GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
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Pathway Name ▲ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
NOTCH1 Intracellular Domain Regulates Transcription
  • BCL8B
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHB33
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • BHLHE39
  • BHLHE78
  • CBP
  • CCNC
  • CDK8
  • CG1
  • CHF1
  • CHF2
  • CREBBP
  • CTG26
  • CUL1
  • CXorf6
  • EMC19
  • EP300
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRG4
  • GRL
  • HDAC1
  • HDAC10
  • HDAC11
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HDAC4
  • HDAC5
  • HDAC6
  • HDAC7
  • HDAC7A
  • HDAC7B
  • HDAC8
  • HDAC9
  • HDACL1
  • HDRP
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HES1
  • HES5
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HEYL
  • HIF1A
  • HL
  • HRT1
  • HRT2
  • HRT3
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • IRA1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA0288
  • KIAA0600
  • KIAA0744
  • KIAA0901
  • KIAA1047
  • KIAA1261
  • KIAA1544
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • LYST2
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MITR
  • MOP1
  • MYC
  • NBEA
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NOTCH1
  • OCP2
  • P300
  • PASD8
  • PCAF
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RBX1
  • RNF75
  • ROC1
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SKIIP
  • SKIP
  • SKP1
  • SKP1A
  • SNW1
  • TAN1
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TCEB1L
  • TLE1
  • TLE2
  • TLE4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
NOTCH2 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • APH1A
  • APH1B
  • CNTN1
  • DIP1
  • DLL1
  • DLL4
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KIAA0253
  • KIAA1323
  • KUZ
  • MADM
  • MDK
  • MIB1
  • MIB2
  • MK1
  • NCSTN
  • NEGF2
  • NEURL
  • NEURL1
  • NEURL1A
  • NEURL1B
  • NEURL3
  • NOTCH2
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RNF67
  • RPS27A
  • SKD
  • STM2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZZANK1
  • ZZANK2
Homo sapiens (human)
NOTCH2 intracellular domain regulates transcription
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • CD23A
  • CG1
  • CGL1
  • CLEC4J
  • CSPB
  • CTLA1
  • CXorf6
  • EP300
  • FCE2
  • FCER2
  • GRB
  • GZMB
  • HES1
  • HES5
  • HL
  • HRY
  • IGEBF
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KIAA0200
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • NOTCH2
  • P300
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
Homo sapiens (human)
NOTCH3 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • APH1A
  • APH1B
  • DIP1
  • DLL1
  • DLL4
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERIC1
  • HER1
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KIAA0253
  • KIAA1323
  • KUZ
  • MADM
  • MIB1
  • MIB2
  • NCSTN
  • NEURL
  • NEURL1
  • NEURL1A
  • NEURL1B
  • NEURL3
  • NOTCH3
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RNF67
  • RPS27A
  • SKD
  • STM2
  • TACC3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WWP2
  • ZZANK1
  • ZZANK2
Homo sapiens (human)
NOTCH3 Intracellular Domain Regulates Transcription
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHB33
