GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1351 - 1375 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
MicroRNA (miRNA) biogenesis
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • ARA24
  • BCDIN3D
  • C22orf12
  • DGCR8
  • DGCRK6
  • DICER
  • DICER1
  • DROSHA
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • HERNA
  • KIAA0928
  • KIAA1291
  • KIAA1567
  • PACT
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PRKRA
  • RAN
  • RANBP21
  • RAX
  • RN3
  • RNASE3L
  • RNASEN
  • RPB7
  • TARBP2
  • TRBP
  • XPO5
Homo sapiens (human)
PLC-gamma1 signalling
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • PLC1
  • PLCG1
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Synthesis, secretion, and inactivation of Glucose-dependent Insulinotropic Polypeptide (GIP)
  • ADCP2
  • AN2
  • CD26
  • DPP4
  • FFAR1
  • GATA4
  • GIP
  • GPR119
  • GPR40
  • ISL1
  • KIAA0102
  • NEC1
  • PAX6
  • PCSK1
  • SEC11A
  • SEC11C
  • SEC11L1
  • SEC11L3
  • SPC12
  • SPC18
  • SPC21
  • SPC22
  • SPC25
  • SPCS1
  • SPCS2
  • SPCS3
  • SPCS4A
  • SPCS4C
Homo sapiens (human)
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production
  • DDX36
  • DDX9
  • DHX36
  • DHX9
  • IRF7
  • KIAA1488
  • LKP
  • LYT10
  • MLEL1
  • MYD88
  • NDH2
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • RELA
  • RHAU
Homo sapiens (human)
Defective SLCO1B3 causes hyperbilirubinemia, Rotor type (HBLRR)
  • LST2
  • OATP1B3
  • OATP8
  • SLC21A8
  • SLCO1B3
Homo sapiens (human)
Abacavir metabolism
  • ADAL
  • ADAL1
  • ADH1
  • ADH1A
  • NT5B
  • NT5C2
  • NT5CP
  • PCK1
  • PEPCK1
  • PNT5
Homo sapiens (human)
Defective CSF2RA causes SMDP4
  • COLEC4
  • COLEC5
  • COLEC7
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • IL3RB
  • IL5RB
  • PSAP
  • PSPD
  • SFTA3
  • SFTP1
  • SFTP2
  • SFTP3
  • SFTP4
  • SFTPA
  • SFTPA1
  • SFTPA1B
  • SFTPA2
  • SFTPA2B
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SFTPH
Homo sapiens (human)
Multifunctional anion exchangers
  • DRA
  • DTD
  • DTDST
  • PDS
  • SAT1
  • SLC26A1
  • SLC26A11
  • SLC26A2
  • SLC26A3
  • SLC26A4
  • SLC26A6
  • SLC26A7
  • SLC26A9
  • SLC5A12
  • SMCT2
  • SUT2
Homo sapiens (human)
Defective EXT1 causes exostoses 1, TRPS2 and CHDS
  • AGRIN
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
Homo sapiens (human)
Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT)
  • BC2
  • C13orf9
  • C14orf123
  • C20orf178
  • C6orf55
  • C9orf28
  • C9orf83
  • CFBP
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP5
  • CHMP6
  • CHMP7
  • DERP9
  • EAP20
  • EAP30
  • EAP45
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HBP
  • HCRP1
  • HGS
  • HRS
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NEDF
  • PML39
  • RPS27A
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • SKD1
  • SNF7DC2
  • SNF8
  • STAM
  • STAM1
  • STAM2
  • TSG101
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS25
  • VPS28
  • VPS36
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • VPS4
  • VPS42
  • VPS4A
  • VPS4B
  • VTA1
  • WBSCR24
Homo sapiens (human)
NOTCH4 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • APH1A
  • APH1B
  • DLL4
  • INT3
  • JAG1
  • JAGL1
  • KIAA0253
  • KUZ
  • MADM
  • NCSTN
  • NOTCH4
