GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1351 - 1375 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Regulation of NPAS4 gene transcription
  • CSEN
  • DREAM
  • GRL
  • KCHIP3
  • KCNIP3
  • NR3C1
  • NRSF
  • REST
  • SRF
  • XBR
Homo sapiens (human)
CTNNB1 S45 mutants aren't phosphorylated
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
Amine ligand-binding receptors
  • GPR102
  • GPR143
  • GPR57
  • GPR58
  • OA1
  • PNR
  • TA1
  • TA3
  • TA4
  • TA5
  • TAAR1
  • TAAR2
  • TAAR3
  • TAAR3P
  • TAAR5
  • TAAR6
  • TAAR8
  • TAAR9
  • TAR1
  • TAR3
  • TAR4
  • TAR5
  • TRAR1
  • TRAR3
  • TRAR4
  • TRAR5
Homo sapiens (human)
Tat-mediated HIV elongation arrest and recovery
  • C19orf17
  • CCNT1
  • CDC2L4
  • CDK9
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2S
  • KIAA1182
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SSRP1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • WHSC2
  • tat
Homo sapiens (human)
Histidine catabolism
  • AMDHD1
  • ATPGD1
  • C9orf41
  • CARNMT1
  • CARNS1
  • FTCD
  • HAL
  • HDC
  • HIS
  • HNMT
  • KIAA1394
  • UROC1
Homo sapiens (human)
mTORC1-mediated signalling
  • AKT1S1
  • C11orf59
  • C7orf59
  • EEF2K
  • EIF4B
  • EIF4E
  • EIF4EBP1
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GBL
  • HBXIP
  • KIAA1303
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LST8
  • MAP2K1IP1
  • MAPBPIP
  • MAPKSP1
  • MLST8
  • MTOR
  • PDRO
  • PRAS40
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RAPTOR
  • RHEB
  • RHEB2
  • ROBLD3
  • RPS6
  • RPS6KB1
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • STK14A
  • URLC11
  • XIP
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
MyD88:MAL(TIRAP) cascade initiated on plasma membrane
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • ECSIT
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • HMG1
  • HMGB1
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • IRAK3
  • IRAK4
  • KIAA0012
  • LY96
  • MAL
  • MAP3K1
  • MAPKKK1
  • MD2
  • MEKK
  • MEKK1
  • MRP14
  • MRP8
  • MYD88
  • RNF85
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • SIGIRR
  • SOCS1
  • SSI1
  • TIL4
  • TIP3
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • TRAF6
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
RET signaling
  • ARTN
  • BMK1
  • C20orf180
  • CDHF12
  • CDHR16
  • DOK1
  • DOK2
  • DOK4
  • DOK5
  • DOK5L
  • DOK6
  • ENIGMA
  • ERK5
  • EVN
  • FRS2
  • GAB1
  • GAB2
  • GDNF
  • GDNFRA
  • GDNFRB
  • GFRA1
  • GFRA2
  • GFRA3
  • GFRA4
  • GRB1
  • GRB10
  • GRB7
  • GRBIR
  • IRS2
  • KIAA0207
  • KIAA0474
  • KIAA0571
  • KIAA1650
  • MAPK7
  • NRTN
  • NSHC
  • PDLIM7
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKACA
  • PKCA
  • PLC1
  • PLCG1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKCA
  • PRKM7
  • PROSAP2
  • PSAP2
  • PSPN
  • PTC
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAP1GA1
