GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1401 - 1425 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Amplification of signal from unattached kinetochores via a MAD2 inhibitory signal
  • AHCTF1
  • AIK2
  • AIM1
  • AIRK2
  • API4
  • APITD1
  • ARK2
  • AURKB
  • B9D2
  • BIRC5
  • BUB1
  • BUB1B
  • BUB1L
  • BUB3
  • BUBR1
  • C16orf56
  • C16orf60
  • C18orf24
  • C1orf155
  • C1orf48
  • C20orf172
  • C22orf18
  • C6orf139
  • CASC5
  • CCDC99
  • CDC20
  • CDCA1
  • CDCA8
  • CENPA
  • CENPC
  • CENPC1
  • CENPE
  • CENPF
  • CENPH
  • CENPI
  • CENPK
  • CENPL
  • CENPM
  • CENPN
  • CENPO
  • CENPP
  • CENPQ
  • CENPR
  • CENPS
  • CENPT
  • CENPU
  • CKAP5
  • CLASP1
  • CLASP2
  • CLIP1
  • CRM1
  • CYLN1
  • D3S1231E
  • DHC1
  • DLC1
  • DLC2
  • DNCH1
  • DNCI1
  • DNCI2
  • DNCIC1
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNCLI1
  • DNCLI2
  • DNECL
  • DSN1
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • ELYS
  • EOPA
  • ERCC6L
  • FAAP16
  • FAM33A
  • FSHPRH1
  • HDLC1
  • HEC
  • HEC1
  • IAP4
  • ICEN19
  • ICEN22
  • ICEN24
  • ICEN32
  • ICEN33
  • ICEN35
  • ICEN36
  • ICEN37
  • ICEN39
  • ICEN7
  • INCENP
  • ITGB3BP
  • KIAA0044
  • KIAA0097
  • KIAA0166
  • KIAA0197
  • KIAA0325
  • KIAA0622
  • KIAA0627
  • KIAA1361
  • KIAA1470
  • KIAA1570
  • KIAA1835
  • KIF18A
  • KIF2
  • KIF2A
  • KIF2B
  • KIF2C
  • KLIP1
  • KNL1
  • KNS2
  • KNSL6
  • KNTC1
  • KNTC2
  • LIC2
  • LIS1
  • LRPR1
  • MAD1
  • MAD1L1
  • MAD2
  • MAD2L1
  • MAD3L
  • MAP3K16
  • MAPRE1
  • MARKK
  • MAST1
  • MCM21R
  • MDCR
  • MDS
  • MHF1
  • MIS12
  • MIS13
  • MITAP1
  • MKSR2
  • MLF1IP
  • MPS1
  • NDC80
  • NDE1
  • NDEL1
  • NRIF3
  • NSL1
  • NUDC
  • NUDE
  • NUDEL
  • NUF2
  • NUF2R
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP133
  • NUP160
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP43
  • NUP75
  • NUP85
  • PAFAH1B1
  • PAFAHA
  • PANE1
  • PBIP1
  • PCNT1
  • PESCRG3
  • PICH
  • PLK
  • PLK1
  • PMF1
  • PPP1CC
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • RCC2
  • RPS27
  • RSN
  • SD
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SGO1
  • SGO2
  • SGOL1
  • SGOL2
  • SKA1
  • SKA2
  • SPBC24
  • SPBC25
  • SPC24
  • SPC25
  • SPDL1
  • SSK1
  • STK1
  • STK12
  • STK5
  • TAOK1
  • TD60
  • TMBS62
  • TXBP181
  • XPO1
  • ZW10
  • ZWILCH
  • ZWINT
Homo sapiens (human)
Signaling by plasma membrane FGFR1 fusions
  • BAG4
  • BFGFR
  • C8orf2
  • CEK
  • ERLIN2
  • FGFBR
  • FGFR1
  • FLG
  • FLT2
  • HBGFR
  • SODD
  • SPFH2
Homo sapiens (human)
Entry of Influenza Virion into Host Cell via Endocytosis
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • HA
  • KIAA0034
  • M
  • NA
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Defective MPI causes CDG-1b
  • MPI
  • PMI1
Homo sapiens (human)
Atorvastatin ADME
  • ABCB1
  • ABCC2
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMRP
  • CYP3A3
  • CYP3A4
  • GNT1
  • LST1
  • LST2
  • MDR1
  • MRP2
  • OATP1B1
  • OATP1B3
  • OATP2
  • OATP8
  • OATPC
  • PGY1
  • PON
  • PON1
  • PON3
  • SLC21A6
  • SLC21A8
  • SLCO1B1
  • SLCO1B3
  • UGT1
  • UGT1A3
Homo sapiens (human)
Defective EXT2 causes exostoses 2
  • AGRIN
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HSPG1
  • HSPG2
  • KIAA0468
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
Homo sapiens (human)
Regulation of gene expression in endocrine-committed (NEUROG3+) progenitor cells
