GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Class I peroxisomal membrane protein import
  • ABCD1
  • ABCD2
  • ABCD3
  • ACBD5
  • ALD
  • ALD1
  • ALDL1
  • ALDR
  • ALDRP
  • ATAD1
  • FIS1
  • GDAP1
  • HK33
  • KIAA1996
  • PAF1
  • PAF3
  • PEX11B
  • PEX12
  • PEX13
  • PEX14
  • PEX16
  • PEX19
  • PEX2
  • PEX26
  • PEX3
  • PMP22
  • PMP24
  • PMP3
  • PMP34
  • PMP35
  • PMP70
  • PXF
  • PXMP1
  • PXMP2
  • PXMP3
  • PXMP4
  • RNF72
  • SLC25A17
  • TTC11
Homo sapiens (human)
Beta-oxidation of very long chain fatty acids
  • ABCD1
  • ACAA
  • ACAA1
  • ACOT4
  • ACOT6
  • ACOT8
  • ACTEIII
  • ALD
  • C14orf42
  • DECR2
  • ECHD
  • EDH17B4
  • EHHADH
  • HSD17B4
  • PDCR
  • PTE1
  • PTE2B
  • PTEIB
  • PTHIO
  • SDR17C1
  • SDR8C1
Homo sapiens (human)
alpha-linolenic acid (ALA) metabolism
  • ABCD1
  • ACAA
  • ACAA1
  • ACOT8
  • ACSL1
  • ACTEIII
  • ALD
  • CIG30
  • EDH17B4
  • ELG3
  • ELOVL1
  • ELOVL2
  • ELOVL3
  • ELOVL5
  • FACL1
  • FACL2
  • FADS1
  • FADS2
  • FADSD5
  • HSD17B4
  • LACS
  • LACS1
  • LACS2
  • PTE1
  • PTHIO
  • SCP2
  • SDR8C1
  • SSC1
  • SSC2
Homo sapiens (human)
Linoleic acid (LA) metabolism
  • ABCD1
  • ACSL1
  • ALD
  • CIG30
  • ELG3
  • ELOVL1
  • ELOVL2
  • ELOVL3
  • ELOVL5
  • FACL1
  • FACL2
  • FADS1
  • FADS2
  • FADSD5
  • LACS
  • LACS1
  • LACS2
  • SSC1
  • SSC2
Homo sapiens (human)
Defective ABCD1 causes ALD
  • ABCD1
  • ALD
Homo sapiens (human)
RHOC GTPase cycle
  • ABCD3
  • ABR
  • ACBD5
  • AKAP13
  • ANLN
  • ARH12
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHC
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP18
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP5
  • ARHGAP7
  • ARHGDIA
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF17
  • ARHGEF25
  • ARHGEF28
  • ARHGEF40
  • ARHGEF5
  • BCR
  • BCR1
  • BND7
  • BRX
  • C1QBP
  • CAV
  • CAV1
  • CAVIN1
  • CCDC187
  • CDC42GAP
  • CIT
  • CRIK
  • CTNNG
  • D22S11
  • DAAM1
  • DBL
  • DEPDC1B
  • DIAP1
  • DIAP3
  • DIAPH1
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DLC2
  • DP3
  • EPB72
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • ERGIC53
  • ESA1
  • F5F8D
  • FHOD2
  • FHOD3
  • FLOT1
  • FLOT2
  • FMNL2
  • FMNL3
  • FRL2
  • GC1QBP
  • GDIA1
  • GEFT
  • GRAF
  • GRB1
  • GRF1
  • GRINCHGEF
  • GRIT
  • GRLF1
  • GT650
  • HABP1
  • HT31
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • JUP
  • KIAA0051
  • KIAA0204
  • KIAA0294
  • KIAA0337
  • KIAA0362
  • KIAA0380
  • KIAA0382
  • KIAA0619
  • KIAA0621
  • KIAA0666
  • KIAA0712
  • KIAA0949
  • KIAA1225
  • KIAA1415
  • KIAA1424
  • KIAA1478
  • KIAA1626
  • KIAA1688
  • KIAA1722
  • KIAA1723
  • KIAA1902
  • KIAA1996
  • KIAA1998
  • KIAA2014
  • LAP2
  • LARG
  • LBC
  • LBR
  • LMAN1
  • LOK
  • M17S1
  • MACO1
  • MCAM
  • MCF2
  • MCF2L
  • MGCRACGAP
  • MUC18
  • MYO9B
  • MYR5
  • OPHN1
  • OPHN1L
  • OST
  • P190A
  • PAK1
  • PIK3R1
  • PKN
