GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 451 - 475 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Glycolysis
  • ADPGK
  • ALDA
  • ALDB
  • ALDC
  • ALDOA
  • ALDOB
  • ALDOC
  • BM32A
  • BPGM
  • C10orf134
  • ENO1
  • ENO1L1
  • ENO2
  • ENO3
  • ENO4
  • GAPD
  • GAPD2
  • GAPDH
  • GAPDH2
  • GAPDHS
  • GAPDS
  • GCK
  • GNP2
  • GNPDA1
  • GNPDA2
  • GNPI
  • GPI
  • HK1
  • HK2
  • HK3
  • HKDC1
  • HLN
  • KIAA0060
  • MBPB1
  • MPB1
  • PFKF
  • PFKL
  • PFKM
  • PFKP
  • PFKX
  • PGAM1
  • PGAM2
  • PGAMA
  • PGAMM
  • PGK1
  • PGK2
  • PGKA
  • PGKB
  • PGM2L1
  • PGP
  • TPI
  • TPI1
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodeling of DAG and TAG
  • ADPN
  • AGRP1
  • ATGL
  • AWAT2
  • C22orf20
  • DC3
  • DC4
  • DGAT
  • DGAT1
  • DGAT2
  • DGAT2L4
  • DGAT2L6
  • MFAT
  • MGLL
  • PNPLA2
  • PNPLA3
  • WS
Homo sapiens (human)
POLB-Dependent Long Patch Base Excision Repair
  • ADPRHL2
  • ADPRS
  • ADPRT
  • ADPRT2
  • ADPRTL2
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • ARH3
  • FEN1
  • HAP1
  • LIG1
  • PARG
  • PARP1
  • PARP2
  • POLB
  • PPOL
  • RAD2
  • REF1
Homo sapiens (human)
Phosphate bond hydrolysis by NUDT proteins
  • ADPRM
  • C17orf48
  • MTH2
  • NUDIX5
  • NUDT15
  • NUDT16
  • NUDT5
Homo sapiens (human)
Formation of Incision Complex in GG-NER
  • ADPRT
  • ADPRT2
  • ADPRTL2
  • ALC1
  • BLU
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CALT
  • CAP35
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • CEN2
  • CETN2
  • CHD1L
  • CUL4A
  • CUL4B
  • DDB1
  • DDB2
  • DDXBP1
  • ERCC1
  • ERCC11
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC4
  • ERCC5
  • ERCM2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA0695
  • MAT1
  • MMS2
  • MNAT1
  • MO15
  • PARP1
  • PARP2
  • PIAS1
  • PIAS3
  • PPOL
  • RAD23A
  • RAD23B
  • RBX1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RNF111
  • RNF66
  • RNF75
  • ROC1
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • STK1
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2I
  • UBE2N
  • UBE2V2
  • UBL1
  • UEV2
  • USP45
  • XAP1
  • XPA
  • XPAC
  • XPB
  • XPBC
  • XPC
  • XPCC
  • XPD
  • XPDC
  • XPF
  • XPG
  • XPGC
Homo sapiens (human)
Dual Incision in GG-NER
  • ADPRT
  • ADPRT2
  • ADPRTL2
  • ALC1
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CHD1L
  • CHRAC17
  • CUL4A
  • CUL4B
  • DDB1
  • DDB2
  • DINB1
  • DPE2
  • ERCC1
  • ERCC11
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC4
  • ERCC5
  • ERCM2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA0039
  • KIAA0695
  • PARP1
  • PARP2
  • PCNA
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • POLK
  • PPOL
  • RBX1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RNF75
  • ROC1
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • XAP1
  • XPA
  • XPAC
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • XPF
  • XPG
  • XPGC
Homo sapiens (human)
HDR through MMEJ (alt-NHEJ)
  • ADPRT
  • ADPRT2
  • ADPRTL2
  • BRCA2
  • CTIP
  • FACD
  • FANCD1
  • FEN1
  • HNGS1
  • LIG3
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PARP1
  • PARP2
  • POLH
  • POLQ
  • PPOL
  • RAD2
  • RAD50
  • RAD52
  • RBBP8
  • XRCC1
Homo sapiens (human)
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity
  • ADPRT
  • ATP1B4
  • CTG26
  • DFFRX
