GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1476 - 1500 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
C6 deamination of adenosine
  • ADAR
  • ADAR1
  • ADAR2
  • ADARB1
  • DRADA2
  • DSRAD
  • G1P1
  • IFI4
  • RED1
Homo sapiens (human)
Thyroxine biosynthesis
  • C6orf71
  • CGA
  • DEHAL1
  • DUOX
  • DUOX1
  • DUOX2
  • IYD
  • LNOX1
  • LNOX2
  • NIS
  • SLC5A5
  • THOX1
  • THOX2
  • TPO
  • TSHB
Homo sapiens (human)
Negative feedback regulation of MAPK pathway
  • BRAF
  • BRAF1
  • ERK1
  • ERK2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
Homo sapiens (human)
Signaling by MAP2K mutants
  • ERK1
  • ERK2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
Homo sapiens (human)
MAPK1 (ERK2) activation
  • ERK2
  • IFNB2
  • IL6
  • IL6R
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MEK2
  • MKK2
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKMK2
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • TYK2
Homo sapiens (human)
activated TAK1 mediates p38 MAPK activation
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CROC1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • FIP3
  • IKBKG
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • KIAA0733
  • MAP2K3
  • MAP2K6
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPKAPK2
  • MAPKAPK3
  • MEK3
  • MEK6
  • MKK3
  • MKK6
  • MXI2
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • PRKM11
  • PRKMK3
  • PRKMK6
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SKK2
  • SKK3
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
JNK (c-Jun kinases) phosphorylation and activation mediated by activated human TAK1
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKG
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • JNK1
  • JNK2
  • JNK3
  • JNK3A
  • JNKK1
  • JNKK2
  • KIAA0733
  • MAP2K4
  • MAP2K7
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MAPK10
  • MAPK8
  • MAPK9
  • MEK4
  • MEK7
  • MKK4
  • MKK7
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • PRKM10
  • PRKM8
  • PRKM9
  • PRKMK4
  • PRKMK7
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • SAPK1
  • SAPK1A
  • SAPK1B
  • SAPK1C
  • SEK1
  • SERK1
  • SKK1
  • SKK4
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
Signalling to ERK5
  • BMK1
  • ERK5
  • MAP2K5
  • MAPK7
  • MEK5
  • MKK5
  • PRKM7
  • PRKMK5
Homo sapiens (human)
Signaling by MAPK mutants
  • C11orf81
  • DUSP10
  • DUSP16
  • DUSP6
  • DUSP7
  • DUSP8
  • DUSP9
  • ERK2
  • KIAA1700
  • MAPK1
  • MKP3
  • MKP4
  • MKP5
  • MKP7
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PYST1
  • PYST2
  • VH5
Homo sapiens (human)
Suppression of autophagy
  • DUSP16
  • KIAA1700
  • MKP7
  • RAB7
  • RAB7A
  • eis
  • sapM
Homo sapiens (human)
ERKs are inactivated
  • BMK1
  • DUSP3
  • DUSP4
  • DUSP6
  • DUSP7
  • ERK1
  • ERK2
  • ERK5
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPK7
  • MKP2
  • MKP3
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5D
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKM7
  • PYST1
  • PYST2
  • VH2
  • VHR
  • VRK3
Homo sapiens (human)
Regulation of Apoptosis
  • KIAA0567
  • MPRP1
  • OMA1
  • OPA1
Homo sapiens (human)
Defective POMGNT1 causes MDDGA3, MDDGB3 and MDDGC3
  • DAG1
  • MGAT1.2
  • POMGNT1
Homo sapiens (human)
Defective POMT1 causes MDDGA1, MDDGB1 and MDDGC1
  • DAG1
  • POMT1
  • POMT2
Homo sapiens (human)
Defective POMT2 causes MDDGA2, MDDGB2 and MDDGC2
  • DAG1
  • POMT1
  • POMT2
Homo sapiens (human)
Regulation of IFNG signaling
  • CIS3
  • DDXBP1
  • HCP
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • IFNGT1
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • PIAS1
  • PTP1B
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN1
