GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 326 - 350 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Abasic sugar-phosphate removal via the single-nucleotide replacement pathway
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • HAP1
  • POLB
  • REF1
Homo sapiens (human)
Sensing of DNA Double Strand Breaks
  • ATM
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KPNA2
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • RAD50
  • RCH1
  • SRP1
  • TIP60
Homo sapiens (human)
Neurophilin interactions with VEGF and VEGFR
  • FLK1
  • FLT
  • FLT1
  • FRT
  • KDR
  • NRP
  • NRP1
  • NRP2
  • VEGF165R
  • VEGF165R2
  • VEGFR1
  • VEGFR2
Homo sapiens (human)
Asparagine N-linked glycosylation
  • ASGR1
  • ASGR2
  • B4GALNT2
  • CLEC4H1
  • CLEC4H2
  • DAD1
  • DDOST
  • GALGT2
  • IAG2
  • ITM1
  • KIAA0115
  • MAGT1
  • N33
  • OST48
  • RPN1
  • RPN2
  • STT3A
  • TMC
  • TUSC3
  • UMOD
Homo sapiens (human)
UNC93B1 deficiency - HSE
  • TLR3
  • UNC93
  • UNC93B
  • UNC93B1
Homo sapiens (human)
FGFRL1 modulation of FGFR1 signaling
  • FGF10
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGFB
  • FGFR5
  • FGFRL1
  • FHFR
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • INT2
  • KS3
  • SPRED1
  • SPRED2
Homo sapiens (human)
G beta:gamma signalling through PI3Kgamma
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • ARH12
  • ARHA
  • C17orf38
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • PDK1
  • PDPK1
  • PIK3CG
  • PIK3R5
  • PIK3R6
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • RHO12
  • RHOA
Homo sapiens (human)
G0 and Early G1
  • BARA
  • C14orf46
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDK2
  • CDKN2
  • CXCDC1
  • DP1
  • DP2
  • DYRK
  • DYRK1A
  • E2F4
  • E2F5
  • HDAC1
  • KIAA2037
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MNB
  • MNBH
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBL1
  • RBL2
  • RPD3L1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
Homo sapiens (human)
Downstream signal transduction
  • APRF
  • BCAR1
  • CAS
  • CASS1
  • CRK
  • CRKAS
  • CRKL
  • GAP
  • GRB1
  • GRB4
  • GRB7
  • GRF2
  • HRAS
  • HRAS1
  • NCK
  • NCK1
  • NCK2
  • NRAS
  • PDGF2
  • PDGFB
  • PDGFR
  • PDGFR1
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLC1
  • PLCG1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAPGEF1
  • RASA
  • RASA1
  • RHEPDGFRA
  • SHPTP2
  • SIS
  • SOS1
  • SRC
  • SRC1
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • STAT6
Homo sapiens (human)
HDR through Single Strand Annealing (SSA)
  • ABL
  • ABL1
  • AGS1
  • ATM
  • ATR
  • ATRIP
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRIP1
  • C12orf32
  • C16orf75
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • ERCC1
  • ERCC11
  • ERCC4
  • EXO1
  • EXOI
  • FANCJ
  • FRP1
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • HUS1
  • JTK7
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA0259
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • R24L
  • RAD1
  • RAD17
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD52
  • RAD9A
  • RAD9B
  • RBBP8
  • REC1
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RHINO
  • RHNO1
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • TOPBP1
  • WRN
  • XPF
Homo sapiens (human)
Toxicity of botulinum toxin type E (botE)
  • KIAA0735
  • KIAA0736
  • SNAP
  • SNAP25
  • SV2A
  • SV2B
  • botE
  • ntnha
Homo sapiens (human)
RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE during HIV infection
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP1A
  • CAP35
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • ERCC2
  • ERCC3
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA0398
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RNF66
  • RNGTT
  • RNMT
  • RPB7
  • SPT5
  • SPT5H
  • STK1
  • SUPT5H
  • TTDA
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
Mitotic Prophase
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • NMP22
