GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Defective gamma-carboxylation of F9
  • F9
  • GC
  • GGCX
Homo sapiens (human)
Enzymatic degradation of dopamine by COMT
  • COMT
  • COMT2
  • LRTOMT
  • MAOA
  • TOMT
Homo sapiens (human)
Defective SLC2A1 causes GLUT1 deficiency syndrome 1 (GLUT1DS1)
  • GLUT1
  • SLC2A1
Homo sapiens (human)
MAPK1 (ERK2) activation
  • ERK2
  • IFNB2
  • IL6
  • IL6R
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MEK2
  • MKK2
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKMK2
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • TYK2
Homo sapiens (human)
Recycling of bile acids and salts
  • ABCB11
  • ABCC3
  • ACSB
  • ACSVL6
  • ALB
  • ASBT
  • BAAT
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BSEP
  • CMOAT2
  • FABP6
  • FACVL3
  • FATP5
  • FXR
  • HRR1
  • ILBP
  • ILLBP
  • ISBT
  • LST1
  • LST2
  • MLP2
  • MRP3
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • NTCP
  • NTCP2
  • OATP
  • OATP1
  • OATP1A2
  • OATP1B1
  • OATP1B3
  • OATP2
  • OATP8
  • OATPC
  • OSTA
  • OSTB
  • RIP14
  • RXRA
  • SLC10A1
  • SLC10A2
  • SLC21A3
  • SLC21A6
  • SLC21A8
  • SLC27A5
  • SLC51A
  • SLC51B
  • SLCO1A2
  • SLCO1B1
  • SLCO1B3
  • SRC1
  • SRC2
  • STARD5
  • TIF2
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase II Transcription Termination
  • ALY
  • ALYREF
  • ASF
  • BAT1
  • BEF
  • C1orf77
  • C22orf19
  • CASC3
  • CBP20
  • CBP80
  • CDC40
  • CFIM25
  • CHTOP
  • CLP1
  • COD
  • CPSF1
  • CPSF100
  • CPSF160
  • CPSF2
  • CPSF25
  • CPSF3
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CPSF5
  • CPSF7
  • CPSF73
  • CSTF1
  • CSTF2
  • CSTF2T
  • CSTF3
  • CXorf3
  • DDX38
  • DDX39
  • DDX39A
  • DDX39B
  • DDX48
  • DHX38
  • EHB3
  • EIF4A3
  • FIP1
  • FIP1L1
  • FOP
  • FYTTD1
  • HBP
  • HCC1
  • HEAB
  • HPR1
  • HRS
  • KIAA0111
  • KIAA0224
  • KIAA0663
  • KIAA0689
  • KIAA0824
  • KIAA0983
  • KIAA1141
  • KIAA1367
  • KIAA1649
  • LDC2
  • LSM10
  • LSM11
  • LUZP4
  • MAGOH
  • MAGOH2
  • MAGOHA
  • MAGOHB
  • MLN51
  • NAR
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEB1
  • NIF3L1BP1
  • NUDT21
  • PAB2
  • PABP2
  • PABPN1
  • PAP
  • PAPOLA
  • PBSCF
  • PBSCG
  • PCF11
  • PDIP46
  • POLDIP3
  • PRP16
  • PRP17
  • PRPF17
  • RBM8
  • RBM8A
  • RENT3B
  • RHE
  • RNPS1
  • SARNP
  • SF2
  • SF2P33
  • SFRS1
  • SFRS11
  • SFRS2
  • SFRS3
  • SFRS4
  • SFRS5
  • SFRS6
  • SFRS7
  • SFRS9
  • SLBP
  • SLU7
  • SNRPB
  • SNRPB1
  • SNRPD3
  • SNRPE
  • SNRPF
  • SNRPG
  • SPK
  • SRM160
  • SRP20
  • SRP30C
  • SRP40
  • SRP55
  • SRP75
  • SRRM1
  • SRSF1
  • SRSF11
  • SRSF2
  • SRSF3
  • SRSF4
  • SRSF5
  • SRSF6
  • SRSF7
  • SRSF9
  • SYMPK
  • THOC1
  • THOC2
  • THOC3
  • THOC4
  • THOC5
  • THOC6
  • THOC7
  • U2AF1
  • U2AF1-RS3
  • U2AF1L3
  • U2AF1L4
  • U2AF2
  • U2AF35
  • U2AF65
  • U2AFBP
  • UAP56
  • UIF
  • UPF3B
  • UPF3X
  • WDC146
  • WDR33
  • WDR58
  • ZC3H11A
  • ZC3HDC11A
  • ZFP100
  • ZNF473
Homo sapiens (human)
Impaired BRCA2 binding to PALB2
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
Homo sapiens (human)
Signal regulatory protein family interactions
  • BIT
  • CD47
  • DAP12
  • FAK