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • BLBP
  • CBP
  • CG1
  • CHF1
  • CHF2
  • CREBBP
  • CXorf6
  • DLG7
  • DLGAP5
  • EP300
  • FABP7
  • FABPB
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRL
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HES1
  • HES5
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HEYL
  • HL
  • HRT1
  • HRT2
  • HRT3
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0008
  • KIAA0200
  • KIAA0620
  • KIAA0869
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • KIBRA
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MRG
  • NOTCH1
  • NOTCH3
  • P300
  • PBX1
  • PCAF
  • PLXND1
  • PRL
  • PTCRA
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • SKIIP
  • SKIP
  • SNW1
  • STAT1
  • TAN1
  • WWC1
Homo sapiens (human)
NOTCH4 Activation and Transmission of Signal to the Nucleus
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • APH1A
  • APH1B
  • DLL4
  • INT3
  • JAG1
  • JAGL1
  • KIAA0253
  • KUZ
  • MADM
  • NCSTN
  • NOTCH4
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • STM2
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
NOTCH4 Intracellular Domain Regulates Transcription
  • ACTA2
  • ACTSA
  • ACTVS
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • CBP
  • CG1
  • CHF1
  • CHF2
  • CREBBP
  • CXorf6
  • EP300
  • FLT4
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRL
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HES1
  • HES5
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HL
  • HRT1
  • HRT2
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • INT3
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • MADH3
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • NOTCH1
  • NOTCH2
  • NOTCH4
  • P300
  • PCAF
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • SKIIP
  • SKIP
  • SMAD3
  • SNW1
  • TAN1
  • VEGFR3
Homo sapiens (human)
NPAS4 regulates expression of target genes
  • ARNT
  • ARNT2
  • ARNTL
  • BDNF
  • BHLHE1
  • BHLHE2
  • BHLHE5
  • BHLHE79
  • BMAL1
  • CBP
  • CDHF12
  • CDHR16
  • CDK5
  • CDK5R
  • CDK5R1
  • CDKN5
  • CREBBP
  • CRM1
  • ERK1
  • ERK2
  • FOS
  • G0S7
  • GEM
  • INS
  • IQSEC3
  • KIAA0307
  • KIAA1110
  • KIR
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MDM2
  • MOP3
  • NAMPT
  • NCK5A
  • NPAS4
  • NXF
  • PASD10
  • PASD3
  • PBEF
  • PBEF1
  • PLK2
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PSSALRE
  • PTC
  • RBFOX3
  • RET
  • SNK
  • SYT10
  • XPO1
Homo sapiens (human)
NR1D1 (REV-ERBA) represses gene expression
  • EAR1
  • HDAC3
  • HREV
  • KIAA1047
  • NCOR1
  • NR1D1
  • THRAL
Homo sapiens (human)
NRAGE signals death through JNK
  • AATF
  • ABR
  • AKAP13
  • ARHDH9
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF17
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF2
  • ARHGEF26
  • ARHGEF3
  • ARHGEF33
  • ARHGEF35
  • ARHGEF37
  • ARHGEF38
  • ARHGEF39
  • ARHGEF4
  • ARHGEF40
  • ARHGEF5
  • ARHGEF5L
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF8
  • ARHGEF9
  • BAD
  • BBC6
  • BCL2L11
  • BCL2L8
  • BIM
  • BRX
  • C9orf100
  • CHE1
  • COOL1
  • COOL2
  • DBL
  • DED
  • DUET
  • DUO
  • ECT2
  • EPHEXIN4
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • FGDY
  • FRABP
  • GNA13
  • GRF2
  • GRINCHGEF
  • HAPIP
  • HT31
  • ITSN
