GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1701 - 1725 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name ▼ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Aryl hydrocarbon receptor signalling
  • AHR
  • AHRR
  • AIP
  • ARNT
  • ARNT2
  • BHLHE1
  • BHLHE2
  • BHLHE76
  • BHLHE77
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCB
  • KIAA0307
  • KIAA1234
  • P23
  • PTGES3
  • TEBP
  • XAP2
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase II Transcription Elongation
  • AF5Q31
  • AF9
  • AFF4
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C19orf17
  • C1orf28
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CCNH
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDC2L4
  • CDC73
  • CDK7
  • CDK9
  • CDKN7
  • COBRA1
  • CPR4
  • CTDP1
  • CTR9
  • EAF1
  • EAF2
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • ENL
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • HRPT2
  • IWS1
  • IWS1L
  • KIAA0155
  • KIAA0162
  • KIAA0252
  • KIAA1182
  • LEO1
  • LTG19
  • MAT1
  • MCEF
  • MLLT1
  • MLLT3
  • MNAT1
  • MO15
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • PAF1
  • PD2
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RDL
  • RNF66
  • RPB7
  • RTF1
  • SH2BP1
  • SKIC8
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SPT6H
  • SSRP1
  • STK1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • SUPT6H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • TRAITS
  • TTDA
  • WDR61
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • YEATS1
  • YEATS3
Homo sapiens (human)
Formation of RNA Pol II elongation complex
  • AF5Q31
  • AF9
  • AFF4
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C19orf17
  • C1orf28
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CBP20
  • CBP80
  • CCNH
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDC2L4
  • CDC73
  • CDK7
  • CDK9
  • CDKN7
  • COBRA1
  • CPR4
  • CTDP1
  • CTR9
  • EAF1
  • EAF2
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • ENL
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • HRPT2
  • IWS1
  • IWS1L
  • KIAA0155
  • KIAA0162
  • KIAA0252
  • KIAA1182
  • LEO1
  • LTG19
  • MAT1
  • MCEF
  • MLLT1
  • MLLT3
  • MNAT1
  • MO15
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • PAF1
  • PD2
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RD
  • RDBP
  • RDL
  • RNF66
  • RPB7
  • RTF1
  • SH2BP1
  • SKIC8
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SPT6H
  • SSRP1
  • STK1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • SUPT6H
  • TAK
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • TRAITS
  • TTDA
  • WDR61
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • YEATS1
  • YEATS3
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase II Pre-transcription Events
  • AF5Q31
  • AF9
  • AFF4
  • BA2R
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C19orf17
  • C1orf28
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP35
  • CBP20
  • CBP80
  • CCG1
  • CCGS
  • CCNH
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDC2L4
  • CDC73
  • CDK7
  • CDK9
  • CDKN7
  • CIF150
  • COBRA1
  • CPR4
  • CTDP1
  • CTR9
  • EAF1
