GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1126 - 1150 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Protein methylation
  • BTCD
  • C10orf138
  • C12orf72
  • C14orf138
  • C16orf68
  • C2orf34
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAMKMT
  • CLNMT
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EEF1AKMT1
  • EEF1AKMT2
  • EEF2
  • EEF2KMT
  • EF1A
  • EF2
  • ETFB
  • ETFBKMT
  • FAM119A
  • FAM86A
  • HCA557B
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HRMT1L3
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • KIN
  • KIN17
  • LENG7
  • METTL10
  • METTL20
  • METTL21A
  • METTL21D
  • METTL22
  • N6AMT2
  • PRMT3
  • RPS2
  • RPS4
  • VCP
  • VCPKMT
Homo sapiens (human)
Uptake and function of anthrax toxins
  • AIP1
  • ALIX
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • FUR
  • FURIN
  • JNKK1
  • JNKK2
  • KIAA1375
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP2K4
  • MAP2K7
  • MEK1
  • MEK2
  • MEK4
  • MEK7
  • MKK2
  • MKK4
  • MKK7
  • PACE
  • PCSK3
  • PDCD6IP
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • PRKMK4
  • PRKMK7
  • SEK1
  • SERK1
  • SKK1
  • SKK4
  • cya
  • lef
  • pag
  • pagA
Homo sapiens (human)
RHO GTPases activate PAKs
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CDC42
  • CTTN
  • EMS1
  • FLN
  • FLN1
  • FLNA
  • KIAA0866
  • KIAA2034
  • LIMK
  • LIMK1
  • MBS
  • MLC2
  • MLCK
  • MLCK1
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYLK
  • MYLK1
  • MYPT1
  • MYPT2
  • MYRL2
  • NF2
  • OPHN3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • PPP1R12B
  • RAC1
  • SCH
  • TC25
Homo sapiens (human)
Activation of Ca-permeable Kainate Receptor
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • GLUR5
  • GLUR6
  • GLUR7
  • GRIK
  • GRIK1
  • GRIK2
  • GRIK3
  • GRIK4
  • GRIK5
  • KIAA1232
  • NCALD
  • PSD95
Homo sapiens (human)
Cam-PDE 1 activation
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • PDE1A
  • PDE1B
  • PDE1C
  • PDES1B
Homo sapiens (human)
Glycogen breakdown (glycogenolysis)
  • AGL
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • GAA
  • GDE
  • GYG
  • GYG1
  • GYG2
  • PGM1
  • PHKA
  • PHKA1
  • PHKA2
  • PHKB
  • PHKG
  • PHKG1
  • PHKG2
  • PHKLA
  • PYGB
  • PYGL
  • PYGM
  • PYK
Homo sapiens (human)
Sodium/Calcium exchangers
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CNC
  • JSX
  • KIAA0702
  • KIAA1087
  • NCKX1
  • NCKX2
  • NCKX3
  • NCKX4
  • NCKX5
  • NCKX6
  • NCLX
  • NCX1
  • NCX2
  • NCX3
  • SLC24A1
  • SLC24A2
  • SLC24A3
  • SLC24A4
  • SLC24A5
  • SLC24A6
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SLC8B1
  • SRI
Homo sapiens (human)
Reduction of cytosolic Ca++ levels
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CNC
  • KIAA1087
  • MXRA1
  • NCX1
  • NCX2
