GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 226 - 250 of 2090 in total
Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
COX reactions
  • COX1
  • PTGS1
Homo sapiens (human)
CREB phosphorylation
  • ATF1
  • ISPK1
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • MAPKAPK2
  • MSK1
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RPS6KA5
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
Homo sapiens (human)
CREB1 phosphorylation through NMDA receptor-mediated activation of RAS signaling
  • ISPK1
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RPS6KA6
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
  • RSK4
Homo sapiens (human)
CREB1 phosphorylation through the activation of Adenylate Cyclase
  • ADCY1
  • ADCY8
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PKX1
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • PRKX
  • TSE1
Homo sapiens (human)
CREB1 phosphorylation through the activation of CaMKII/CaMKK/CaMKIV cascasde
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-GR
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • CAMK4
  • CAMKB
  • CAMKG
  • CAMKIV
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • KIAA0787
  • KPNA2
  • RCH1
  • SRP1
Homo sapiens (human)
CREB3 factors activate genes
  • AIBZIP
  • BBF2H7
  • C5orf41
  • CREB3
  • CREB3L1
  • CREB3L2
  • CREB3L3
  • CREB3L4
  • CREB4
  • CREBH
  • CREBRF
  • DCSTAMP
  • JAL
  • KIAA0091
  • LZIP
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • OASIS
  • S1P
  • S2P
  • SKI1
  • TM7SF4
Homo sapiens (human)
CRMPs in Sema3A signaling
  • CDK5
  • CDK5R
  • CDK5R1
  • CDKN5
  • CRMP1
  • CRMP2
  • CRMP3
  • CRMP4
  • CRMP5
  • DPYSL1
  • DPYSL2
  • DPYSL3
  • DPYSL4
  • DPYSL5
  • DRP3
  • FES
  • FPS
  • FYN
  • GSK3B
  • KIAA0463
  • KIAA1550
  • NCK5A
  • NOV
  • NRP
  • NRP1
  • OCT
  • PLXN1
  • PLXN2
  • PLXN4
  • PLXNA1
  • PLXNA2
  • PLXNA3
  • PLXNA4
  • PLXNA4A
  • PLXNA4B
  • PSSALRE
  • SEMA3A
  • SEMAD
  • SEX
  • ULIP
  • ULIP1
  • ULIP2
  • ULIP3
  • ULIP4
  • ULIP6
  • VEGF165R
Homo sapiens (human)
CS/DS degradation
  • ARSB
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • DCN
  • HEXA
  • HEXB
  • HYAL1
  • HYAL3
  • IDS
  • IDUA
  • LUCA1
  • LUCA3
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • SIDS
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
Homo sapiens (human)
CTLA4 inhibitory signaling
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • CD152
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • CTLA4
  • FYN
  • JTK8
  • KIAA0044
  • LAB7
  • LCK
  • LYN
  • PKB
  • PKBG
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAC
  • SHPTP2
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
CTNNB1 S33 mutants aren't phosphorylated
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
CTNNB1 S37 mutants aren't phosphorylated
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
CTNNB1 S45 mutants aren't phosphorylated
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
CTNNB1 T41 mutants aren't phosphorylated
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
Ca activated K+ channels
  • IK1
  • IKCA1
  • K3
  • KCA4
  • KCNMA
  • KCNMA1
  • KCNMB1
  • KCNMB2
  • KCNMB3
  • KCNMB4
  • KCNMBL
  • KCNN1
  • KCNN2
  • KCNN3
  • KCNN4
  • SK
  • SK4
  • SLO
Homo sapiens (human)
Ca2+ pathway
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • C2orf31
  • CAGH26
  • CALM
  • CALM1
  • CALNA
  • CALNA2
  • CALNB
  • CAM
  • CAM1
  • CAMK2A
  • CAMKA
  • CNA
  • CNA2
  • CNB
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • FZD2
  • FZD3
  • FZD4
  • FZD5
  • FZD6
  • GNAO1
  • GNAT2
  • GNATC
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • INSP3R1
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KIAA0581
  • KIAA0968
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • LAK1
  • LEF1
  • MAP3K7
  • MOV10
  • NFAT2
  • NFATC
  • NFATC1
  • NLK
  • PDE6A
  • PDE6B
  • PDE6G
  • PDEA
  • PDEB
  • PDEG
  • PKCA
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PPP3CA
  • PPP3CB
  • PPP3R1