  • DPC4
  • ERK1
  • ERK2
  • FAM
  • HDAC1
  • KIAA0439
  • KIAA1047
  • KIAA1113
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADH7
  • MADH8
  • MADR2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NEDD4L
  • NEDL3
  • PARP1
  • PPM1A
  • PPOL
  • PPPM1A
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RFG7
  • RNF111
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SFT
  • SKI
  • SKIIP
  • SKIL
  • SKIP
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SMAD7
  • SMURF2
  • SNO
  • SNW1
  • TAZ
  • TGIF
  • TGIF1
  • TGIF2
  • TIF1G
  • TRIM33
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBC5C
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5C
  • UBE2D1
  • UBE2D3
  • USP9
  • USP9X
  • WWTR1
Homo sapiens (human)
vRNA Synthesis
  • ADPRT
  • NP
  • PA
  • PARP1
  • PB1
  • PB2
  • PPOL
Homo sapiens (human)
Nicotinamide salvaging
  • ADPRTL1
  • AIBP
  • AIT
  • APOA1BP
  • ARTD15
  • BAL
  • BAL1
  • BAL2
  • C10orf59
  • C15orf30
  • CARKD
  • COX2
  • CYP12
  • CYP8
  • CYP8A1
  • CYP8B1
  • FHIP
  • KIAA0177
  • KIAA1268
  • NAMPT
  • NAPRT
  • NAPRT1
  • NAXD
  • NAXE
  • NNMT
  • NUDT12
  • OCTL1
  • ORCTL3
  • PARP10
  • PARP14
  • PARP16
  • PARP4
  • PARP6
  • PARP8
  • PARP9
  • PARPL
  • PBEF
  • PBEF1
  • PTGIS
  • PTGS2
  • RNLS
  • SLC22A13
  • SLC5A8
  • SMCT
  • SMCT1
  • YJEFN1
Homo sapiens (human)
Maturation of nucleoprotein
  • ADPRTL1
  • ARTD15
  • BAL
  • BAL1
  • BAL2
  • C15orf30
  • CSNK1A1
  • GSK3A
  • GSK3B
  • HMT2
  • HRMT1L2
  • IR1B4
  • KIAA0177
  • KIAA1268
  • N
  • PARP10
  • PARP14
  • PARP16
  • PARP4
  • PARP6
  • PARP8
  • PARP9
  • PARPL
  • PRMT1
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SRPK1
  • SRPK2
  • SUMO1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Maturation of nucleoprotein
  • ADPRTL1
  • ARTD15
  • BAL
  • BAL1
  • BAL2
  • C15orf30
  • GSK3A
  • GSK3B
  • KIAA0177
  • KIAA1268
  • N
  • PARP10
  • PARP14
  • PARP16
  • PARP4
  • PARP6
  • PARP8
  • PARP9
  • PARPL
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Sealing of the nuclear envelope (NE) by ESCRT-III
  • ADPSP
  • BC2
  • C14orf123
  • C20orf178
  • CC2D1B
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • FSP2
  • IST1
  • KIAA0174
  • KIAA1083
  • KIAA1836
  • LEMD2
  • LGD1
  • NEDF
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • SPAST
  • SPG4
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA1B
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA3E
  • TUBA4
  • TUBA4A
  • TUBA4B
  • TUBA6
  • TUBA8
  • TUBAL2
  • TUBAL3
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
  • TUBB8
  • TUBB8B
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS4
  • VPS4A
Homo sapiens (human)
Adrenoceptors
  • ADRA1A
  • ADRA1B
  • ADRA1C
  • ADRA1D
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • ADRA2L1
  • ADRA2L2
  • ADRA2R
  • ADRA2RL1
  • ADRA2RL2
  • ADRAR
  • ADRB1
  • ADRB1R
  • ADRB2
  • ADRB2R
  • ADRB3
  • ADRB3R
  • B1AR
  • B2AR
  • B3AR
Homo sapiens (human)
Adrenaline signalling through Alpha-2 adrenergic receptor
  • ADRA2A
  • ADRA2B
  • ADRA2C
  • ADRA2L1
  • ADRA2L2
  • ADRA2R
  • ADRA2RL1
  • ADRA2RL2
  • ADRAR
Homo sapiens (human)
Serotonin receptors
  • ADRB2RL1
  • ADRBRL1
  • HTR1A
  • HTR1B
  • HTR1C
  • HTR1D
  • HTR1DA
  • HTR1DB
  • HTR1E
  • HTR1EL
