GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1676 - 1700 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
PKR-mediated signaling
  • ADAR
  • ADAR1
  • APITD1
  • APRF
  • ARI
  • ARIH1
  • C17orf70
  • C19orf40
  • C1orf86
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • CEB1
  • CEBP1
  • CENPS
  • CENPX
  • CHUK
  • DDX9
  • DHX9
  • DNAJC3
  • DRBF
  • DSRAD
  • DUS2
  • DUS2L
  • EFP
  • EIF2A
  • EIF2AK2
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • FAA
  • FAAP10
  • FAAP100
  • FAAP16
  • FAAP20
  • FAAP24
  • FAC
  • FACA
  • FACC
  • FACE
  • FANCA
  • FANCB
  • FANCC
  • FANCE
  • FANCF
  • FANCG
  • FANCH
  • FANCL
  • FANCM
  • FIP3
  • G1P1
  • G1P2
  • HERC5
  • HSC70
  • HSP72
  • HSP73
  • HSPA1
  • HSPA10
  • HSPA1A
  • HSPA1B
  • HSPA1L
  • HSPA2
  • HSPA8
  • HSX70
  • IFI4
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • ILF2
  • ILF3
  • IPS1
  • ISG15
  • KIAA1271
  • KIAA1596
  • LKP
  • MAP2K6
  • MAVS
  • MEK6
  • MHF1
  • MHF2
  • MKK6
  • MOP6
  • MPHOSPH4
  • N
  • NACP
  • NCK
  • NCK1
  • NDH2
  • NEMO
  • NF45
  • NF90
  • NPM
  • NPM1
  • NS
  • P34CDC2
  • P53
  • P58IPK
  • PACT
  • PARK1
  • PHF9
  • PKR
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PRKMK6
  • PRKR
  • PRKRA
  • PRKRI
  • PTPN2
  • PTPT
  • RAX
  • RNF147
  • SK1
  • SKK3
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SNCA
  • SPHK
  • SPHK1
  • SPK
  • STAT1
  • STAT3
  • STRA13
  • SUMO1
  • TARBP2
  • TCF16
  • TP53
  • TRBP
  • TRIM25
  • TRS1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBCH7BP
  • UBCH8
  • UBE2I
  • UBE2L6
  • UBL1
  • UCRP
  • VISA
  • XRCC9
  • ZNF147
  • tat
Homo sapiens (human)
Formation of editosomes by ADAR proteins
  • ADAR
  • ADAR1
  • ADAR2
  • ADARB1
  • DRADA2
  • DSRAD
  • G1P1
  • IFI4
  • RED1
Homo sapiens (human)
C6 deamination of adenosine
  • ADAR
  • ADAR1
  • ADAR2
  • ADARB1
  • DRADA2
  • DSRAD
  • G1P1
  • IFI4
  • RED1
Homo sapiens (human)
Collagen biosynthesis and modifying enzymes
  • ADAMTS14
  • ADAMTS2
  • ADAMTS3
  • BMP1
  • BP180
  • BPAG2
  • C1orf17
  • C3orf7
  • CASP
  • CBP1
  • CBP2
  • COL10A1
  • COL11A1
  • COL11A2
  • COL12A1
  • COL12A1L
  • COL13A1
  • COL14A1
  • COL15A1
  • COL16A1
  • COL17A1
  • COL18A1
  • COL19A1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL1AL
  • COL20A1
  • COL21A1
  • COL22A1
  • COL23A1
  • COL24A1
  • COL25A1
  • COL26A1
  • COL27A1
  • COL28
  • COL28A1
  • COL29A1
  • COL2A1
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL4A5
  • COL4A6
  • COL5A1
  • COL5A2
  • COL5A3
  • COL6A1
  • COL6A2
  • COL6A3
  • COL6A5
  • COL6A6
  • COL7A1
  • COL8A1
  • COL8A2
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COLGALT1
  • COLGALT2
  • COLL6
  • CRTAP
  • CYPB
  • EMID2
  • EMU2
  • ERBA2L
  • GLT25D1
  • GLT25D2
  • GROS1
  • HSP47
  • KIAA0366
  • KIAA0584
  • KIAA0932
  • KIAA1510
