GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1701 - 1725 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Phase 1 - inactivation of fast Na+ channels
  • CALP
  • CSEN
  • DREAM
  • KCHIP1
  • KCHIP2
  • KCHIP3
  • KCHIP4
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNIP1
  • KCNIP2
  • KCNIP3
  • KCNIP4
  • KIAA1044
  • VABP
Homo sapiens (human)
Defective homologous recombination repair (HRR) due to BRCA1 loss of function
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
Homo sapiens (human)
Nef and signal transduction
  • DOCK2
  • ELMO1
  • FYN
  • HCK
  • KIAA0209
  • KIAA0281
  • LCK
  • PAK2
  • RAC1
  • TC25
  • nef
Homo sapiens (human)
Metal sequestration by antimicrobial proteins
  • CAGA
  • CAGB
  • CFAG
  • GIG12
  • HNL
  • LCN2
  • LF
  • LTF
  • MRP14
  • MRP8
  • NGAL
  • PSOR1
  • S100A15
  • S100A7
  • S100A7A
  • S100A7C
  • S100A7L1
  • S100A8
  • S100A9
Homo sapiens (human)
Defective LARGE causes MDDGA6 and MDDGB6
  • B3GNT1
  • B3GNT6
  • B4GAT1
  • KIAA0609
  • LARGE
  • LARGE1
Homo sapiens (human)
Switching of origins to a post-replicative state
  • BM28
  • CCNL1
  • CDC21
  • CDC46
  • CDC47
  • CDCL1
  • CDT1
  • GMNN
  • KIAA0030
  • MCM2
  • MCM3
  • MCM4
  • MCM5
  • MCM6
  • MCM7
Homo sapiens (human)
Cyclin E associated events during G1/S transition
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • BARA
  • BHLHD4
  • BHLHE39
  • C14orf46
  • CABLES
  • CABLES1
  • CAK
  • CAK1
  • CAP20
  • CAP35
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CCNH
  • CDC25A
  • CDK2
  • CDK7
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CDKN2
  • CDKN7
  • CIP1
  • CXCDC1
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F4
  • E2F5
  • KIAA2037
  • KIP1
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MAT1
  • MAX
  • MDA6
  • MNAT1
  • MO15
  • MYC
  • PIC1
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • RB1
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBL2
  • RNF66
  • SDI1
  • STK1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
  • WAF1
  • WEE1
  • p27
Homo sapiens (human)
Metabolism of polyamines
  • AMD
  • AMD1
  • ODC1
  • SMS
  • SPS1
  • SRM
  • SRML1
Homo sapiens (human)
MET activates STAT3
  • APRF
  • HGF
  • HPTA
  • MET
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Defective SLC39A4 causes acrodermatitis enteropathica, zinc-deficiency type (AEZ)
  • SLC39A4
  • ZIP4
Homo sapiens (human)
Defective binding of VWF variant to GPIb:IX:V
  • F8VWF
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • VWF
Homo sapiens (human)
Defective ABCB6 causes MCOPCB7
  • ABCB6
  • MTABC3
  • PRP
  • UMAT
Homo sapiens (human)
Defective HDR through Homologous Recombination Repair (HRR) due to PALB2 loss of BRCA2/RAD51/RAD51C binding function
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
Homo sapiens (human)
Acetylcholine inhibits contraction of outer hair cells
  • CHRNA10
  • CHRNA9
  • KCNMA
  • KCNMA1
  • KCNMB1
  • KCNN2
  • NACHRA10
  • NACHRA9
  • SLO
Homo sapiens (human)
Defective SLC35A1 causes congenital disorder of glycosylation 2F (CDG2F)
  • SLC35A1
Homo sapiens (human)
Antagonism of Activin by Follistatin
  • FLRG
  • FST
  • FSTL3
  • INHBA
  • INHBB
Homo sapiens (human)
Fatty acyl-CoA biosynthesis
  • ACAC
  • ACACA
  • ACC1
  • ACCA
  • ACLY
  • ACOD4
  • ACSVL1
  • CBR4
  • CLN1
  • FABGL
  • FACVL1
  • FADS5
  • FAS
  • FASN
  • FATP2
  • HKE6
  • HSD17B8
  • HTD2
  • KIAA0852
  • MORC2
  • OLAH
  • PPT
  • PPT1
  • PPT2
  • RING2
  • SCD
  • SCD1
  • SCD2
  • SCD4
  • SCD5
  • SCDOS
  • SDR30C1
  • SDR45C1
  • SLC27A2
  • THEDC1
  • VLACS
  • ZCWCC1
Homo sapiens (human)
Somitogenesis
  • BHLHB37
  • BHLHC6
  • C6orf159
  • C7orf76
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DLL1
  • DLL3
  • DSS1
  • EPHA4
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HEK8
  • HES7
  • HSPC
  • IFI5111
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KIAA0072
  • KIAA0107
  • LEF1
  • LFNG
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MESP2
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSGN1