  • NCX3
  • PMCA1
  • PMCA2
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SRI
Homo sapiens (human)
CaM pathway
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
Homo sapiens (human)
Calnexin/calreticulin cycle
  • CALR
  • CANX
  • CRTC
  • ERP57
  • ERP60
  • G19P1
  • G2AN
  • GANAB
  • GRP58
  • KIAA0088
  • PDIA3
  • PRKCSH
Homo sapiens (human)
Assembly of Viral Components at the Budding Site
  • CALR
  • CANX
  • CRTC
  • HA
  • M
  • NA
  • NP
Homo sapiens (human)
Interleukin-27 signaling
  • APRF
  • CANX
  • CRL1
  • CRLF1
  • EBI3
  • IL27
  • IL27A
  • IL27B
  • IL27RA
  • IL30
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • STAT1
  • STAT3
  • TCCR
  • TYK2
  • WSX1
Homo sapiens (human)
Interleukin-35 Signalling
  • APRF
  • CANX
  • CRL1
  • EBI3
  • IL12A
  • IL12RB2
  • IL27B
  • IL27RA
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • NKSF1
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • TCCR
  • TYK2
  • WSX1
Homo sapiens (human)
Formation of the cornified envelope
  • C1orf196
  • C1orf44
  • CANPL1
  • CAPN1
  • CAPN4
  • CAPNS
  • CAPNS1
  • CASP14
  • CDHF1
  • CDHF13
  • CDHF2
  • CDHF3
  • CDHF4
  • CDHF5
  • CDHF6
  • CDSN
  • CELA2A
  • CSTA
  • CTNNG
  • DP3
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSC4
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • ELA2A
  • EVPL
  • FLG
  • FUR
  • FURIN
  • IVL
  • JUP
  • KAZ
  • KAZN
  • KCP1
  • KIAA0568
  • KIAA1026
  • KLK12
  • KLK13
  • KLK14
  • KLK5
  • KLK8
  • KLKL4
  • KLKL5
  • KLKL6
  • KRTCAP1
  • KTG
  • LCE1A
  • LCE1B
  • LCE1C
  • LCE1D
  • LCE1E
  • LCE1F
  • LCE2A
  • LCE2B
  • LCE2C
  • LCE2D
  • LCE3A
  • LCE3B
  • LCE3C
  • LCE3D
  • LCE3E
  • LCE4A
  • LCE5A
  • LCE6A
  • LEKTI2
  • LELP1
  • LEP1
  • LEP10
  • LEP11
  • LEP12
  • LEP13
  • LEP14
  • LEP15
  • LEP16
  • LEP17
  • LEP18
  • LEP2
  • LEP3
  • LEP4
  • LEP5
  • LEP6
  • LEP8
  • LEP9
  • LIPJ
  • LIPK
  • LIPL1
  • LIPL2
  • LIPL3
  • LIPL4
  • LIPM
  • LIPN
  • LOR
  • LORICRIN
  • LRN
  • NRPN
  • PACE
  • PACE4
  • PCSK3
  • PCSK6
  • PERP
  • PI3
  • PIGPC1
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
  • PPL
  • PRSS14
  • PRSS19
  • PRSS8
  • RPTN
  • SCTE
  • SNC19
  • SPINK5
  • SPINK6
  • SPINK9
  • SPRC
  • SPRL1A
  • SPRL1B
  • SPRL2A
  • SPRL3A
  • SPRL4A
  • SPRL5A
  • SPRL6A
  • SPRL6B
  • SPRR1A
  • SPRR1B
  • SPRR2A
  • SPRR2B
  • SPRR2D
  • SPRR2E
  • SPRR2F
  • SPRR2G
  • SPRR3
  • ST14
  • STF1
  • STFA
  • TADG14
  • TADG15
  • TCHH
  • TGM1
  • TGM5
  • TGMX
  • THH
  • THL
  • THW
  • TRHY
  • WAP3
  • WFDC14
  • XP5
Homo sapiens (human)
ATF6 (ATF6-alpha) activates chaperone genes
  • ATF4
  • ATF6
  • CALR
  • CHOP
  • CHOP10
  • CREB2
  • CRTC
  • DDIT3
  • GADD153
  • GRP78
  • GRP94
  • HAP3
  • HSP90B1
  • HSPA5
  • HSPC4
