GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 176 - 200 of 1070 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Macroautophagy
  • AABR07040864.1
  • Ambra1
  • Ampk1
  • Apg12l
  • Apg3l
  • Apg7l
  • Apg9l1
  • Atg10
  • Atg101
  • Atg12
  • Atg13
  • Atg14
  • Atg14L
  • Atg16l1
  • Atg3
  • Atg4a
  • Atg4al1
  • Atg4b
  • Atg4c
  • Atg4d
  • Atg5
  • Atg7
  • Atg9a
  • Atg9b
  • Becn1
  • Chmp2a
  • Chmp2b
  • Chmp3
  • Chmp4b
  • Chmp4c
  • Chmp6
  • Chmp7
  • Dlc2
  • Dncl1
  • Dnclc1
  • Dynll1
  • Dynll2
  • ENSRNOG00000066475
  • Frap1
  • Gabarap
  • Gabarapl1
  • Gabarapl2
  • Gbl
  • Gec1
  • Gef2
  • LOC678769
  • Lamtor1
  • Lamtor3
  • Lamtor4
  • Lamtor5
  • Lst8
  • Map1alc3
  • Map1lc3
  • Map1lc3a
  • Map1lc3b
  • Map2k1ip1
  • Mlst8
  • Mtmr14
  • Mtmr3
  • Mtor
  • Pik3c3
  • Pik3r4
  • Pin
  • Prkaa1
  • Prkab1
  • Prkab2
  • Prkag1
  • Prkag2
  • Prkag3
  • Raft1
  • Rb1cc1
  • Rheb
  • Rptor
  • RragB
  • Rraga
  • Rragc
  • Rragc_predicted
  • Rragd
  • Slc38a9
  • Tsc1
  • Tsc2
  • Ulk1
  • Uvrag
  • Vps24
  • Vps34
  • WDR45L
  • Wdr45
  • Wdr45b
  • Wdr45l
  • Wdr45l_predicted
  • Wipi1
  • Wipi2
  • Wipi4
Rattus norvegicus (Norway rat)
Energy dependent regulation of mTOR by LKB1-AMPK
  • Ampk1
  • Cab39
  • Cab39l
  • ENSRNOG00000066475
  • Frap1
  • Gbl
  • Lamtor1
  • Lamtor3
  • Lamtor4
  • Lamtor5
  • Lkb1
  • Lst8
  • Lyk5
  • Map2k1ip1
  • Mlst8
  • Mtor
  • Pp2c1
  • Ppm1a
  • Pppm1a
  • Prkaa1
  • Prkab1
  • Prkab2
  • Prkag1
  • Prkag2
  • Prkag3
  • Raft1
  • Rheb
  • Rptor
  • RragB
  • Rraga
  • Rragc
  • Rragc_predicted
  • Rragd
  • Slc38a9
  • Stk11
  • Strad
  • Strada
  • Stradb
  • Tsc1
  • Tsc2
Rattus norvegicus (Norway rat)
Carnitine metabolism
  • Cact
  • Cpt-1
  • Cpt-2
  • Cpt1
  • Cpt1a
  • Cpt1b
  • Cpt2
  • Mid1ip1
  • Mig12
  • Nr2b1
  • Octn2
  • Prkab2
  • Prkag2
  • Rxra
  • S14
  • Slc22a5
  • Slc25a20
  • Thrsp
Rattus norvegicus (Norway rat)
Nicotinate metabolism
  • Bst1
  • Cd38
  • Mnadk
  • Nadk
  • Nadk2
  • Nadkd1
  • Nadsyn1
  • Nmnat1
  • Nmnat2
  • Nmnat3
  • Nmrk1
  • Nrk1
  • Nt5
  • Nt5e
  • Nte
  • Qns1
  • Qprt
Rattus norvegicus (Norway rat)
Heme biosynthesis
  • Abcg2
  • Alad
  • Alas1
  • Alas2
  • Alase
  • Alb
  • Bcrp1
  • Cox10
  • Cox15
  • Cpo
  • Cpox
  • Fech
  • Hmbs
  • LOC100911779
  • Ppox
  • Urod
  • Uros
Rattus norvegicus (Norway rat)
Serotonin receptors
  • 5ht1a
  • 5ht1b
  • 5ht1c
  • 5ht1f
  • 5ht5a
  • Htr1a
  • Htr1b
  • Htr1c
  • Htr1d
