GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1451 - 1475 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▼ GlyTouCan ID
Biosynthesis of DPAn-6 SPMs
  • 12LO
  • ALOX12
  • ALOX15
  • LOG12
  • LOG15
Homo sapiens (human)
Masitinib-resistant KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
RHOQ GTPase cycle
  • ABCC7
  • ARHDH9
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP33
  • ARHGAP34
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGAP7
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • ARHQ
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • ASCT2
  • BND7
  • BORG1
  • BORG2
  • BORG4
  • BORG5
  • BT
  • C11orf59
  • C6orf114
  • CAL
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP4
  • CDC42GAP
  • CEP1
  • CEP2
  • CEP3
  • CEP4
  • CFTR
  • CIP4
  • COOL1
  • CPNE8
  • CRIB1
  • CTNNG
  • DEPDC1B
  • DIAP3
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DP3
  • EPB72
  • FBP17
  • FIG
  • FNBP1
  • FNBP2
  • GFOD1
  • GIT1
  • GIT2
  • GJA1
  • GJAL
  • GOPC
  • GRAF
  • GRF1
  • GRIT
  • GRLF1
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • ITSN
  • ITSN1
  • JUP
  • KIAA0051
  • KIAA0142
  • KIAA0147
  • KIAA0148
  • KIAA0424
  • KIAA0451
  • KIAA0456
  • KIAA0554
  • KIAA0599
  • KIAA0621
  • KIAA0712
  • KIAA1124
  • KIAA1142
  • KIAA1415
  • KIAA1424
  • KIAA1556
  • KIAA1639
  • KIAA1722
  • KIAA1723
  • LAMTOR1
  • LAP4
  • M7V1
  • MPP7
  • MSE55
  • NBC2
  • NBC2B
  • NBC3
  • NBCn1
  • OBSCN
  • OPHN1
  • OPHN1L
  • P190A
  • P85SPR
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3BP
  • PAK4
  • PDRO
  • PIXB
  • PLEKHG3
  • PREX1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RASL7A
  • RDR
  • RDRC
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RHOQ
  • RICH1
  • RICS
  • SBC2
  • SCRB1
  • SCRIB
  • SH3D1A
  • SLC1A5
  • SLC4A6
  • SLC4A7
  • SNAP23
  • SNX26
  • SRGAP2
  • SRGAP2A
  • STARD12
  • STB2
  • STEAP3
  • STOM
  • STOT
  • STP
  • SYB3
  • SYDE1
  • TC10
  • TCGAP
  • TFRC
  • TRIP10
  • TSAP6
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VARTUL
  • WASL
  • WWP2
  • XTP8
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
Digestion of dietary lipid
  • BAL
  • CEL
  • CLPS
  • LIPF
  • PLRP1
  • PLRP2
  • PNLIP
  • PNLIPRP1
  • PNLIPRP2
  • PNLIPRP3
Homo sapiens (human)
RHOU GTPase cycle
  • ARHGAP30
  • ARHGAP31
  • ARHGAP34
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHU
  • BP230
  • BP240
  • BPAG1
  • CDC42
  • CDC42L1
  • CDGAP
  • CLH17
  • CLTC
  • CLTCL2
  • COOL1
  • COOL2
  • DEPDC1B
  • DFFRX
  • DLG5
  • DMH
  • DST
  • DT
  • ECK
  • EPHA2
  • FAK2
  • FAM
  • FNBP2
  • G28K
  • GIT1
  • GIT2
  • GRB1
  • GRB4
  • HBP
  • HGS
  • HRS
  • IQGAP1
  • ITSN2
  • KIAA0006
  • KIAA0034
  • KIAA0051
  • KIAA0142
  • KIAA0148
  • KIAA0389
  • KIAA0456
  • KIAA0583
  • KIAA0728
  • KIAA1142
  • KIAA1204
  • KIAA1256
  • KIAA2002
  • MYO6
  • NCK
  • NCK1
  • NCK2
  • NEAS
  • OPHN3
  • P85SPR
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PAK3BP
  • PAK4
  • PAR6A
  • PARD6A
  • PDLG
  • PEAK1
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIXA
  • PIXB
  • PTK2B
  • PYK2
  • RAFTK
  • RHOU
  • SH3D1B
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • SPTB2
  • SPTBN1
  • SRC
  • SRC1
  • SRGAP2
  • SRGAP2A
  • STAM
  • STAM1
  • STAM2
  • STB2
  • SWAP
  • TRP32
  • TXL
  • TXNL
  • TXNL1
  • USP9
  • USP9X
  • VANGL1
  • WDR6
  • WRCH1
  • WWP2
  • XTP8
Homo sapiens (human)
Hormone ligand-binding receptors
  • CGA
  • FSHB
  • FSHR
  • GNRH
  • GNRH1
