GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1326 - 1350 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
FGFR1b ligand binding and activation
  • C19orf3
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF22
  • FGF3
  • FGFA
  • FGFB
  • GIPC
  • GIPC1
  • INT2
  • RGS19IP1
  • TGFBR3
Homo sapiens (human)
Defective C1GALT1C1 causes TNPS
  • C1GALT1
  • C1GALT1C1
  • C6orf205
  • CA125
  • COSMC
  • DRCC1
  • KIAA1359
  • MG2
  • MUC1
  • MUC11
  • MUC12
  • MUC13
  • MUC15
  • MUC16
  • MUC17
  • MUC19
  • MUC2
  • MUC20
  • MUC21
  • MUC3
  • MUC3A
  • MUC3B
  • MUC4
  • MUC5
  • MUC5AC
  • MUC5B
  • MUC6
  • MUC7
  • MUCL1
  • PUM
  • RECC
  • SBEM
  • SMUC
Homo sapiens (human)
Defective SERPING1 causes hereditary angioedema
  • C1IN
  • C1NH
  • F12
  • KLK3
  • KLKB1
  • SERPING1
Homo sapiens (human)
Initial triggering of complement
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1QG
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C4A
  • C4B
  • C4B_2
  • CLL1
  • CO4
  • COLEC1
  • COLEC10
  • COLEC11
  • CPAMD2
  • CPAMD3
  • CRARF
  • CRARF1
  • FCN1
  • FCN2
  • FCN3
  • FCNH
  • FCNL
  • FCNM
  • HAKA1
  • IGHG1
  • IGHG2
  • IGHG3
  • IGHG4
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • MASP1
  • MBL
  • MBL2
  • PRSS5
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
Homo sapiens (human)
Classical antibody-mediated complement activation
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1QG
  • C1R
  • C1S
  • CRP
  • IGHG1
  • IGHG2
  • IGHG3
  • IGHG4
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • PTX1
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
Homo sapiens (human)
Defective Intrinsic Pathway for Apoptosis Due to p14ARF Loss of Function
  • C1QBP
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • GC1QBP
  • HABP1
  • MLM
  • SF2P32
Homo sapiens (human)
Apoptotic factor-mediated response
  • C1QBP
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • GC1QBP
  • HABP1
  • MLM
  • SF2P32
Homo sapiens (human)
Sialic acid metabolism
  • C1orf13
  • C20orf147
  • CGS23
  • CMAS
  • CTSA
  • ELNR1
  • GLB1
  • GLCNE
  • GNE
  • HDHD4
  • IBM2
  • KIAA1877
  • NANH
  • NANP
  • NANS
  • NANTA3
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • NEU4
  • NPL
  • PPGB
  • PST
  • PST1
  • SAS
  • SIAT1
  • SIAT10
  • SIAT2
  • SIAT3C
  • SIAT4
  • SIAT4A
  • SIAT4B
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7A
  • SIAT7B
  • SIAT7C
  • SIAT7D
  • SIAT7E
  • SIAT7F
  • SIAT8
  • SIAT8A
  • SIAT8B
  • SIAT8C
  • SIAT8D
  • SIAT8E
  • SIAT8F
  • SIAT9
  • SIATL1
  • SLC17A5
  • SLC35A1
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST3GAL5
  • ST3GAL6
  • ST6GAL1
  • ST6GAL2
