GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 951 - 975 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID ▼ Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
APOBEC3G mediated resistance to HIV-1 infection
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Integration of provirus
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • KPNA1
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • RCH2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
2-LTR circle formation
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • DFS70
  • G22P1
  • G22P2
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • LIG4
  • PSIP1
  • PSIP2
  • XRCC4
  • XRCC5
  • XRCC6
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
IRE1alpha activates chaperones
  • ERN1
  • GRP78
  • HSPA5
  • IRE1
Homo sapiens (human)
Processing of SMDT1
  • AFG3L2
  • BAP
  • C10orf42
  • C22orf32
  • C2orf47
  • CALC
  • CAR
  • CBARA1
  • CCDC109A
  • CCDC109B
  • CMAR
  • EFHA1
  • EFHA2
  • EMRE
  • FTSH1
  • INPP5E
  • KIAA0123
  • MAIP1
  • MCU
  • MCUB
  • MICU1
  • MICU2
  • MICU3
  • MPPA
  • MPPB
  • PARL
  • PGN
  • PHB
  • PHB1
  • PHB2
  • PMPCA
  • PMPCB
  • PSARL
  • REA
  • SLP2
  • SMDT1
  • SPG7
  • STOML2
  • YME1L
  • YME1L1
Homo sapiens (human)
Cristae formation
  • APOO
  • APOOL
  • ATP5A
  • ATP5A1
  • ATP5AL2
  • ATP5B
  • ATP5C
  • ATP5C1
  • ATP5CL1
  • ATP5D
  • ATP5E
  • ATP5F1
  • ATP5F1A
  • ATP5F1B
  • ATP5F1C
  • ATP5F1D
  • ATP5F1E
  • ATP5G1
  • ATP5G2
  • ATP5G3
  • ATP5H
  • ATP5I
  • ATP5J
  • ATP5J2
  • ATP5JL
  • ATP5K
  • ATP5L
  • ATP5MC1
  • ATP5MC2
  • ATP5MC3
  • ATP5ME
  • ATP5MF
  • ATP5MG
  • ATP5O
  • ATP5PB
  • ATP5PD
  • ATP5PF
  • ATP5PO
  • ATP5S
  • ATP6
  • ATP8
  • ATPASE6
  • ATPASE8
  • ATPM
  • ATPMB
  • ATPO
  • ATPSB
  • ATPW
  • C17orf35
  • C19orf70
  • C1orf151
  • CHCHD3
  • CHCHD6
  • CHCM1
  • CXorf33
  • DMAC2L
  • DNAJC11
  • FAM121A
  • FAM121B
  • GRP75
  • HMP
  • HSPA9
  • HSPA9B
  • IMMT
  • MIC10
  • MIC13
  • MIC19
  • MIC23
  • MIC25
  • MIC26
  • MIC27
  • MIC60
  • MICOS10
  • MICOS13
  • MINOS1
  • MINOS2
  • MINOS3
  • MT-ATP6
  • MT-ATP8
  • MTATP6
  • MTATP8
  • MTX
  • MTX1
  • MTX2
  • MTXN
  • PM1
  • QIL1
  • SAM50
  • SAMM50
  • TMEM11
  • mt-HSP70
Homo sapiens (human)
Unwinding of DNA
  • BM28
  • C20orf154
  • CCNL1
  • CDC21
  • CDC45
  • CDC45L
  • CDC45L2
  • CDC46
  • CDC47
  • CDCL1
  • GINS1
  • GINS2
  • GINS3
  • GINS4
  • KIAA0030
  • KIAA0186
  • MCM2
  • MCM3
  • MCM4
  • MCM5
  • MCM6
  • MCM7
  • MCM8
  • PSF1
  • PSF2
  • PSF3
  • SLD5
Homo sapiens (human)
G1/S-Specific Transcription
  • BARA
  • C14orf46
  • CCNA1
  • CCNE
  • CCNE1
  • CDC18L
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDC45
  • CDC45L
  • CDC45L2
  • CDC6
  • CDK1
  • CDKN1
  • CDT1
  • CXCDC1
  • DHFR
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F4
  • E2F5
  • E2F6
  • EMI1
  • FBX5
  • FBXO5
  • HDAC1
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • ORC1
  • ORC1L
  • P34CDC2
  • PARC1
  • PCNA
  • POLA
  • POLA1
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBL1
  • RBL2
  • RPD3L1
  • RR2
  • RRM2
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
  • TK1
  • TS
  • TYMS
Homo sapiens (human)
Amino acid transport across the plasma membrane
  • ASC1
  • ASCT1
  • ASCT2
  • ATA1
  • ATA2
  • ATA3
  • ATRC1
  • ATRC3