  • Htr1f
  • Htr2
  • Htr2a
  • Htr2b
  • Htr2c
  • Htr4
  • Htr5a
  • Htr6
  • Htr7
  • Srl
Rattus norvegicus (Norway rat)
Neurotransmitter receptors and postsynaptic signal transmission
  • 5ht3
  • Glra1
  • Glra2
  • Glra3
  • Glrb
  • Glyr
  • Htr3
  • Htr3a
  • Htr3b
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOBTB3 ATPase cycle
  • Ccne
  • Ccne1
  • Cul3
  • Hgs
  • Hrs
  • Hrs2
  • Htr7
  • Lrrc41
  • Rab9
  • Rab9a
  • Rab9b
  • Rhobtb3
  • Vhl
Rattus norvegicus (Norway rat)
Glutathione synthesis and recycling
  • Botch
  • Chac1
  • Chac2
  • Cndp2
  • Gclc
  • Gclm
  • Ggct
  • Ggt
  • Ggt1
  • Ggt5
  • Ggt6
  • Ggt7
  • Ggtl3
  • Ggtla1
  • Glclc
  • Glclr
  • Gss
  • Npg7
  • Oplah
Rattus norvegicus (Norway rat)
Collagen degradation
  • Col13a1
  • Col15a1
  • Col18a1
  • Col19a1
  • Col25a1
  • Col26a1
  • Cts7l2
  • Ctsb
  • Ctsd
  • Ctsk
  • Ctsll3
  • Fur
  • Furin
  • LOC100365995
  • LOC100909752
  • LOC103690164
  • LOC687064
  • Mmel
  • Mmp-7
  • Mmp1
  • Mmp10
  • Mmp12
  • Mmp13
  • Mmp14
  • Mmp15
  • Mmp1a
  • Mmp2
  • Mmp20
  • Mmp3
  • Mmp7
  • Mmp8
  • Mmp9
  • Mtmmp
  • Pcsk3
  • Phykpl
  • Prss3
  • RGD1308751
  • Tmprss6
  • Try4
  • Try5
Rattus norvegicus (Norway rat)
Pentose phosphate pathway
  • Dera
  • G6pd
  • G6pdx
  • Pgd
  • Pgls
  • Pgm2
  • RBKS
  • Rbks
  • Rpe
  • Rpia
  • Taldo1
  • Tkt
Rattus norvegicus (Norway rat)
Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation
  • Akt1
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Gch
  • Gch1
  • Gchfr
  • Gfrp
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Nos3
  • Prkg2
  • Pts
  • Spr
Rattus norvegicus (Norway rat)
Aspartate and asparagine metabolism
  • Asns
  • Aspa
  • Aspg
  • Folh1
  • Gadl1
  • Got1
  • Got2
  • Maat
  • Naalad1
  • Naalad2
  • Nat8l
  • Slc25a12
  • Slc25a13
Rattus norvegicus (Norway rat)
Degradation of the extracellular matrix
  • 2b7
  • A2m
  • A2m1
  • Acan
  • Adam10
  • Adam15
  • Adam8
  • Adamts4
  • Adamts5
  • Agc
  • Agc1
  • Bcan
  • Behab
  • Bsg
  • Capa6
  • Capn1
  • Capn10
  • Capn11
  • Capn12
  • Capn13
  • Capn15
  • Capn2
  • Capn3
  • Capn4
  • Capn5
  • Capn6
  • Capn7
  • Capn8
  • Capn9
  • Capns1
  • Cast
  • Cd44
  • Cdh1
  • Cls1
  • Cls4
  • Css1
  • Ctsg
  • Ctsk
  • Ctsl
  • Ctsl1
  • Ctss
  • Dcn
  • Elane
  • Htra
  • Htra1
  • Madm
  • Mdc15
  • Mmel
  • Mmp-7
  • Mmp1
  • Mmp10
  • Mmp11
  • Mmp12
  • Mmp13
  • Mmp14
  • Mmp1a
  • Mmp2
  • Mmp20
  • Mmp3
  • Mmp7
  • Mmp8