  • RAP1GAP
  • RET
  • RETL1
  • RETL2
  • SHANK3
  • SHC
  • SHC1
  • SHC3
  • SHCA
  • SHCC
  • SHPTP2
  • SOS1
  • TRNR1
  • TRNR2
Homo sapiens (human)
Regulation of TP53 Activity through Methylation
  • ATM
  • BAT8
  • C5orf35
  • C6orf30
  • CDS1
  • CHEK2
  • CHK2
  • EHMT1
  • EHMT2
  • EP300
  • EUHMTASE1
  • G9A
  • GLP
  • HRMT1L5
  • IBP72
  • JBP1
  • JMY
  • KIAA0681
  • KIAA1876
  • KMT1C
  • KMT1D
  • KMT3C
  • KMT5A
  • L3MBT
  • L3MBTL
  • L3MBTL1
  • MDM2
  • MDM4
  • MDMX
  • NG36
  • P300
  • P53
  • PRMT5
  • PRSET7
  • RAD53
  • RPS27A
  • SET07
  • SET8
  • SETD8
  • SETD9
  • SKB1
  • SMYD2
  • TP53
  • TTC5
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Defective MUT causes MMAM
  • MMAA
  • MMUT
  • MUT
Homo sapiens (human)
Regulation of MITF-M-dependent genes involved in pigmentation
  • ACTB
  • ACTL6A
  • AKT2
  • ARID1A
  • ARID1B
  • BAF155
  • BAF170
  • BAF190A
  • BAF190B
  • BAF250
  • BAF250A
  • BAF250B
  • BAF45B
  • BAF45C
  • BAF45D
  • BAF47
  • BAF53
  • BAF53A
  • BAF57
  • BAF60A
  • BAF60B
  • BAF60C
  • BCL7A
  • BCL7B
  • BCL7C
  • BHLHB11
  • BRG1
  • BRM
  • C1orf4
  • CAS2
  • CERD4
  • CREST
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • D12S53E
  • DAN15
  • DCT
  • DPF1
  • DPF2
  • DPF3
  • GPR143
  • INI1
  • INO80K
  • KIAA0693
  • KIAA1235
  • LEF1
  • MART1
  • MLANA
  • MYH12
  • MYO5A
  • NEUD4
  • OA1
  • OSA1
  • OSA2
  • PMEL
  • PMEL17
  • RAB27
  • RAB27A
  • REQ
  • SILV
  • SMARCA2
  • SMARCA4
  • SMARCB1
  • SMARCC1
  • SMARCC2
  • SMARCD1
  • SMARCD2
  • SMARCD3
  • SMARCE1
  • SMARCF1
  • SNF2A
  • SNF2B
  • SNF2L2
  • SNF2L4
  • SNF5L1
  • SOX10
  • SS18
  • SS18L1
  • SSXT
  • SYT
  • TYR
  • TYRP
  • TYRP1
  • TYRP2
  • TYRRP
  • UBID4
  • USF
  • USF1
Homo sapiens (human)
Apoptosis induced DNA fragmentation
  • CAD
  • CASP3
  • CPP32
  • DFF1
  • DFF2
  • DFF40
  • DFF45
  • DFFA
  • DFFB
  • H1-0
  • H1-1
  • H1-2
  • H1-3
  • H1-4
  • H1-5
  • H1F0
  • H1F1
  • H1F2
  • H1F3
  • H1F4
  • H1F5
  • H1FV
  • HIST1H1A
  • HIST1H1B
  • HIST1H1C
  • HIST1H1D
  • HIST1H1E
  • HMG1
  • HMG2
  • HMGB1
  • HMGB2
  • KPNA1
  • KPNB1
  • NTF97
  • RCH2
Homo sapiens (human)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of keratinocytes
  • AML1
  • CATL2
  • CBFA2
  • CBFB
  • CIS3
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSL2
  • CTSO
  • CTSO2
  • CTSU
  • CTSV
  • PI13
  • RUNX1
  • SERPINB13
  • SOCS3
  • SOCS4
  • SOCS7
  • SSI3
Homo sapiens (human)
Modulation by Mtb of host immune system
  • B2M
  • CLEC13D
  • CLEC13DL
  • MRC1
  • MRC1L1
  • RPS27A
  • Rv2779c
  • TIL4
  • TLR2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • esaT6
  • esxA
  • mptpA
  • phoS1
  • pstS1
  • ptpA
Homo sapiens (human)
Blockage of phagosome acidification
  • ATP6V1H
  • mptpA
  • ptpA
Homo sapiens (human)
Cysteine formation from homocysteine
  • CBS
  • CTH
Homo sapiens (human)
