AD1
  • APPL2
  • Adam10
  • Afp
  • Ags
  • Ahsg
  • Alb
  • Ambn
  • Amel
  • Amelx
  • Amgx
  • Amtn
  • Ano8
  • Aplp2
  • Apoa1
  • Apoa2
  • Apoa5
  • Apob
  • Apoe
  • Apol11a
  • Apol2
  • Apol7a
  • Apol7b
  • Apol9a
  • App
  • Atgl
  • Bmp-4
  • Bmp15
  • Bmp4
  • Bpifb2
  • C3
  • C4
  • C4a
  • C4b
  • Cabp1
  • Ccn1
  • Cdh2
  • Chgb
  • Chgc
  • Chrdl1
  • Ckap4
  • Cp
  • Csf1
  • Csfm
  • Cspg2
  • Cst3
  • Cyr61
  • Dmp1
  • Dnajc3
  • Dvr-4
  • Egfl3
  • Enam
  • Erc
  • Fam20a
  • Fam20c
  • Fbn1
  • Fetua
  • Fga
  • Fgf23
  • Fgg
  • Flrg
  • Fn1
  • Frp
  • Fstl1
  • Fstl3
  • Fuca2
  • Gas6
  • Gbp
  • Golm1
  • Gpc3
  • Grp94
  • Hcf2
  • Hrc
  • Hsp90b1
  • Hspa5bp1
  • Hspc4
  • Hspg1
  • Igfbp-1
  • Igfbp-3
  • Igfbp-4
  • Igfbp-5
  • Igfbp1
  • Igfbp10
  • Igfbp3
  • Igfbp4
  • Igfbp5
  • Igfbp7
  • Il-6
  • Il6
  • Itih2
  • Kjr
  • Kng
  • Kng1
  • Ktn1
  • LOC120093819
  • LOC503164
  • Lgals1
  • Ltbp1
  • Madm
  • Matn3
  • Mbtps1
  • Megf6
  • Meltf
  • Men1
  • Mepe
  • Mfge8
  • Mfi2
  • Mgat4a
  • Mia3
  • Mpf
  • Msln
  • Mxra8
  • Narc1
  • Ng1
  • Notum
  • Nuc
  • Nucb1
  • P4hb
  • P58ipk
  • Pcsk9
  • Pdia1
  • Pdia6
  • Penk
  • Penk-rs
  • Penk1
  • Pnpla2
  • Prkcsh
  • Proc
  • Prss23
  • Qscn6
  • Qsox1
  • RGD1309808
  • Rap3
  • Rasp1
  • Rcn1
  • S1p
  • Sc1
  • Scg-2
  • Scg2
  • Scg3
  • Sdc2
  • Serpina1
  • Serpina10
  • Serpinc1
  • Serpind1
  • Ski1
  • Sox2
  • Sparcl1
  • Spp-1
  • Spp1
  • Spp2
  • Spp24
  • Stc2
  • Synd2
  • Tf
  • Timp-1
  • Timp1
  • Tmem132a
  • Tnc
  • Tra1
  • Ttgn1
  • Txndc7
  • Vcan
  • Vgf
  • Vwa1
  • Wfs1
  • Zpi
Rattus norvegicus (Norway rat)
Postmitotic nuclear pore complex (NPC) reformation
  • Ahctf1
  • LOC683983
  • Ndc1
  • Nup107
  • Nup121
  • Nup133
  • Nup155
  • Nup160
  • Nup188
  • Nup205
  • Nup35
  • Nup37
  • Nup43
  • Nup53
  • Nup85
  • Nup93
  • Nup98
  • Pcnt1
  • Pom121
  • Ran
  • Rangap1
  • Rcc1
  • Sec13
  • Sec13l1
  • Sumo1
  • Tmem48
  • Ubce9
  • Ube2i
Rattus norvegicus (Norway rat)
Potassium transport channels
  • Kab-2
  • Kcnj1
  • Kcnj10
  • Kcnj16
  • Romk1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Pre-NOTCH Processing in Golgi
  • Notch3
  • Rnp24