  • GNRH2
  • GNRHR
  • GNRHR2
  • GPA2
  • GPB5
  • GPHA2
  • GPHB5
  • GRH
  • GRHR
  • LCGR
  • LGR1
  • LGR2
  • LGR3
  • LHB
  • LHCGR
  • LHRH
  • LHRHR
  • TSHB
  • TSHR
  • ZLUT1
  • ZSIG51
Homo sapiens (human)
Membrane binding and targetting of GAG proteins
  • C9orf28
  • CFBP
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HCRP1
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NMT2
  • PML39
  • RPS27A
  • TSG101
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS28
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • WBSCR24
  • gag
Homo sapiens (human)
ERK/MAPK targets
  • BMK1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • ELK1
  • ERK1
  • ERK2
  • ERK5
  • ISPK1
  • MAPK1
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPK3
  • MAPK7
  • MAPKAPK1A
  • MAPKAPK1B
  • MAPKAPK1C
  • MEF2
  • MEF2A
  • MEF2C
  • MSK1
  • MXI2
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5D
  • PRKM1
  • PRKM11
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKM7
  • RPS6KA1
  • RPS6KA2
  • RPS6KA3
  • RPS6KA5
  • RSK1
  • RSK2
  • RSK3
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
Homo sapiens (human)
Hedgehog 'on' state
  • C14orf41
  • C1orf28
  • C7orf76
  • CDC73
  • CUL3
  • DHH
  • DSS1
  • DZIP
  • DZIP1
  • DZIP2
  • EVC
  • EVC2
  • GLI
  • GLI1
  • GLI2
  • GLI3
  • GPR161
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HRPT2
  • HSPC
  • IFI5111
  • IHH
  • ITCH
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA0617
  • KIAA0996
  • KIAA1625
  • KIF7
  • LBN
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • NUMB
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTCH
  • PTCH1
  • RBX1
  • RING10
  • RING12
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SHH
  • SMO
  • SMOH
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SPOP
  • SPOPL
  • SUFU
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • THP
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ULK3
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
NOD1/2 Signaling Pathway
  • AAMP
  • API1
  • API2
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARD9
  • CARDIAK
  • CASP1
  • CASP2
  • CASP4
  • CASP8
  • CASP9
  • CHUK
  • CROC1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CYLD
  • CYLD1
  • ERK6
  • FIP3
  • ICH1
  • ICH2
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • ITCH
  • KIAA0733
  • KIAA0849
  • MAP2K6
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MAPK11
  • MAPK12
  • MAPK13
  • MAPK14
  • MCH5
  • MCH6
  • MEK6
  • MIHB
  • MIHC
  • MKK6
  • MXI2
  • N
  • NEDD2
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • OTUD7C
  • PRKM11
  • PRKM13
  • PRKMK6
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF85
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SAPK3
  • SAPK4
  • SKK3
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TCF16
  • TNFAIP3
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
Intracellular metabolism of fatty acids regulates insulin secretion
  • ACS3
  • ACS4
  • ACSL3
  • ACSL4
  • CD36
  • FACL3
  • FACL4
  • GP3B
  • GP4
  • LACS3
  • LACS4
Homo sapiens (human)
Nephron development
  • BRN1
  • DLL1
  • HNF1B
  • HNF4
  • HNF4A
  • IRX1
  • IRX2
  • IRXA1
  • IRXA2
  • JAG1
  • JAGL1
  • LFNG
  • LHX1
  • LIM-1
  • LIM1
  • NR2A1
  • OTF8
  • POU3F3
  • TCF14
  • TCF2
  • WNT14B
  • WNT15
  • WNT4
  • WNT9B
  • WT1
Homo sapiens (human)
RUNX1 regulates transcription of genes involved in interleukin signaling
  • AML1
  • CBFA2
  • CBFB
  • ELF1
  • IL3
  • LIFR
  • RUNX1