  • ST6GALNAC1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA1
  • ST8SIA2
  • ST8SIA3
  • ST8SIA4
  • ST8SIA5
  • ST8SIA6
  • STHM
  • STX
  • STZ
Homo sapiens (human)
WNT ligand biogenesis and trafficking
  • C1orf139
  • GPR177
  • INT1
  • INT1L1
  • INT4
  • IRP
  • MEM3
  • MG61
  • PORC
  • PORCN
  • PPN
  • SNX3
  • TMED5
  • VPS26
  • VPS26A
  • VPS29
  • VPS35
  • WLS
  • WNT1
  • WNT10A
  • WNT10B
  • WNT11
  • WNT12
  • WNT13
  • WNT14
  • WNT14B
  • WNT15
  • WNT16
  • WNT2
  • WNT2B
  • WNT3
  • WNT3A
  • WNT4
  • WNT5A
  • WNT5B
  • WNT6
  • WNT7A
  • WNT7B
  • WNT8A
  • WNT8B
  • WNT8D
  • WNT9A
  • WNT9B
Homo sapiens (human)
Synthesis of wybutosine at G37 of tRNA(Phe)
  • C1orf171
  • C2orf60
  • KIAA0547
  • KIAA1393
  • LCMT2
  • RSAFD1
  • TRM12
  • TRM5
  • TRMT12
  • TRMT5
  • TYW1
  • TYW2
  • TYW3
  • TYW4
  • TYW5
Homo sapiens (human)
Formation of the cornified envelope
  • C1orf196
  • C1orf44
  • CANPL1
  • CAPN1
  • CAPN4
  • CAPNS
  • CAPNS1
  • CASP14
  • CDHF1
  • CDHF13
  • CDHF2
  • CDHF3
  • CDHF4
  • CDHF5
  • CDHF6
  • CDSN
  • CELA2A
  • CSTA
  • CTNNG
  • DP3
  • DSC1
  • DSC2
  • DSC3
  • DSC4
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSG4
  • DSP
  • ELA2A
  • EVPL
  • FLG
  • FUR
  • FURIN
  • IVL
  • JUP
  • KAZ
  • KAZN
  • KCP1
  • KIAA0568
  • KIAA1026
  • KLK12
  • KLK13
  • KLK14
  • KLK5
  • KLK8
  • KLKL4
  • KLKL5
  • KLKL6
  • KRTCAP1
  • KTG
  • LCE1A
  • LCE1B
  • LCE1C
  • LCE1D
  • LCE1E
  • LCE1F
  • LCE2A
  • LCE2B
  • LCE2C
  • LCE2D
  • LCE3A
  • LCE3B
  • LCE3C
  • LCE3D
  • LCE3E
  • LCE4A
  • LCE5A
  • LCE6A
  • LEKTI2
  • LELP1
  • LEP1
  • LEP10
  • LEP11
  • LEP12
  • LEP13
  • LEP14
  • LEP15
  • LEP16
  • LEP17
  • LEP18
  • LEP2
  • LEP3
  • LEP4
  • LEP5
  • LEP6
  • LEP8
  • LEP9
  • LIPJ
  • LIPK
  • LIPL1
  • LIPL2
  • LIPL3
  • LIPL4
  • LIPM
  • LIPN
  • LOR
  • LORICRIN
  • LRN
  • NRPN
  • PACE
  • PACE4
  • PCSK3
  • PCSK6
  • PERP
  • PI3
  • PIGPC1
  • PKP1
  • PKP2
  • PKP3
  • PKP4
  • PPL
  • PRSS14
  • PRSS19
  • PRSS8
  • RPTN
  • SCTE
  • SNC19
  • SPINK5
  • SPINK6
  • SPINK9
  • SPRC
  • SPRL1A
  • SPRL1B
  • SPRL2A
  • SPRL3A
  • SPRL4A
  • SPRL5A
  • SPRL6A
  • SPRL6B
  • SPRR1A
  • SPRR1B
  • SPRR2A
  • SPRR2B
  • SPRR2D
  • SPRR2E
  • SPRR2F
  • SPRR2G
  • SPRR3
  • ST14
  • STF1
  • STFA
  • TADG14
  • TADG15
  • TCHH
  • TGM1
  • TGM5
  • TGMX
  • THH
  • THL
  • THW
  • TRHY
  • WAP3
  • WFDC14
  • XP5
Homo sapiens (human)
Voltage gated Potassium channels
  • C1orf30
  • EAG
  • EAG1
  • EAG2
  • ERG
  • ERG1
  • ERG2
  • ERG3
  • HERG
  • HGK5
  • KCNA1
  • KCNA10
  • KCNA1B
  • KCNA2
  • KCNA2B
  • KCNA3
  • KCNA3B
  • KCNA4
  • KCNA4L
  • KCNA5
  • KCNA6
  • KCNA7
  • KCNA8
  • KCNA9
