GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1751 - 1775 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha)
  • COCA2
  • EXO1
  • EXOI
  • GTBP
  • HEX1
  • KIAA0039
  • LIG1
  • MLH1
  • MSH2
  • MSH6
  • PCNA
  • PMS2
  • PMSL2
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
Homo sapiens (human)
Methionine salvage pathway
  • ADI1
  • APIP
  • ENOPH1
  • GOT1
  • MASA
  • MRDI
  • MRI1
  • MSAP
  • MTAP
  • MTCBP1
Homo sapiens (human)
Enhanced cleavage of VWF variant by ADAMTS13
  • ADAMTS13
  • C9orf8
  • F8VWF
  • VWF
Homo sapiens (human)
RHOBTB2 GTPase cycle
  • 99D8.1
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTN1
  • BAT1
  • CCT2
  • CCT6
  • CCT6A
  • CCT7
  • CCTB
  • CCTH
  • CCTZ
  • CDC37
  • CDC37A
  • CUL3
  • D0S117E
  • DBC2
  • DBN1
  • DCAF14
  • DDX39B
  • HNRNPC
  • HNRPC
  • HNRPG
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KIAA0389
  • KIAA0617
  • KIAA0717
  • MSI2
  • MYO6
  • NDR1
  • NIP7-1
  • PHIP
  • PTK9
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RHOBTB2
  • SFRS10
  • SRM160
  • SRRM1
  • STK38
  • TMOD3
  • TRA2B
  • TRP32
  • TWF1
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • UAP56
  • WDR11
Homo sapiens (human)
RHOC GTPase cycle
  • ABCD3
  • ABR
  • ACBD5
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARH12
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHC
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP18
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGAP7
  • ARHGDIA
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF17
  • ARHGEF25
  • ARHGEF28
  • ARHGEF40
  • ARHGEF5
  • BCR
  • BCR1
  • BND7
  • BRX
  • C1QBP
  • CAV
  • CAV1
  • CAVIN1
  • CCDC187
  • CDC42GAP
  • CIT
  • CRIK
  • CTNNG
  • D22S11
  • DAAM1
  • DBL
  • DEPDC1B
  • DIAP1
  • DIAP3
  • DIAPH1
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DLC2
  • DP3
  • EPB72
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • ERGIC53
  • ESA1
  • F5F8D
  • FHOD2
  • FHOD3
  • FLOT1
  • FLOT2
  • FMNL2
  • FMNL3
  • FRL2
  • GC1QBP
  • GDIA1
  • GEFT
  • GRAF
  • GRB1
  • GRF1
  • GRINCHGEF
  • GRIT
  • GRLF1
  • GT650
  • HABP1
  • HT31
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • JUP
  • KIAA0051
  • KIAA0204
  • KIAA0294
  • KIAA0337
  • KIAA0362
  • KIAA0380
  • KIAA0382
  • KIAA0619
  • KIAA0621
  • KIAA0666
  • KIAA0712
  • KIAA0949
  • KIAA1225
  • KIAA1415
  • KIAA1424
  • KIAA1478
  • KIAA1626
  • KIAA1688
  • KIAA1722
  • KIAA1723
  • KIAA1902
  • KIAA1996
  • KIAA1998
  • KIAA2014
  • LAP2
  • LARG
  • LBC
  • LBR
  • LMAN1
  • LOK
  • M17S1
  • MACO1
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MGCRACGAP
  • MUC18
  • MYO9B
  • MYR5
  • OPHN1
  • OPHN1L
  • OST
  • P190A
  • PAK1
  • PIK3R1
  • PKN
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PKNBETA
  • PMP70
  • PREX1
  • PRK1
  • PRK2
  • PRKCL1
  • PRKCL2
  • PTRF
  • PXMP1
  • RACGAP1
  • RGNEF
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOC
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RICS
  • ROCK1
  • ROCK2
  • RTKN
  • RTKN1
  • SF2P32
  • SLK
  • SOLO
  • STARD12
  • STARD13
  • STB2
  • STK10
  • STK2
  • STK21
  • STOM
  • STX5
  • STX5A
  • SYB3
  • TEM4
  • TFRC
  • TIM
  • TJP2
  • TMEM57
  • TMPO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV2
  • WBP3
  • X104
  • XTP8
  • ZO2
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Chylomicron clearance
  • APOB
  • APOE
  • ARH
  • HTGL
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPC
Homo sapiens (human)
Sensory processing of sound by inner hair cells of the cochlea
