GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1351 - 1375 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Biosynthesis of maresin-like SPMs
  • CYP1A2
  • CYP2C10
  • CYP2C8
  • CYP2C9
  • CYP2D6
  • CYP2DL1
  • CYP2E
  • CYP2E1
  • CYP3A3
  • CYP3A4
Homo sapiens (human)
Aromatic amines can be N-hydroxylated or N-dealkylated by CYP1A2
  • CYP1A2
Homo sapiens (human)
Defective CYP1B1 causes Glaucoma
  • CYP1B1
Homo sapiens (human)
Fatty acids
  • CYP2A13
  • CYP2A7
  • CYP2B6
  • CYP2D6
  • CYP2DL1
  • CYP2F1
  • CYP2J2
  • CYP4A11
  • CYP4A2
  • CYP4A22
  • CYP4B1
  • CYP4F11
  • CYP4F12
  • CYP4F2
  • CYP4F22
  • CYP4F3
  • CYP4F8
  • LTB4H
Homo sapiens (human)
Miscellaneous substrates
  • CYP2D6
  • CYP2DL1
  • CYP2S1
  • CYP2U1
  • CYP2W1
  • CYP3A43
  • CYP4A11
  • CYP4A2
  • CYP4A22
  • CYP4B1
  • CYP4F11
  • CYP4F2
  • CYP4F22
  • CYP4F3
  • LTB4H
Homo sapiens (human)
Cross-presentation of particulate exogenous antigens (phagosomes)
  • CD36
  • CYBA
  • CYBB
  • GP3B
  • GP4
  • ITGAV
  • ITGB5
  • MSK8
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NOX2
  • NOXA2
  • NOXO2
  • P67PHOX
  • SH3PXD1A
  • SH3PXD4
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
RHO GTPases Activate NADPH Oxidases
  • CAGA
  • CAGB
  • CFAG
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CYBA
  • CYBB
  • ERK1
  • ERK2
  • MAPK1
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPK3
  • MOX1
  • MOX2
  • MRP14
  • MRP8
  • MXI2
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NOH1
  • NOX1
  • NOX2
  • NOX3
  • NOXA1
  • NOXA2
  • NOXO1
  • NOXO2
  • P41NOX
  • P51NOX
  • P67PHOX
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PIN1
  • PKC2
  • PKCA
  • PKCB
  • PKCD
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PRKCD
  • PRKCZ
  • PRKM1
  • PRKM11
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RAC1
  • RAC2
  • S100A8
  • S100A9
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SH3PXD1A
  • SH3PXD4
  • SH3PXD5
  • TC25
  • VPS15
  • VPS34
Homo sapiens (human)
ROS and RNS production in phagocytes
  • ATP6A1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6E1
  • ATP6E2
  • ATP6EL2
  • ATP6F
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6G2
  • ATP6G3
  • ATP6H
  • ATP6J
  • ATP6L
  • ATP6M
  • ATP6N1
  • ATP6N1A
  • ATP6N1B
  • ATP6N1C
  • ATP6N2
  • ATP6S14
  • ATP6V0A1
  • ATP6V0A2
  • ATP6V0A3
  • ATP6V0A4
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V0E2L
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1D
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1EL2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • ATPL
  • C7orf32
  • CYBA
  • CYBB
  • HVCN1
  • LSH
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NG38
  • NOS1
  • NOS2
  • NOS2A
  • NOS3
  • NOX2
  • NOXA2
  • NOXO2
  • NRAMP
  • NRAMP1
  • P67PHOX
  • RAC2
  • SH3PXD1A
  • SH3PXD4
  • SLC11A1
  • TCIRG1
  • VATB
  • VATC
  • VATD
  • VATF
  • VPATPD
  • VPP1
  • VPP2
  • VPP3
  • VSOP
Homo sapiens (human)
WNT5:FZD7-mediated leishmania damping
  • CYBA
  • DVL1
  • DVL2
  • DVL3
  • FZD7
  • JNK1
  • JUN
  • KIAA0208
  • MAPK8
  • MOX1
  • NOH1
  • NOX1
  • NOXA1
  • NOXO1
  • P41NOX
  • P51NOX
  • PRKM8
  • RAC1
  • SAPK1
  • SAPK1C
