GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1326 - 1350 of 2090 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Presynaptic phase of homologous DNA pairing and strand exchange
  • AGS1
  • ATM
  • ATR
  • ATRIP
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C12orf32
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CHEK1
  • CHK1
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FRP1
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • HUS1
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA0259
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • R24L
  • RAD1
  • RAD17
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RAD9A
  • RAD9B
  • RBBP8
  • REC1
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RHINO
  • RHNO1
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • TOPBP1
  • WRN
  • XRCC2
Homo sapiens (human)
Prevention of phagosomal-lysosomal fusion
  • CORO1
  • CORO1A
  • HGS
  • HRS
  • RAB5
  • RAB5A
  • RAB7
  • RAB7A
  • RPS27A
  • Rv1410c
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS33B
  • cfp7
  • esxG
  • esxH
  • lpd
  • lpdC
  • lpp-27
  • lprG
  • mptpA
  • ndk
  • ndkA
  • ptpA
  • sapM
  • secA2
Homo sapiens (human)
Primitive streak formation
  • BMP2B
  • BMP4
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DPC4
  • DVR4
  • EOMES
  • FAST1
  • FAST2
  • FOXH1
  • GSC
  • KIAA1113
  • LEF1
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MIXL
  • MIXL1
  • NANOG
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • POU5F1
  • RFG7
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SOX2
  • T
  • TBP2
  • TBPL2
  • TBR2
  • TBXT
  • TCF1
  • TCF7
  • TIF1G
  • TRF3
  • TRIM33
Homo sapiens (human)
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA
  • ASF
  • AUF1
  • C1orf199
  • CBP20
  • CBP80
  • CFIM25
  • CLP1
  • CPSF1
  • CPSF100
  • CPSF160
  • CPSF2
  • CPSF25
  • CPSF3
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CPSF5
  • CPSF7
  • CPSF73
  • CSTF1
  • CSTF2
  • CSTF2T
  • CSTF3
  • DXS8237E
  • FIP1
  • FIP1L1
  • FTP3
  • FUS
  • FUSIP1
  • FUSIP2
  • GPATC9
  • GPATCH9
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • HEAB
  • HNRNPA1
  • HNRNPA2B1
  • HNRNPA3
  • HNRNPC
  • HNRNPD
  • HNRNPF
  • HNRNPH1
  • HNRNPH2
  • HNRNPK
  • HNRNPL
  • HNRNPM
  • HNRNPR
  • HNRNPU
  • HNRPA1
  • HNRPA2B1
  • HNRPA3
  • HNRPC
  • HNRPD
  • HNRPF
  • HNRPG
  • HNRPH
  • HNRPH1
  • HNRPH2
  • HNRPK
  • HNRPL
  • HNRPM
  • HNRPR
  • HNRPU
  • HRS
  • KIAA0105
  • KIAA0122
  • KIAA0689
  • KIAA0824
  • KIAA1367
  • KIAA1627
  • METTL14
  • METTL3
  • MTA70
  • NAGR1
  • NAR
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEB1
  • NSEP1
  • NUDT21
  • PAB2
  • PABP2
  • PABPN1
  • PAP
  • PAPOLA
  • PCBP1
  • PCBP2
  • PCF11
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PTB
  • PTBP1
  • RAP30
  • RAP74
  • RBM10
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RHE
  • RPB7
  • SAFA
  • SF2
  • SF2P33
  • SFRS1
  • SFRS10
  • SFRS11
  • SFRS13A
  • SFRS13B
  • SFRS19
  • SFRS2
  • SFRS2B
  • SFRS3
  • SFRS4
  • SFRS5
  • SFRS6
  • SFRS7
  • SFRS9
  • SPK
  • SRP20
  • SRP30C
  • SRP40
  • SRP46
  • SRP55
  • SRP75
  • SRRP35
  • SRSF1
  • SRSF10
  • SRSF11
  • SRSF12
  • SRSF2
  • SRSF3
  • SRSF4
  • SRSF5
  • SRSF6
  • SRSF7
  • SRSF8
  • SRSF9
  • SYMPK
  • TASR
  • TLS
  • TRA2B
  • U21.1
  • WDC146
  • WDR33
  • WTAP
  • YB1
  • YBX1
Homo sapiens (human)
Processing of DNA double-strand break ends
  • ABRA1
  • ABRAXAS1
  • AGS1
  • ATM
  • ATR