  • ITSN1
  • JNK1
  • KALRN
  • KIAA0006
  • KIAA0142
  • KIAA0294
  • KIAA0337
  • KIAA0362
  • KIAA0380
  • KIAA0382
  • KIAA0424
  • KIAA0521
  • KIAA0651
  • KIAA0720
  • KIAA0915
  • KIAA1112
  • KIAA1415
  • KIAA1556
  • KIAA1626
  • KIAA1639
  • KIAA2016
  • LARG
  • LBC
  • LFP40
  • MAGED1
  • MAPK8
  • MCF2
  • MCF2L
  • NBR
  • NET1
  • NGEF
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • NRAGE
  • OBSCN
  • OST
  • P85SPR
  • PAK3BP
  • PIXA
  • PIXB
  • PLEKHG2
  • PLEKHG5
  • PREX1
  • PRKM8
  • RAC1
  • RASGRF2
  • SAPK1
  • SAPK1C
  • SGEF
  • SH3D1A
  • SOLO
  • SOS1
  • SOS2
  • STEF
  • TC25
  • TEM4
  • TIAM1
  • TIAM2
  • TIM
  • TNFRSF16
  • TRAD
  • TRIO
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • ZFYVE3
  • ZFYVE4
  • ZFYVE5
  • ZFYVE6
Homo sapiens (human)
NRIF signals cell death from the nucleus
  • AD3
  • AD4
  • APH1A
  • APH1B
  • CENPR
  • ITGB3BP
  • JNK1
  • KIAA0253
  • MAPK8
  • NCSTN
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • NRIF3
  • ORCA
  • OSIL
  • PEN2
  • PRKM8
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RNF85
  • RPS27A
  • SAPK1
  • SAPK1C
  • SQSTM1
  • STM2
  • TNFRSF16
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
NS1 Mediated Effects on Host Pathways
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • G1P2
  • ISG15
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KPNA1
  • KPNA2
  • KPNA3
  • KPNA4
  • KPNA5
  • KPNA7
  • KPNB1
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NS
  • NTF97
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • QIP1
  • QIP2
  • RAE1
  • RANBP2
  • RCH1
  • RCH2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SRP1
  • TMEM48
  • TPR
  • UCRP
Homo sapiens (human)
NTF3 activates NTRK2 (TRKB) signaling
  • NTF3
  • NTRK2
  • TRKB
Homo sapiens (human)
NTF3 activates NTRK3 signaling
  • NTF3
  • NTRK3
  • TRKC
Homo sapiens (human)
NTF4 activates NTRK2 (TRKB) signaling
  • NTF4
  • NTF5
  • NTRK2
  • TRKB
Homo sapiens (human)
NTRK2 activates RAC1
  • BDNF
  • DOCK3
  • KIAA0299
  • MOCA
  • NTRK2
  • RAC1
  • TC25
  • TRKB
Homo sapiens (human)
NTRK3 as a dependence receptor
  • BAX
  • BCL2L4
  • COBRA1
  • KIAA1182
  • NELFB
  • NTRK3
  • TRKC
Homo sapiens (human)
NVP-TAE684-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters
  • B0AT1
  • B0AT2
  • B0AT3
  • BGT1
  • DAT1
  • GABATR
  • GABT1
  • GABT3
  • GAT1
  • GAT2
  • GAT3
  • GLYT2
  • NAT1
  • NET1
  • NTT73
  • OCT1
  • OCT2
  • PROT
  • SBAT1
  • SIT1
  • SLC18A1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A13
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A2
  • SLC6A20
  • SLC6A3
  • SLC6A5
  • SLC6A6
  • SLC6A7
  • SLC6A9
  • SVMT
  • VAT1
  • VMAT1
  • VMAT2
  • XT3
  • XTRP2
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
Nectin/Necl trans heterodimerization
  • CADM1
  • CADM3
  • HVEB
  • HVEC
  • IGSF4
  • IGSF4A
  • IGSF4B
  • LNIR
  • NECL1
  • NECL2
  • NECTIN1
  • NECTIN2
  • NECTIN3
  • NECTIN4
  • PRR1
  • PRR2
  • PRR3
  • PRR4
  • PVR
  • PVRL1
  • PVRL2
  • PVRL3
  • PVRL4
  • PVS
  • SYNCAM
  • SYNCAM3
  • TSLC1
  • TSLL1
Homo sapiens (human)
Neddylation
  • AMER1
  • ANKRD9
  • API4
  • APPBP1
  • ASB1
  • ASB10
  • ASB11
  • ASB12
  • ASB13
  • ASB14
  • ASB15
  • ASB16
  • ASB17
  • ASB18
  • ASB2
  • ASB3
  • ASB4