  • NFYA
  • NFYB
  • NFYC
  • TRA1
  • TXREB
Homo sapiens (human)
Regulation of NPAS4 gene transcription
  • CSEN
  • DREAM
  • GRL
  • KCHIP3
  • KCNIP3
  • NR3C1
  • NRSF
  • REST
  • SRF
  • XBR
Homo sapiens (human)
Phase 1 - inactivation of fast Na+ channels
  • CALP
  • CSEN
  • DREAM
  • KCHIP1
  • KCHIP2
  • KCHIP3
  • KCHIP4
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNIP1
  • KCNIP2
  • KCNIP3
  • KCNIP4
  • KIAA1044
  • VABP
Homo sapiens (human)
Reversible hydration of carbon dioxide
  • CA1
  • CA12
  • CA13
  • CA14
  • CA2
  • CA3
  • CA4
  • CA5
  • CA5A
  • CA5B
  • CA6
  • CA7
  • CA9
  • G250
  • MN
Homo sapiens (human)
Insulin processing
  • CLTRN
  • CPE
  • ERBA2L
  • ERO1B
  • ERO1LB
  • EXO70
  • EXOC1
  • EXOC2
  • EXOC3
  • EXOC4
  • EXOC5
  • EXOC6
  • EXOC7
  • EXOC8
  • INS
  • KIAA0531
  • KIAA1067
  • KIAA1699
  • KIF5A
  • KIF5B
  • KIF5C
  • KNS
  • KNS1
  • MYH12
  • MYO5A
  • MYRIP
  • NEC1
  • NEC2
  • NKHC1
  • NKHC2
  • P4HB
  • PCSK1
  • PCSK2
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
  • RAB27
  • RAB27A
  • SEC10
  • SEC10L1
  • SEC15A
  • SEC15L
  • SEC15L1
  • SEC3
  • SEC3L1
  • SEC5
  • SEC5L1
  • SEC6
  • SEC6L1
  • SEC8
  • SEC8L1
  • SLAC2C
  • SLC30A5
  • SLC30A8
  • STX1
  • STX1A
  • SYB2
  • TMEM27
  • VAMP2
  • ZNT5
  • ZNT8
  • ZNTL1
  • ZTL1
Homo sapiens (human)
Fibronectin matrix formation
  • BGP
  • BGP1
  • CEACAM1
  • CEACAM6
  • CEACAM8
  • CGM6
  • FN
  • FN1
  • FNRA
  • FNRB
  • ITGA5
  • ITGB1
  • MDF2
  • MSK12
  • NCA
Homo sapiens (human)
Regulation of MITF-M dependent genes involved in invasion
  • BGP
  • BGP1
  • CEACAM1
  • DIAP1
  • DIAPH1
  • GMPR
  • GMPR1
Homo sapiens (human)
IL-6-type cytokine receptor ligand interactions
  • BSF3
  • CLC
  • CLCF1
  • CNTF
  • CNTFR
  • CRL3
  • CRLF1
  • CTF1
  • GPL
  • HILDA
  • IL11
  • IL11RA
  • IL31
  • IL31RA
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • LIF
  • LIFR
  • NNT1
  • OSM
  • OSMR
  • OSMRB
  • TYK2
Homo sapiens (human)
Signaling by Retinoic Acid
  • CPT1
  • CPT1A
  • CPT1B
  • CRABP2
  • DLAT
  • DLD
  • DLTA
  • FABP5
  • GCSL
  • HAP
  • KIAA1670
  • LAD
  • NR1B1
  • NR1B2
  • NR1B3
  • NR1C2
  • NR2B1
  • NR2B2
  • NR2B3
  • PDHA1
  • PDHA2
  • PDHAL
  • PDHB
  • PDHK1
  • PDHK2
  • PDHK3
  • PDHK4
  • PDHX
  • PDK1
  • PDK2
  • PDK3
  • PDK4
  • PDX1
  • PHE1A
  • PHE1B
  • PHE3
  • PPARB
  • PPARD
  • RARA
  • RARB
  • RARG
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
Homo sapiens (human)
Histidine catabolism
  • AMDHD1
  • ATPGD1
  • C9orf41
  • CARNMT1
  • CARNS1
  • FTCD
  • HAL
  • HDC
  • HIS
  • HNMT
  • KIAA1394
  • UROC1
Homo sapiens (human)
Signaling by Type 1 Insulin-like Growth Factor 1 Receptor (IGF1R)
  • CILP
  • IBP1
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024