  • ACZ
  • AIE75
  • ATP2B1
  • BSN
  • C20orf145
  • C6orf32
  • C9orf75
  • CABP1
  • CABP2
  • CACH3
  • CACN4
  • CACNA1D
  • CACNA2D2
  • CACNB2
  • CACNL1A2
  • CACNLB2
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZB
  • CASK
  • CCHL1A2
  • CDH23
  • CIB2
  • CLIC5
  • CLN4
  • CMYA3
  • DAL1
  • DFNB25
  • DFNB31
  • DFNB36
  • DFNB59
  • DIFF48
  • DNAJC5
  • EPB41L1
  • EPB41L3
  • EPS8
  • EPS8L2
  • EPS8R2
  • ESPN
  • ESPNL
  • EZR
  • FAM65B
  • FER1L2
  • FSCN2
  • GRXCR1
  • GRXCR2
  • KCNMA
  • KCNMA1
  • KCNMB1
  • KCNQ4
  • KIAA0338
  • KIAA0386
  • KIAA0434
  • KIAA0558
  • KIAA0559
  • KIAA0987
  • KIAA1526
  • KIAA1774
  • KIAA1812
  • KIP2
  • LHFPL5
  • LIN2
  • LRRC52
  • MSN
  • MYH9
  • MYO15
  • MYO15A
  • MYO1C
  • MYO3A
  • MYO3B
  • MYO7A
  • MYSB
  • NEAS
  • OTOF
  • PCDH15
  • PCLO
  • PJVK
  • PL48
  • PLS1
  • PMCA1
  • PTK9
  • PTK9L
  • RAB3A
  • RDX
  • RIPOR2
  • SANS
  • SLC17A8
  • SLO
  • SNAP
  • SNAP25
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • SPTB2
  • SPTBN1
  • STRC
  • STX1
  • STX1A
  • SYB2
  • SYN1
  • SYP
  • TMC1
  • TMC2
  • TMHS
  • TMIE
  • TPRN
  • TWF1
  • TWF2
  • USH1B
  • USH1C
  • USH1F
  • USH1G
  • VAMP2
  • VGLUT3
  • VIL2
  • WHRN
  • XIRP2
  • ZNF231
Homo sapiens (human)
Activation of RAC1 downstream of NMDARs
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAMK1
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • GIT1
  • KIAA0787
  • RAC1
  • TC25
Homo sapiens (human)
Urea cycle
  • ARG1
  • ARG2
  • ASL
  • ASS
  • ASS1
  • CPS1
  • HSCARG
  • NAGS
  • NMRAL1
  • ORC1
  • ORC2
  • ORNT1
  • ORNT2
  • OTC
  • SLC25A15
  • SLC25A2
Homo sapiens (human)
Recruitment and ATM-mediated phosphorylation of repair and signaling proteins at DNA double strand breaks
  • ABL
  • ABL1
  • ABRA1
  • ABRAXAS1
  • APBB1
  • ATM
  • BABAM1
  • BABAM2
  • BAP1
  • BARD1
  • BAZ1B
  • BLU
  • BRCA1
  • BRCC3
  • BRCC36
  • BRCC45
  • BRE
  • C19orf62
  • C6.1A
  • CCDC98
  • CDS1
  • CHEK2
  • CHK2
  • CXorf53
  • EAB1
  • EYA1
  • EYA2
  • EYA3
  • EYA4
  • FAM175A
  • FE65
  • H2AFX
  • H2AX
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-4
  • H3FT
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HERC2
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2BE
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST3H3
  • HIST4H4
  • HNGS1
  • HTATIP
  • JHDM3A
  • JHDM3B
  • JMJD2
  • JMJD2A
  • JMJD2B
  • JNK1
  • JTK7
  • KAT5
  • KDM4A
  • KDM4B
  • KIAA0170
  • KIAA0272
  • KIAA0646
  • KIAA0677
  • KIAA0876
  • KIAA1090
  • MAPK8
  • MDC1
  • MERIT40
  • MMS2
  • MMSET
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBA1
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • NFBD1
  • NSD2
  • P53
  • P95
  • PIAS4
  • PIASG
  • PPP5
  • PPP5C
  • PRKM8
  • RAD50
  • RAD53
  • RAP80
  • RIR
  • RNF168
  • RNF53
  • RNF8
  • RPS27A
  • RXRIP110
  • SAKS1
  • SAPK1
  • SAPK1C
  • SMARCA5
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SNF2H
  • SUMO1
  • TIP60
  • TP53
  • TP53BP1
  • TRX5
  • TSH2B
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2I
  • UBE2N
  • UBE2V2
  • UBL1
  • UBXN1
  • UEV2
  • UIMC1
  • WBSC10
  • WBSCR10
  • WBSCR9
  • WCRF135
  • WHSC1
  • WSTF
Homo sapiens (human)
Synthesis And Processing Of GAG, GAGPOL Polyproteins
  • gag
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation by the AP-2 (TFAP2) family of transcription factors
  • AP2TF
  • APOE
  • DEK
  • TFAP2
  • TFAP2A
Homo sapiens (human)
Defective SLC17A8 causes autosomal dominant deafness 25 (DFNA25)
  • SLC17A8
  • VGLUT3