  • Mmp9
  • Mtmmp
  • Ncl2
  • Ncl4
  • Optc
  • Prss11
  • Scube1
  • Scube3
  • Spp-1
  • Spp1
  • Tmprss6
Rattus norvegicus (Norway rat)
Regulation of IGF Activity by IGFBP
  • 2b7
  • A4
  • AABR07058479.1
  • AD1
  • APPL2
  • Adam10
  • Afp
  • Ags
  • Ahsg
  • Alb
  • Als
  • Ambn
  • Amel
  • Amelx
  • Amgx
  • Amtn
  • Ano8
  • Aplp2
  • Apoa1
  • Apoa2
  • Apoa5
  • Apob
  • Apoe
  • Apol11a
  • Apol2
  • Apol7a
  • Apol7b
  • Apol9a
  • App
  • Atgl
  • Bmp-4
  • Bmp15
  • Bmp4
  • Bpifb2
  • C3
  • C4
  • C4a
  • C4b
  • Cabp1
  • Ccn1
  • Cdh2
  • Chgb
  • Chgc
  • Chrdl1
  • Ckap4
  • Cp
  • Csf1
  • Csfm
  • Cspg2
  • Cst3
  • Ctsg
  • Cyr61
  • Dmp1
  • Dnajc3
  • Dvr-4
  • ENSRNOG00000066972
  • ENSRNOG00000067174
  • ENSRNOG00000069479
  • ENSRNOG00000071144
  • Egfl3
  • Enam
  • Erc
  • F2
  • Fam20a
  • Fam20c
  • Fbn1
  • Fetua
  • Fga
  • Fgf23
  • Fgg
  • Flrg
  • Fn1
  • Frp
  • Fstl1
  • Fstl3
  • Fuca2
  • Gas6
  • Gbp
  • Golm1
  • Gpc3
  • Grp94
  • Hcf2
  • Hrc
  • Hsp90b1
  • Hspa5bp1
  • Hspc4
  • Hspg1
  • Igf-1
  • Igf-2
  • Igf1
  • Igf2
  • Igfals
  • Igfbp-1
  • Igfbp-2
  • Igfbp-3
  • Igfbp-4
  • Igfbp-5
  • Igfbp-6
  • Igfbp1
  • Igfbp10
  • Igfbp2
  • Igfbp3
  • Igfbp4
  • Igfbp5
  • Igfbp6
  • Igfbp7
  • Il-6
  • Il6
  • Itih2
  • Kjr
  • Klk-1
  • Klk-10
  • Klk-12
  • Klk-2
  • Klk-7
  • Klk-8
  • Klk-9
  • Klk1
  • Klk10
  • Klk12
  • Klk13
  • Klk1c4
  • Klk1c6
  • Klk2
  • Klk6
  • Klk7
  • Klk8
  • Klk9
  • Klks3
  • Klnl
  • Kng
  • Kng1
  • Ktn1
  • LOC120093819
  • LOC503164
  • Lgals1
  • Ltbp1
  • Madm
  • Matn3
  • Mbtps1
  • Megf6
  • Meltf
  • Men1
  • Mepe
  • Mfge8
  • Mfi2
  • Mgat4a
  • Mia3
  • Mmp1
  • Mmp1a
  • Mmp2
  • Mpf
  • Msln
  • Mxra8
  • Narc1
  • Ng1
  • Ngfg
  • Notum
  • Nuc
  • Nucb1
  • P4hb
  • P58ipk
  • Pappa
  • Pappa1
  • Pappa2
  • Pcsk9
  • Pdia1
  • Pdia6
  • Penk
  • Penk-rs
  • Penk1
  • Plg
  • Pnpla2
  • Prkcsh
  • Proc
  • Prss23
  • Qscn6
  • Qsox1
  • RGD1309808
  • Rap3
  • Rasp1
  • Rcn1
  • S1p
  • Sc1
  • Scg-2
  • Scg2
  • Scg3
  • Sdc2
  • Serpina1
  • Serpina10
  • Serpinc1
  • Serpind1
  • Ski1
  • Sox2
  • Sparcl1
  • Spp-1
  • Spp1
  • Spp2
  • Spp24
  • Stc2
  • Synd2
  • Tf
  • Timp-1
  • Timp1
  • Tmem132a
  • Tnc
  • Ton
  • Tra1
  • Ttgn1
  • Txndc7
  • Vcan
  • Vgf
  • Vwa1
  • Wfs1
  • Zpi
Rattus norvegicus (Norway rat)
Extra-nuclear estrogen signaling
  • Akt1
  • Areg
  • Btc
  • CaMIII
  • Calm3
  • Cam3
  • Camc
  • Cav
  • Cav1
  • Cav2