  • ASB5
  • ASB6
  • ASB7
  • ASB8
  • ASB9
  • BCRG2
  • BDPL
  • BHLHE17
  • BHLHE73
  • BHLHE78
  • BIG3
  • BIRC5
  • BKLHD2
  • BRCA1
  • BTBD1
  • BTBD6
  • BTRC
  • BTRCP
  • BTRCP2
  • BUP
  • C10orf8
  • C13orf17
  • C15orf1
  • C16orf22
  • C16orf31
  • C19orf58
  • C1orf166
  • C20orf163
  • C20orf92
  • C2orf37
  • C2orf5
  • C4orf30
  • C7orf76
  • CAND1
  • CAP20
  • CCDC22
  • CCDC8
  • CCNF
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDT2
  • CDW1
  • CIP1
  • CIS2
  • CIS3
  • CIS4
  • CIS6
  • CISH
  • CISH5
  • CISH6
  • CKN1
  • COMMD1
  • COMMD10
  • COMMD2
  • COMMD3
  • COMMD4
  • COMMD5
  • COMMD6
  • COMMD7
  • COMMD8
  • COMMD9
  • COP1
  • COPS1
  • COPS2
  • COPS3
  • COPS4
  • COPS5
  • COPS6
  • COPS7A
  • COPS7B
  • COPS8
  • CSA
  • CSN1
  • CSN2
  • CSN3
  • CSN4
  • CSN5
  • CSN6
  • CSN7A
  • CSN7B
  • CSN8
  • CUL1
  • CUL2
  • CUL3
  • CUL4A
  • CUL4B
  • CUL5
  • CUL7
  • CUL9
  • CXorf37
  • DCAF10
  • DCAF11
  • DCAF13
  • DCAF16
  • DCAF17
  • DCAF2
  • DCAF4
  • DCAF5
  • DCAF6
  • DCAF7
  • DCAF8
  • DCN1
  • DCUN1D1
  • DCUN1D2
  • DCUN1D3
  • DCUN1D4
  • DCUN1D5
  • DCUN1L1
  • DCUN1L2
  • DDA1
  • DDB1
  • DDB2
  • DEN1
  • DERP10
  • DPP3
  • DRC6
  • DSS1
  • DTL
  • ELOB
  • ELOC
  • EMC19
  • ENC2
  • EPAS1
  • EPRAP
  • ERCC8
  • F1AA
  • FAM123B
  • FANCN
  • FAT10
  • FBG2
  • FBG3
  • FBG4
  • FBG5
  • FBL12
  • FBL13
  • FBL14
  • FBL16
  • FBL18
  • FBL19
  • FBL2
  • FBL21
  • FBL3
  • FBL3A
  • FBL4
  • FBL5
  • FBL6
  • FBL7
  • FBL8
  • FBS2
  • FBW12
  • FBW1A
  • FBW1B
  • FBW2
  • FBW4
  • FBW5
  • FBW6
  • FBW7
  • FBW8
  • FBW9
  • FBX1
  • FBX10
  • FBX11
  • FBX14
  • FBX15
  • FBX17
  • FBX2
  • FBX20
  • FBX21
  • FBX22
  • FBX26
  • FBX27
  • FBX29
  • FBX30
  • FBX31
  • FBX4
  • FBX40
  • FBX41
  • FBX44
  • FBX6
  • FBX6A
  • FBX7
  • FBX9
  • FBXL1
  • FBXL12
  • FBXL13
  • FBXL14
  • FBXL15
  • FBXL16
  • FBXL18
  • FBXL19
  • FBXL20
  • FBXL21
  • FBXL21P
  • FBXL22
  • FBXL3
  • FBXL3A
  • FBXL3B
  • FBXL3P
  • FBXL4
  • FBXL5
  • FBXL7
  • FBXL8
  • FBXO1
  • FBXO10
  • FBXO11
  • FBXO12
  • FBXO15
  • FBXO17
  • FBXO2
  • FBXO20
  • FBXO21
  • FBXO22
  • FBXO26
  • FBXO27
  • FBXO29
  • FBXO30
  • FBXO31
  • FBXO32
  • FBXO35
  • FBXO37
  • FBXO4
  • FBXO40
  • FBXO41
  • FBXO44
  • FBXO6
  • FBXO6A
  • FBXO7
  • FBXO9
  • FBXW10
  • FBXW11
  • FBXW12
  • FBXW1A
  • FBXW1B
  • FBXW2
  • FBXW4
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  • WSB2
  • WTX
  • X
  • XAP1
  • Y
  • Y2
  • Z
  • ZBTB16
  • ZNF145
  • x
Homo sapiens (human)
Nef Mediated CD4 Down-regulation
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ARF1
  • ATP6V1H
  • CD4
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • LCK
  • nef
Homo sapiens (human)
Nef Mediated CD8 Down-regulation
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • ATP6V1H
  • CD8B
  • CD8B1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0109
  • KIAA0899
  • nef
Homo sapiens (human)
Nef and signal transduction
  • DOCK2
  • ELMO1
  • FYN
  • HCK
  • KIAA0209
  • KIAA0281
  • LCK
  • PAK2
  • RAC1
  • TC25
  • nef
Homo sapiens (human)
Nef mediated downregulation of CD28 cell surface expression
  • AP2M1
  • CD28
  • CLAPM1
  • KIAA0109
  • nef
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024