  • EAF2
  • ELL
  • ELOA
  • ELOA2
  • ELOB
  • ELOC
  • ENL
  • ERCC2
  • ERCC3
  • FACT140
  • FACT80
  • FACTP140
  • FCP1
  • GTF2A1
  • GTF2A2
  • GTF2B
  • GTF2D1
  • GTF2E1
  • GTF2E2
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • GTF2S
  • HRPT2
  • IWS1
  • IWS1L
  • KIAA0155
  • KIAA0162
  • KIAA0252
  • KIAA1182
  • LEO1
  • LTG19
  • MAT1
  • MCEF
  • MLLT1
  • MLLT3
  • MNAT1
  • MO15
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NELFA
  • NELFB
  • NELFCD
  • NELFD
  • NELFE
  • PAF1
  • PD2
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RBP56
  • RD
  • RDBP
  • RDL
  • RNF66
  • RPB7
  • RTF1
  • SH2BP1
  • SKIC8
  • SPT4H
  • SPT5
  • SPT5H
  • SPT6H
  • SSRP1
  • STK1
  • SUPT16H
  • SUPT4H
  • SUPT4H1
  • SUPT5H
  • SUPT6H
  • TAF1
  • TAF10
  • TAF11
  • TAF12
  • TAF13
  • TAF15
  • TAF1L
  • TAF2
  • TAF2A
  • TAF2B
  • TAF2C
  • TAF2C1
  • TAF2C2
  • TAF2D
  • TAF2E
  • TAF2F
  • TAF2G
  • TAF2H
  • TAF2I
  • TAF2J
  • TAF2K
  • TAF2N
  • TAF2Q
  • TAF3
  • TAF4
  • TAF4A
  • TAF4B
  • TAF5
  • TAF6
  • TAF7
  • TAF7L
  • TAF9
  • TAF9B
  • TAF9L
  • TAFII105
  • TAFII130
  • TAFII135
  • TAFII18
  • TAFII20
  • TAFII30
  • TAFII31
  • TAFII55
  • TAFII70
  • TAK
  • TBP
  • TCEA1
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TCEB3
  • TCEB3B
  • TCEB3L
  • TF2A1
  • TF2A2
  • TF2B
  • TF2D
  • TF2E1
  • TF2E2
  • TFIIB
  • TFIID
  • TFIIS
  • TH1
  • TH1L
  • TRAITS
  • TTDA
  • WDR61
  • WHSC2
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • YEATS1
  • YEATS3
Homo sapiens (human)
Influenza Virus Induced Apoptosis
  • AAC3
  • ANT3
  • NA
  • PB1
  • SLC25A6
  • TGFB
  • TGFB1
Homo sapiens (human)
Vpr-mediated induction of apoptosis by mitochondrial outer membrane permeabilization
  • AAC1
  • AAC2
  • AAC3
  • ANT1
  • ANT2
  • ANT3
  • SLC25A4
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • vpr
Homo sapiens (human)
Phosphate bond hydrolysis by NUDT proteins
  • ADPRM
  • C17orf48
  • MTH2
  • NUDIX5
  • NUDT15
  • NUDT16
  • NUDT5
Homo sapiens (human)
POLB-Dependent Long Patch Base Excision Repair
  • ADPRHL2
  • ADPRS
  • ADPRT
  • ADPRT2
  • ADPRTL2
  • APE
  • APE1
  • APEX
  • APEX1
  • APX
  • ARH3
  • FEN1
  • HAP1
  • LIG1
  • PARG
  • PARP1
  • PARP2
  • POLB
  • PPOL
  • RAD2
  • REF1
Homo sapiens (human)
BBSome-mediated cargo-targeting to cilium
  • 99D8.1
  • ARL6
  • BBIP1
  • BBIP10
  • BBS1
  • BBS10
  • BBS12
  • BBS2
  • BBS2L1
  • BBS2L2
  • BBS3
  • BBS4
  • BBS5
  • BBS6
  • BBS7
  • BBS8
  • BBS9
  • C12orf58
  • C21orf112
  • C4orf24
  • CCT1
  • CCT2
  • CCT3
  • CCT4
  • CCT5
  • CCT8
  • CCTA
  • CCTB
  • CCTD
  • CCTE
  • CCTG
  • CCTQ
  • GPR24
  • KIAA0002
  • KIAA0098
  • LZTFL1
  • MCHR1
  • MKKS
  • NCRNA00081
  • PTHB1
  • RAB3IP
  • RABIN8
  • SLC1
  • SMO
  • SMOH
  • SRB
  • SSTR3
  • TCP1
  • TRIC5
  • TTC8
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression linked to cholesterol transport and efflux
  • ABC1
  • ABC8
  • ABCA1
  • ABCG1
  • ABCG5
  • ABCG8
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • AOF1
  • AOF2
  • APC2
  • APOC1
  • APOC2
  • APOC4
  • APOD
  • APOE
  • ARL4C
  • ARL7