  • Dtr
  • Egf
  • Egfr
  • Erbeta
  • Ereg
  • Esr
  • Esr1
  • Esr2
  • Estr
  • Fak
  • Fak1
  • Gnai-1
  • Gnai-2
  • Gnai-3
  • Gnai1
  • Gnai2
  • Gnai3
  • Gnat-3
  • Gnat3
  • Hbegf
  • Hegfl
  • Hrmt1l2
  • Hsp86
  • Hsp90aa1
  • Hspca
  • Igf1r
  • Mmp-7
  • Mmp2
  • Mmp3
  • Mmp7
  • Mmp9
  • Nos3
  • Nr3a1
  • Nr3a2
  • Pik3ca
  • Pik3r1
  • Pik3r2
  • Pik3r3
  • Prmt1
  • Ptk2
  • S1pr3
  • Sdgf
  • Serz
  • Shc1
  • Sphk1
  • Src
  • Strn
  • Tgfa
  • Zdhhc7
Rattus norvegicus (Norway rat)
Activation of Matrix Metalloproteinases
  • Cma1
  • Col18a1
  • Ctrb
  • Ctrb1
  • Ctsg
  • Ctsk
  • Ctsl
  • Ctsl1
  • ENSRNOG00000066972
  • ENSRNOG00000067174
  • ENSRNOG00000069479
  • ENSRNOG00000071144
  • Elane
  • Fur
  • Furin
  • Klk-1
  • Klk-10
  • Klk-12
  • Klk-2
  • Klk-7
  • Klk-8
  • Klk-9
  • Klk1
  • Klk10
  • Klk12
  • Klk1c4
  • Klk1c6
  • Klk2
  • Klk3
  • Klk6
  • Klk7
  • Klk8
  • Klk9
  • Klkb1
  • Klks3
  • LOC100365995
  • LOC102554637
  • LOC683849
  • Mcp6
  • Mcpt3
  • Mcpt6
  • Mmp-7
  • Mmp1
  • Mmp10
  • Mmp11
  • Mmp13
  • Mmp14
  • Mmp15
  • Mmp16
  • Mmp17
  • Mmp1a
  • Mmp2
  • Mmp24
  • Mmp25
  • Mmp3
  • Mmp7
  • Mmp8
  • Mmp9
  • Mt5mmp
  • Mtmmp
  • Ngfg
  • Pcsk3
  • Pk
  • Plg
  • Prss1
  • Prss2
  • Prss2l1
  • Prss3
  • Spock3
  • Timp-1
  • Timp-2
  • Timp1
  • Timp2
  • Ton
  • Tpsb2
  • Trp1
  • Try1
  • Try10
  • Try2
  • Try4
  • Try5
  • Tryp1
Rattus norvegicus (Norway rat)
EPH-ephrin mediated repulsion of cells
  • Aph1a
  • Efnb1
  • Efnb3
  • Elk
  • Ephb1
  • Ephb2
  • Ephb3
  • Ephb4
  • Ephb6
  • Eplg2
  • Epth2
  • Fyn
  • LOC686310
  • Lerk2
  • Lyn
  • Mmp2
  • Mmp9
  • Ncstn
  • Ps2
  • Psen1
  • Psen2
  • Psenen
  • Psnl1
  • Psnl2
  • Rac
  • Rac1
  • Src
  • Tiam1
  • Vav2
  • Vav3
  • Yes1
Rattus norvegicus (Norway rat)
Acyl chain remodelling of PE
  • A-C1
  • Abhd4
  • Cpla2
  • Grcc3f
  • H-rev107
  • Hrasls
  • Hrasls3
  • Hrasls5
  • Hrasrs
  • Hrev107
  • Hrlp5
  • Lpcat3
  • Lpcat4
  • Mboat1
  • Mboat2
  • Mboat5
  • Oact2
  • Oact5
  • Pla2g10
  • Pla2g12a
  • Pla2g16
  • Pla2g1b
  • Pla2g2a
  • Pla2g2d
  • Pla2g2f
  • Pla2g3
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g4b
  • Pla2g4c
  • Pla2g4d
  • Pla2g4e
  • Pla2g4f
  • Pla2g5
  • Pla2g6
  • Pla2r1
  • Plaat1
  • Plaat3
  • Plaat5
  • Plbd1
  • Pnpla8
  • Pnpla9
  • RLP-2
  • Rlp-1
  • Rlp-3
Rattus norvegicus (Norway rat)
Acyl chain remodelling of PC
  • Aytl1
  • Aytl1a
  • Aytl2
  • Cpla2
  • Grcc3f
  • H-rev107