  • MSS1
  • NOTCH1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSMF1
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RING10
  • RING12
  • RIPPLY2
  • SCDO2
  • SEK
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TAN1
  • TBP1
  • TBP7
  • TBX6
  • TRAP2
  • TYRO1
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
Interferon gamma signaling
  • ATDC
  • B2M
  • BERP
  • C6orf13
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CD44
  • CES1
  • CIITA
  • CIS3
  • EFP
  • ERK1
  • ERK2
  • FCG1
  • FCGR1
  • FCGR1A
  • FCGR1B
  • FCGR1BP
  • FXY
  • GBP1
  • GBP2
  • GBP3
  • GBP4
  • GBP4L
  • GBP5
  • GBP6
  • GBP7
  • GC109
  • GERP
  • GILT
  • HCP
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-DP1A
  • HLA-DP1B
  • HLA-DPA1
  • HLA-DPB1
  • HLA-DQA1
  • HLA-DQA2
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HLA-DQB2
  • HLA-DRA
  • HLA-DRA1
  • HLA-DRB1
  • HLA-DRB3
  • HLA-DRB4
  • HLA-DRB5
  • HLA-DXA
  • HLA-DXB
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • HLASB
  • HLS5
  • ICAM1
  • ICSBP1
  • IFI30
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • IFNGT1
  • IFP1
  • IGFR1
  • IGFRB
  • IP30
  • IRF1
  • IRF2
  • IRF3
  • IRF4
  • IRF5
  • IRF6
  • IRF7
  • IRF8
  • IRF9
  • ISGF3G
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • KIAA0129
  • KIAA0517
  • KIAA0968
  • KIAA1098
  • LHR
  • MADH7
  • MADH8
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MDU2
  • MDU3
  • MHC2TA
  • MIC4
  • MID1
  • MT2
  • MT2A
  • MUM1
  • MYL
  • NCAM
  • NCAM1
  • NSEP1
  • OAS1
  • OAS2
  • OAS3
  • OASL
  • OIAS
  • PAFR
  • PKCD
  • PML
  • PP8675
  • PRKCD
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTAFR
  • PTP1C
  • PTPN6
  • RBCC
  • RFB30
  • RNF
  • RNF101
  • RNF137
  • RNF147
  • RNF15
  • RNF16
  • RNF21
  • RNF22
  • RNF27
  • RNF59
  • RNF71
  • RNF81
  • RNF86
  • RNF88
  • RNF89
  • RNF9
  • RNF94
  • RNF95
  • RNF97
  • RNF99
  • RO52
  • RORET
  • SMAD7
  • SOCS1
  • SOCS3
  • SP100
  • SS56
  • SSA1
  • SSI1
  • SSI3
  • STAF50
  • TERF
  • TIP3
  • TRIFIC
  • TRIM10
  • TRIM14
  • TRIM17
  • TRIM18
  • TRIM19
  • TRIM2
  • TRIM21
  • TRIM22
  • TRIM25
  • TRIM26
  • TRIM29
  • TRIM3
  • TRIM31
  • TRIM34
  • TRIM35
  • TRIM38
  • TRIM45
  • TRIM46
  • TRIM48
  • TRIM5
  • TRIM6
  • TRIM62
  • TRIM68
  • TRIM8
  • TRIP14
  • VCAM1
  • XPRF
  • YB1
  • YBX1
  • ZNF147
  • ZNF173
Homo sapiens (human)
mRNA Editing: C to U Conversion
  • A1CF
  • ACF
  • APOBEC1
  • APOBEC1L
  • APOBEC2
  • APOBEC3A
  • APOBEC3B
  • APOBEC3C
  • APOBEC3H
  • APOBEC4
  • ASP
  • C1orf169
  • PBI
Homo sapiens (human)
Defective F9 activation
  • F11
  • F9
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
Homo sapiens (human)
Golgi Cisternae Pericentriolar Stack Reorganization
  • BLZF1
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • ERK2
  • GOLGA2
  • GOLPH5
  • GOLPH6
  • GORASP1
  • GORASP2
  • GRASP65
  • JEM1
  • MAPK1
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • RAB1
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RAB2
  • RAB2A
  • USO1
  • VDP
Homo sapiens (human)
Signaling by high-kinase activity BRAF mutants
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA1027
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RIAM
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Metabolism of serotonin
  • ALDH2
  • ALDM
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane
  • A4
  • AD1
  • ALTPRP
  • APP
  • ARSA
  • ASNA1
  • BAG6
  • BAT3
  • C7orf20
  • CAML
  • CAMLG
  • CEE
  • CHD5
  • DXS254E
  • EDMD
  • EMD
  • FER1L2
  • G3
  • GDX
  • GET1
  • GET2
  • GET3
  • GET4
  • HMOX1
  • HO
  • HO1
  • OTOF
  • PRIP
  • PRNP
  • PRP
  • RAMP4
  • SEC61B
  • SEC61G
  • SERP1
  • SGT
  • SGT1
  • SGTA
  • STA
  • STX1
  • STX1A
  • STX5
  • STX5A
  • SYB2
  • TRC35
  • TRC40
  • UBL4
  • UBL4A
  • VAMP2
  • VAP33
  • VAPA
  • WRB
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


Logo License Policies Site Map

Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024