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade
  • CD14
  • CD36
  • GP3B
  • GP4
  • TIL4
  • TLR2
  • TLR6
  • mip
Homo sapiens (human)
Regulation of cytoskeletal remodeling and cell spreading by IPP complex components
  • ACTN1
  • ARHGEF6
  • COOL2
  • KIAA0006
  • LIMS1
  • MXRA2
  • PARVA
  • PARVB
  • PINCH
  • PINCH1
  • PIXA
  • PXN
  • RSP1
  • RSU1
  • TESK1
Homo sapiens (human)
SUMOylation of DNA replication proteins
  • AAAS
  • ADRACALA
  • AIK
  • AIK2
  • AIM1
  • AIRK1
  • AIRK2
  • API4
  • ARK1
  • ARK2
  • AURA
  • AURKA
  • AURKB
  • AYK1
  • BIRC5
  • BTAK
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CDCA8
  • CG1
  • D3S1231E
  • IAK1
  • IAP4
  • INCENP
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KIAA1835
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNA
  • PCNT1
  • PESCRG3
  • PIAS3
  • PIAS4
  • PIASG
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • SD
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SMT3A
  • SMT3B
  • SMT3C
  • SMT3H1
  • SMT3H2
  • SMT3H3
  • STK1
  • STK12
  • STK15
  • STK5
  • STK6
  • SUMO1
  • SUMO2
  • SUMO3
  • TMEM48
  • TOP1
  • TOP2
  • TOP2A
  • TOP2B
  • TPR
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Cytosolic iron-sulfur cluster assembly
  • ABC7
  • ABCB7
  • BACH1
  • BRIP1
  • C20orf41
  • CIA1
  • CIAB
  • CIAO1
  • CIAO2B
  • CIAO3
  • CIAPIN1
  • ERCC2
  • FAM96B
  • FANCJ
  • KIAA1088
  • MIP18
  • MMS19
  • MMS19L
  • NARFL
  • NBP
  • NBP1
  • NDOR1
  • NHL
  • NR1
  • NUBP1
  • NUBP2
  • POLD
  • POLD1
  • PRN
  • RTEL1
  • WDR39
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
Defective MGAT2 causes CDG-2a
  • MGAT2
Homo sapiens (human)
FLT3 signaling through SRC family kinases
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FYN
  • HCK
  • LCK
  • STK1
  • SYK
Homo sapiens (human)
Proton/oligopeptide cotransporters
  • OCTP
  • PEPT1
  • PEPT2
  • PHT1
  • PHT2
  • PTR3
  • PTR4
  • SLC15A1
  • SLC15A2
  • SLC15A3
  • SLC15A4
Homo sapiens (human)
Tandem pore domain halothane-inhibited K+ channel (THIK)
  • KCNK13
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade
  • TLR7
  • TLR8
Homo sapiens (human)
NOTCH2 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • APH1A
  • APH1B
  • CNTN1
  • DIP1
  • DLL1
  • DLL4
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KIAA0253
  • KIAA1323
  • KUZ
  • MADM
  • MDK
  • MIB1
  • MIB2
  • MK1
  • NCSTN
  • NEGF2
  • NEURL
  • NEURL1
  • NEURL1A
  • NEURL1B
  • NEURL3
  • NOTCH2
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RNF67
  • RPS27A
  • SKD
  • STM2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZZANK1
  • ZZANK2
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PC
  • AGPAT11
  • AGPAT7
  • AYTL1
  • AYTL2
  • AYTL3
  • CLEC13C
  • CPLA2
  • HRASLS3
  • HREV107
  • IPLA22
  • IPLA2G
  • LPCAT1
  • LPCAT2
  • LPCAT3
  • LPCAT4
  • LPEAT2
  • MBOAT2
  • MBOAT5
  • OACT2
  • OACT5
  • PFAAP3
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G3
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4C
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2G6
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PLAAT3
  • PLB
  • PLB1
  • PLBD1
  • PLPLA9
  • PNPLA8
  • PPLA2
  • RASF-A
  • SPLASH
  • TMEM86B
Homo sapiens (human)
FasL/ CD95L signaling
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP10
  • CASP8
  • CD95L
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • MCH4
  • MCH5
  • MORT1
  • TNFRSF6
  • TNFSF6
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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Last updated: August 19, 2024