  • NUMA
  • NUMA1
  • P34CDC2
Homo sapiens (human)
Nicotinate metabolism
  • BST1
  • C1orf15
  • C5orf33
  • C9orf95
  • CD38
  • ITGB1BP3
  • KIAA0479
  • MNADK
  • NADK
  • NADK2
  • NADKD1
  • NADSYN1
  • NMNAT
  • NMNAT1
  • NMNAT2
  • NMNAT3
  • NMRK1
  • NMRK2
  • NRK1
  • NRK2
  • NT5
  • NT5E
  • NTE
  • QPRT
Homo sapiens (human)
Regulation of gene expression in late stage (branching morphogenesis) pancreatic bud precursor cells
  • ATOH5
  • BHLHA7
  • BHLHB39
  • CBP
  • CG1
  • CREBBP
  • CXorf6
  • EP300
  • GCN5
  • GCN5L2
  • HES1
  • HL
  • HNF1B
  • HNF6
  • HNF6A
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • NEUROG3
  • NGN3
  • NOTCH1
  • ONECUT1
  • ONECUT3
  • P300
  • PCAF
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • SKIIP
  • SKIP
  • SNW1
  • TAN1
  • TCF2
Homo sapiens (human)
Oncogene Induced Senescence
  • AGO1
  • AGO3
  • AGO4
  • BHLHB24
  • CAGH26
  • CDK4
  • CDK6
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • CDKN2B
  • CDKN2C
  • CDKN2D
  • CDKN6
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F2
  • E2F3
  • EIF2C1
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • ERF
  • ERK1
  • ERK2
  • ETS1
  • ETS2
  • EWSR2
  • ID
  • ID1
  • KIAA0075
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MDM2
  • MDM4
  • MDMX
  • MLM
  • MOV10
  • MTS1
  • MTS2
  • P53
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RB1
  • RBBP3
  • RPS27A
  • SP1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • TP53
  • TSFP1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Defective Intrinsic Pathway for Apoptosis Due to p14ARF Loss of Function
  • C1QBP
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • GC1QBP
  • HABP1
  • MLM
  • SF2P32
Homo sapiens (human)
MPS IIIB - Sanfilippo syndrome B
  • NAGLU
  • UFHSD1
Homo sapiens (human)
tamatinib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
Phase 0 - rapid depolarisation
  • CACH2
  • CACN2
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • CACNL1A1
  • CACNLB1
  • CACNLB2
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CCHL1A1
  • FGF11
  • FGF12
  • FGF12B
  • FGF13
  • FGF14
  • FHF1
  • FHF2
  • FHF3
  • FHF4
  • HBA
  • KIAA0558
  • KIAA0968
  • KIAA1158
  • KIAA1356
  • MED
  • MOG1
  • MYSB
  • NAC1
  • NAC2
  • NAC3
  • NENA
  • RANGNRF
  • RANGRF
  • SCN1
  • SCN10A
  • SCN11A
  • SCN12A
  • SCN1A
  • SCN1B
  • SCN2A
  • SCN2A1
  • SCN2A2
  • SCN2B
  • SCN3A
  • SCN3B
  • SCN4A
  • SCN4B
  • SCN5A
  • SCN6A
  • SCN7A
  • SCN8A
  • SCN9A
  • SNS2
Homo sapiens (human)
Regulation of FZD by ubiquitination
  • C20orf182
  • C2orf31
  • FZD4
  • FZD5
  • FZD6
  • FZD8
  • GPR48
  • GPR49
  • GPR67
  • KIAA0055
  • KIAA1133
  • LGR4
  • LGR5
  • LGR6
  • LR3
  • LRP5
  • LRP6
  • LRP7
  • PWTSR
  • RNF203
  • RNF43
  • RPS27A
  • RSPO1
  • RSPO2
  • RSPO3
  • RSPO4
  • THSD2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBPY
  • USP8
  • WNT3A
  • ZNRF3
Homo sapiens (human)
Vitamin B2 (riboflavin) metabolism
  • ACP5
  • C20orf54
  • ENPP1
  • FLAD1
  • GPR172A
  • GPR172B
  • M6S1
  • NPPS
  • PAR1
  • PAR2
  • PC1
  • PDNP1
  • RFK
  • RFT1
  • RFT2
  • RFT3
  • RFVT3
  • SLC52A1
  • SLC52A2
  • SLC52A3
Homo sapiens (human)
Platelet homeostasis
  • P2RX1
  • P2RX2
  • P2RX3
  • P2RX4
  • P2RX5
  • P2RX6
  • P2RX7
  • P2RXL1
  • P2X1
  • P2X2
  • P2X5
  • P2X5FL
  • P2X6
  • PAFAH2
Homo sapiens (human)
Defective Mismatch Repair Associated With MSH3
  • DUC1
  • DUG
  • MSH2
  • MSH3
Homo sapiens (human)
Thrombin signalling through proteinase activated receptors (PARs)
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • CF2R
  • ERK1
  • ERK2
  • F2
  • F2R
  • F2RL2
  • F2RL3
  • GA11
  • GAQ
  • GNA11
  • GNA12
  • GNA13
  • GNA14
  • GNA15
  • GNA16
  • GNAQ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PAR1
  • PAR3
  • PAR4
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • TR
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024