GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1376 - 1400 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Synthesis of PIPs at the late endosome membrane
  • C8orf9
  • CG2
  • FIG4
  • KIAA0274
  • KIAA0647
  • KIAA0981
  • KIAA1073
  • MTM1
  • MTMR2
  • MTMR4
  • MTMR7
  • MTMR8
  • MTMR9
  • PIK3C2A
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PIKFYVE
  • PIP5K3
  • SAC3
  • TAX1BP2
  • TRX
  • VAC14
  • VPS15
  • VPS34
  • ZFYVE11
Homo sapiens (human)
Lysosphingolipid and LPA receptors
  • C9orf108
  • C9orf47
  • CHEDG1
  • EDG1
  • EDG2
  • EDG3
  • EDG4
  • EDG5
  • EDG6
  • EDG7
  • EDG8
  • GPR92
  • GPR93
  • KIAA0455
  • LPA1
  • LPA2
  • LPA3
  • LPAR1
  • LPAR2
  • LPAR3
  • LPAR5
  • LPPR1
  • LPPR2
  • LPPR3
  • LPPR4
  • LPPR5
  • PAP2D
  • PHP1
  • PHP2
  • PLPPR1
  • PLPPR2
  • PLPPR3
  • PLPPR4
  • PLPPR5
  • PRG1
  • PRG2
  • PRG3
  • PRG4
  • PRG5
  • S1PR1
  • S1PR2
  • S1PR3
  • S1PR4
  • S1PR5
Homo sapiens (human)
Glycerophospholipid catabolism
  • C9orf111
  • ENPP6
  • GDE1
  • GDE2
  • GDE4
  • GDE7
  • GDPD1
  • GDPD3
  • GDPD5
  • MIR16
  • NTE
  • PNPLA6
  • PNPLA7
Homo sapiens (human)
Synthesis of IPs in the nucleus
  • C9orf12
  • IHPK1
  • IHPK2
  • IMPK
  • IP6K1
  • IP6K2
  • IPMK
  • IPPK
  • KIAA0263
Homo sapiens (human)
Other semaphorin interactions
  • C9orf164
  • CD100
  • CD108
  • CD45
  • CD72
  • DAP12
  • FNRB
  • ITGA1
  • ITGB1
  • KARAP
  • KIAA0331
  • KIAA0463
  • KIAA0620
  • KIAA1206
  • KIAA1368
  • KIAA1479
  • KIAA1550
  • MDF2
  • MSK12
  • NOV
  • OCT
  • PLXN1
  • PLXN2
  • PLXN6
  • PLXNA1
  • PLXNA2
  • PLXNA4
  • PLXNA4A
  • PLXNA4B
  • PLXNB3
  • PLXNC1
  • PLXND1
  • PTPRC
  • SEMA3E
  • SEMA4A
  • SEMA4D
  • SEMA5A
  • SEMA6A
  • SEMA6D
  • SEMA7A
  • SEMAB
  • SEMAF
  • SEMAH
  • SEMAJ
  • SEMAL
  • SEMAQ
  • SEMB
  • TREM2
  • TYROBP
  • VESPR
Homo sapiens (human)
Interleukin-33 signaling
  • C9orf26
  • DER4
  • IL1F11
  • IL1RL1
  • IL33
  • NFHEV
  • ST2
  • T1
Homo sapiens (human)
Membrane binding and targetting of GAG proteins
  • C9orf28
  • CFBP
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HCRP1
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NMT2
  • PML39
  • RPS27A
  • TSG101
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS28
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • WBSCR24
  • gag
Homo sapiens (human)
Reversible hydration of carbon dioxide
  • CA1
  • CA12
  • CA13
  • CA14
  • CA2
  • CA3
  • CA4
  • CA5
  • CA5A
  • CA5B
  • CA6
  • CA7
  • CA9
  • G250
  • MN
Homo sapiens (human)
Phase 0 - rapid depolarisation
  • CACH2
  • CACN2
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • CACNL1A1
  • CACNLB1
  • CACNLB2
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CCHL1A1
  • FGF11
  • FGF12
  • FGF12B
  • FGF13
  • FGF14
  • FHF1
  • FHF2
  • FHF3
  • FHF4
  • HBA
  • KIAA0558
  • KIAA0968
  • KIAA1158
  • KIAA1356
  • MED
  • MOG1
  • MYSB
  • NAC1
  • NAC2
  • NAC3
  • NENA
  • RANGNRF
  • RANGRF
  • SCN1
  • SCN10A
  • SCN11A
  • SCN12A
  • SCN1A
  • SCN1B
  • SCN2A
  • SCN2A1
  • SCN2A2
  • SCN2B
  • SCN3A