  • BHLHE74
  • C6orf193
  • CAGH26
  • CERP
  • CETP
  • CTG26
  • EEPD1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • EP300
  • GPS2
  • HDAC3
  • IRA1
  • JHDM2A
  • JHDM3A
  • JMJD1
  • JMJD1A
  • JMJD2
  • JMJD2A
  • KDM1
  • KDM1A
  • KDM1B
  • KDM3A
  • KDM4A
  • KIAA0601
  • KIAA0677
  • KIAA0742
  • KIAA1047
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • KIAA1706
  • LSD1
  • LSD2
  • LXRA
  • LXRB
  • MOV10
  • NCOA1
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • P300
  • RXRA
  • RXRB
  • SRC1
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • TSGA
  • UNR
  • WHT1
Homo sapiens (human)
Trafficking of myristoylated proteins to the cilium
  • ARFL3
  • ARL3
  • CYS1
  • KIAA2000
  • NPHP3
  • RP2
  • UNC119B
Homo sapiens (human)
Transport of nucleosides and free purine and pyrimidine bases across the plasma membrane
  • AAC1
  • AAC2
  • AAC3
  • ANT1
  • ANT2
  • ANT3
  • ARL2
  • ARL2BP
  • BART
  • BART1
  • CNT1
  • CNT2
  • CNT3
  • DER12
  • ENT1
  • ENT2
  • ENT3
  • ENT4
  • HNP36
  • PMAT
  • SLC25A4
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • SLC28A1
  • SLC28A2
  • SLC28A3
  • SLC29A1
  • SLC29A2
  • SLC29A3
  • SLC29A4
Homo sapiens (human)
Post-chaperonin tubulin folding pathway
  • ARL2
  • CG22
  • CKAP1
  • KIAA0988
  • SSD1
  • TBCA
  • TBCB
  • TBCC
  • TBCD
  • TBCE
  • TFCD
  • TUBA1
  • TUBA1A
  • TUBA1B
  • TUBA1C
  • TUBA2
  • TUBA3
  • TUBA3C
  • TUBA3D
  • TUBA3E
  • TUBA4
  • TUBA4A
  • TUBA4B
  • TUBA6
  • TUBA8
  • TUBAL2
  • TUBAL3
  • TUBB1
  • TUBB2
  • TUBB2A
  • TUBB2B
  • TUBB2C
  • TUBB3
  • TUBB4
  • TUBB4A
  • TUBB4B
  • TUBB5
  • TUBB6
Homo sapiens (human)
RAS processing
  • ABHD17A
  • ABHD17B
  • ABHD17C
  • APT1
  • ARL2
  • BCL2L
  • BCL2L1
  • BCLX
  • C19orf27
  • C9orf77
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CXorf11
  • DUB3
  • FACE2
  • FAM108A1
  • FAM108B1
  • FAM108C1
  • FNTA
  • FNTB
  • GCP16
  • GOLGA7
  • HRAS
  • HRAS1
  • ICMT
  • KRAS
  • KRAS2
  • LPL1
  • LYPLA1
  • NRAS
  • PCCMT
  • PDE6D
  • PDED
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • PRKG2
  • PRKGR2
  • RASK2
  • RCE1
  • RCE1A
  • RCE1B
  • USP17
  • USP17H
  • USP17I
  • USP17J
  • USP17K
  • USP17L
  • USP17L2
  • USP17M
  • ZDHHC10
  • ZDHHC9
  • ZNF379
  • ZNF380
Homo sapiens (human)
ARL13B-mediated ciliary trafficking of INPP5E
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • INPP5E
  • PDE6D
  • PDED
Homo sapiens (human)
Chaperone Mediated Autophagy
  • ABCC7
  • ADFP
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • CEN1
  • CETN
  • CETN1
  • CFTR
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EF1A
  • GFAP
  • HBB
  • HDAC6
  • HSC70
  • HSP73
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPA10
  • HSPA8
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • IFT88
  • KIAA0402
  • KIAA0901
  • LAMP2
  • LENG7
  • M6PRBP1
  • PARK7
  • PCNT
  • PCNT2
  • PLIN2
  • PLIN3
  • RIB1
  • RNASE1
  • RNS1
  • RPS27A
  • TG737
  • TIP47
  • TTC10
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Aggrephagy
  • ABCC7
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • BLU
  • CEN1
  • CETN