  • KIAA1870
  • LEPRE1
  • LEPREL1
  • LEPREL2
  • LLH
  • MLAT4
  • P3H1
  • P3H2
  • P3H3
  • P4HA
  • P4HA1
  • P4HA2
  • P4HA3
  • P4HB
  • PCINP
  • PCOLC
  • PCOLCE
  • PCOLCE2
  • PCPE1
  • PCPE2
  • PCPNI
  • PDI
  • PDIA1
  • PLOD
  • PLOD1
  • PLOD2
  • PLOD3
  • PO4DB
  • PPIB
  • SERPINH1
  • SERPINH2
  • TLL
  • TLL1
  • TLL2
  • UND
  • VWA4
Homo sapiens (human)
Defective VWF cleavage by ADAMTS13 variant
  • ADAMTS13
  • C9orf8
  • F8VWF
  • VWF
Homo sapiens (human)
Enhanced cleavage of VWF variant by ADAMTS13
  • ADAMTS13
  • C9orf8
  • F8VWF
  • VWF
Homo sapiens (human)
Platelet Adhesion to exposed collagen
  • ADAMTS13
  • C9orf8
  • CD49B
  • F8VWF
  • FCER1G
  • FNRB
  • FYN
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP6
  • GP9
  • ITGA1
  • ITGA10
  • ITGA2
  • ITGB1
  • JTK8
  • LYN
  • MDF2
  • MSK12
  • VWF
Homo sapiens (human)
Defective B3GALTL causes PpS
  • ADAMTS1
  • ADAMTS10
  • ADAMTS11
  • ADAMTS12
  • ADAMTS13
  • ADAMTS14
  • ADAMTS15
  • ADAMTS16
  • ADAMTS17
  • ADAMTS18
  • ADAMTS19
  • ADAMTS2
  • ADAMTS20
  • ADAMTS21
  • ADAMTS3
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • ADAMTS6
  • ADAMTS7
  • ADAMTS8
  • ADAMTS9
  • ADAMTSL1
  • ADAMTSL2
  • ADAMTSL3
  • ADAMTSL4
  • ADAMTSL5
  • ADAMTSR1
  • ADMP2
  • B3GALTL
  • B3GLCT
  • B3GTL
  • C8orf84
  • C9orf8
  • C9orf94
  • CFP
  • DIL1
  • KIAA0366
  • KIAA0605
  • KIAA0688
  • KIAA0762
  • KIAA0960
  • KIAA1233
  • KIAA1312
  • KIAA1346
  • KIAA1445
  • KIAA1679
  • KIAA2029
  • KIAA2036
  • METH1
  • METH2
  • PCINP
  • PCPNI
  • PFC
  • RPESP
  • SBSPON
  • SEMA5A
  • SEMA5B
  • SEMAF
  • SEMAG
  • SPON1
  • SPON2
  • SSPO
  • SSPOP
  • THBS1
  • THBS2
  • THSD1
  • THSD4
  • THSD6
  • THSD7A
  • THSD7B
  • TMTSP
  • TSP
  • TSP1
  • TSP2
  • TSRC1
  • VSGP
Homo sapiens (human)
O-glycosylation of TSR domain-containing proteins
  • ADAMTS1
  • ADAMTS10
  • ADAMTS11
  • ADAMTS12
  • ADAMTS13
  • ADAMTS14
  • ADAMTS15
  • ADAMTS16
  • ADAMTS17
  • ADAMTS18
  • ADAMTS19
  • ADAMTS2
  • ADAMTS20
  • ADAMTS21
  • ADAMTS3
  • ADAMTS4
  • ADAMTS5
  • ADAMTS6
  • ADAMTS7
  • ADAMTS8
  • ADAMTS9
  • ADAMTSL1
  • ADAMTSL2
  • ADAMTSL3
  • ADAMTSL4
  • ADAMTSL5
  • ADAMTSR1
  • ADMP2
  • B3GALTL
  • B3GLCT
  • B3GTL
  • C21orf80
  • C8orf84
  • C9orf8
  • C9orf94
  • CFP
  • DIL1
  • FUT13
  • KIAA0366
  • KIAA0605
  • KIAA0688
  • KIAA0762
  • KIAA0958
  • KIAA0960
  • KIAA1233
  • KIAA1312
  • KIAA1346
  • KIAA1445
  • KIAA1679
  • KIAA2029
  • KIAA2036
  • METH1
  • METH2
  • PCINP
  • PCPNI
  • PFC
  • POFUT2
  • RPESP
  • SBSPON
  • SEMA5A
  • SEMA5B
  • SEMAF
  • SEMAG
  • SPON1
  • SPON2
  • SSPO
  • SSPOP
  • THBS1
  • THBS2
  • THSD1
  • THSD4
  • THSD6
  • THSD7A
  • THSD7B
  • TMTSP
  • TSP
  • TSP1
  • TSP2
  • TSRC1
  • VSGP
Homo sapiens (human)
Interaction With Cumulus Cells And The Zona Pellucida
  • ADAM2
  • ADAM20
  • ADAM21