  • ATRIP
  • BABAM1
  • BABAM2
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BLU
  • BRCA1
  • BRCC3
  • BRCC36
  • BRCC45
  • BRE
  • BRIP1
  • C12orf32
  • C16orf75
  • C19orf62
  • C6.1A
  • C9orf76
  • CCDC98
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CDK2
  • CDKN2
  • CHEK1
  • CHK1
  • CLSPN
  • CTIP
  • CXorf53
  • DNA2
  • DNA2L
  • EXO1
  • EXOI
  • FAM175A
  • FANCJ
  • FRP1
  • H2AFX
  • H2AX
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-4
  • H3FT
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HERC2
  • HEX1
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2BE
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST3H3
  • HIST4H4
  • HNGS1
  • HTATIP
  • HUS1
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA0170
  • KIAA0259
  • KIAA0646
  • KIAA1090
  • MDC1
  • MERIT40
  • MMS2
  • MMSET
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBA1
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • NFBD1
  • NSD2
  • P95
  • PIAS4
  • PIASG
  • PPP4
  • PPP4C
  • PPP4R2
  • PPX
  • R24L
  • RAD1
  • RAD17
  • RAD50
  • RAD9A
  • RAD9B
  • RAP80
  • RBBP8
  • REC1
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RHINO
  • RHNO1
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF168
  • RNF4
  • RNF53
  • RNF8
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • RXRIP110
  • SIR2L6
  • SIRT6
  • SMT3B
  • SMT3H2
  • SNURF
  • SUMO2
  • TIM
  • TIM1
  • TIMELESS
  • TIMELESS1
  • TIP60
  • TIPIN
  • TOP3
  • TOP3A
  • TOPBP1
  • TP53BP1
  • TRX5
  • TSH2B
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2I
  • UBE2N
  • UBE2V2
  • UEV2
  • UIMC1
  • WHSC1
  • WRN
Homo sapiens (human)
Processing of Intronless Pre-mRNAs
  • CBP20
  • CBP80
  • CFIM25
  • CLP1
  • CPSF1
  • CPSF100
  • CPSF160
  • CPSF2
  • CPSF25
  • CPSF3
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CPSF5
  • CPSF7
  • CPSF73
  • CSTF1
  • CSTF2
  • CSTF2T
  • CSTF3
  • FIP1
  • FIP1L1
  • HEAB
  • KIAA0689
  • KIAA0824
  • KIAA1367
  • NAR
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEB1
  • NUDT21
  • PAB2
  • PABP2
  • PABPN1
  • PAP
  • PAPOLA
  • PCF11
  • RHE
  • SPK
  • SYMPK
  • WDC146
  • WDR33
Homo sapiens (human)
Processing of SMDT1
  • AFG3L2
  • BAP
  • C10orf42
  • C22orf32
  • C2orf47
  • CALC
  • CAR
  • CBARA1
  • CCDC109A
  • CCDC109B
  • CMAR
  • EFHA1
  • EFHA2
  • EMRE
  • FTSH1
  • INPP5E
  • KIAA0123
  • MAIP1
  • MCU
  • MCUB
  • MICU1
  • MICU2
  • MICU3
  • MPPA
  • MPPB
  • PARL
  • PGN
  • PHB
  • PHB1
  • PHB2
  • PMPCA
  • PMPCB
  • PSARL
  • REA
  • SLP2
  • SMDT1
  • SPG7
  • STOML2
  • YME1L
  • YME1L1
Homo sapiens (human)
Processive synthesis on the C-strand of the telomere
  • ACD
  • BLM
  • DRIP5
  • KIAA0039
  • LIG1
  • PCNA
  • PIN2
  • PIP1
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POT1
  • PTOP
  • RAP1
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
  • WRN
Homo sapiens (human)
Processive synthesis on the lagging strand
  • KIAA0039
  • LIG1
  • PCNA
  • POLA
  • POLA1
  • POLA2
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • PRIM1
  • PRIM2
  • PRIM2A
Homo sapiens (human)
Progressive trimming of alpha-1,2-linked mannose residues from Man9/8/7GlcNAc2 to produce Man5GlcNAc2
  • MAN1A1
  • MAN1A2
  • MAN1A3
  • MAN1B
  • MAN1C
  • MAN1C1
Homo sapiens (human)
Prolactin receptor signaling
  • BTRC
  • BTRCP
  • CSH1
  • CUL1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GH1
  • GH2
  • GHR
  • JAK2
  • OCP2
  • PRL
  • PRLR