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • STM2
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
U12 Dependent Splicing
  • ASCC3L1
  • ASF
  • BRR2
  • C16orf33
  • C20orf14
  • C6orf151
  • CBP20
  • CBP80
  • COD
  • DDX23
  • DDX42
  • DIM1
  • EFTUD2
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • HELIC2
  • HM1
  • KIAA0017
  • KIAA0031
  • KIAA0788
  • KIAA1839
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NSEP1
  • PBSCF
  • PBSCG
  • PDCD7
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PRP8BP
  • PRPC8
  • PRPF6
  • PRPF8
  • RAP30
  • RAP74
  • RBM40
  • RNP
  • RNPC3
  • RPB7
  • SAP130
  • SAP14
  • SAP145
  • SAP155
  • SAP49
  • SF2
  • SF2P33
  • SF3B1
  • SF3B10
  • SF3B14
  • SF3B14A
  • SF3B2
  • SF3B3
  • SF3B4
  • SF3B5
  • SF3B6
  • SFP38
  • SFRS1
  • SFRS2
  • SFRS6
  • SFRS7
  • SNRNP200
  • SNRNP25
  • SNRNP35
  • SNRNP40
  • SNRNP48
  • SNRNP65
  • SNRP116
  • SNRPB
  • SNRPB1
  • SNRPD1
  • SNRPD2
  • SNRPD3
  • SNRPE
  • SNRPF
  • SNRPG
  • SRP55
  • SRSF1
  • SRSF2
  • SRSF6
  • SRSF7
  • TXNL4
  • TXNL4A
  • U1SNRNPBP
  • U2AF1-RS2
  • U2AF1L2
  • U2AF1RS2
  • URP
  • WDR57
  • YB1
  • YBX1
  • ZCRB1
  • ZMAT5
  • ZRSR2
Homo sapiens (human)
Signaling by NODAL
  • ACVR1B
  • ACVR1C
  • ACVR2
  • ACVR2A
  • ACVR2B
  • ACVRLK4
  • ALK4
  • ALK7
  • CER1
  • CER2
  • CFC1
  • CKTSF1B3
  • CRIPTO
  • CRIPTO-1
  • CRIPTO-3
  • CRIPTO3
  • DAND4
  • DAND5
  • DPC4
  • DRAP1
  • EBAF
  • ERK1
  • ERK2
  • FAST1
  • FAST2
  • FKHRL1
  • FOXH1
  • FOXO3
  • FOXO3A
  • FUR
  • FURIN
  • GDF1
  • GREM3
  • LEFTA
  • LEFTB
  • LEFTY1
  • LEFTY2
  • LEFTYA
  • LEFTYB
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • NODAL
  • PACE
  • PACE4
  • PCSK3
  • PCSK6
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SP1
  • TDGF1
  • TDGF1P3
  • TDGF2
  • TDGF3
  • TGFB4
Homo sapiens (human)
Amplification of signal from unattached kinetochores via a MAD2 inhibitory signal
  • AHCTF1
  • AIK2
  • AIM1
  • AIRK2
  • API4
  • APITD1
  • ARK2
  • AURKB
  • B9D2
  • BIRC5
  • BUB1
  • BUB1B
  • BUB1L
  • BUB3
  • BUBR1
  • C16orf56
  • C16orf60
  • C18orf24
  • C1orf155
  • C1orf48
  • C20orf172
  • C22orf18
  • C6orf139
  • CASC5
  • CCDC99
  • CDC20
  • CDCA1
  • CDCA8
  • CENPA
  • CENPC
  • CENPC1
  • CENPE
  • CENPF
  • CENPH
  • CENPI
  • CENPK
  • CENPL
  • CENPM
  • CENPN
  • CENPO
  • CENPP
  • CENPQ
  • CENPR
  • CENPS
  • CENPT
  • CENPU
  • CKAP5
  • CLASP1
  • CLASP2
  • CLIP1
  • CRM1
  • CYLN1
  • D3S1231E
  • DHC1
  • DLC1
  • DLC2
  • DNCH1
  • DNCI1
  • DNCI2
  • DNCIC1
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNCLI1
  • DNCLI2
  • DNECL
  • DSN1
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • ELYS
  • EOPA
  • ERCC6L
  • FAAP16
  • FAM33A
  • FSHPRH1
  • HDLC1
  • HEC
  • HEC1
  • IAP4
  • ICEN19
  • ICEN22
  • ICEN24
  • ICEN32
  • ICEN33
  • ICEN35
  • ICEN36
  • ICEN37
  • ICEN39
  • ICEN7
  • INCENP
  • ITGB3BP
  • KIAA0044
  • KIAA0097
  • KIAA0166
  • KIAA0197
  • KIAA0325
  • KIAA0622
  • KIAA0627
  • KIAA1361
  • KIAA1470
  • KIAA1570
  • KIAA1835
  • KIF18A
  • KIF2
  • KIF2A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KLIP1
  • KNL1
  • KNS2
  • KNSL6
  • KNTC1
  • KNTC2
  • LIC2
  • LIS1
  • LRPR1
  • MAD1
  • MAD1L1
  • MAD2
  • MAD2L1
  • MAD3L
  • MAP3K16
  • MAPRE1