  • Tmed2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Prednisone ADME
  • Abcb1
  • Akr1c1
  • Akr1c21
  • Alb
  • Cbg
  • Cyp3a-1
  • Cyp3a-2
  • Cyp3a1
  • Cyp3a11
  • Cyp3a13
  • Cyp3a18
  • Cyp3a2
  • Cyp3a62
  • Cyp3a9
  • Hsd11
  • Hsd11b1
  • Hsd11b2
  • Hsd11k
  • Hsd17b5
  • Mdr1
  • Mdr1b
  • Pgy1
  • RGD1559459
  • Serpina6
  • Udpgtr2
  • Ugt1
  • Ugt1a2
  • Ugt1a3
  • Ugt1a5
  • Ugt2b
  • Ugt2b1
  • Ugt2b12
  • Ugt2b15
  • Ugt2b17
  • Ugt2b2
  • Ugt2b3
  • Ugt2b34l1
  • Ugt2b36
  • Ugt2b37
  • Ugt2b4
  • Ugt2b5
  • Ugt2b6
  • Ugt2b7
  • Ugt2b8
Rattus norvegicus (Norway rat)
Presynaptic depolarization and calcium channel opening
  • Cach4
  • Cach5
  • Cach6
  • Cacn3
  • Cacna1a
  • Cacna1b
  • Cacna1e
  • Cacna2d2
  • Cacna2d3
  • Cacnb1
  • Cacnb2
  • Cacnb3
  • Cacnb4
  • Cacng2
  • Cacng4
  • Cacnl1a4
  • Cacnl1a5
  • Cacnl1a6
  • Cacnlb1
  • Cacnlb2
  • Cacnlb3
  • Stg
Rattus norvegicus (Norway rat)
Presynaptic function of Kainate receptors
  • Glur7
  • Grik3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA
  • AABR07026797.1
  • AC109542.1
  • Auf1
  • Cbp20
  • Cbp80
  • Cl-4
  • Clp1
  • Cpsf1
  • Cpsf2
  • Cpsf3
  • Cpsf4
  • Cpsf5
  • Cpsf6
  • Cpsf7
  • Cstf1
  • Cstf2
  • Cstf2t
  • Cstf3
  • Fblim1
  • Fip1l1
  • Fus
  • Gtf2f1
  • Gtf2f2
  • Hnrnp
  • Hnrnpa1
  • Hnrnpa2b1
  • Hnrnpa3
  • Hnrnpc
  • Hnrnpd
  • Hnrnpf
  • Hnrnph1
  • Hnrnph2
  • Hnrnpk
  • Hnrnpl
  • Hnrnpr
  • Hnrnpr-ps2
  • Hnrnpu
  • Hnrpa1
  • Hnrpa2b1
  • Hnrpc
  • Hnrpd
  • Hnrpf
  • Hnrph
  • Hnrph1
  • Hnrph2
  • Hnrpk
  • Hnrpr
  • Hnrpu
  • Hrs
  • LOC100911361
  • LOC120096281
  • LOC120098305
  • Mettl3
  • Ncbp1
  • Ncbp2
  • Nudt21
  • Pabpn1
  • Papola
  • Pcbp1
  • Pcbp2
  • Pcf11
  • Polr2a
  • Polr2b
  • Polr2c
  • Polr2d
  • Polr2e
  • Polr2f
  • Polr2g
  • Polr2i
  • Polr2j
  • Ptb
  • Ptbp1
  • Pybp
  • Rap30
  • Rbm10
  • Rbmx
  • Rbmxrt
  • Sfrs10
  • Sfrs2
  • Sfrs5
  • Sfrs9
  • Srsf1
  • Srsf10
  • Srsf11
  • Srsf12
  • Srsf2
  • Srsf3
  • Srsf5
  • Srsf7
  • Srsf8
  • Srsf9
  • Sympk
  • Tbfii
  • Tra2b
  • Wtap
  • Yb1
  • Ybx1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Processing of DNA double-strand break ends
  • ABRAXAS1
  • Abra1
  • Atm
  • Atr
  • Atrip
  • Babam1
  • Babam2
  • Bard1
  • Blm