  • ATOH5
  • BHLHA3
  • BHLHA7
  • IA1
  • INSM1
  • NEUROD
  • NEUROD1
  • NEUROG3
  • NGN3
  • NKX2-2
  • NKX2.2
  • NKX2B
  • PAX4
Homo sapiens (human)
Sema3A PAK dependent Axon repulsion
  • CFL
  • CFL1
  • FES
  • FPS
  • FYN
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KIAA0463
  • KIAA1550
  • LIMK
  • LIMK1
  • NOV
  • NRP
  • NRP1
  • OCT
  • OPHN3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PLXN1
  • PLXN2
  • PLXN4
  • PLXNA1
  • PLXNA2
  • PLXNA3
  • PLXNA4
  • PLXNA4A
  • PLXNA4B
  • RAC1
  • SEMA3A
  • SEMAD
  • SEX
  • TC25
  • VEGF165R
Homo sapiens (human)
Replication of the SARS-CoV-2 genome
  • DDX5
  • G17P1
  • HELR
  • HLR1
  • RB1
  • VHL
  • ZCRB1
  • rep
Homo sapiens (human)
ASP-3026-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
CD163 mediating an anti-inflammatory response
  • ADAM17
  • CD163
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CSVP
  • FUR
  • FURIN
  • IFNB2
  • IL10
  • IL6
  • IRHOM2
  • M130
  • MAPK14
  • MXI2
  • MYH9
  • PACE
  • PCSK3
  • PLK2
  • RHBDF2
  • RHBDL5
  • RHBDL6
  • SAPK2A
  • SNK
  • TACE
Homo sapiens (human)
Beta-oxidation of very long chain fatty acids
  • ABCD1
  • ACAA
  • ACAA1
  • ACOT4
  • ACOT6
  • ACOT8
  • ACTEIII
  • ALD
  • C14orf42
  • DECR2
  • ECHD
  • EDH17B4
  • EHHADH
  • HSD17B4
  • PDCR
  • PTE1
  • PTE2B
  • PTEIB
  • PTHIO
  • SDR17C1
  • SDR8C1
Homo sapiens (human)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSC1
  • ARSD
  • ARSE
  • ARSF
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH
  • ASAH1
  • ASAH2
  • ASM
  • CBG
  • CBGL1
  • CTSA
  • ELNR1
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA
  • GBA1
  • GBA2
  • GBA3
  • GC
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GLBA
  • GLUC
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • HNAC1
  • KIAA1001
  • KIAA1418
  • KIAA1605
  • M6PR
  • MPR46
  • MPRD
  • NANH
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • PPGB
  • PSAP
  • SAP1
  • SKNY
  • SMPD1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • SMPD4
  • SPG46
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
  • TSULF
Homo sapiens (human)
Endosomal/Vacuolar pathway
  • B2M
  • CATL2
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSL2
  • CTSS
  • CTSU
  • CTSV
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • LNPEP
  • OTASE
Homo sapiens (human)
Biosynthesis of electrophilic ω-3 PUFA oxo-derivatives
  • ALOX5
  • COX2
  • LOG5
  • PTGS2
Homo sapiens (human)
Cellular hexose transport
  • FGF21
  • GLUT1
  • GLUT10
  • GLUT11
  • GLUT12
  • GLUT14
  • GLUT2
  • GLUT3
  • GLUT4
  • GLUT6
  • GLUT7
  • GLUT8
  • GLUT9
  • GLUTX1
  • KIAA1919
  • MFSD4B
  • NAGLT1
  • NAGT
  • PCANAP6
  • PRST
  • RAG1AP1
  • SAAT1
  • SCP
  • SGLT1
  • SGLT2
  • SGLT3
  • SGLT4
  • SGLT5
  • SLC2A1
  • SLC2A10
  • SLC2A11
  • SLC2A12
  • SLC2A14
  • SLC2A2
  • SLC2A3
  • SLC2A4
  • SLC2A6
  • SLC2A7
  • SLC2A8
  • SLC2A9
  • SLC45A3
  • SLC50A1
  • SLC5A1
  • SLC5A10
  • SLC5A2
  • SLC5A4
  • SLC5A9
Homo sapiens (human)
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD+PEST Domain Mutants
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • ADAM17
  • APH1A
  • APH1B
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHB33
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • BHLHE39
  • CBP
  • CCNC
  • CDK8
  • CG1
  • CHF1
  • CHF2
  • CREBBP
  • CSVP
  • CTG26
  • CUL1
  • CXorf6
  • DIP1
  • DLL1
  • DLL4