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SHPTP2
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SOCS1
  • SOCS3
  • SSI1
  • SSI3
  • SUMO1
  • TIP3
  • UBL1
Homo sapiens (human)
SUMOylation of immune response proteins
  • EIF2AK2
  • FIP3
  • IKBA
  • IKBKE
  • IKBKG
  • IKKE
  • IKKI
  • KIAA0151
  • LUN
  • LYT10
  • MAD3
  • NEMO
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PIASG
  • PKR
  • PRKR
  • RELA
  • SMT3A
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • SUMO3
  • TOPORS
  • TP53BPL
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity
  • ADPRT
  • ATP1B4
  • CTG26
  • DFFRX
  • DPC4
  • ERK1
  • ERK2
  • FAM
  • HDAC1
  • KIAA0439
  • KIAA1047
  • KIAA1113
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADH7
  • MADH8
  • MADR2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NEDD4L
  • NEDL3
  • PARP1
  • PPM1A
  • PPOL
  • PPPM1A
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RFG7
  • RNF111
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SFT
  • SKI
  • SKIIP
  • SKIL
  • SKIP
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SMAD7
  • SMURF2
  • SNO
  • SNW1
  • TAZ
  • TGIF
  • TGIF1
  • TGIF2
  • TIF1G
  • TRIM33
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBC5C
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5C
  • UBE2D1
  • UBE2D3
  • USP9
  • USP9X
  • WWTR1
Homo sapiens (human)
Negative regulation of MET activity
  • AF1P
  • CBL
  • CBL2
  • CIN85
  • CNSA1
  • CNSA2
  • CNSA3
  • DEP1
  • EPS15
  • HBP
  • HGF
  • HGS
  • HPTA
  • HRS
  • KIAA0055
  • LIG1
  • LRIG1
  • MET
  • PTP1B
  • PTPN1
  • PTPN2
  • PTPRJ
  • PTPT
  • RNF55
  • RPS27A
  • SH3D2A
  • SH3D2B
  • SH3D2C
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • STAM
  • STAM1
  • STAM2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBPY
  • USP8
Homo sapiens (human)
InlB-mediated entry of Listeria monocytogenes into host cell
  • AF1P
  • CBL
  • CBL2
  • CIN85
  • CNSA1
  • CNSA2
  • CNSA3
  • EPS15
  • HBP
  • HGS
  • HRS
  • MET
  • RNF55
  • RPS27A
  • SH3D2A
  • SH3D2B
  • SH3D2C
  • SH3GL1
  • SH3GL2
  • SH3GL3
  • SH3KBP1
  • STAM
  • STAM1
  • STAM2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • inlB
Homo sapiens (human)
Negative regulation of FGFR2 signaling
  • CBL
  • CBL2
  • ERK1
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KS3
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Negative regulation of FGFR3 signaling
  • CBL
  • CBL2
  • ERK1
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • KS3
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Negative regulation of FLT3
  • ABL2
  • ABLL
  • ARG
  • C20orf156
  • CBL
  • CBL2
  • CD135
  • CIS2
  • CIS4
  • CSK
  • DEP1
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • LNK
  • PTPRJ
  • RNF55
  • RPS27A
  • SH2B3
  • SLA
  • SLA2
  • SLAP
  • SLAP1
  • SLAP2
  • SOCS2
  • SOCS4
  • SOCS6
  • SSI2
  • STATI2
  • STK1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
FLT3 signaling by CBL mutants
  • CBL
  • CBL2
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • RNF55
  • RPS27A
  • STK1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
TGF-beta receptor signaling activates SMADs
  • ALK5
  • C14orf141
  • CBL
  • CBL2
  • DPC4
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • FNRB
  • FUR
  • FURIN
  • GP3A
  • ITGA8
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB8
  • LTBP1
  • LTBP2
  • LTBP3
  • LTBP4
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK8
  • NEDD8
  • PACE
  • PCSK3
  • RNF55
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFB2
  • TGFB3
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • TGFBR3
  • UBC12
  • UBE2M
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024