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PKNBETA
  • PMP70
  • PREX1
  • PRK1
  • PRK2
  • PRKCL1
  • PRKCL2
  • PTRF
  • PXMP1
  • RACGAP1
  • RGNEF
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOC
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RICS
  • ROCK1
  • ROCK2
  • RTKN
  • RTKN1
  • SF2P32
  • SLK
  • SOLO
  • STARD12
  • STARD13
  • STB2
  • STK10
  • STK2
  • STK21
  • STOM
  • STX5
  • STX5A
  • SYB3
  • TEM4
  • TFRC
  • TIM
  • TJP2
  • TMEM57
  • TMPO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAPB
  • VAV2
  • WBP3
  • X104
  • XTP8
  • ZO2
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Uptake of dietary cobalamins into enterocytes
  • ABCD4
  • AMN
  • C6orf209
  • CBLIF
  • CTRB
  • CTRB1
  • CTRB2
  • CUBN
  • GIF
  • IFCR
  • IFMH
  • LMBRD1
  • NESI
  • PRSS1
  • PRSS3
  • PRSS4
  • PXMP1L
  • TC1
  • TCN1
  • TRP1
  • TRY1
  • TRY3
  • TRY4
  • TRYP1
Homo sapiens (human)
Defective ABCD4 causes MAHCJ
  • ABCD4
  • C6orf209
  • LMBRD1
  • NESI
  • PXMP1L
Homo sapiens (human)
Interferon alpha/beta signaling
  • ABCE1
  • ADAR
  • ADAR1
  • BIRC4BP
  • BST2
  • CD225
  • CIG-42
  • CIG-49
  • CIG5
  • CIS3
  • DSRAD
  • EGR1
  • EIF2AK2
  • G10P1
  • G10P2
  • G1P1
  • G1P2
  • G1P3
  • GBP2
  • HCP
  • HEM45
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • ICSBP1
  • IFB
  • IFI17
  • IFI27
  • IFI35
  • IFI4
  • IFI54
  • IFI56
  • IFI6
  • IFI60
  • IFIT1
  • IFIT2
  • IFIT3
  • IFIT4
  • IFIT5
  • IFITM1
  • IFITM2
  • IFITM3
  • IFNA1
  • IFNA10
  • IFNA13
  • IFNA14
  • IFNA16
  • IFNA17
  • IFNA2
  • IFNA21
  • IFNA2A
  • IFNA2B
  • IFNA2C
  • IFNA4
  • IFNA5
  • IFNA6
  • IFNA7
  • IFNA8
  • IFNAI1
  • IFNAR
  • IFNAR1
  • IFNB
  • IFNB1
  • IFP35
  • IHPK2
  • IP6K2
  • IRF1
  • IRF2
  • IRF3
  • IRF4
  • IRF5
  • IRF6
  • IRF7
  • IRF8
  • IRF9
  • ISG15
  • ISG20
  • ISG54
  • ISG56
  • ISG58
  • ISG60
  • ISGF3G
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • KPNA1
  • KPNB1
  • KROX24
  • LMP7
  • MOP5
  • MUM1
  • MX1
  • MX2
  • N
  • NTF97
  • OAS1
  • OAS2
  • OAS3
  • OASL
  • OIAS
  • PKR
  • PRKR
  • PSMB5i
  • PSMB8
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • RCH2
  • RI58
  • RING10
  • RLI
  • RNASEL
  • RNASEL1
  • RNASELI
  • RNS4
  • RNS4I
  • RPS27A
  • RSAD2
  • SAMHD1
  • SHPTP2
  • SOCS1
  • SOCS3
  • SSI1
  • SSI3
  • STAT1
  • STAT2
  • TIP3
  • TRIP14
  • TYK2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UCRP
  • XAF1
  • XIAPAF1
  • Y2
  • ZNF225
Homo sapiens (human)
OAS antiviral response
  • ABCE1
  • DDX58
  • FLN
  • FLN1
  • FLNA
  • OAS1
  • OAS2
  • OAS3
  • OASL
  • OIAS
  • PDE12
  • RIGI
  • RLI
  • RNASEL
  • RNASEL1
  • RNASELI
  • RNS4
  • RNS4I
  • TRIP14
Homo sapiens (human)
Iron uptake and transport
  • ABCG2
  • ABCP
  • ACO1
  • BCRP
  • BCRP1
  • BOCT
  • BOIT
  • CAND1
  • CP
  • CUL1
  • CYBRD1
  • DCT1
  • DCYTB
  • DMT1
  • EMC19
  • FBL4
  • FBL5
  • FBXL5
  • FLR1
  • FPN