  • B0AT1
  • B0AT2
  • B0AT3
  • BAT1
  • BGT1
  • C14orf69
  • CAT3
  • CD98LC
  • ERR
  • G17
  • JM24
  • KIAA0245
  • KIAA1382
  • LAT1
  • LAT2
  • LAT3
  • LAT4
  • M7V1
  • MCT10
  • MDU1
  • MPE16
  • NAT1
  • NAT2
  • NAT3
  • NBAT
  • NTT73
  • ORNT3
  • PAT1
  • PAT2
  • PAT4
  • PB39
  • POV1
  • RDR
  • RDRC
  • REC1L
  • SAT1
  • SAT2
  • SATT
  • SBAT1
  • SIT1
  • SLC16A10
  • SLC1A4
  • SLC1A5
  • SLC25A29
  • SLC36A1
  • SLC36A2
  • SLC36A4
  • SLC38A1
  • SLC38A2
  • SLC38A3
  • SLC38A4
  • SLC38A5
  • SLC3A1
  • SLC3A2
  • SLC43A1
  • SLC43A2
  • SLC6A12
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A20
  • SLC6A6
  • SLC7A1
  • SLC7A10
  • SLC7A11
  • SLC7A3
  • SLC7A5
  • SLC7A6
  • SLC7A7
  • SLC7A8
  • SLC7A9
  • SN1
  • SN2
  • SNAT1
  • SNAT2
  • SNAT3
  • SNAT4
  • SNAT5
  • TAT1
  • TRAMD1
  • XT3
  • XTRP2
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
TBC/RABGAPs
  • ARF6
  • C20orf140
  • EPI64
  • FIP2
  • FLC3A
  • FLC3B
  • GABARAP
  • GABARAPL2
  • GEF2
  • GGA1
  • GGA2
  • GGA3
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • KIAA0154
  • KIAA0243
  • KIAA0722
  • KIAA1080
  • KIAA1171
  • KIAA1322
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • MEL
  • NRP
  • OATL1
  • OPTN
  • PARIS1
  • PP8997
  • PRC17
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11B
  • RAB1C
  • RAB33A
  • RAB33B
  • RAB35
  • RAB4
  • RAB4A
  • RAB5
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RAB5EP
  • RAB6
  • RAB6A
  • RAB6B
  • RAB7
  • RAB7A
  • RAB7B
  • RAB8
  • RAB8A
  • RAB8B
  • RABEP1
  • RABEX5
  • RABGAP1
  • RABGEF1
  • RABL
  • RABPT5
  • RABPT5A
  • RABS10
  • RAY
  • SLP1
  • SYTL1
  • TBC1D10
  • TBC1D10A
  • TBC1D10B
  • TBC1D10C
  • TBC1D13
  • TBC1D14
  • TBC1D15
  • TBC1D16
  • TBC1D17
  • TBC1D2
  • TBC1D20
  • TBC1D24
  • TBC1D25
  • TBC1D2A
  • TBC1D3
  • TBC1D3A
  • TBC1D7
  • TBC7
  • TSC
  • TSC1
  • TSC2
  • TSC4
  • ULK1
  • YPT3
Homo sapiens (human)
Receptor Mediated Mitophagy
  • APG12
  • APG12L
  • APG5L
  • ASP
  • ATG12
  • ATG5
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • FUNDC1
  • G5A
  • KIAA0722
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3A
  • MAP1LC3B
  • ULK1
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression to control bile acid homeostasis
  • BHLHE74
  • CTG26
  • FABP6
  • GNT1
  • ILBP
  • ILLBP
  • KIAA1047
  • LXRA
  • LXRB
  • NCOA1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • RXRA
  • RXRB
  • SRC1
  • UGT1
  • UGT1A3
  • UNR
Homo sapiens (human)
Nuclear Receptor transcription pathway
  • AD4BP
  • AR
  • ARC205
  • BCON3
  • CRSP1
  • CRSP200
  • CTG26
  • DHTR
  • DRIP205
  • DRIP230
  • EAR1
  • EAR2
  • EAR3
  • EAR7
  • ERBA1
  • ERBA2
  • ERBAL2
  • ERBAL3
  • ERR1
  • ERR3
  • ERRB2
  • ERRG2
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESRL1
  • ESRL2
  • ESRRA
  • ESRRB
  • ESRRG
  • ESTRB
  • FTZF1
  • GFRP1
  • HAP
  • HMR
  • HNF4
  • HNF4A
  • HNF4G
  • HREV
  • KIAA0832
  • KIAA1047
  • LXRB
  • MED1
  • NAK1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NER
  • NOT
  • NR0B2
  • NR1A1
  • NR1A2
  • NR1B1
  • NR1B2
  • NR1B3
  • NR1C1
  • NR1C2
  • NR1C3
  • NR1D1
  • NR1D2
  • NR1F1
  • NR1F2
  • NR1F3
  • NR1H2
  • NR1I1
  • NR2A1
  • NR2A2
  • NR2B1
  • NR2B2
  • NR2B3
  • NR2C1
  • NR2C2
  • NR2C2AP
  • NR2E1
  • NR2F1
  • NR2F6