  • SCN3B
  • SCN4A
  • SCN4B
  • SCN5A
  • SCN6A
  • SCN7A
  • SCN8A
  • SCN9A
  • SNS2
Homo sapiens (human)
Presynaptic depolarization and calcium channel opening
  • CACH4
  • CACH5
  • CACH6
  • CACN3
  • CACNA1A
  • CACNA1B
  • CACNA1E
  • CACNA2D1
  • CACNA2D2
  • CACNA2D3
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNB3
  • CACNB4
  • CACNG2
  • CACNG4
  • CACNL1A4
  • CACNL1A5
  • CACNL1A6
  • CACNLB1
  • CACNLB2
  • CACNLB3
  • CACNLB4
  • KIAA0558
  • MYSB
Homo sapiens (human)
Apoptosis induced DNA fragmentation
  • CAD
  • CASP3
  • CPP32
  • DFF1
  • DFF2
  • DFF40
  • DFF45
  • DFFA
  • DFFB
  • H1-0
  • H1-1
  • H1-2
  • H1-3
  • H1-4
  • H1-5
  • H1F0
  • H1F1
  • H1F2
  • H1F3
  • H1F4
  • H1F5
  • H1FV
  • HIST1H1A
  • HIST1H1B
  • HIST1H1C
  • HIST1H1D
  • HIST1H1E
  • HMG1
  • HMG2
  • HMGB1
  • HMGB2
  • KPNA1
  • KPNB1
  • NTF97
  • RCH2
Homo sapiens (human)
Pyrimidine biosynthesis
  • CAD
  • DHODH
  • UMPS
Homo sapiens (human)
Nectin/Necl trans heterodimerization
  • CADM1
  • CADM3
  • HVEB
  • HVEC
  • IGSF4
  • IGSF4A
  • IGSF4B
  • LNIR
  • NECL1
  • NECL2
  • NECTIN1
  • NECTIN2
  • NECTIN3
  • NECTIN4
  • PRR1
  • PRR2
  • PRR3
  • PRR4
  • PVR
  • PVRL1
  • PVRL2
  • PVRL3
  • PVRL4
  • PVS
  • SYNCAM
  • SYNCAM3
  • TSLC1
  • TSLL1
Homo sapiens (human)
RHO GTPases Activate NADPH Oxidases
  • CAGA
  • CAGB
  • CFAG
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CYBA
  • CYBB
  • ERK1
  • ERK2
  • MAPK1
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPK3
  • MOX1
  • MOX2
  • MRP14
  • MRP8
  • MXI2
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NOH1
  • NOX1
  • NOX2
  • NOX3
  • NOXA1
  • NOXA2
  • NOXO1
  • NOXO2
  • P41NOX
  • P51NOX
  • P67PHOX
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PIN1
  • PKC2
  • PKCA
  • PKCB
  • PKCD
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PRKCD
  • PRKCZ
  • PRKM1
  • PRKM11
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RAC1
  • RAC2
  • S100A8
  • S100A9
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SH3PXD1A
  • SH3PXD4
  • SH3PXD5
  • TC25
  • VPS15
  • VPS34
Homo sapiens (human)
Metal sequestration by antimicrobial proteins
  • CAGA
  • CAGB
  • CFAG
  • GIG12
  • HNL
  • LCN2
  • LF
  • LTF
  • MRP14
  • MRP8
  • NGAL
  • PSOR1
  • S100A15
  • S100A7
  • S100A7A
  • S100A7C
  • S100A7L1
  • S100A8
  • S100A9
Homo sapiens (human)
Cyclin A/B1/B2 associated events during G2/M transition
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CCNH
  • CDC2
  • CDC25A
  • CDC25B
  • CDC25C
  • CDC25HU2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDK2
  • CDK7
  • CDKN1
  • CDKN2
  • CDKN7
  • CRM1
  • FKHL16
  • FOXM1
  • HFH11
  • LCMT
  • LCMT1
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • MPP2
  • MYT1
  • P34CDC2
  • PKMYT1
  • PLK
  • PLK1
  • PME1
  • PPME1
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R2A
  • PPP2R3B
  • PPP2R3L
  • RNF66
  • STK1
  • WEE1
  • WIN
  • XPO1
Homo sapiens (human)
Sensory perception of salty taste
  • CALHM1
  • CALHM3
  • DNACH
  • FAM26A
  • FAM26C
  • SCNN1