  • EMC19
  • EP300
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRL
  • HDAC1
  • HDAC10
  • HDAC11
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HDAC4
  • HDAC5
  • HDAC6
  • HDAC7
  • HDAC7A
  • HDAC7B
  • HDAC8
  • HDAC9
  • HDACL1
  • HDRP
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HES1
  • HES5
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HEYL
  • HL
  • HRT1
  • HRT2
  • HRT3
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • IRA1
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA0253
  • KIAA0288
  • KIAA0600
  • KIAA0744
  • KIAA0901
  • KIAA1047
  • KIAA1323
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • KUZ
  • MADM
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MIB1
  • MIB2
  • MITR
  • MYC
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NCSTN
  • NEURL
  • NEURL1
  • NEURL1A
  • NEURL1B
  • NEURL3
  • NOTCH1
  • OCP2
  • P300
  • PCAF
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RBX1
  • RNF67
  • RNF75
  • ROC1
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SKD
  • SKIIP
  • SKIP
  • SKP1
  • SKP1A
  • SNW1
  • STM2
  • TACE
  • TAN1
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TCEB1L
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZZANK1
  • ZZANK2
Homo sapiens (human)
Vitamin D (calciferol) metabolism
  • ARH
  • CUBN
  • CYP1ALPHA
  • CYP24
  • CYP24A1
  • CYP27B
  • CYP27B1
  • CYP2R1
  • GC
  • IFCR
  • LDLRAP1
  • LGMN
  • LRP2
  • NR1I1
  • PIAS4
  • PIASG
  • PRSC1
  • SMT3B
  • SMT3H2
  • SUMO2
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • VDR
Homo sapiens (human)
RAF-independent MAPK1/3 activation
  • C11orf81
  • CL100
  • DUSP1
  • DUSP10
  • DUSP16
  • DUSP2
  • DUSP4
  • DUSP5
  • DUSP6
  • DUSP7
  • DUSP8
  • DUSP9
  • ERK1
  • ERK2
  • KIAA1700
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MKP1
  • MKP2
  • MKP3
  • MKP4
  • MKP5
  • MKP7
  • PAC1
  • PEA15
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTPN10
  • PYST1
  • PYST2
  • VH1
  • VH2
  • VH3
  • VH5
Homo sapiens (human)
ABO blood group biosynthesis
  • ABO
  • FUT1
  • FUT2
  • H
  • HSC
  • SEC2
Homo sapiens (human)
Defective PAPSS2 causes SEMD-PA
  • ATPSK2
  • PAPSS2
Homo sapiens (human)
Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C7orf76
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • DSS1
  • E2EPF
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • KIAA0072
  • KIAA0107
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSMF1
  • RING10
  • RING12
  • RPS27A
  • SEM1
  • SFT
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • TSG24
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
EPHA-mediated growth cone collapse
  • ARH12
  • ARHA
  • FYN
  • JTK8
  • KIAA0619
  • KIAA0866
  • KIAA2034
  • LYN
  • MLC2
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYRL2
  • NGEF
  • RHO12
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Axonal growth inhibition (RHOA activation)
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGDIA
  • DBL
  • GDIA1
  • GMA
  • KIAA0886
  • LERN1
  • LINGO1
  • LRRN6A
  • MAG
  • MCF2
  • NGFR
  • NOGO
  • OMG
  • OMGP
  • RHO12
  • RHOA
  • RTN4
  • TNFRSF16
Homo sapiens (human)
Pre-NOTCH Processing in the Endoplasmic Reticulum
  • C3orf9
  • CLP46
  • FUT12
  • INT3
  • KIAA0180
  • KTELC1
  • MDSRP
  • NOTCH1
  • NOTCH2
  • NOTCH3
  • NOTCH4
  • POFUT1
  • POGLUT1
  • TAN1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024