GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 351 - 375 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Synthesis of dolichyl-phosphate mannose
  • DPM1
  • DPM2
  • DPM3
Homo sapiens (human)
Interleukin-6 signaling
  • APRF
  • CBL
  • CBL2
  • CIS3
  • IFNB2
  • IL6
  • IL6R
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF55
  • SHPTP2
  • SOCS3
  • SSI3
  • STAT1
  • STAT3
  • TYK2
Homo sapiens (human)
Apoptotic cleavage of cellular proteins
  • ACIN1
  • ACINUS
  • APC
  • API1
  • BAP31
  • BCAP31
  • BIRC2
  • BMX
  • CASP3
  • CASP6
  • CASP7
  • CASP8
  • CLSPN
  • CPP32
  • DP2.5
  • DXS1357E
  • FAK
  • FAK1
  • FNTA
  • KIAA0670
  • MASK
  • MCH2
  • MCH3
  • MCH5
  • MIHB
  • MST3
  • MST4
  • PKCD
  • PRKCD
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • PTK2
  • RNF48
  • ROCK1
  • SATB1
  • STK24
  • STK26
  • STK3
Homo sapiens (human)
Translesion synthesis by POLI
  • MAD2B
  • MAD2L2
  • PCNA
  • POLI
  • POLZ
  • RAD30B
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • REV1
  • REV1L
  • REV3
  • REV3L
  • REV7
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Peptide chain elongation
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DXS648E
  • EC45
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EEF2
  • EF1A
  • EF2
  • FAU
  • FTE1
  • LAMBR
  • LAMR1
  • LENG7
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SURF-3
  • SURF3
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Interleukin-12 signaling
  • ERBA2L
  • IL12A
  • IL12B
  • IL12R
  • IL12RB
  • IL12RB1
  • IL12RB2
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • NKSF1
  • NKSF2
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
  • STAT4
  • SYBL1
  • TYK2
  • VAMP7
Homo sapiens (human)
Mitotic Metaphase/Anaphase Transition
  • EMI1
  • FBX5
  • FBXO5
  • PLK
  • PLK1
Homo sapiens (human)
Laminin interactions
  • CD49B
  • COL18A1
  • FNRB
  • HSPG2
  • ITGA1
  • ITGA2
  • ITGA3
  • ITGA6
  • ITGA7
  • ITGAV
  • ITGB1
  • ITGB4
  • KIAA0533
  • KIAA1907
  • LAMA
  • LAMA1
  • LAMA2
  • LAMA3
  • LAMA4
  • LAMA5
  • LAMB1
  • LAMB2
  • LAMB2T
  • LAMB3
  • LAMC1
  • LAMC2
  • LAMC3
  • LAMM
  • LAMNA
  • LAMNB1
  • LAMNB2
  • LAMS
  • MDF2
  • MSK12
  • MSK18
  • MSK8
  • NID
  • NID1
  • NID2
  • VNRA
  • VTNR
Homo sapiens (human)
RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CAK
  • CAK1
  • CAP1A
  • CAP35
  • CCNH
  • CDK7
  • CDKN7
  • ERCC2
  • ERCC3
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA0398
  • MAT1
  • MNAT1
  • MO15
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • RAP30
  • RAP74
  • RNF66
  • RNGTT
  • RNMT
  • RPB7
  • SPT5
  • SPT5H
  • STK1
  • SUPT5H
  • TTDA
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
Homo sapiens (human)
RHO GTPases Activate ROCKs
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • CFL
  • CFL1
  • KIAA0619
  • KIAA0866
  • KIAA2034
  • LIMK
  • LIMK1
  • LIMK2
  • MBS
  • MLC2
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYPT1
  • MYPT2
  • MYRL2
  • PAK1
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • PPP1R12B
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • ROCK1
  • ROCK2
Homo sapiens (human)
Glycine degradation
  • AMT
  • DLD
  • DLST
  • DLTS
  • GCSH
  • GCSL
  • GCSP
  • GCST