  • KCNAB1
  • KCNAB2
  • KCNAB3
  • KCNB1
  • KCNB2
  • KCNC1
  • KCNC2
  • KCNC3
  • KCNC4
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNF1
  • KCNF2
  • KCNG1
  • KCNG2
  • KCNG3
  • KCNG4
  • KCNH1
  • KCNH2
  • KCNH3
  • KCNH4
  • KCNH5
  • KCNH6
  • KCNH7
  • KCNH8
  • KCNK2
  • KCNQ1
  • KCNQ2
  • KCNQ3
  • KCNQ4
  • KCNQ5
  • KCNS1
  • KCNS2
  • KCNS3
  • KCNV1
  • KCNV2
  • KIAA1044
  • KIAA1144
  • KIAA1282
  • KVLQT1
Homo sapiens (human)
Lipid particle organization
  • C20orf142
  • C7orf68
  • CIDEA
  • CIDEC
  • FIT1
  • FIT2
  • FITM1
  • FITM2
  • FSP27
  • HIG2
  • HILPDA
  • HSD17B13
  • SCDR9
  • SDR16C3
Homo sapiens (human)
E2F-enabled inhibition of pre-replication complex formation
  • C20orf154
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • LATHEO
  • MCM8
  • ORC1
  • ORC1L
  • ORC2
  • ORC2L
  • ORC3
  • ORC3L
  • ORC4
  • ORC4L
  • ORC5
  • ORC5L
  • ORC6
  • ORC6L
  • P34CDC2
  • PARC1
Homo sapiens (human)
CDC6 association with the ORC:origin complex
  • C20orf154
  • CDC18L
  • CDC6
  • LATHEO
  • MCM8
  • ORC1
  • ORC1L
  • ORC2
  • ORC2L
  • ORC3
  • ORC3L
  • ORC4
  • ORC4L
  • ORC5
  • ORC5L
  • ORC6
  • ORC6L
  • PARC1
Homo sapiens (human)
Regulation of FZD by ubiquitination
  • C20orf182
  • C2orf31
  • FZD4
  • FZD5
  • FZD6
  • FZD8
  • GPR48
  • GPR49
  • GPR67
  • KIAA0055
  • KIAA1133
  • LGR4
  • LGR5
  • LGR6
  • LR3
  • LRP5
  • LRP6
  • LRP7
  • PWTSR
  • RNF203
  • RNF43
  • RPS27A
  • RSPO1
  • RSPO2
  • RSPO3
  • RSPO4
  • THSD2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBPY
  • USP8
  • WNT3A
  • ZNRF3
Homo sapiens (human)
RIP-mediated NFkB activation via ZBP1
  • C20orf183
  • CHUK
  • DDX9
  • DHX9
  • DLM1
  • FIP3
  • IKBA
  • IKBB
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KBRAS1
  • KBRAS2
  • LKP
  • LYT10
  • MAD3
  • MYD88
  • NDH2
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NFKBIB
  • NKIRAS1
  • NKIRAS2
  • PRVTIRB
  • RELA
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TCF16
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRIF
  • TRIP9
  • ZBP1
Homo sapiens (human)
IRF3 mediated activation of type 1 IFN
  • C20orf183
  • DLM1
  • DTX4
  • IRF3
  • KIAA0937
  • NAK
  • NALP4
  • NLRP4
  • PAN2
  • PYPAF4
  • RNF155
  • RNH2
  • TBK1
  • ZBP1
Homo sapiens (human)
ZBP1(DAI) mediated induction of type I IFNs
  • C20orf183
  • DLM1
  • ZBP1
Homo sapiens (human)
Maturation of spike protein
  • C20orf31
  • C20orf49
  • CANX
  • CGS23
  • CXorf11
  • DAD1
  • DDOST
  • EDEM2
  • FUT8
  • G19P1
  • G2AN
  • GANAB
  • GCP16
  • GCS1
  • GGNT1
  • GGNT5
  • GLCT1
  • GLYT1
  • GOLGA7
  • IAG2
  • ITM1
  • KIAA0088
  • KIAA0115
  • KIAA1292
  • KIAA1748
  • MAGT1
  • MAN1B1