  • CETN1
  • CFTR
  • CROC1
  • DHC1
  • DLC1
  • DLC2
  • DNCH1
  • DNCI1
  • DNCI2
  • DNCIC1
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNCLI1
  • DNCLI2
  • DNECL
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • HDAC6
  • HDLC1
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HSF1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • HSTF1
  • IFT88
  • KIAA0325
  • KIAA0402
  • KIAA0901
  • LIC2
  • PARK2
  • PARK7
  • PCNT
  • PCNT2
  • PRKN
  • RPS27A
  • TG737
  • TTC10
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
  • VCP
Homo sapiens (human)
Late endosomal microautophagy
  • ABCC7
  • ADFP
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • BC2
  • C14orf123
  • C20orf178
  • C9orf28
  • CEN1
  • CETN
  • CETN1
  • CFBP
  • CFTR
  • CGI149
  • CHMP2
  • CHMP2A
  • CHMP2B
  • CHMP3
  • CHMP4A
  • CHMP4B
  • CHMP4C
  • CHMP6
  • CHMP7
  • FAM125A
  • FAM125B
  • HBB
  • HCRP1
  • HDAC6
  • HSC70
  • HSP73
  • HSPA10
  • HSPA8
  • IFT88
  • KIAA0402
  • KIAA0901
  • M6PRBP1
  • MVB12A
  • MVB12B
  • NEDF
  • PARK7
  • PCNT
  • PCNT2
  • PLIN2
  • PLIN3
  • PML39
  • RIB1
  • RNASE1
  • RNS1
  • RPS27A
  • SHAX1
  • SHAX2
  • SHAX3
  • TG737
  • TIP47
  • TSG101
  • TTC10
  • UBA52
  • UBA80
  • UBAP1
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VPS20
  • VPS24
  • VPS28
  • VPS37A
  • VPS37B
  • VPS37C
  • VPS37D
  • WBSCR24
Homo sapiens (human)
RHOQ GTPase cycle
  • ABCC7
  • ARHDH9
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP33
  • ARHGAP34
  • ARHGAP35
  • ARHGAP5
  • ARHGAP7
  • ARHGEF7
  • ARHGEF9
  • ARHQ
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • ASCT2
  • BND7
  • BORG1
  • BORG2
  • BORG4
  • BORG5
  • BT
  • C11orf59
  • C6orf114
  • CAL
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42BPA
  • CDC42BPB
  • CDC42EP1
  • CDC42EP2
  • CDC42EP3
  • CDC42EP4
  • CDC42GAP
  • CEP1
  • CEP2
  • CEP3
  • CEP4
  • CFTR
  • CIP4
  • COOL1
  • CPNE8
  • CRIB1
  • CTNNG
  • DEPDC1B
  • DIAP3
  • DIAPH3
  • DLC1
  • DP3
  • EPB72
  • FBP17
  • FIG
  • FNBP1
  • FNBP2
  • GFOD1
  • GIT1
  • GIT2
  • GJA1
  • GJAL
  • GOPC
  • GRAF
  • GRF1
  • GRIT
  • GRLF1
  • IQGAP1
  • IQGAP3
  • ITSN
  • ITSN1
  • JUP
  • KIAA0051
  • KIAA0142
  • KIAA0147
  • KIAA0148
  • KIAA0424
  • KIAA0451
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Homo sapiens (human)
RHOJ GTPase cycle
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Homo sapiens (human)
Retrograde transport at the Trans-Golgi-Network
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Homo sapiens (human)
Amyloid fiber formation
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Homo sapiens (human)
CDC42 GTPase cycle
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Homo sapiens (human)
XBP1(S) activates chaperone genes
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  • VLCAD
  • VPATPD
  • WFS1
  • WIPI1
  • WIPI49
  • YIF1
  • YIF1A
  • ZBTB17
  • ZNF151
  • ZNF60
Homo sapiens (human)
MET receptor recycling
  • ARF6
  • CRK
  • CRKL
  • GAB1
  • GGA3
  • HGF
  • HPTA
  • KIAA0154
  • MET
  • RAB4
  • RAB4A
  • RAB4B
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024