GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1376 - 1400 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Endosomal/Vacuolar pathway
  • B2M
  • CATL2
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSL2
  • CTSS
  • CTSU
  • CTSV
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • LNPEP
  • OTASE
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of electrophilic ω-3 PUFA oxo-derivatives
  • ALOX5
  • COX2
  • LOG5
  • PTGS2
Homo sapiens (human)
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • ADAM17
  • APH1A
  • APH1B
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHB33
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • BHLHE39
  • CBP
  • CCNC
  • CDK8
  • CG1
  • CHF1
  • CHF2
  • CREBBP
  • CSVP
  • CTG26
  • CUL1
  • CXorf6
  • DIP1
  • DLL1
  • DLL4
  • EMC19
  • EP300
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRL
  • HDAC1
  • HDAC10
  • HDAC11
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HDAC4
  • HDAC5
  • HDAC6
  • HDAC7
  • HDAC7A
  • HDAC7B
  • HDAC8
  • HDAC9
  • HDACL1
  • HDRP
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HES1
  • HES5
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HEYL
  • HL
  • HRT1
  • HRT2
  • HRT3
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • IRA1
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA0253
  • KIAA0288
  • KIAA0600
  • KIAA0744
  • KIAA0901
  • KIAA1047
  • KIAA1323
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • KUZ
  • MADM
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MIB1
  • MIB2
  • MITR
  • MYC
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NCSTN
  • NEURL
  • NEURL1
  • NEURL1A
  • NEURL1B
  • NEURL3
  • NOTCH1
  • OCP2
  • P300
  • PCAF
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RBX1
  • RNF67
  • RNF75
  • ROC1
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SKD
  • SKIIP
  • SKIP
  • SKP1
  • SKP1A
  • SNW1
  • STM2
  • TACE
  • TAN1
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TCEB1L
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZZANK1
  • ZZANK2
Homo sapiens (human)
Vitamin D (calciferol) metabolism
  • ARH
  • CUBN
  • CYP1ALPHA
  • CYP24
  • CYP24A1
  • CYP27B
  • CYP27B1
  • CYP2R1
  • GC
  • IFCR
  • LDLRAP1
  • LGMN
  • LRP2
  • NR1I1
  • PIAS4
  • PIASG
  • PRSC1
  • SMT3B
  • SMT3H2
  • SUMO2
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • VDR
Homo sapiens (human)
RAF-independent MAPK1/3 activation
  • C11orf81
  • CL100
  • DUSP1
  • DUSP10
  • DUSP16
  • DUSP2
  • DUSP4
  • DUSP5
  • DUSP6
  • DUSP7
  • DUSP8
  • DUSP9
  • ERK1
  • ERK2
  • KIAA1700
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MKP1
  • MKP2
  • MKP3
  • MKP4
  • MKP5
  • MKP7
  • PAC1
  • PEA15
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTPN10
  • PYST1
  • PYST2
  • VH1
  • VH2
  • VH3
  • VH5
Homo sapiens (human)
ABO blood group biosynthesis
  • ABO
  • FUT1
  • FUT2
  • H
  • HSC
  • SEC2
Homo sapiens (human)
Defective PAPSS2 causes SEMD-PA
  • ATPSK2
  • PAPSS2
Homo sapiens (human)
Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C7orf76
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • DSS1
  • E2EPF
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • KIAA0072
  • KIAA0107
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSMF1
  • RING10
  • RING12
  • RPS27A
  • SEM1
  • SFT
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • TSG24
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
EPHA-mediated growth cone collapse
  • ARH12
  • ARHA
  • FYN
  • JTK8
  • KIAA0619
  • KIAA0866
  • KIAA2034
  • LYN
  • MLC2
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYRL2
  • NGEF
  • RHO12
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Axonal growth inhibition (RHOA activation)
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGDIA
  • DBL
  • GDIA1
  • GMA
  • KIAA0886
  • LERN1
  • LINGO1
  • LRRN6A
  • MAG
  • MCF2
  • NGFR
  • NOGO
  • OMG
  • OMGP
  • RHO12
  • RHOA
  • RTN4
  • TNFRSF16
Homo sapiens (human)
Pre-NOTCH Processing in the Endoplasmic Reticulum
  • C3orf9
  • CLP46
  • FUT12
  • INT3
  • KIAA0180
  • KTELC1
  • MDSRP