  • SH3PXD5
  • TC25
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
Vitamin C (ascorbate) metabolism
  • CYB5
  • CYB5A
  • CYB5R3
  • DIA1
  • GLUT1
  • GLUT3
  • GSTO1
  • GSTO2
  • GSTTLP28
  • KIAA0238
  • NBTL1
  • SLC23A1
  • SLC23A2
  • SLC2A1
  • SLC2A3
  • SVCT1
  • SVCT2
  • YSPL2
  • YSPL3
Homo sapiens (human)
Interleukin receptor SHC signaling
  • CSF2
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • GAB2
  • GMCSF
  • GRB1
  • HCP
  • IL15RB
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • IL3
  • IL3R
  • IL3RA
  • IL3RB
  • IL5
  • IL5R
  • IL5RA
  • IL5RB
  • INPP5D
  • INPPL1
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • JAK3
  • KIAA0571
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PTP1C
  • PTPN6
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SHIP
  • SHIP1
  • SHIP2
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Defective CSF2RB causes SMDP5
  • COLEC4
  • COLEC5
  • COLEC7
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • IL3RB
  • IL5RB
  • PSAP
  • PSPD
  • SFTA3
  • SFTP1
  • SFTP2
  • SFTP3
  • SFTP4
  • SFTPA
  • SFTPA1
  • SFTPA1B
  • SFTPA2
  • SFTPA2B
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SFTPH
Homo sapiens (human)
Defective CSF2RA causes SMDP4
  • COLEC4
  • COLEC5
  • COLEC7
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • IL3RB
  • IL5RB
  • PSAP
  • PSPD
  • SFTA3
  • SFTP1
  • SFTP2
  • SFTP3
  • SFTP4
  • SFTPA
  • SFTPA1
  • SFTPA1B
  • SFTPA2
  • SFTPA2B
  • SFTPB
  • SFTPC
  • SFTPD
  • SFTPH
Homo sapiens (human)
STAT3 nuclear events downstream of ALK signaling
  • AIM
  • APRF
  • B7H1
  • BHLHE78
  • BLIMP1
  • CD274
  • CXXC9
  • DNMT
  • DNMT1
  • EP300
  • HDAC1
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HIF1A
  • IL2RG
  • MOP1
  • P300
  • PASD8
  • PDCD1L1
  • PDCD1LG1
  • PDL1
  • PRDM1
  • RPD3L1
  • SIN3A
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Interleukin-15 signaling
  • APRF
  • ASH
  • GAB2
  • GRB2
  • IL15
  • IL15RA
  • IL15RB
  • IL2RB
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK3
  • KIAA0571
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SOS1
  • SOS2
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
Homo sapiens (human)
Interleukin-2 signaling
  • FAK2
  • IL15RB
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK3
  • LCK
  • PTK2B
  • PYK2
  • RAFTK
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • SYK
Homo sapiens (human)
Interleukin-21 signaling
  • APRF
  • IL21
  • IL21R
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK3
  • NILR
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
Homo sapiens (human)
Interleukin-9 signaling
  • APRF
  • IL2RG
  • IL9
  • IL9R
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK3
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
Homo sapiens (human)
NADPH regeneration
  • ACO1
  • IDH1
  • IREB1
  • PICD
Homo sapiens (human)
Activation of RAC1
  • DUTT1
  • GRB4
  • KIAA1142
  • KIAA1264
  • NCK
  • NCK1
  • NCK2
  • OPHN3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PAK4
  • PAK5
  • PAK6
  • PAK7
  • RAC1
  • ROBO1
  • SLIL3
  • SLIT2
  • SOS1
  • SOS2
  • TC25
Homo sapiens (human)
Regulation of cortical dendrite branching
  • DUTT1
  • GRB4