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • SHPTP2
  • SKP1
  • SKP1A
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TCEB1L
Homo sapiens (human)
Proline catabolism
  • ALDH4
  • ALDH4A1
  • HSPOX1
  • HYPDH
  • P5CDH
  • PIG6
  • POX2
  • PRODH
  • PRODH2
Homo sapiens (human)
Propionyl-CoA catabolism
  • MCEE
  • MMAA
  • MMUT
  • MUT
  • PCCA
  • PCCB
Homo sapiens (human)
Prostacyclin signalling through prostacyclin receptor
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GSP
  • PRIPR
  • PTGIR
Homo sapiens (human)
Prostanoid ligand receptors
  • CRTH2
  • DL1R
  • GPR44
  • PRIPR
  • PTGDR
  • PTGDR2
  • PTGER1
  • PTGER2
  • PTGER3
  • PTGER4
  • PTGFR
  • PTGIR
  • TBXA2R
Homo sapiens (human)
Protein hydroxylation
  • ASPH
  • BAH
  • C14orf169
  • DFRP1
  • DFRP2
  • DRG1
  • DRG2
  • ERF1
  • ETF1
  • F9
  • JMJD4
  • JMJD5
  • JMJD6
  • JMJD7
  • KDM8
  • KIAA0585
  • KIAA1612
  • LEREPO4
  • MAPJD
  • MDIG
  • MINA
  • MINA53
  • NEDD3
  • NO52
  • NO66
  • OGFOD1
  • PSR
  • PTDSR
  • RCCD1
  • RF1
  • RIOX1
  • RIOX2
  • RPL27A
  • RPL8
  • RPS23
  • RPS6
  • RWDD1
  • SUP45L1
  • TPA1
  • U2AF2
  • U2AF65
  • ZC3H15
Homo sapiens (human)
Protein lipoylation
  • ADX
  • BCATE2
  • BCKDHE2
  • DBT
  • DLAT
  • DLST
  • DLTA
  • DLTS
  • FDX1
  • GCSH
  • HIRIP5
  • LAS
  • LIAS
  • LIPT1
  • LIPT2
  • NDUFAB1
  • NFU1
Homo sapiens (human)
Protein methylation
  • BTCD
  • C10orf138
  • C12orf72
  • C14orf138
  • C16orf68
  • C2orf34
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAMKMT
  • CLNMT
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EEF1AKMT1
  • EEF1AKMT2
  • EEF2
  • EEF2KMT
  • EF1A
  • EF2
  • ETFB
  • ETFBKMT
  • FAM119A
  • FAM86A
  • HCA557B
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HRMT1L3
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • KIN
  • KIN17
  • LENG7
  • METTL10
  • METTL20
  • METTL21A
  • METTL21D
  • METTL22
  • N6AMT2
  • PRMT3
  • RPS2
  • RPS4
  • VCP
  • VCPKMT
Homo sapiens (human)
Protein repair
  • CBS-1
  • MSRA
  • MSRB
  • MSRB1
  • MSRB2
  • MSRB3
  • PCMT1
  • SEPX1
  • TRDX
  • TRX
  • TRX1
  • TXN
Homo sapiens (human)
Proton-coupled monocarboxylate transport
  • BSG
  • EMB
  • MCT1
  • MCT2
  • MCT3
  • MCT4
  • SLC16A1
  • SLC16A3
  • SLC16A7
  • SLC16A8
Homo sapiens (human)
Proton-coupled neutral amino acid transporters
  • PAT1
  • PAT2
  • SLC36A1
  • SLC36A2
  • TRAMD1
Homo sapiens (human)
Proton/oligopeptide cotransporters
  • OCTP
  • PEPT1
  • PEPT2
  • PHT1
  • PHT2
  • PTR3
  • PTR4
  • SLC15A1
  • SLC15A2
  • SLC15A3
  • SLC15A4
Homo sapiens (human)
Purine catabolism
  • AIRP
  • C20orf37
  • C6orf108
  • DNPH1
  • DNT1
  • GDA
  • ITPA
  • KIAA1258
  • NP
  • NT5
  • NT5B
  • NT5C
  • NT5C1A
  • NT5C1B
  • NT5C2
  • NT5CP
  • NT5E
  • NTE
  • PNP
  • PNT5
  • RCL
  • UMPH2
  • XDH
  • XDHA
Homo sapiens (human)
Purine ribonucleoside monophosphate biosynthesis
  • ADE2
  • ADSL
  • ADSS
  • ADSS1
  • ADSS2
  • ADSSL1
  • AIRC
  • AMPS
  • ATIC
  • GART
  • GMPS
  • GPAT
  • IMPD1
  • IMPD2
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • KIAA0361
  • PAICS
  • PAIS
  • PFAS
  • PGFT
  • PPAT
  • PRGS
  • PURH
Homo sapiens (human)
Purine salvage
  • ADA
  • ADA1
  • ADAL
  • ADAL1
  • ADK
  • AMPD1
  • AMPD2
  • AMPD3
  • APRT
  • DCK
  • DGK
  • DGUOK
  • GMPR
  • GMPR1
  • GMPR2
  • HPRT
  • HPRT1
  • NP
  • PNP
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

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GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024