  • Brca1
  • Brcc3
  • Brcc36
  • Bre
  • Brip1
  • Ccdc98
  • Ccna1
  • Ccna2
  • Cdk2
  • Cdkn2
  • Chek1
  • Chk1
  • Clspn
  • Ctip
  • Dna2
  • ENSRNOG00000064540
  • ENSRNOG00000066901
  • ENSRNOG00000068034
  • Exo1
  • Fam175a
  • H2afx
  • H2ax
  • H2bc1
  • H2bc12l1
  • H2bc6
  • H2bcl1
  • H2bcl2
  • H2bu1
  • H4c16
  • H4c2
  • H4f16
  • H4ft
  • Herc2
  • Hist1h2ba
  • Hist1h2bc
  • Hist1h2bg
  • Hist1h2bo
  • Hist1h2bq
  • Hist1h4b
  • Hist1h4m
  • Hist4
  • Hist4h4
  • Htatip
  • Hus1
  • Kat5
  • LOC100365043
  • LOC100910200
  • LOC120094818
  • LOC684797
  • Mdc1
  • Merit40
  • Mms2
  • Mre11
  • Mre11a
  • Nba1
  • Nbn
  • Nbs1
  • Nsd2
  • Pias4
  • Ppp4c
  • Ppp4r2
  • RGD1564788
  • Rad1
  • Rad17
  • Rad50
  • Rad9a
  • Rad9b
  • Rap80
  • Rbbp8
  • Rfc2
  • Rfc3
  • Rfc4
  • Rfc5
  • Rhno1
  • Rmi1
  • Rmi2
  • Rnf168
  • Rnf8
  • Rpa1
  • Rpa2
  • Rpa3
  • Smt3a
  • Smt3h2
  • Sumo2
  • Th2b
  • Timeless
  • Tip60
  • Tip60b
  • Tipin
  • Tipinl1
  • Top3a
  • Topbp1
  • Tp53bp1
  • Ubce9
  • Ube2i
  • Ube2v2
  • Uev2
  • Uimc1
  • Whsc1
  • Wrn
Rattus norvegicus (Norway rat)
Processing of SMDT1
  • Afg3l2
  • Bcap37
  • Cbara1
  • Efha1
  • Maip1
  • Mcu
  • Mcub
  • Micu1
  • Micu2
  • Micu3
  • Mppa
  • Mppb
  • Parl
  • Phb
  • Phb1
  • Phb2
  • Pmpca
  • Pmpcb
  • Psarl
  • Smdt1
  • Smhs2
  • Spg7
  • Stoml2
  • Yme1l1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • Man1a1
  • Man1a2
  • Man1c1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Prolactin receptor signaling
  • Btrc
  • Cul1
  • Gh
  • Gh1
  • Ghr
  • Jak2
  • Prl
  • Prlr
  • Rbx1
  • Sh2-b
  • Sh2b1
  • Sh2bpsm1
  • Skp1
  • Skp1a
Rattus norvegicus (Norway rat)
Propionyl-CoA catabolism
  • LOC100361295
  • Mcee
  • Mmaa
  • Mmut
  • Mut
  • Pcca
  • Pccb
Rattus norvegicus (Norway rat)
Prostacyclin signalling through prostacyclin receptor
  • Ptgir
Rattus norvegicus (Norway rat)
Prostanoid ligand receptors
  • Crth2
  • Gpr44
  • Ptgdr
  • Ptgdr2
  • Ptgdrl
  • Ptger1
  • Ptger2
  • Ptger3
  • Ptger4
  • Ptgfr
  • Ptgir
  • Tbxa2r
Rattus norvegicus (Norway rat)

About Release Notes Help Feedback

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GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024