  • MARKK
  • MAST1
  • MCM21R
  • MDCR
  • MDS
  • MHF1
  • MIS12
  • MIS13
  • MITAP1
  • MKSR2
  • MLF1IP
  • MPS1
  • NDC80
  • NDE1
  • NDEL1
  • NRIF3
  • NSL1
  • NUDC
  • NUDE
  • NUDEL
  • NUF2
  • NUF2R
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP133
  • NUP160
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP43
  • NUP75
  • NUP85
  • PAFAH1B1
  • PAFAHA
  • PANE1
  • PBIP1
  • PCNT1
  • PESCRG3
  • PICH
  • PLK
  • PLK1
  • PMF1
  • PPP1CC
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • RCC2
  • RPS27
  • RSN
  • SD
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SGO1
  • SGO2
  • SGOL1
  • SGOL2
  • SKA1
  • SKA2
  • SPBC24
  • SPBC25
  • SPC24
  • SPC25
  • SPDL1
  • SSK1
  • STK1
  • STK12
  • STK5
  • TAOK1
  • TD60
  • TMBS62
  • TXBP181
  • XPO1
  • ZW10
  • ZWILCH
  • ZWINT
Homo sapiens (human)
Signaling by plasma membrane FGFR1 fusions
  • BAG4
  • BFGFR
  • C8orf2
  • CEK
  • ERLIN2
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • SODD
  • SPFH2
Homo sapiens (human)
Entry of Influenza Virion into Host Cell via Endocytosis
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • HA
  • KIAA0034
  • M
  • NA
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Defective MPI causes CDG-1b
  • MPI
  • PMI1
Homo sapiens (human)
Atorvastatin ADME
  • ABCB1
  • ABCC2
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMRP
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • GNT1
  • LST1
  • LST2
  • MDR1
  • MRP2
  • OATP1B1
  • OATP1B3
  • OATP2
  • OATP8
  • OATPC
  • PGY1
  • PON
  • PON1
  • PON3
  • SLC21A6
  • SLC21A8
  • SLCO1B1
  • SLCO1B3
  • UGT1
  • UGT1A3
Homo sapiens (human)
Defective EXT2 causes exostoses 2
  • AGRIN
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
Homo sapiens (human)
Regulation of gene expression in endocrine-committed (NEUROG3+) progenitor cells
  • ATOH5
  • BHLHA3
  • BHLHA7
  • IA1
  • INSM1
  • NEUROD
  • NEUROD1
  • NEUROG3
  • NGN3
  • NKX2-2
  • NKX2.2
  • NKX2B
  • PAX4
Homo sapiens (human)
Sema3A PAK dependent Axon repulsion
  • CFL
  • CFL1
  • FES
  • FPS
  • FYN
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KIAA0463
  • KIAA1550
  • LIMK
  • LIMK1
  • NOV
  • NRP
  • NRP1
  • OCT
  • OPHN3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PLXN1
  • PLXN2
  • PLXN4
  • PLXNA1
  • PLXNA2
  • PLXNA3
  • PLXNA4
  • PLXNA4A
  • PLXNA4B
  • RAC1
  • SEMA3A
  • SEMAD
  • SEX
  • TC25
  • VEGF165R
Homo sapiens (human)
Replication of the SARS-CoV-2 genome
  • DDX5
  • G17P1
  • HELR
  • HLR1
  • RB1
  • VHL
  • ZCRB1
  • rep
Homo sapiens (human)
ASP-3026-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
CD163 mediating an anti-inflammatory response
  • ADAM17
  • CD163
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CSVP
  • FUR
  • FURIN
  • IFNB2
  • IL10
  • IL6
  • IRHOM2
  • M130
  • MAPK14
  • MXI2
  • MYH9
  • PACE
  • PCSK3
  • PLK2
  • RHBDF2
  • RHBDL5
  • RHBDL6
  • SAPK2A
  • SNK
  • TACE
Homo sapiens (human)
Beta-oxidation of very long chain fatty acids
  • ABCD1
  • ACAA
  • ACAA1
  • ACOT4
  • ACOT6
  • ACOT8
  • ACTEIII
  • ALD
  • C14orf42
  • DECR2
  • ECHD
  • EDH17B4
  • EHHADH
  • HSD17B4
  • PDCR
  • PTE1
  • PTE2B
  • PTEIB
  • PTHIO
  • SDR17C1
  • SDR8C1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024