  • MAN2A1
  • MANA2
  • MGAT
  • MGAT1
  • MGAT2
  • MGAT4A
  • MGAT4B
  • MGAT4C
  • MGAT5
  • MOGS
  • N33
  • NANTA3
  • OST48
  • PRKCSH
  • REAM
  • REC
  • RPN1
  • RPN2
  • S
  • SIAT1
  • SIAT3C
  • SIAT4
  • SIAT4A
  • SIAT4B
  • SIAT4C
  • SIAT6
  • SIAT7B
  • SIAT7C
  • SIAT7D
  • SIATL1
  • ST3GAL1
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL4
  • ST6GAL1
  • ST6GALNAC2
  • ST6GALNAC3
  • ST6GALNAC4
  • STHM
  • STT3A
  • STZ
  • TMC
  • TUSC3
  • ZDHHC10
  • ZDHHC11
  • ZDHHC2
  • ZDHHC20
  • ZDHHC3
  • ZDHHC5
  • ZDHHC8
  • ZDHHC9
  • ZDHHCL1
  • ZNF372
  • ZNF375
  • ZNF378
  • ZNF379
  • ZNF380
  • ZNF399
Homo sapiens (human)
Coenzyme A biosynthesis
  • C20orf48
  • COAB
  • COAC
  • COASY
  • DCAKD
  • PANK
  • PANK1
  • PANK2
  • PANK3
  • PPCDC
  • PPCS
Homo sapiens (human)
Cobalamin (Cbl) metabolism
  • C2orf25
  • CL25022
  • MMAA
  • MMAB
  • MMACHC
  • MMADHC
  • MMUT
  • MTR
  • MTRR
  • MUT
Homo sapiens (human)
Deadenylation of mRNA
  • C2orf29
  • CAF1
  • CALIF
  • CCR4
  • CCR4B
  • CCR4a
  • CDC36
  • CDC39
  • CNOT1
  • CNOT10
  • CNOT11
  • CNOT2
  • CNOT3
  • CNOT4
  • CNOT6
  • CNOT6L
  • CNOT7
  • CNOT8
  • CNOT9
  • DAN
  • DDX2A
  • DDX2B
  • DDX48
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4A3
  • EIF4B
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • HS2
  • KIAA0111
  • KIAA0191
  • KIAA0691
  • KIAA0710
  • KIAA1007
  • KIAA1194
  • KIAA1711
  • KIAA1741
  • LENG2
  • NOT1
  • NOT2
  • NOT3
  • NOT4
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PAIP1
  • PAN2
  • PAN3
  • PARN
  • POP2
  • RCD1
  • RQCD1
  • TAB182
  • TNKS1BP1
  • TUT4
  • TUT7
  • USP52
  • ZCCHC11
  • ZCCHC6
Homo sapiens (human)
Hedgehog ligand biogenesis
  • C2orf30
  • C7orf76
  • DER2
  • DERL2
  • DHH
  • DSS1
  • ERBA2L
  • ERLEC1
  • FLANA
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HHAT
  • HRD1
  • HSPC
  • IFI5111
  • IHH
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA1810
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MART2
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  • UBC
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  • UBCEP2
  • VCP
  • X
  • XTP3TPB
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
Hh mutants are degraded by ERAD
  • C2orf30
  • C7orf76
  • DER2
  • DERL2
  • DSS1
  • ERLEC1
  • FLANA
  • HC2
  • HC3
  • HC8
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  • HEL-220
  • HEL-S-70
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  • KIAA0077
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  • UBCEP2
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  • Y
  • Y2
  • Z
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Last updated: August 19, 2024