  • GLDC
  • KGD4
  • LAD
  • MRPS36
  • OGDH
  • PHE3
Homo sapiens (human)
CaMK IV-mediated phosphorylation of CREB
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-GR
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMK4
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CAMKIV
  • CAMKK1
  • CAMKK2
  • CAMKKA
  • CAMKKB
  • KIAA0787
  • KIAA0968
  • KPNA2
  • RCH1
  • SRP1
Homo sapiens (human)
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade
  • TLR10
Homo sapiens (human)
Formation of the posterior neural plate
  • AIGF
  • EHZF
  • FGF8
  • GBX2
  • KIAA0569
  • LIP3
  • OCT6
  • OTF6
  • OTX2
  • POU3F1
  • SIP1
  • SOX1
  • SOX2
  • TBX6
  • WNT3A
  • ZEB2
  • ZFHX1B
  • ZFX1B
  • ZNF521
Homo sapiens (human)
EPH-Ephrin signaling
  • BSK
  • DRT
  • ECK
  • EEK
  • EFL2
  • EFL3
  • EFNA1
  • EFNA2
  • EFNA3
  • EFNA4
  • EFNA5
  • EFNB1
  • EFNB2
  • EFNB3
  • EHK1
  • EHK2
  • EHK3
  • ELK
  • EPH
  • EPHA1
  • EPHA10
  • EPHA2
  • EPHA3
  • EPHA4
  • EPHA5
  • EPHA6
  • EPHA7
  • EPHA8
  • EPHB1
  • EPHB2
  • EPHB3
  • EPHB4
  • EPHB6
  • EPHT
  • EPHT1
  • EPHT2
  • EPHT3
  • EPLG1
  • EPLG2
  • EPLG3
  • EPLG4
  • EPLG5
  • EPLG6
  • EPLG7
  • EPLG8
  • EPTH3
  • ERK
  • ETK
  • ETK1
  • ETK2
  • FYN
  • HEK
  • HEK11
  • HEK12
  • HEK2
  • HEK3
  • HEK5
  • HEK6
  • HEK7
  • HEK8
  • HTK
  • HTKL
  • JTK8
  • KIAA1459
  • LERK1
  • LERK2
  • LERK3
  • LERK4
  • LERK5
  • LERK6
  • LERK7
  • LERK8
  • LYN
  • MYK1
  • NET
  • SEK
  • TNFAIP4
  • TYRO1
  • TYRO11
  • TYRO4
  • TYRO5
  • TYRO6
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
FRS-mediated FGFR2 signaling
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • FRS3
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KS3
  • NRAS
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Transcriptional regulation by RUNX2
  • BAX
  • BCL1
  • BCL2L4
  • BHLHA26
  • BHLHA38
  • BHLHA39
  • BMP2
  • BMP2A
  • CAP20
  • CBFB
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCND1
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDK4
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CIP1
  • DERMO1
  • DHAND
  • HAND2
  • HDAC6
  • KIAA0901
  • MDA6
  • P34CDC2
  • PIC1
  • PPM1D
  • PRAD1
  • SDI1
  • SOX9
  • TWIST
  • TWIST1
  • TWIST2
  • WAF1
  • WIP1
Homo sapiens (human)
Activation of C3 and C5
  • BF
  • BFD
  • C2
  • C3
  • C4A
  • C4B
  • C4B_2
  • C5
  • CFB
  • CO4
  • CPAMD1
  • CPAMD2
  • CPAMD3
  • CPAMD4
Homo sapiens (human)
PTK6 promotes HIF1A stabilization
  • BHLHE78
  • BRK
  • DTR
  • DTS
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • GPNMB
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HGFIN
  • HIF1A
  • LRRK2
  • MOP1
  • NMB
  • PARK8
  • PASD8
  • PTK6
Homo sapiens (human)
Viral RNP Complexes in the Host Cell Nucleus
  • HSP72
  • HSPA1
  • HSPA1A
  • HSX70
  • M
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Beta-catenin phosphorylation cascade
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • FRAT1
  • FRAT2
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
NRAGE signals death through JNK
  • AATF
  • ABR
  • AKAP13
  • ARHDH9
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF17
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF2
  • ARHGEF26
  • ARHGEF3
  • ARHGEF33