  • KIAA0813
  • KIAA1568
  • MEGF4
  • NCK2
  • ROBO1
  • ROBO2
  • SLIL1
  • SLIT1
Homo sapiens (human)
Amino acids regulate mTORC1
  • ATP6A1
  • ATP6B1
  • ATP6B2
  • ATP6C
  • ATP6D
  • ATP6E
  • ATP6E1
  • ATP6E2
  • ATP6EL2
  • ATP6F
  • ATP6G
  • ATP6G1
  • ATP6G2
  • ATP6G3
  • ATP6H
  • ATP6J
  • ATP6L
  • ATP6M
  • ATP6N1C
  • ATP6S14
  • ATP6V0A3
  • ATP6V0B
  • ATP6V0C
  • ATP6V0D1
  • ATP6V0D2
  • ATP6V0E
  • ATP6V0E1
  • ATP6V0E2
  • ATP6V0E2L
  • ATP6V1A
  • ATP6V1A1
  • ATP6V1B1
  • ATP6V1B2
  • ATP6V1C1
  • ATP6V1C2
  • ATP6V1D
  • ATP6V1E1
  • ATP6V1E2
  • ATP6V1EL2
  • ATP6V1F
  • ATP6V1G1
  • ATP6V1G2
  • ATP6V1G3
  • ATP6V1H
  • ATPL
  • BHD
  • BMT2
  • BOG25
  • C11orf59
  • C12orf66
  • C16orf21
  • C16orf35
  • C1orf84
  • C7orf32
  • C7orf59
  • C7orf60
  • CASTOR1
  • CASTOR2
  • CGTHBA
  • D3S1231E
  • DEPDC5
  • EHB10
  • FLCN
  • FNIP1
  • FNIP2
  • FNIPL
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GATSL1
  • GATSL2
  • GATSL3
  • GBL
  • HBXIP
  • Hi95
  • ITFG2
  • KIAA0467
  • KIAA0645
  • KIAA1303
  • KIAA1450
  • KIAA1923
  • KIAA1961
  • KICS2
  • KPTN
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LST8
  • MAP2K1IP1
  • MAPBPIP
  • MAPKSP1
  • MAPO1
  • MARE
  • MIOS
  • MLST8
  • MTOR
  • NG38
  • NPRL2
  • NPRL3
  • PA26
  • PDRO
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RAPTOR
  • RHEB
  • RHEB2
  • ROBLD3
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SAMTOR
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEH1
  • SEH1L
  • SESN1
  • SESN2
  • SEST1
  • SEST2
  • SH3BP4
  • SLC38A9
  • SZT2
  • TCIRG1
  • TTP
  • TUSC4
  • URLC11
  • VATB
  • VATC
  • VATD
  • VATF
  • VPATPD
  • VPP2
  • VPP3
  • WDR24
  • WDR59
  • XIP
Homo sapiens (human)
Carboxyterminal post-translational modifications of tubulin
  • AGBL1
  • AGBL2
  • AGBL3
  • AGBL4
  • AGBL5
  • AGTPBP1
  • C18orf10
  • C19orf20
  • C20orf125
  • C22orf7
  • C6orf104
  • C9orf20
  • CCDC23
  • CCP1
  • CCP2
  • CCP3
  • CCP4
  • CCP5
  • CCP6
  • CSTPP2
  • KIAA0153
  • KIAA0173
  • KIAA0998
  • KIAA1035
  • KIAA1036
  • LRRC49
  • NICN1
  • NNA1
  • STAMP
  • SVBP
  • TPGS1
  • TPGS2
  • TTL
  • TTL.6
  • TTLL1
  • TTLL10
  • TTLL11
  • TTLL12
  • TTLL13
  • TTLL13P
  • TTLL2
  • TTLL3
  • TTLL4
  • TTLL5
  • TTLL6
  • TTLL7
  • TTLL8
  • TTLL9
  • TUBA1A
  • TUBA1B
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA3E
  • TUBA6
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
  • TUBB8
  • TUBB8B
  • VASH
  • VASH1
  • VASH2
  • VASHL
Homo sapiens (human)
Hydrolysis of LPC
  • CPLA2
  • GDE5
  • GPCPD1
  • KIAA1434
  • LYPLA3
  • PLA2G15
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4C
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLBD1
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PS
  • AGPAT7
  • AYTL3
  • CLEC13C
  • CPLA2
  • HRASLS3
  • HREV107
  • KIAA1451
  • KIAA1534
  • LPCAT3
  • LPCAT4
  • LPEAT2
  • MBOAT1
  • MBOAT5
  • NMD
  • OACT1
  • OACT5
  • OBPH1
  • ORP10
  • ORP5
  • ORP8
  • OSBP10
  • OSBP9
  • OSBPL10
  • OSBPL5
  • OSBPL8
  • PLA1A
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PLAAT3
  • PPLA2
  • PSPLA1
  • RASF-A
  • SPLASH
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024