  • FPN1
  • FRRS3
  • FTH
  • FTH1
  • FTHL6
  • FTL
  • FTMT
  • G21
  • GLRX3
  • HCP1
  • HEPH
  • HMOX1
  • HMOX2
  • HNL
  • HO
  • HO1
  • HO2
  • IREB1
  • IREB2
  • IREG1
  • KIAA0698
  • KIAA0829
  • LCN2
  • MXR
  • NEDD8
  • NGAL
  • NRAMP2
  • OCP2
  • PCFT
  • PICOT
  • RPS27A
  • SKP1
  • SKP1A
  • SLC11A2
  • SLC11A3
  • SLC22A17
  • SLC40A1
  • SLC46A1
  • TCEB1L
  • TF
  • TIP120
  • TIP120A
  • TXNL2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Heme biosynthesis
  • ABCG2
  • ABCP
  • ALAD
  • ALAS1
  • ALAS2
  • ALAS3
  • ALASE
  • ALASH
  • ALB
  • ASB
  • BCRP
  • BCRP1
  • COX10
  • COX15
  • CPO
  • CPOX
  • CPX
  • FECH
  • HMBS
  • MXR
  • PBGD
  • PPOX
  • UPS
  • UROD
  • UROS
Homo sapiens (human)
Ciprofloxacin ADME
  • ABCG2
  • ABCP
  • ALB
  • BCRP
  • BCRP1
  • MXR
  • OAT3
  • OATP
  • OATP1
  • OATP1A2
  • OCT1
  • SLC21A3
  • SLC22A1
  • SLC22A8
  • SLCO1A2
Homo sapiens (human)
Defective ABCG8 causes GBD4 and sitosterolemia
  • ABCG5
  • ABCG8
Homo sapiens (human)
Defective ABCG5 causes sitosterolemia
  • ABCG5
  • ABCG8
Homo sapiens (human)
ALKBH3 mediated reversal of alkylation damage
  • ABH3
  • ALKBH3
  • ASC1P100
  • ASCC1
  • ASCC2
  • ASCC3
  • DEPC1
  • HELIC1
  • RQT2
  • RQT3
Homo sapiens (human)
Reversal of alkylation damage by DNA dioxygenases
  • ABH5
  • ALKBH5
  • FTO
  • KIAA1752
  • OFOXD1
Homo sapiens (human)
tRNA modification in the nucleus and cytosol
  • ABH8
  • ADAT1
  • ADAT2
  • ADAT3
  • ALKBH8
  • ATPBD3
  • C12orf1
  • C14orf172
  • C16orf84
  • C20orf64
  • C4orf23
  • C6orf75
  • C8orf79
  • C9orf74
  • CCDC76
  • CDKAL1
  • CTU1
  • CTU2
  • DEADC1
  • DNMT2
  • DUS2
  • DUS2L
  • DXS9879E
  • EPRS
  • EPRS1
  • ESO3
  • FTSJ1
  • GCPL1
  • GITA
  • GLNS
  • ICF45
  • IPT
  • ITBA2
  • KIAA1153
  • KIAA1456
  • KIAA1767
  • KIAA1897
  • LAGE3
  • METTL1
  • METTL19
  • MOD5
  • NCS2
  • NCS6
  • NOPD1
  • NSUN2
  • NSUN6
  • OSGEP
  • PARS
  • PRPK
  • PUS3
  • PUS7
  • QARS
  • QPRS
  • QTRT1
  • QTRT2
  • QTRTD1
  • RG9MTD2
  • SAKI
  • TAD3
  • TGT
  • TGUT
  • THADA
  • THG1L
  • TP53RK
  • TPRKB
  • TRDMT1
  • TRIT1
  • TRM4
  • TRM6
  • TRM61
  • TRM9L
  • TRMT1
  • TRMT10A
  • TRMT11
  • TRMT112
  • TRMT13
  • TRMT44
  • TRMT6
  • TRMT61A
  • TRMT9B
  • URM1
  • WDR4
Homo sapiens (human)
Glucuronidation
  • ABHD10
  • GNT1
  • UGT1
  • UGT1A1
  • UGT1A10
  • UGT1A3
  • UGT1A4
  • UGT1A5
  • UGT1A6
  • UGT1A7
  • UGT1A8
  • UGT1A9
  • UGT2A1
  • UGT2A2
  • UGT2A3
  • UGT2B10
  • UGT2B11
  • UGT2B15
  • UGT2B17
  • UGT2B28
  • UGT2B4
  • UGT2B7
  • UGT2B8
  • UGT3A1
  • UGT3A2
  • UGTB2B9
Homo sapiens (human)
Arachidonate production from DAG
  • ABHD12
  • ABHD6
  • C11orf11
  • C20orf22
  • DAGLA
  • DAGLB
  • KIAA0659
  • MGLL
  • NSDDR
Homo sapiens (human)
Cytosolic sulfonation of small molecules
  • ABHD14B
  • BPNT1
  • BPNT2
  • CIB
  • HST
  • IMPA3
  • IMPAD1
  • PODXL2
  • ST1B2
  • STD
  • STE
  • STM
  • STP
  • STP1
