GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1426 - 1450 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
linifanib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
Defective SLC6A3 causes Parkinsonism-dystonia infantile (PKDYS)
  • DAT1
  • SLC6A3
Homo sapiens (human)
Hereditary fructose intolerance
  • ALDB
  • ALDOB
Homo sapiens (human)
CTNNB1 S33 mutants aren't phosphorylated
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
Activation of NF-kappaB in B cells
  • BCL10
  • BTRC
  • BTRCP
  • BTRCP2
  • C7orf76
  • CARD11
  • CARMA1
  • CHUK
  • CIPER
  • CLAP
  • CUL1
  • DSS1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBW1B
  • FBXW11
  • FBXW1A
  • FBXW1B
  • FIP3
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • IKBA
  • IKBB
  • IKBE
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA0696
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MAD3
  • MALT1
  • MAP3K7
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MLT
  • MOV34L
  • MSS1
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NFKBIE
  • NU
  • OCP2
  • PFAAP4
  • PKCB
  • POH1
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • REL
  • RELA
  • RING10
  • RING12
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • SUG2
  • TAK1
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TCF16
  • TRAP2
  • TRIP9
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
mRNA Capping
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP1A
  • CAP35
  • CBP20
  • CBP80
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • ERCC2
  • ERCC3
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA0398
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RNF66
  • RNGTT
  • RNMT
  • RPB7
  • SPT5
  • SPT5H
  • STK1
  • SUPT5H
  • TTDA
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ANPEP
  • APN
  • ATP6AP2
  • ATP6IP2
  • CAPER
  • CD13
  • CES1
  • CES2
  • CGL2
  • CMA1
  • CPA3
  • CPB
  • CPB1
  • CPB2
  • CPSD
  • CTSD
  • CTSG
  • CTSGL2
  • CTSZ
  • CYH
  • CYM
  • DCP
  • DCP1
  • ELDF10
  • ENPEP
  • EPN
  • GZMH
  • MME
  • PCPB
  • PEPN
  • REN
  • SERPINA8
  • SES1
Homo sapiens (human)
Defective SLC26A4 causes Pendred syndrome (PDS)
  • PDS
  • SLC26A4
Homo sapiens (human)
Interleukin-2 signaling
  • FAK2
  • IL15RB
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK3
  • LCK
  • PTK2B
  • PYK2
  • RAFTK
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • SYK
Homo sapiens (human)
Defective SLC6A18 may confer susceptibility to iminoglycinuria and/or hyperglycinuria
  • B0AT3
  • SLC6A18
  • XTRP2
Homo sapiens (human)
Translation of respiratory syncytial virus mRNAs
  • 1B
  • 1C
  • F
  • L
  • M
  • M2-1
  • M2-2
  • N
  • NS1
  • NS2
  • P
Homo sapiens (human)
Oleoyl-phe metabolism
  • PM20D1
Homo sapiens (human)
Response of EIF2AK4 (GCN2) to amino acid deficiency
  • ASNS
  • ATF2
  • ATF3
  • ATF4
  • BBC1
  • C20orf97
  • CCG2
  • CEBPB
  • CEBPG
  • CHOP
  • CHOP10
  • CREB2
  • CREBP1
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DDIT3
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF2A
  • EIF2AK4
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • FAU
  • FTE1
  • GADD153
  • GCN1
  • GCN1L1
  • GCN2
  • IMPACT
  • KIAA0219
  • KIAA1338
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • NIPK
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SKIP3
  • SURF-3
  • SURF3
  • TCF5
  • TRB3
  • TRIB3
  • TS11
  • TXREB
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Interleukin-37 signaling
  • APRF
  • BDP1
  • CASP1
  • FIL1Z
  • HCP
  • IL18BP
  • IL18R1
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IL1F7
  • IL1H4
  • IL1RP1
  • IL1RRP
  • IL37
  • KIAA1471
  • MADH3
  • NAK
  • PEZ
  • PNP1
  • PTP1C
  • PTP1E
  • PTP2C
  • PTPD2
  • PTPL1
  • PTPN11
  • PTPN12
  • PTPN13
  • PTPN14
  • PTPN18
  • PTPN2
  • PTPN20
  • PTPN20A
  • PTPN20B
  • PTPN23
  • PTPN4
  • PTPN5
  • PTPN6
  • PTPN7
  • PTPN9
  • PTPT
  • SHPTP2
  • SIGIRR
  • SMAD3
  • STAT3
  • TBK1
Homo sapiens (human)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR3
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • KS3
  • PLC1
  • PLCG1
Homo sapiens (human)
Defective GGT1 causes GLUTH
  • GGT
  • GGT1