  • SCNN1A
  • SCNN1B
  • SCNN1D
  • SCNN1G
Homo sapiens (human)
Sensory perception of sweet, bitter, and umami (glutamate) taste
  • CALHM1
  • CALHM3
  • FAM26A
  • FAM26C
  • GNAT3
  • GNB1
  • GNB3
  • GNG13
  • GPR60
  • GPR70
  • GPR71
  • GPRC1A
  • GPRC1D
  • GRM1
  • GRM4
  • HBA
  • ITPR3
  • KIAA1356
  • LTRPC4
  • LTRPC5
  • MGLUR1
  • MGLUR4
  • MTR1
  • NAC2
  • NAC3
  • NENA
  • PLCB2
  • PTC
  • SCN1B
  • SCN2A
  • SCN2A1
  • SCN2A2
  • SCN2B
  • SCN3A
  • SCN4B
  • SCN9A
  • T1R1
  • T1R2
  • T1R3
  • TAS1R1
  • TAS1R2
  • TAS1R3
  • TAS2R1
  • TAS2R10
  • TAS2R13
  • TAS2R14
  • TAS2R16
  • TAS2R20
  • TAS2R3
  • TAS2R30
  • TAS2R31
  • TAS2R38
  • TAS2R39
  • TAS2R4
  • TAS2R40
  • TAS2R41
  • TAS2R43
  • TAS2R44
  • TAS2R46
  • TAS2R47
  • TAS2R49
  • TAS2R5
  • TAS2R50
  • TAS2R7
  • TAS2R8
  • TR1
  • TR2
  • TR3
  • TRPM4
  • TRPM5
Homo sapiens (human)
DARPP-32 events
  • CALM
  • CALM1
  • CALNA
  • CALNA2
  • CALNA3
  • CALNB
  • CAM
  • CAM1
  • CDK5
  • CDKN5
  • CNA
  • CNA2
  • CNA3
  • CNB
  • DARPP32
  • DPDE1
  • DPDE2
  • DPDE3
  • PDE4A
  • PDE4C
  • PDE4D
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PPP1A
  • PPP1CA
  • PPP1R1B
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5D
  • PPP3CA
  • PPP3CB
  • PPP3CC
  • PPP3R1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • PSSALRE
  • TSE1
Homo sapiens (human)
Calcineurin activates NFAT
  • CALM
  • CALM1
  • CALNA
  • CALNA2
  • CALNB
  • CAM
  • CAM1
  • CNA
  • CNA2
  • CNB
  • CYPA
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • NFAT1
  • NFAT2
  • NFAT4
  • NFATC
  • NFATC1
  • NFATC2
  • NFATC3
  • NFATP
  • PPIA
  • PPP3CA
  • PPP3CB
  • PPP3R1
Homo sapiens (human)
CaMK IV-mediated phosphorylation of CREB
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-GR
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMK4
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CAMKIV
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • KIAA0787
  • KIAA0968
  • KPNA2
  • RCH1
  • SRP1
Homo sapiens (human)
CREB1 phosphorylation through the activation of CaMKII/CaMKK/CaMKIV cascasde
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-GR
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • CAMK4
  • CAMKB
  • CAMKG
  • CAMKIV
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • KIAA0787
  • KPNA2
  • RCH1
  • SRP1
Homo sapiens (human)
Loss of phosphorylation of MECP2 at T308
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAMK
  • CAMK-GR
  • CAMK4
  • CAMKIV
  • PKACA
  • PRKACA
Homo sapiens (human)
Activation of RAC1 downstream of NMDARs
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAMK1
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • GIT1
  • KIAA0787
  • RAC1
  • TC25
Homo sapiens (human)
RHO GTPases activate IQGAPs
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CDC42
  • CDH1
  • CDHE
  • CLIP1
  • CTNNA1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CYLN1
  • IQGAP1
  • IQGAP2
  • IQGAP3
  • KIAA0051
  • MEN1
  • RAC1
  • RSN
  • SCG2
  • TC25
  • UVO
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024