GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1401 - 1425 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
RHO GTPases activate PAKs
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CDC42
  • CTTN
  • EMS1
  • FLN
  • FLN1
  • FLNA
  • KIAA0866
  • KIAA2034
  • LIMK
  • LIMK1
  • MBS
  • MLC2
  • MLCK
  • MLCK1
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYLK
  • MYLK1
  • MYPT1
  • MYPT2
  • MYRL2
  • NF2
  • OPHN3
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • PPP1R12B
  • RAC1
  • SCH
  • TC25
Homo sapiens (human)
Sodium/Calcium exchangers
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CNC
  • JSX
  • KIAA0702
  • KIAA1087
  • NCKX1
  • NCKX2
  • NCKX3
  • NCKX4
  • NCKX5
  • NCKX6
  • NCLX
  • NCX1
  • NCX2
  • NCX3
  • SLC24A1
  • SLC24A2
  • SLC24A3
  • SLC24A4
  • SLC24A5
  • SLC24A6
  • SLC8A1
  • SLC8A2
  • SLC8A3
  • SLC8B1
  • SRI
Homo sapiens (human)
Activation of Ca-permeable Kainate Receptor
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • DLG1
  • DLG3
  • DLG4
  • GLUR5
  • GLUR6
  • GLUR7
  • GRIK
  • GRIK1
  • GRIK2
  • GRIK3
  • GRIK4
  • GRIK5
  • KIAA1232
  • NCALD
  • PSD95
Homo sapiens (human)
Cam-PDE 1 activation
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • PDE1A
  • PDE1B
  • PDE1C
  • PDES1B
Homo sapiens (human)
CaM pathway
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
Homo sapiens (human)
Phase 1 - inactivation of fast Na+ channels
  • CALP
  • CSEN
  • DREAM
  • KCHIP1
  • KCHIP2
  • KCHIP3
  • KCHIP4
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNIP1
  • KCNIP2
  • KCNIP3
  • KCNIP4
  • KIAA1044
  • VABP
Homo sapiens (human)
Calnexin/calreticulin cycle
  • CALR
  • CANX
  • CRTC
  • ERP57
  • ERP60
  • G19P1
  • G2AN
  • GANAB
  • GRP58
  • KIAA0088
  • PDIA3
  • PRKCSH
Homo sapiens (human)
Assembly of Viral Components at the Budding Site
  • CALR
  • CANX
  • CRTC
  • HA
  • M
  • NA
  • NP
Homo sapiens (human)
Signal transduction by L1
  • CAML1
  • CK2A1
  • CK2A2
  • CK2N
  • CSNK2A1
  • CSNK2A2
  • CSNK2B
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERK1
  • ERK2
  • FNRA
  • FNRB
  • G5A
  • GP2B
  • GP3A
  • HER1
  • ITGA2B
  • ITGA5
  • ITGA9
  • ITGAB
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB3
  • L1CAM
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MDF2
  • MEK1
  • MEK2
  • MIC5
  • MKK2
  • MSK12
  • MSK8
  • NCAM
  • NCAM1
  • NRP
  • NRP1
  • PAK1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAC1
  • TC25
  • VAV2
  • VEGF165R
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Maturation of spike protein
  • CANX
  • G19P1
  • G2AN
  • GANAB
  • GCS1
  • GGNT1
  • GLCT1
  • GLYT1
  • KIAA0088
  • MGAT
  • MGAT1
  • MOGS
  • PRKCSH
  • S
Homo sapiens (human)
Activation of IRF3, IRF7 mediated by TBK1, IKKε (IKBKE)
  • CAP-1
  • CD14
  • CRAF1
  • ESOP1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IRF3
  • IRF7
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • LY96
  • MD2
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRAM
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Regulation of TBK1, IKKε (IKBKE)-mediated activation of IRF3, IRF7
  • CAP-1
  • CD14
  • CRAF1
  • ESOP1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • LY96
  • MD2
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • RPS27A
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRAM
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
TICAM1-dependent activation of IRF3/IRF7
  • CAP-1
  • CRAF1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IRF3
  • IRF7
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • RPS27A