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKG1
  • PRKG1B
  • PRKG2
  • PRKGR1A
  • PRKGR1B
  • PRKGR2
  • TAK1
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • WNT11
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
CaM pathway
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
Homo sapiens (human)
CaMK IV-mediated phosphorylation of CREB
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-GR
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMK4
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CAMKIV
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • KIAA0787
  • KIAA0968
  • KPNA2
  • RCH1
  • SRP1
Homo sapiens (human)
Calcineurin activates NFAT
  • CALM
  • CALM1
  • CALNA
  • CALNA2
  • CALNB
  • CAM
  • CAM1
  • CNA
  • CNA2
  • CNB
  • CYPA
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • NFAT1
  • NFAT2
  • NFAT4
  • NFATC
  • NFATC1
  • NFATC2
  • NFATC3
  • NFATP
  • PPIA
  • PPP3CA
  • PPP3CB
  • PPP3R1
Homo sapiens (human)
Calcitonin-like ligand receptors
  • ADM
  • ADM2
  • AM
  • AM2
  • CALC1
  • CALC2
  • CALCA
  • CALCB
  • CALCR
  • CALCRL
  • CGRPR
  • IAPP
  • RAMP1
  • RAMP2
  • RAMP3
Homo sapiens (human)
Calmodulin induced events
  • ADRBK1
  • BARK
  • BARK1
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • GRK2
  • PKCA
  • PKCD
  • PKCG
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCD
  • PRKCG
Homo sapiens (human)
Calnexin/calreticulin cycle
  • CALR
  • CANX
  • CRTC
  • ERP57
  • ERP60
  • G19P1
  • G2AN
  • GANAB
  • GRP58
  • KIAA0088
  • PDIA3
  • PRKCSH
Homo sapiens (human)
Cam-PDE 1 activation
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • PDE1A
  • PDE1B
  • PDE1C
  • PDES1B
Homo sapiens (human)
Carboxyterminal post-translational modifications of tubulin
  • AGBL1
  • AGBL2
  • AGBL3
  • AGBL4
  • AGBL5
  • AGTPBP1
  • C18orf10
  • C19orf20
  • C20orf125
  • C22orf7
  • C6orf104
  • C9orf20
  • CCDC23
  • CCP1
  • CCP2
  • CCP3
  • CCP4
  • CCP5
  • CCP6
  • CSTPP2
  • KIAA0153
  • KIAA0173
  • KIAA0998
  • KIAA1035
  • KIAA1036
  • LRRC49
  • NICN1
  • NNA1
  • STAMP
  • SVBP
  • TPGS1
  • TPGS2
  • TTL
  • TTL.6
  • TTLL1
  • TTLL10
  • TTLL11
  • TTLL12
  • TTLL13
  • TTLL13P
  • TTLL2
  • TTLL3
  • TTLL4
  • TTLL5
  • TTLL6
  • TTLL7
  • TTLL8
  • TTLL9
  • TUBA1A
  • TUBA1B
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA3E
  • TUBA6
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
  • TUBB8
  • TUBB8B
  • VASH
  • VASH1
  • VASH2
  • VASHL
Homo sapiens (human)
Cardiogenesis
  • AFX
  • AFX1
  • BHLHA26
  • BHLHA27
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHC5
  • BIG3
  • BSP1
  • CHF1
  • CHF2
  • CLIM2
  • CSX
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DHAND
  • DPC4
  • EHAND
  • EOMES
  • FOXO4
  • GATA4
  • GATA6
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRL
  • HAND1
  • HAND2
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HRT1
  • HRT2
  • HTATIP
  • ISL1
  • KAT2A
  • KAT5
  • LDB1
  • LEF1
  • MADH1
  • MADH4
  • MADR1
  • MEF2C
  • MESP1
  • MLLT7
  • MYCD
  • MYOCD
  • NKX2-5
  • NKX2.5
  • NKX2E
  • SMAD1
  • SMAD4
  • SMYD1
  • SRF
  • T
  • TBR2
  • TBX1
  • TBX20
  • TBX5
  • TBXT
  • TIP60
  • WDR5
Homo sapiens (human)
Cargo concentration in the ER
  • AAT
  • AREG
  • AREGB
  • C5orf8
  • CD59
  • CNIH
  • CNIH1
  • CNIH2
  • CNIH3
  • CNIL
  • COL7A1
  • CPPI
  • CTAGE5
  • CTSC
  • CTSZ
  • ERGIC53
  • ERGL
  • F5
  • F5F8D
  • F8
  • F8C
  • FOLR
  • FOLR1
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GOSR2
  • GRIA1
  • GS27
  • KIAA0079
  • KIAA0268
  • KIAA0755
  • LMAN1
  • LMAN1L
  • LMAN2
  • LMAN2L
  • MCFD2
  • MEA11
  • MEA6
  • MGEA11
  • MGEA6
  • MIA2
  • MIA3
  • MIC11
  • MIN1
  • MIN2
  • MIN3
  • MSK21
  • PI
  • PREB
  • RNP24
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SDGF
  • SDNSF
  • SEC12
  • SEC22B
  • SEC22L1
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SERPINA1
  • STX5
  • STX5A
  • TANGO
  • TGFA
  • TMED10
  • TMED2
  • TMP21
  • VIPL
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024