  • NOTCH1
  • NOTCH2
  • NOTCH3
  • NOTCH4
  • POFUT1
  • POGLUT1
  • TAN1
Homo sapiens (human)
linifanib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
Defective SLC6A3 causes Parkinsonism-dystonia infantile (PKDYS)
  • DAT1
  • SLC6A3
Homo sapiens (human)
Hereditary fructose intolerance
  • ALDB
  • ALDOB
Homo sapiens (human)
CTNNB1 S33 mutants aren't phosphorylated
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
Activation of NF-kappaB in B cells
  • BCL10
  • BTRC
  • BTRCP
  • BTRCP2
  • C7orf76
  • CARD11
  • CARMA1
  • CHUK
  • CIPER
  • CLAP
  • CUL1
  • DSS1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBW1B
  • FBXW11
  • FBXW1A
  • FBXW1B
  • FIP3
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • IKBA
  • IKBB
  • IKBE
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA0696
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MAD3
  • MALT1
  • MAP3K7
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MLT
  • MOV34L
  • MSS1
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NFKBIE
  • NU
  • OCP2
  • PFAAP4
  • PKCB
  • POH1
  • PRKCB
  • PRKCB1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • REL
  • RELA
  • RING10
  • RING12
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • SUG2
  • TAK1
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TCF16
  • TRAP2
  • TRIP9
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
mRNA Capping
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP1A
  • CAP35
  • CBP20
  • CBP80
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • ERCC2
  • ERCC3
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA0398
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RNF66
  • RNGTT
  • RNMT
  • RPB7
  • SPT5
  • SPT5H
  • STK1
  • SUPT5H
  • TTDA
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
Metabolism of Angiotensinogen to Angiotensins
  • ACE
  • ACE2
  • AGT
  • ANPEP
  • APN
  • ATP6AP2
  • ATP6IP2
  • CAPER
  • CD13
  • CES1
  • CES2
  • CGL2
  • CMA1
  • CPA3
  • CPB
  • CPB1
  • CPB2
  • CPSD
  • CTSD
  • CTSG
  • CTSGL2
  • CTSZ
  • CYH
  • CYM
  • DCP
  • DCP1
  • ELDF10
  • ENPEP
  • EPN
  • GZMH
  • MME
  • PCPB
  • PEPN
  • REN
  • SERPINA8
  • SES1
Homo sapiens (human)
Defective SLC26A4 causes Pendred syndrome (PDS)
  • PDS
  • SLC26A4
Homo sapiens (human)
Interleukin-2 signaling
  • FAK2
  • IL15RB
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK3
  • LCK
  • PTK2B
  • PYK2
  • RAFTK
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • SYK
Homo sapiens (human)
Defective SLC6A18 may confer susceptibility to iminoglycinuria and/or hyperglycinuria
  • B0AT3
  • SLC6A18
  • XTRP2
Homo sapiens (human)
Translation of respiratory syncytial virus mRNAs
  • 1B
  • 1C
  • F
  • L
  • M
  • M2-1
  • M2-2
  • N
  • NS1
  • NS2
  • P
Homo sapiens (human)
Oleoyl-phe metabolism
  • PM20D1
Homo sapiens (human)
Response of EIF2AK4 (GCN2) to amino acid deficiency
  • ASNS
  • ATF2
  • ATF3
  • ATF4
  • BBC1
  • C20orf97
  • CCG2
  • CEBPB
  • CEBPG
  • CHOP
  • CHOP10
  • CREB2
  • CREBP1
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DDIT3
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF2A
  • EIF2AK4
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • FAU
  • FTE1
  • GADD153
  • GCN1
  • GCN1L1
  • GCN2
  • IMPACT
  • KIAA0219
  • KIAA1338
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • NIPK
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SKIP3
  • SURF-3
  • SURF3
  • TCF5
  • TRB3
  • TRIB3
  • TS11
  • TXREB
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Interleukin-37 signaling
  • APRF
  • BDP1
  • CASP1
  • FIL1Z
  • HCP
  • IL18BP
  • IL18R1
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IL1F7
  • IL1H4
  • IL1RP1
  • IL1RRP
  • IL37
  • KIAA1471
  • MADH3
  • NAK
  • PEZ
  • PNP1
  • PTP1C
  • PTP1E
  • PTP2C
  • PTPD2
  • PTPL1
  • PTPN11
  • PTPN12
  • PTPN13
  • PTPN14
  • PTPN18
  • PTPN2
  • PTPN20
  • PTPN20A
  • PTPN20B
  • PTPN23
  • PTPN4
  • PTPN5
  • PTPN6
  • PTPN7
  • PTPN9
  • PTPT
  • SHPTP2
  • SIGIRR
  • SMAD3
  • STAT3
  • TBK1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024