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Regulation of TBK1, IKKε-mediated activation of IRF3, IRF7 upon TLR3 ligation
  • CAP-1
  • CRAF1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • RPS27A
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
TRAF3 deficiency - HSE
  • CAP-1
  • CRAF1
  • PRVTIRB
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRIF
Homo sapiens (human)
p53-Dependent G1 DNA Damage Response
  • CAP20
  • CCN1
  • CCNA
  • CCNA1
  • CCNA2
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDK2
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CDKN2
  • CIP1
  • KIP1
  • MDA6
  • PIC1
  • SDI1
  • WAF1
  • p27
Homo sapiens (human)
Signaling by FLT3 fusion proteins
  • CAP20
  • CD245
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CEV14
  • CIP1
  • ETV6
  • FIM
  • GAB2
  • GOLGB1
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • KIAA0216
  • KIAA0571
  • MDA6
  • MYO18A
  • MYSPDZ
  • NOX4
  • NRAS
  • PIC1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIM1
  • RAMP
  • RENOX
  • SDI1
  • SOS1
  • SPTB2
  • SPTBN1
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TEL
  • TEL1
  • TIAF1
  • TRIP11
  • WAF1
  • ZMYM2
  • ZNF198
Homo sapiens (human)
Transcriptional activation of cell cycle inhibitor p21
  • CAP20
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CIP1
  • HZF
  • MDA6
  • P53
  • PCBP4
  • PIC1
  • RZF
  • SDI1
  • TP53
  • WAF1
  • ZNF385
  • ZNF385A
Homo sapiens (human)
Condensation of Prophase Chromosomes
  • CAPC
  • CAPD3
  • CAPE
  • CAPH2
  • CCNB
  • CCNB1
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3-4
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H3FT
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST3H3
  • HIST4H4
  • KIAA0056
  • KMT5A
  • LUZP5
  • MCPH1
  • NCAPD3
  • NCAPG2
  • NCAPH2
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
  • PRSET7
  • RB1
  • SET
  • SET07
  • SET8
  • SETD8
  • SMC2
  • SMC2L1
  • SMC4
  • SMC4L1
  • TSH2B
Homo sapiens (human)
p75NTR recruits signalling complexes
  • CARDIAK
  • DXS1179E
  • IKBKB
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • MYD88
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • ORCA
  • OSIL
  • PRKCI
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • RPS27A
  • SQSTM1
  • TNFRSF16
  • TRAF6
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Pentose phosphate pathway
  • CARKL
  • DERA
  • G6PD
  • PGD
  • PGDH
  • PGLS
  • PGM2
  • RBKS
  • RBSK
  • RPE
  • RPEL1
  • RPI
  • RPIA
  • SHPK
  • TAL
  • TALDO
  • TALDO1
  • TALDOR
  • TKT
Homo sapiens (human)
Interleukin-1 processing
  • CASP1
  • CTSG
  • DFNA5L
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • IGIF
  • IL18
  • IL1A
  • IL1B
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IL1F1
  • IL1F2
  • IL1F4
  • LYT10
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • RELA
Homo sapiens (human)
NF-kB activation through FADD/RIP-1 pathway mediated by caspase-8 and -10
  • CASP10
  • CASP8
  • CHUK
  • DDX58
  • EFP
  • FADD
  • FIP3
  • IFIH1
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IPS1
  • KIAA1271
  • MAVS
  • MCH4
  • MCH5
  • MDA5
  • MORT1
  • NEMO
  • RH116
  • RIGI
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF87
  • TCF16
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)
Apoptotic cleavage of cell adhesion proteins
  • CASP3
  • CDH1
  • CDHE
  • CDHF4
  • CDHF5
  • CDHF6
  • CPP32
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DSG1
  • DSG2
  • DSG3
  • DSP
  • OCLN
  • PKP1
  • TJP1
  • TJP2
  • UVO
  • X104
  • ZO1
  • ZO2
Homo sapiens (human)
Stimulation of the cell death response by PAK-2p34
  • CASP3
  • CPP32
  • PAK2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024