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NR3B1
  • NR3B2
  • NR3B3
  • NR3C3
  • NR3C4
  • NR4A1
  • NR4A2
  • NR5A1
  • NRBP
  • NRBP1
  • NURR1
  • PBP
  • PGR
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARB
  • PPARBP
  • PPARD
  • PPARG
  • PPARGBP
  • RARA
  • RARB
  • RARG
  • RB18A
  • RORA
  • RORB
  • RORC
  • RORG
  • RXRA
  • RXRB
  • RXRG
  • RZRA
  • RZRB
  • RZRG
  • SF1
  • SHP
  • TAK1
  • TCF14
  • TFCOUP1
  • THR1
  • THRA
  • THRA1
  • THRA2
  • THRAL
  • THRB
  • TINUR
  • TLX
  • TR2
  • TR4
  • TRA16
  • TRAP220
  • TRIP2
  • UNR
  • VDR
Homo sapiens (human)
Phosphate bond hydrolysis by NTPDase proteins
  • CD39
  • CD39L1
  • CD39L2
  • CD39L3
  • CD39L4
  • ENTPD1
  • ENTPD2
  • ENTPD3
  • ENTPD4
  • ENTPD5
  • ENTPD6
  • ENTPD7
  • ENTPD8
  • IL6ST2
  • KIAA0392
  • LALP1
  • LALP70
  • LYSAL1
  • PCPH
Homo sapiens (human)
Defective MPDU1 causes CDG-1f
  • MPDU1
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of the N-glycan precursor (dolichol lipid-linked oligosaccharide, LLO) and transfer to a nascent protein
  • ALG1
  • ALG10
  • ALG10A
  • ALG10B
  • ALG11
  • ALG12
  • ALG13
  • ALG14
  • ALG2
  • ALG3
  • ALG6
  • ALG8
  • ALG9
  • CXorf45
  • DIBD1
  • DPAGT1
  • DPAGT2
  • GLT28D1
  • GT8
  • HMAT1
  • HMT1
  • KCR1
  • MPDU1
  • NOT
  • NOT56L
  • RFT1
Homo sapiens (human)
Nitric oxide stimulates guanylate cyclase
  • GUC1A2
  • GUC1A3
  • GUC1B3
  • GUCSA2
  • GUCSA3
  • GUCSB3
  • GUCY1A1
  • GUCY1A2
  • GUCY1A3
  • GUCY1B1
  • GUCY1B2
  • GUCY1B3
  • NOS1
  • NOS2
  • NOS2A
  • NOS3
Homo sapiens (human)
Synthesis of 12-eicosatetraenoic acid derivatives
  • 12LO
  • ALOX12
  • ALOX12B
  • ALOX15
  • ALOXE3
  • GPX1
  • GPX2
  • GPX4
  • LOG12
  • LOG15
Homo sapiens (human)
Signaling by Type 1 Insulin-like Growth Factor 1 Receptor (IGF1R)
  • CILP
  • IBP1
  • IGF1
  • IGF1R
  • IGF2
Homo sapiens (human)
Ubiquinol biosynthesis
  • ADCK3
  • ADCK4
  • C16orf49
  • C6orf210
  • CABC1
  • CL640
  • COQ2
  • COQ3
  • COQ4
  • COQ5
  • COQ6
  • COQ7
  • COQ8A
  • COQ8B
  • COQ9
  • DLP1
  • DPS1
  • PDSS1
  • PDSS2
  • TPRT
Homo sapiens (human)
Signaling by LRP5 mutants
  • DKK1
  • DKK2
  • DKK4
  • KREMEN
  • KREMEN1
  • KREMEN2
  • KRM1
  • KRM2
  • LR3
  • LRP5
  • LRP7
Homo sapiens (human)
Formation of xylulose-5-phosphate
  • AKR1A1
  • ALDR1
  • ALR
  • CRY
  • CRYL1
  • DCXR
  • SDR20C1
  • SORD
  • XYLB
Homo sapiens (human)
Receptor-type tyrosine-protein phosphatases
  • CXorf2
  • IL1R9
  • IL1RAPL1
  • IL1RAPL2
  • KIAA0654
  • KIAA0848
  • KIAA0897
  • KIAA0918
  • KIAA1230
  • KIAA1854
  • KIAA1910
  • LAR
  • LIP1
  • LRIG4
  • LRRC11
  • LRRC12
  • LRRC4B
  • NTRK3
  • OPHN4
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • PPFIBP1
  • PPFIBP2
  • PTPRD
  • PTPRF
  • PTPRS
  • SLITL1
  • SLITRK1
  • SLITRK2
  • SLITRK3
  • SLITRK4
  • SLITRK5
  • SLITRK6
  • TRKC
Homo sapiens (human)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • AGK
  • CPN1
  • CPN3
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPNE6
  • CPNE7
  • KIAA0636
  • MULK
Homo sapiens (human)
Role of ABL in ROBO-SLIT signaling
  • ABL
  • ABL1
  • ABL2
  • ABLL
  • ARG
  • CAP
  • CAP1
  • CAP2
  • CLASP1
  • CLASP2
  • DUTT1
  • JTK7
  • KIAA0622
  • KIAA0627
  • MAST1
  • ROBO1
  • SLIL3
  • SLIT2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024