Homo sapiens (human)
Carboxyterminal post-translational modifications of tubulin
  • AGBL1
  • AGBL2
  • AGBL3
  • AGBL4
  • AGBL5
  • AGTPBP1
  • C18orf10
  • C19orf20
  • C20orf125
  • C22orf7
  • C6orf104
  • C9orf20
  • CCDC23
  • CCP1
  • CCP2
  • CCP3
  • CCP4
  • CCP5
  • CCP6
  • CSTPP2
  • KIAA0153
  • KIAA0173
  • KIAA0998
  • KIAA1035
  • KIAA1036
  • LRRC49
  • NICN1
  • NNA1
  • STAMP
  • SVBP
  • TPGS1
  • TPGS2
  • TTL
  • TTL.6
  • TTLL1
  • TTLL10
  • TTLL11
  • TTLL12
  • TTLL13
  • TTLL13P
  • TTLL2
  • TTLL3
  • TTLL4
  • TTLL5
  • TTLL6
  • TTLL7
  • TTLL8
  • TTLL9
  • TUBA1A
  • TUBA1B
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA3E
  • TUBA6
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
  • TUBB8
  • TUBB8B
  • VASH
  • VASH1
  • VASH2
  • VASHL
Homo sapiens (human)
Lysosomal oligosaccharide catabolism
  • KIAA0935
  • LAMAN
  • MAN2B1
  • MAN2B2
  • MAN2C1
  • MANA
  • MANA1
  • MANB
  • MANB1
  • MANBA
Homo sapiens (human)
Oxidative demethylation of DNA
  • CXXC6
  • KIAA0401
  • KIAA1546
  • KIAA1676
  • LCX
  • TDG
  • TET1
  • TET2
  • TET3
Homo sapiens (human)
Defective CYP11A1 causes AICSR
  • ADX
  • ADXR
  • CYP11A
  • CYP11A1
  • FDX1
  • FDX1L
  • FDX2
  • FDXR
Homo sapiens (human)
Cam-PDE 1 activation
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • PDE1A
  • PDE1B
  • PDE1C
  • PDES1B
Homo sapiens (human)
Transcriptional Regulation by VENTX
  • AGO1
  • AGO3
  • AGO4
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • BAT8
  • BCL1
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C6orf30
  • C9orf17
  • CAGH26
  • CCND1
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • CEBPB
  • CENP-27
  • CSF1R
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • EHMT1
  • EHMT2
  • EIF2C1
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • EUHMTASE1
  • FMS
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • G9A
  • GLP
  • HPX42B
  • IFNB2
  • IL6
  • KIAA1093
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • KIAA1876
  • KMT1C
  • KMT1D
  • LEF1
  • MOV10
  • MTS1
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NG36
  • P53
  • PRAD1
  • RELA
  • SFT
  • TCF4
  • TCF5
  • TCF7L2
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • TP53
  • TSG24
  • UBC5A
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
  • VENTX
  • VENTX2
Homo sapiens (human)
Synthesis of PIPs at the late endosome membrane
  • C8orf9
  • CG2
  • FIG4
  • KIAA0274
  • KIAA0647
  • KIAA0981
  • KIAA1073
  • MTM1
  • MTMR2
  • MTMR4
  • MTMR7
  • MTMR8
  • MTMR9
  • PIK3C2A
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PIKFYVE
  • PIP5K3
  • SAC3
  • TAX1BP2
  • TRX
  • VAC14
  • VPS15
  • VPS34
  • ZFYVE11
Homo sapiens (human)
RND1 GTPase cycle
  • ALDH10
  • ALDH3A2
  • ANKRD26
  • APE
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARMS
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • C1orf8
  • C6orf143
  • CAV
  • CAV1
  • CCDC88A
  • CPD
  • DEPDC1B
  • DLG5
  • DMH
  • DRCC1
  • DSP
  • DST
  • DT
  • ECK
  • EPHA2
  • EPSTI1
  • ESA1
  • FALDH
  • FAM135A
  • FAM83B
  • FLOT2
  • FRS2
  • FRS3
  • GRB1
  • GRB7
  • GRDN
  • GRF1
  • GRLF1
  • HNRPG
  • KIAA0042
  • KIAA0583
  • KIAA0720
  • KIAA0728
  • KIAA1074
  • KIAA1212
  • KIAA1215
  • KIAA1250
  • KIAA1411
  • KIAA1722
  • KIDINS220
  • KIF14
  • LEMD3
  • M17S1
  • MAN1
  • MUC13
  • NGAP
  • NOV
  • P190A
  • PDLG
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PKP4
  • PLEKHG5
  • PLXN1
  • PLXNA1
  • PNP1
  • PTP1E
  • PTPL1
  • PTPN13
  • RASAL2
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RECC
  • RHO6
  • RHOGAP5
  • RND1
  • RRAS2
  • SCG10
  • SCGN10
  • SOC
  • STB1
  • STB2
  • STIP1
  • STMN2
  • TC21
  • TFRC
  • TMEM59
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • UBXD5
  • UBXN11
  • VANGL1
  • VANGL2
  • WDR6
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Receptor Mediated Mitophagy
  • APG12
  • APG12L
  • APG5L
  • ASP
  • ATG12
  • ATG5
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • FUNDC1
  • G5A
  • KIAA0722
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3A
  • MAP1LC3B
  • ULK1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: August 19, 2024