  • HTR1F
  • HTR2
  • HTR2A
  • HTR2B
  • HTR2C
  • HTR4
  • HTR5A
  • HTR6
  • HTR7
  • HTRL
Homo sapiens (human)
Activation of SMO
  • ADRBK1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BARK
  • BARK1
  • BOC
  • CDO
  • CDON
  • CSNK1A1
  • DHH
  • DRC4
  • EFCAB7
  • EVC
  • EVC2
  • GAS1
  • GAS11
  • GAS8
  • GRK2
  • IHH
  • IQCE
  • KIAA1023
  • KIAA1799
  • KIF3
  • KIF3A
  • LBN
  • PTCH
  • PTCH1
  • SHH
  • SMO
  • SMOH
Homo sapiens (human)
Calmodulin induced events
  • ADRBK1
  • BARK
  • BARK1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • GRK2
  • PKCA
  • PKCD
  • PKCG
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCG
Homo sapiens (human)
WNT5A-dependent internalization of FZD4
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARB2
  • ARR2
  • ARRB2
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL2
  • DVL2
  • FZD4
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • PKCA
  • PKCB
  • PKCG
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PRKCG
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
Nef Mediated CD4 Down-regulation
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • ATP6V1H
  • CD4
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • LCK
  • nef
Homo sapiens (human)
Nef Mediated CD8 Down-regulation
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ATP6V1H
  • CD8B
  • CD8B1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • nef
Homo sapiens (human)
VLDLR internalisation and degradation
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • BZF1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • HIP9
  • HYPJ
  • IDOL
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • LXRA
  • LXRB
  • MYLIP
  • NARC1
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • PCSK9
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UNR
  • VLDLR
Homo sapiens (human)
Recycling pathway of L1
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • C14orf41
  • CAML1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CNSA2
  • CRMP2
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DPYSL2
  • DYN2
  • ERK2
  • EZR
  • HIP9
  • HYPJ
  • ISPK1
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0820
  • KIAA0899
  • KIAA1598
  • KIF4
  • KIF4A
  • KIF4B
  • L1CAM
  • MAPK1
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • MIC5
  • MSK1
  • MSK2
  • MSN
  • NUMB
  • PRKM1
  • PRKM2
  • RDX
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RPS6KA4
  • RPS6KA5
  • RPS6KA6
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
  • RSK4
  • SH3D2A
  • SH3GL2
  • SHTN1
  • ULIP2
  • VIL2
Homo sapiens (human)
WNT5A-dependent internalization of FZD2, FZD5 and ROR2
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • C2orf31
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTB
  • CLTC
  • CLTCL2
  • FZD2
  • FZD5
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • NTRKR1
  • NTRKR2
  • ROR1
  • ROR2
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
Retrograde neurotrophin signalling
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CNSA2
  • DNAL4
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYN2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0820
  • KIAA0899
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • SH3D2A
  • SH3GL2
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024