  • ADAM30
  • B4GALT1
  • FTNB
  • GGTB2
  • HYAL3
  • MUC9
  • OGP
  • OVGP1
  • PH20
  • SPAM1
  • ZP1
  • ZP2
  • ZP3
  • ZP3A
  • ZP3B
  • ZP4
  • ZPA
  • ZPB
  • ZPC
Homo sapiens (human)
Regulation of CDH11 function
  • ADAM19
  • ADAM33
  • ANGPTL4
  • ARP4
  • C20orf153
  • CDH11
  • CTNNA1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • CTNNG
  • DP3
  • HFARP
  • JUP
  • KIAA0384
  • MLTNB
  • PGAR
Homo sapiens (human)
CD163 mediating an anti-inflammatory response
  • ADAM17
  • CD163
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CSVP
  • FUR
  • FURIN
  • IFNB2
  • IL10
  • IL6
  • IRHOM2
  • M130
  • MAPK14
  • MXI2
  • MYH9
  • PACE
  • PCSK3
  • PLK2
  • RHBDF2
  • RHBDL5
  • RHBDL6
  • SAPK2A
  • SNK
  • TACE
Homo sapiens (human)
Release of Hh-Np from the secreting cell
  • ADAM17
  • C15orf36
  • CEGP1
  • CSVP
  • DHH
  • DISP2
  • DISPB
  • GPC5
  • IHH
  • KIAA1742
  • LINC00594
  • NOTUM
  • SCUBE2
  • SHH
  • TACE
Homo sapiens (human)
TNF signaling
  • ADAM17
  • BAG4
  • CSVP
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • SODD
  • TACE
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAP3
Homo sapiens (human)
Growth hormone receptor signaling
  • ADAM17
  • APRF
  • CIS2
  • CIS3
  • CISH
  • CSH1
  • CSVP
  • ERK1
  • ERK2
  • G18
  • GH1
  • GH2
  • GHR
  • HCP
  • IRS1
  • IRS2
  • JAK2
  • JTK8
  • LYN
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRL
  • PRLR
  • PTP1B
  • PTP1C
  • PTPN1
  • PTPN6
  • SOCS1
  • SOCS2
  • SOCS3
  • SSI1
  • SSI2
  • SSI3
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • STATI2
  • TACE
  • TIP3
Homo sapiens (human)
Invadopodia formation
  • ADAM12
  • ADAM15
  • ADAM19
  • FISH
  • KIAA0418
  • MDC15
  • MLTN
  • MLTNB
  • SH3MD1
  • SH3PXD2A
  • TKS5
Homo sapiens (human)
LGI-ADAM interactions
  • ADAM11
  • ADAM22
  • ADAM23
  • CACNG2
  • CACNG3
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG8
  • DLG4
  • EPT
  • KIAA1916
  • LGI1
  • LGI2
  • LGI3
  • LGI4
  • LGIL2
  • LGIL3
  • LGIL4
  • MDC
  • MDC2
  • MDC3
  • PSD95
  • STX1
  • STX1A
  • STX1B
  • STX1B1
  • STX1B2
Homo sapiens (human)
Constitutive Signaling by NOTCH1 t(7;9)(NOTCH1:M1580_K2555) Translocation Mutant
  • ADAM10
  • ADAM17
  • CSVP
  • DLL1
  • DLL4
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KUZ
  • MADM
  • NOTCH1
  • TACE
  • TAN1
Homo sapiens (human)
Constitutive Signaling by NOTCH1 HD Domain Mutants
  • ADAM10
  • ADAM17
  • CSVP
  • DIP1
  • DLL1
  • DLL4
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KIAA1323
  • KUZ
  • MADM
  • MIB1
  • MIB2
  • NEURL
  • NEURL1
  • NEURL1A
  • NEURL1B
  • NEURL3
  • NOTCH1
  • RNF67
  • RPS27A
  • SKD
  • TACE
  • TAN1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZZANK1
  • ZZANK2
Homo sapiens (human)
Collagen degradation
  • ADAM10
  • ADAM17
  • ADAM9
  • AGXT2L2
  • BP180
  • BPAG2
  • CLG
  • CLG1
  • CLG4A