  • Hrasls3
  • Hrev107
  • Lpcat1
  • Lpcat2
  • Lpcat2a
  • Lpcat3
  • Lpcat4
  • Mboat2
  • Mboat5
  • Oact2
  • Oact5
  • Phlpb
  • Pla2g10
  • Pla2g12a
  • Pla2g16
  • Pla2g1b
  • Pla2g2a
  • Pla2g2d
  • Pla2g2f
  • Pla2g3
  • Pla2g4
  • Pla2g4a
  • Pla2g4b
  • Pla2g4c
  • Pla2g4d
  • Pla2g4e
  • Pla2g4f
  • Pla2g5
  • Pla2g6
  • Pla2r1
  • Plaat3
  • Plb1
  • Plbd1
  • Pnpla8
  • Pnpla9
  • Rlp-3
  • Tmem86b
Rattus norvegicus (Norway rat)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • Adamts1
  • Adamts10
  • Adamts12
  • Adamts13
  • Adamts14
  • Adamts15
  • Adamts16
  • Adamts17
  • Adamts18
  • Adamts19
  • Adamts2
  • Adamts20
  • Adamts3
  • Adamts4
  • Adamts5
  • Adamts6
  • Adamts7
  • Adamts8
  • Adamts9
  • Adamtsl1
  • Adamtsl2
  • Adamtsl3
  • Adamtsl4
  • Adamtsl5
  • B3glct
  • Pofut2
  • Rpesp
  • Sbspon
  • Sema5a
  • Sema5b
  • Spon1
  • Spon2
  • Sponf
  • Sspo
  • Thbs1
  • Thbs2
  • Thsd1
  • Thsd4
  • Thsd7a
  • Thsd7b
Rattus norvegicus (Norway rat)
Factors involved in megakaryocyte development and platelet production
  • Ak3
  • Ak3l1
  • Akap
  • Akap1
  • Akap10
  • Akl3l
  • Aps
  • Capza1
  • Capza2
  • Capzb
  • Carmil1
  • Cbx5
  • Cdc42
  • Dock10
  • Dock11
  • Dock2
  • Dock3
  • Dock4
  • Dock5
  • Dock6
  • Dock7
  • Dock8
  • Ehd1
  • Ehd2
  • Ehd3
  • Fzo1a
  • Fzo1b
  • Gata1
  • Gata2
  • Gata4
  • Gata6
  • H3-3b
  • H3.3b
  • H3c13
  • H3f3b
  • Hdac1
  • Hdac2
  • Hist2h3c2
  • Hmg20b
  • Itpk1
  • Jak2
  • Jmjd1c
  • Kdm1a
  • Maff
  • Mafg
  • Mfn1
  • Mfn2
  • Nfe2
  • Phf21a
  • Pkacb
  • Prkaca
  • Prkacb
  • Prkar1a
  • Prkar1b
  • Prkar2a
  • Prkar2b
  • Rab5a
  • Rac
  • Rac1
  • Rad51b
  • Rad51c
  • Rbsn
  • Rcor1
  • Sh2-b
  • Sh2b1
  • Sh2b2
  • Sh2bpsm1
  • Vps45
  • Vps45a
  • Zfpm1
  • Zfpm2
  • Zfyve20
Rattus norvegicus (Norway rat)
RHOF GTPase cycle
  • Actb
  • Actg
  • Actg1
  • Actn1
  • Add3
  • Akap12
  • Arhgap1
  • Arhgap12
  • Arhgap21
  • Arhgap32
  • Arhgap5
  • Baiap2l1
  • Baiap2l2
  • Basp1
  • Capzb
  • Cav
  • Cav1
  • Depdc1b
  • Diap1
  • Diaph1
  • Diaph3
  • Esyt1
  • Fam169a
  • Fam62a
  • Farp1
  • Lmnb1
  • Mbc2
  • Mcam
  • Mtmr1
  • Muc18
  • Myo9b
  • Myr5
  • Nap22
  • Nbc
  • Nbc2
  • Nbc3
  • Nbcn1
  • Pik3r1
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Rattus norvegicus (Norway rat)
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Rattus norvegicus (Norway rat)
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Last updated: August 19, 2024