Defective GCK causes maturity-onset diabetes of the young 2 (MODY2)
  • GCK
Homo sapiens (human)
Ligand-receptor interactions
  • BOC
  • CDO
  • CDON
  • DHH
  • GAS1
  • HHIP
  • HIP
  • IHH
  • PTCH
  • PTCH1
  • SHH
Homo sapiens (human)
Organic cation transport
  • AML1
  • BWR1A
  • BWSCR1A
  • CBFA2
  • EMTH
  • ETT
  • FLIPT1
  • HET
  • IMPT1
  • ITM
  • OCT1
  • OCT2
  • OCT3
  • OCT6
  • OCTN1
  • OCTN2
  • ORCTL2
  • RSC1A1
  • RUNX1
  • SLC22A1
  • SLC22A15
  • SLC22A16
  • SLC22A18
  • SLC22A1L
  • SLC22A2
  • SLC22A3
  • SLC22A4
  • SLC22A5
  • TSSC5
  • UT2H
Homo sapiens (human)
Defective CHST6 causes MCDC1
  • ACAN
  • AGC1
  • CHST6
  • CSPG1
  • FM
  • FMOD
  • KERA
  • LDC
  • LUM
  • MSK16
  • OGN
  • OIF
  • OMD
  • PRELP
  • SLRR2A
  • SLRR2B
  • SLRR2C
  • SLRR2D
  • SLRR2E
  • SLRR3A
Homo sapiens (human)
TWIK-related alkaline pH activated K+ channel (TALK)
  • KCNK16
  • KCNK17
  • TALK1
  • TALK2
  • TASK4
Homo sapiens (human)
Depolymerization of the Nuclear Lamina
  • C16orf69
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CNEP1R1
  • CTDNEP1
  • DULLARD
  • EDMD
  • EMD
  • KIAA0188
  • KIAA0249
  • LEMD2
  • LEMD3
  • LIPN3L
  • LMN2
  • LMNB
  • LMNB1
  • LPIN1
  • LPIN2
  • LPIN3
  • MAN1
  • P34CDC2
  • PKCA
  • PKCB
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • STA
  • TMEM188
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PG
  • AGPAT7
  • AYTL2
  • AYTL3
  • C20orf155
  • CLEC13C
  • CLS1
  • CPLA2
  • CRLS1
  • FAM34A
  • KIAA0205
  • LPCAT1
  • LPCAT4
  • LPEAT2
  • LPGAT1
  • PFAAP3
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G3
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4D
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PPLA2
  • RASF-A
  • SPLASH
Homo sapiens (human)
Transcriptional and post-translational regulation of MITF-M expression and activity
  • AIMP1
  • AIMP2
  • AIMP3
  • ALX3
  • BHLHE32
  • BHLHE33
  • BHLHE34
  • BHLHE35
  • BRN2
  • CBP
  • CREBBP
  • CRM1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DARS
  • DARS1
  • EEF1E1
  • EMAP2
  • EPRS
  • EPRS1
  • ERK1
  • ERK2
  • FOXD3
  • GLNS
  • GSK3B
  • HFH2
  • HINT
  • HINT1
  • HUP2
  • IARS
  • IARS1
  • JTV1
  • KARS
  • KARS1
  • KIAA0070
  • KIAA1352
  • KIT
  • LARS
  • LARS1
  • LEF1
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPKAPK1A
  • MARS
  • MARS1
  • MC1R
  • MC3R
  • MC4R
  • MC5R
  • MITF
  • MSHR
  • OCT7
  • OTF7
  • P18
  • PARS
  • PAX3
  • PKCI1
  • POMC
  • POU3F2
  • PRKCNH1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • QARS
  • QARS1
  • QPRS
  • RARS
  • RARS1
  • RPS6KA1
  • RSK1
  • SCFR
  • SCYE1
  • SOX10
  • SOX2
  • TCFEC
  • TFE3
  • TFEB
  • TFEC
  • TFECL
  • WNT3A
  • XPO1
Homo sapiens (human)
Activation of NIMA Kinases NEK9, NEK6, NEK7
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • KIAA1995
  • NEK6
  • NEK7
  • NEK8
  • NEK9
  • NERCC
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024