  • CLG4B
  • COL12A1
  • COL12A1L
  • COL13A1
  • COL14A1
  • COL15A1
  • COL16A1
  • COL17A1
  • COL18A1
  • COL19A1
  • COL23A1
  • COL25A1
  • COL26A1
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • CPSB
  • CPSD
  • CSVP
  • CTSB
  • CTSD
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSO
  • CTSO2
  • ELA2
  • ELANE
  • EMID2
  • EMU2
  • FUR
  • FURIN
  • HME
  • KIAA0021
  • KUZ
  • MADM
  • MCMP
  • MDC9
  • MLTNG
  • MMP1
  • MMP10
  • MMP11
  • MMP12
  • MMP13
  • MMP14
  • MMP15
  • MMP18
  • MMP19
  • MMP2
  • MMP20
  • MMP3
  • MMP7
  • MMP8
  • MMP9
  • MPSL1
  • PACE
  • PCSK3
  • PHYKPL
  • PRSS2
  • PUMP1
  • RASI
  • STMY1
  • STMY2
  • STMY3
  • TACE
  • TMPRSS6
  • TRY2
  • TRYP2
  • UND
Homo sapiens (human)
Abacavir metabolism
  • ADAL
  • ADAL1
  • ADH1
  • ADH1A
  • NT5B
  • NT5C2
  • NT5CP
  • PCK1
  • PEPCK1
  • PNT5
Homo sapiens (human)
Formation of WDR5-containing histone-modifying complexes
  • ADA3
  • AIB3
  • AKAP8L
  • ALL1
  • ALR
  • ASH2L
  • ASH2L1
  • BIG3
  • BOD1
  • BOD1L
  • BOD1L1
  • C12orf41
  • C16orf53
  • C20orf104
  • C20orf13
  • CCDC101
  • CENP-36
  • CFP1
  • CGBP
  • CSRP2BP
  • CXXC1
  • CXXC7
  • DFS70
  • DPY30
  • DR1
  • FAM44A
  • FAM44B
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GLEA2
  • HALR
  • HCA58
  • HCF1
  • HCFC1
  • HCFC2
  • HFC1
  • HRX
  • HRX2
  • HTRX
  • INO80Q
  • KANSL1
  • KANSL2
  • KANSL3
  • KAT14
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KAT8
  • KDM6A
  • KIAA0181
  • KIAA0304
  • KIAA0339
  • KIAA1076
  • KIAA1197
  • KIAA1267
  • KIAA1310
  • KIAA1327
  • KIAA1506
  • KMT2A
  • KMT2B
  • KMT2C
  • KMT2D
  • KMT2F
  • KMT2G
  • LEDGF
  • MBIP
  • MCRS1
  • MEN1
  • MLL
  • MLL1
  • MLL2
  • MLL3
  • MLL4
  • MOF
  • MSL1V1
  • MSP58
  • MYST1
  • NAKAP
  • NAKAP95
  • NCOA6
  • NSL1
  • NSL2
  • NSL3
  • NZF
  • OGT
  • PA1
  • PAGR1
  • PAXIP1
  • PAXIP1L
  • PCAF
  • PCCX1
  • PHF18
  • PHF20
  • PHF20L1
  • PRTD
  • PSIP1
  • PSIP2
  • PTIP
  • RAP250
  • RBBP5
  • RBQ3
  • SCG2
  • SET1
  • SET1A
  • SET1B
  • SETD1A
  • SETD1B
  • SGF29
  • SI1
  • SWD2
  • TADA2A
  • TADA2L
  • TADA3
  • TADA3L
  • TASP1
  • TMEM113
  • TRBP
  • TRX1
  • TRX2
  • TZP
  • UTX
  • WBP7
  • WDR5
  • WDR82
  • WDR82A
  • YEATS2
  • ZZZ3
Homo sapiens (human)
Defective ADA disrupts (deoxy)adenosine deamination
  • ADA
  • ADA1
Homo sapiens (human)
Ribavirin ADME
  • ADA
  • ADA1
  • ADK
  • C20orf37
  • CNT2
  • CNT3
  • ENT1
  • ENT3
  • ITPA
  • NDPKA
  • NM23
  • NM23B
  • NME1
  • NME2
  • NP
  • NT5B
  • NT5C2
  • NT5CP
  • PNP
  • PNT5
  • SLC28A2
  • SLC28A3
  • SLC29A1
  • SLC29A3
Homo sapiens (human)
Purine salvage
  • ADA
  • ADA1
  • ADAL
  • ADAL1
  • ADK
  • AMPD1
  • AMPD2
  • AMPD3
  • APRT
  • DCK
  • DGK
  • DGUOK
  • GMPR
  • GMPR1
  • GMPR2
  • HPRT
  • HPRT1
  • NP
  • PNP
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024