  • ARHGEF35
  • ARHGEF37
  • ARHGEF38
  • ARHGEF39
  • ARHGEF4
  • ARHGEF40
  • ARHGEF5
  • ARHGEF5L
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF8
  • ARHGEF9
  • BAD
  • BBC6
  • BCL2L11
  • BCL2L8
  • BIM
  • BRX
  • C9orf100
  • CHE1
  • COOL1
  • COOL2
  • DBL
  • DED
  • DUET
  • DUO
  • ECT2
  • EPHEXIN4
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • FGDY
  • FRABP
  • GNA13
  • GRF2
  • GRINCHGEF
  • HAPIP
  • HT31
  • ITSN
  • ITSN1
  • JNK1
  • KALRN
  • KIAA0006
  • KIAA0142
  • KIAA0294
  • KIAA0337
  • KIAA0362
  • KIAA0380
  • KIAA0382
  • KIAA0424
  • KIAA0521
  • KIAA0651
  • KIAA0720
  • KIAA0915
  • KIAA1112
  • KIAA1415
  • KIAA1556
  • KIAA1626
  • KIAA1639
  • KIAA2016
  • LARG
  • LBC
  • LFP40
  • MAGED1
  • MAPK8
  • MCF2
  • MCF2L
  • NBR
  • NET1
  • NGEF
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • NRAGE
  • OBSCN
  • OST
  • P85SPR
  • PAK3BP
  • PIXA
  • PIXB
  • PLEKHG2
  • PLEKHG5
  • PREX1
  • PRKM8
  • RAC1
  • RASGRF2
  • SAPK1
  • SAPK1C
  • SGEF
  • SH3D1A
  • SOLO
  • SOS1
  • SOS2
  • STEF
  • TC25
  • TEM4
  • TIAM1
  • TIAM2
  • TIM
  • TNFRSF16
  • TRAD
  • TRIO
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • ZFYVE3
  • ZFYVE4
  • ZFYVE5
  • ZFYVE6
Homo sapiens (human)
Resolution of D-loop Structures through Synthesis-Dependent Strand Annealing (SDSA)
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C20orf41
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA1088
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • NHL
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • RTEL1
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
  • XRCC3
Homo sapiens (human)
Deactivation of the beta-catenin transactivating complex
  • AKT1
  • AKT2
  • ALR
  • APC
  • API3
  • ARB1
  • ASH2L
  • ASH2L1
  • BCL9
  • BCL9L
  • BIRC4
  • BTRC
  • BTRCP
  • C22orf2
  • CBY
  • CBY1
  • CHD8
  • CRM1
  • CTBP
  • CTBP1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNNBIP1
  • DLNB11
  • DP2.5
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GRG4
  • HDAC1
  • HELSNF1
  • IAP3
  • ICAT
  • KIAA1261
  • KIAA1547
  • KIAA1564
  • KMT2D
  • LEF1
  • MEN1
  • MLL2
  • MLL4
  • PGEA1
  • PKB
  • PYGO1
  • PYGO2
  • RAC
  • RBBP5
  • RBQ3
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SCG2
  • SOX13
  • SOX17
  • SOX2
  • SOX3
  • SOX4
  • SOX6
  • SOX7
  • SOX9
  • SRY
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TDF
  • TLE1
  • TLE2
  • TLE3
  • TLE4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • XIAP
  • XPO1
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Dopamine Neurotransmitter Release Cycle
  • APBA1
  • BZRAP1
  • CASK
  • CPLX1
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0897
  • LIN2
  • LIN7A
  • LIN7B
  • LIN7C
  • LIP1
  • MALS1
  • MALS2
  • MALS3
  • MINT1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • SVMT
  • SVP65
  • SYB2
  • SYN1
  • SYN2
  • SYN3
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VAMP2
  • VELI1
  • VELI2
  • VELI3
  • VMAT2
  • X11
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

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GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

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Last updated: August 19, 2024