  • STP2
  • SULT1A1
  • SULT1A2
  • SULT1A3
  • SULT1A4
  • SULT1B1
  • SULT1B2
  • SULT1C1
  • SULT1C2
  • SULT1C4
  • SULT1E1
  • SULT2A1
  • SULT4A1
  • SULT6B1
  • SULTX3
  • TPST1
  • TPST2
Homo sapiens (human)
RAS processing
  • ABHD17A
  • ABHD17B
  • ABHD17C
  • APT1
  • ARL2
  • BCL2L
  • BCL2L1
  • BCLX
  • C19orf27
  • C9orf77
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CXorf11
  • DUB3
  • FACE2
  • FAM108A1
  • FAM108B1
  • FAM108C1
  • FNTA
  • FNTB
  • GCP16
  • GOLGA7
  • HRAS
  • HRAS1
  • ICMT
  • KRAS
  • KRAS2
  • LPL1
  • LYPLA1
  • NRAS
  • PCCMT
  • PDE6D
  • PDED
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • PRKG2
  • PRKGR2
  • RASK2
  • RCE1
  • RCE1A
  • RCE1B
  • USP17
  • USP17H
  • USP17I
  • USP17J
  • USP17K
  • USP17L
  • USP17L2
  • USP17M
  • ZDHHC10
  • ZDHHC9
  • ZNF379
  • ZNF380
Homo sapiens (human)
Synthesis of PC
  • ABHD3
  • ACHE
  • AYTL2
  • BCHE
  • C6orf29
  • CCTB
  • CD92
  • CDW92
  • CEPT1
  • CHAT
  • CHE1
  • CHETK
  • CHK
  • CHKA
  • CHKB
  • CHKL
  • CHPT1
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CKI
  • CPT1
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • CTL1
  • CTL2
  • CTL3
  • CTL4
  • CTL5
  • CTPCT
  • G5A
  • GTT1
  • KIAA0188
  • KIAA0249
  • LIPN3L
  • LPCAT1
  • LPIN1
  • LPIN2
  • LPIN3
  • MFSD2
  • MFSD2A
  • NG22
  • NLS1
  • PCTP
  • PCYT1
  • PCYT1A
  • PCYT1B
  • PEMPT
  • PEMT
  • PFAAP3
  • PHOSPHO1
  • PNMT
  • SDCCAG28
  • SLC44A1
  • SLC44A2
  • SLC44A3
  • SLC44A4
  • SLC44A5
  • STARD10
  • STARD2
  • STARD7
  • TPPT1
Homo sapiens (human)
Acyl chain remodelling of PE
  • ABHD4
  • AGPAT7
  • AYTL3
  • CLEC13C
  • CPLA2
  • HRASLS
  • HRASLS2
  • HRASLS3
  • HRASLS5
  • HREV107
  • HRLP5
  • IPLA22
  • IPLA2G
  • LPCAT3
  • LPCAT4
  • LPEAT2
  • MBOAT1
  • MBOAT2
  • MBOAT5
  • OACT1
  • OACT2
  • OACT5
  • PLA2
  • PLA2A
  • PLA2B
  • PLA2G10
  • PLA2G12
  • PLA2G12A
  • PLA2G16
  • PLA2G1B
  • PLA2G2A
  • PLA2G2D
  • PLA2G2E
  • PLA2G2F
  • PLA2G3
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4C
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLA2G5
  • PLA2G6
  • PLA2L
  • PLA2R1
  • PLAAT1
  • PLAAT2
  • PLAAT3
  • PLAAT4
  • PLAAT5
  • PLBD1
  • PLPLA9
  • PNPLA8
  • PPLA2
  • RARRES3
  • RASF-A
  • RIG1
  • SPLASH
  • TIG3
Homo sapiens (human)
Triglyceride catabolism
  • ABHD5
  • BLBP
  • CAV
  • CAV1
  • DXS1283E
  • FABP1
  • FABP11
  • FABP12
  • FABP2
  • FABP3
  • FABP4
  • FABP5
  • FABP6
  • FABP7
  • FABP9
  • FABPB
  • FABPI
  • FABPL
  • GPD2
  • GS2
  • GS2L
  • ILBP
  • ILLBP
  • LIPE
  • M6PRBP1
  • MDGI
  • MGLL
  • MRG
  • NCIE2
  • PERI
  • PKACA
  • PLIN
  • PLIN1
  • PLIN3
  • PNPLA4
  • PNPLA5
  • PPP1A
  • PPP1CA
  • PPP1CB
  • PPP1CC
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • TIP47
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

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GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024