Homo sapiens (human)
Activation of SMO
  • ADRBK1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BARK
  • BARK1
  • BOC
  • CDO
  • CDON
  • CSNK1A1
  • DHH
  • DRC4
  • EFCAB7
  • EVC
  • EVC2
  • GAS1
  • GAS11
  • GAS8
  • GRK2
  • IHH
  • IQCE
  • KIAA1023
  • KIAA1799
  • KIF3
  • KIF3A
  • LBN
  • PTCH
  • PTCH1
  • SHH
  • SMO
  • SMOH
Homo sapiens (human)
Mitochondrial calcium ion transport
  • AKAP1
  • AKAP149
  • C10orf42
  • C22orf32
  • CALC
  • CBARA1
  • CCDC109A
  • CCDC109B
  • EFHA1
  • EFHA2
  • EMRE
  • LETM1
  • MCU
  • MCUB
  • MICU1
  • MICU2
  • MICU3
  • NCKX6
  • NCLX
  • NCX3
  • PRKA1
  • SLC24A6
  • SLC8A3
  • SLC8B1
  • SMDT1
  • VDAC
  • VDAC1
  • VDAC2
  • VDAC3
Homo sapiens (human)
Interleukin-18 signaling
  • ALOX5
  • FIL1Z
  • IGIF
  • IL13
  • IL18
  • IL18BP
  • IL18R1
  • IL18RAP
  • IL1F4
  • IL1F7
  • IL1H4
  • IL1R7
  • IL1RP1
  • IL1RRP
  • IL37
  • IL4
  • LOG5
  • NC30
Homo sapiens (human)
Phosphorylation of proteins involved in G1/S transition by active Cyclin E:Cdk2 complexes
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CDK2
  • CDKN2
  • RB1
Homo sapiens (human)
SMAD2/3 Phosphorylation Motif Mutants in Cancer
  • ALK5
  • MADH2
  • MADH3
  • MADR2
  • SKR4
  • SMAD2
  • SMAD3
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
Homo sapiens (human)
IRAK1 recruits IKK complex upon TLR7/8 or 9 stimulation
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • IRAK
  • IRAK1
  • NEMO
  • PELI1
  • PELI2
  • PELI3
  • PRISM
  • RNF85
  • TCF16
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
Coenzyme A biosynthesis
  • C20orf48
  • COAB
  • COAC
  • COASY
  • DCAKD
  • PANK
  • PANK1
  • PANK2
  • PANK3
  • PPCDC
  • PPCS
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Transcription Initiation From Type 1 Promoter
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF
  • BRF1
  • C6orf51
  • CRCP
  • GTF2D1
  • GTF3A
  • GTF3B
  • GTF3C1
  • GTF3C2
  • GTF3C3
  • GTF3C4
  • GTF3C5
  • GTF3C6
  • KIAA0011
  • KIAA1241
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • RPC11
  • RPC8
  • TAF3B2
  • TAF3C
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
Homo sapiens (human)
CaM pathway
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
Homo sapiens (human)
CREB1 phosphorylation through the activation of CaMKII/CaMKK/CaMKIV cascasde
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-GR
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2B
  • CAMK2G
  • CAMK4
  • CAMKB
  • CAMKG
  • CAMKIV
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • KIAA0787
  • KPNA2
  • RCH1
  • SRP1
Homo sapiens (human)
PCNA-Dependent Long Patch Base Excision Repair
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • CHRAC17
  • DPE2
  • FEN1
  • HAP1
  • KIAA0039
  • LIG1
  • PCNA
  • POLB
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • RAD2
  • REF1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
Homo sapiens (human)
Tat-mediated elongation of the HIV-1 transcript
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C19orf17
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCNH
  • CCNT1
  • CDC2L4
  • CDK7
  • CDK9
  • CDKN7
  • COBRA1
  • CTDP1
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • KIAA1182
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RNF66
  • RPB7
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SSRP1
  • STK1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • TTDA
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • tat
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024