  • FAK1
  • FAK2
  • FYB
  • FYB1
  • HCP
  • KARAP
  • MER6
  • MFR
  • MYD1
  • PRAP
  • PTK2
  • PTK2B
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • PTPNS1
  • PYK2
  • RA70
  • RAFTK
  • SAPS
  • SCAP2
  • SHPS1
  • SHPTP2
  • SIRP
  • SIRPA
  • SIRPB1
  • SIRPB2
  • SIRPG
  • SKAP2
  • SKAP55R
  • SLAP130
  • TYROBP
Homo sapiens (human)
Ephrin signaling
  • ARHGEF7
  • COOL1
  • DRT
  • EFL3
  • EFNB1
  • EFNB2
  • EFNB3
  • ELK
  • EPHB1
  • EPHB2
  • EPHB3
  • EPHB4
  • EPHB6
  • EPHT2
  • EPHT3
  • EPLG2
  • EPLG5
  • EPLG8
  • EPTH3
  • ERK
  • ETK2
  • FYN
  • GIT1
  • GRB4
  • HEK2
  • HEK5
  • HEK6
  • HTK
  • HTKL
  • KIAA0142
  • LERK2
  • LERK5
  • LERK8
  • MDA9
  • MLCB
  • MRLC3
  • MYK1
  • MYL12A
  • NCK2
  • NET
  • OPHN3
  • P85SPR
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PAK3BP
  • PIXB
  • RAC1
  • RLC
  • SDCBP
  • SYCL
  • TC25
  • TYRO11
  • TYRO5
  • TYRO6
Homo sapiens (human)
Defective SLC34A2 causes pulmonary alveolar microlithiasis (PALM)
  • SLC34A2
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance
  • BA2R
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCG1
  • CCGS
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CIF150
  • ERCC2
  • ERCC3
  • GTF2A1
  • GTF2A2
  • GTF2B
  • GTF2D1
  • GTF2E1
  • GTF2E2
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RBP56
  • RNF66
  • RPB7
  • STK1
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF13
  • TAF15
  • TAF1L
  • TAF2
  • TAF2A
  • TAF2B
  • TAF2C
  • TAF2C1
  • TAF2C2
  • TAF2D
  • TAF2E
  • TAF2F
  • TAF2G
  • TAF2H
  • TAF2I
  • TAF2J
  • TAF2K
  • TAF2N
  • TAF2Q
  • TAF3
  • TAF4
  • TAF4A
  • TAF4B
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF7
  • TAF7L
  • TAF9
  • TAF9B
  • TAF9L
  • TAFII105
  • TAFII130
  • TAFII135
  • TAFII18
  • TAFII20
  • TAFII30
  • TAFII31
  • TAFII55
  • TAFII70
  • TBP
  • TF2A1
  • TF2A2
  • TF2B
  • TF2D
  • TF2E1
  • TF2E2
  • TFIIB
  • TFIID
  • TTDA
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1
  • ATM
  • C7orf76
  • COP1
  • DSS1
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • P53
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RFWD2
  • RING10
  • RING12
  • RNF200
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TP53
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
SIRT1 negatively regulates rRNA expression
  • GTF2D1
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • JOSD3
  • KIAA0409
  • KMT1A
  • NML
  • RRP8
  • SIR2L1
  • SIRT1
  • SUV39H
  • SUV39H1
  • TAF1A
  • TAF1B
  • TAF1C
  • TAF1D
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TSH2B
Homo sapiens (human)
Synthesis of bile acids and bile salts
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • CH25H
  • CYP7
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • FXR
  • HRR1
  • KIAA0704
  • KIAA0772
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • ORP1
  • ORP2
  • ORP3
  • ORP6
  • ORP7
  • ORP9
  • OSBP
  • OSBP1
  • OSBP3
  • OSBP4
  • OSBP8
  • OSBPL1
  • OSBPL1A
  • OSBPL1B
  • OSBPL2
  • OSBPL3
  • OSBPL6
  • OSBPL7
  • OSBPL9
  • RIP14
  • RXRA
  • SRC1
  • SRC2
  • TIF2
Homo sapiens (human)
PTK6 Down-Regulation
  • BRK
  • C20orf148
  • PTK6
  • PTP1B
  • PTPN1
  • SRMS
Homo sapiens (human)
Metabolism of ingested MeSeO2H into MeSeH
  • GRIM12
  • KDRF
  • TXNRD1
Homo sapiens (human)
VEGF binds to VEGFR leading to receptor dimerization
  • FIGF
  • FLK1
  • FLT
  • FLT1
  • FLT4
  • FRT
  • KDR
  • PGF
  • PGFL
  • PLGF
  • VEGF
  • VEGFA
  • VEGFB
  • VEGFC
  • VEGFD
  • VEGFR1
  • VEGFR2
  • VEGFR3
  • VRF
Homo sapiens (human)
Termination of translesion DNA synthesis
  • CHRAC17
  • DINB1
  • DPE2
  • EFP
  • G1P2
  • ISG15
  • KIAA0039
  • KIAA0101
  • KIAA0190
  • NS5ATP9
  • PAF
  • PCLAF
  • PCNA
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • POLH
  • POLI
  • POLK
  • RAD30
  • RAD30A
  • RAD30B
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • REV1
  • REV1L
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RNF147
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • TRIM25
  • UBA52
  • UBA7
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH8
  • UBE1L
  • UBE2
  • UBE2L6
  • UCRP
  • USP10
  • USP43
  • XPV
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
InlA-mediated entry of Listeria monocytogenes into host cells
  • CBLL1
  • CDH1
  • CDHE
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • HAKAI
  • KIAA0384
  • RNF188
  • RPS27A
  • SRC
  • SRC1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UVO
  • inlA
Homo sapiens (human)
eNOS activation
  • AKT1
  • APT1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAV
  • CAV1
  • CYGB
  • DDAH
  • DDAH1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • LPL1
  • LYPLA1
  • NOS3
  • PKB
  • RAC
  • SPR
  • STAP
  • ZDHHC21
Homo sapiens (human)
Defective CSF2RB causes SMDP5
  • COLEC4
  • COLEC5
  • COLEC7
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • IL3RB
  • IL5RB
  • PSAP
  • PSPD
  • SFTA3
  • SFTP1
  • SFTP2
  • SFTP3
  • SFTP4
  • SFTPA
  • SFTPA1
  • SFTPA1B
  • SFTPA2
  • SFTPA2B
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SFTPH
Homo sapiens (human)
Defective ACY1 causes encephalopathy
  • ACY1
Homo sapiens (human)
Glycogen synthesis
  • EPM2A
  • EPM2B
  • GBE1
  • GYG
  • GYG1
  • GYG2
  • GYS
  • GYS1
  • GYS2
  • NHLRC1
  • PGM1
  • PPP1R3C
  • PPP1R5
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UGP1
  • UGP2
Homo sapiens (human)
EGR2 and SOX10-mediated initiation of Schwann cell myelination
  • ACOD4
  • ADGRG6
  • ADGRV1
  • BAF190A
  • BHLHD2
  • BRG1
  • BRN2
  • CYP51
  • CYP51A1
  • DAG1
  • DMDL
  • DREG
  • DRP1
  • DRP2
  • EGR2
  • GAS3
  • GMA
  • GPR126
  • GPR98
  • HDAC2
  • HMGCR
  • KIAA0686
  • KIAA1620
  • KIAA1943
  • KROX20
  • LAMA2
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMC1
  • LAMM
  • MADER
  • MAG
  • MASS1
  • MBP
  • MPZ
  • NAB1
  • NAB2
  • OCT6
  • OCT7
  • OTF6
  • OTF7
  • PMP22
  • POU3F1
  • POU3F2
  • PRX
  • SCD2
  • SCD4
  • SCD5
  • SMARCA4
  • SNF2B
  • SNF2L4
  • SOX10
  • SREBF2
  • SREBP2
  • TAZ
  • TCF13
  • TEAD1
  • TEF1
  • UTRN
  • VIGR
  • VLGR1
  • WWTR1
  • YAP1
  • YAP65
Homo sapiens (human)
Invadopodia formation
  • ADAM12
  • ADAM15
  • ADAM19
  • FISH
  • KIAA0418
  • MDC15
  • MLTN
  • MLTNB
  • SH3MD1
  • SH3PXD2A
  • TKS5
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024