GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1676 - 1700 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
FCERI mediated NF-kB activation
  • BCL10
  • BLU
  • BTRC
  • BTRCP
  • BTRCP2
  • C7orf76
  • CARD11
  • CARMA1
  • CDC25L
  • CDC34
  • CHUK
  • CIPER
  • CLAP
  • CROC1
  • CUL1
  • DSS1
  • EMC19
  • FBW1A
  • FBW1B
  • FBXW11
  • FBXW1A
  • FBXW1B
  • FIP3
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • IGHE
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • IKBA
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • JTK8
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA0696
  • KIAA0733
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • LYN
  • MAD3
  • MALT1
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MB1
  • MCB1
  • MCG7
  • MECL1
  • MIP224
  • MLT
  • MOV34L
  • MSS1
  • NEMO
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NFKBI
  • NFKBIA
  • NU
  • OCP2
  • PDK1
  • PDPK1
  • PFAAP4
  • POH1
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • PUBC1
  • RASGRP
  • RASGRP1
  • RASGRP2
  • RASGRP4
  • RELA
  • RING10
  • RING12
  • RNF85
  • RPS27A
  • SEM1
  • SFT
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SUG1
  • SUG2
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TCF16
  • TRAF6
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH3
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2N
  • UBE2R1
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
PKMTs methylate histone lysines
  • AEBP2
  • ALL1
  • ALR
  • ARA267
  • ASH1L
  • ASH2L
  • ASH2L1
  • ATF7IP
  • BAT8
  • BIG3
  • C13orf4
  • C14orf154
  • C6orf30
  • CHET9
  • CLLD8
  • CXXC7
  • DOT1L
  • DPY30
  • EED
  • EHMT1
  • EHMT2
  • ESET
  • EUHMTASE1
  • EVI1
  • EZH2
  • G9A
  • GLP
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HALR
  • HIF1
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST4H4
  • HRX
  • HRX2
  • HTRX
  • HYPB
  • JJAZ1
  • KIAA0067
  • KIAA0160
  • KIAA0304
  • KIAA0339
  • KIAA1076
  • KIAA1090
  • KIAA1420
  • KIAA1506
  • KIAA1675
  • KIAA1717
  • KIAA1732
  • KIAA1814
  • KIAA1876
  • KMT1A
  • KMT1B
  • KMT1C
  • KMT1D
  • KMT1E
  • KMT1F
  • KMT2A
  • KMT2B
  • KMT2C
  • KMT2D
  • KMT2F
  • KMT2G
  • KMT2H
  • KMT3A
  • KMT3B
  • KMT3C
  • KMT4
  • KMT5A
  • KMT5B
  • KMT5C
  • KMT6
  • KMT7
  • LYT10
  • MCAF
  • MCAF1
  • MDS1
  • MECOM
  • MEL1
  • MLL
  • MLL1
  • MLL2
  • MLL3
  • MLL4
  • MMSET
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NG36
  • NSD1
  • NSD2
  • NSD3
  • PFM13
  • PFM6
  • PRDM16
  • PRDM3
  • PRDM9
  • PRSET7
  • RBAP46
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBBP5
  • RBBP7
  • RBQ3
  • RELA
  • SET07
  • SET1
  • SET1A
  • SET1B
  • SET2
  • SET7
  • SET8
  • SET9
  • SETD1A
  • SETD1B
  • SETD2
  • SETD3
  • SETD6
  • SETD7
  • SETD8
  • SETDB1
  • SETDB2
  • SMYD2
  • SMYD3
  • SUV39H
  • SUV39H1
  • SUV39H2
  • SUV420H1
  • SUV420H2
  • SUZ12
  • TRX1
  • TRX2
  • TRX5
  • WBP7
  • WDR5
  • WHSC1
  • WHSC1L1
  • ZMYND1
  • ZNFN3A1
Homo sapiens (human)
Signaling by juxtamembrane domain KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Response of EIF2AK1 (HRI) to heme deficiency
  • ASNS
  • ATF3
  • ATF4
  • ATF5
  • ATFX
  • BOTCH
  • C20orf97
  • CEBPB
  • CEBPG
  • CHAC1
  • CHOP
  • CHOP10
  • CREB2
  • DDIT3
  • EIF2A
  • EIF2AK1
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • GADD153
  • GADD34
  • GRB10
  • GRBIR
  • HRI
  • KIAA0207
  • KIAA1369
  • NIPK
  • PPP1R15A
  • SKIP3
  • TCF5
  • TRB3
  • TRIB3
  • TS11
  • TXREB
Homo sapiens (human)
Retrograde neurotrophin signalling
  • ADTAA
  • ADTAB
  • ADTB2
  • AP17
  • AP2A1
  • AP2A2
  • AP2B1
  • AP2M1
  • AP2S1
  • CLAPA1
  • CLAPA2
  • CLAPB1
  • CLAPM1
  • CLAPS2
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • CNSA2
  • DNAL4
  • DNM
  • DNM1
  • DNM2
  • DNM3
  • DYN2
  • HIP9
  • HYPJ
  • KIAA0034
  • KIAA0109
  • KIAA0820
  • KIAA0899
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • SH3D2A
  • SH3GL2
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Chaperone Mediated Autophagy
  • ABCC7
  • ADFP
  • ARL13B
  • ARL2L1
  • CEN1
  • CETN
  • CETN1
  • CFTR
  • EEF1A
  • EEF1A1
  • EF1A
  • GFAP
  • HBB
  • HDAC6
  • HSC70
  • HSP73
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPA10
  • HSPA8
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • IFT88
  • KIAA0402
  • KIAA0901
  • LAMP2
  • LENG7
  • M6PRBP1
  • PARK7
  • PCNT
  • PCNT2
  • PLIN2
  • PLIN3
  • RIB1
  • RNASE1
  • RNS1
  • RPS27A
  • TG737
  • TIP47
  • TTC10
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Defective CP causes aceruloplasminemia (ACERULOP)
  • CP
  • FPN
  • FPN1
  • IREG1
  • SLC11A3
  • SLC40A1
Homo sapiens (human)
IL-6-type cytokine receptor ligand interactions
  • BSF3
  • CLC
  • CLCF1
  • CNTF
  • CNTFR
  • CRL3
  • CRLF1
  • CTF1
  • GPL
  • HILDA
  • IL11
  • IL11RA
  • IL31
  • IL31RA
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • LIF
  • LIFR
  • NNT1
  • OSM
  • OSMR
  • OSMRB
  • TYK2
Homo sapiens (human)
Interleukin-9 signaling
  • APRF
  • IL2RG
  • IL9
  • IL9R
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK3
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
Homo sapiens (human)
RHO GTPases activate PKNs
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • CDC25C
  • CPI17
  • HME1
  • KIAA0866
  • KIAA2034
  • MBS
  • MLC2
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYPT1
  • MYPT2
  • MYRL2
  • PAK1
  • PDK1
  • PDPK1
  • PKN
  • PKN1
  • PKN2
  • PKN3
  • PKNBETA
  • PPP1CB
  • PPP1INL
  • PPP1R12A
  • PPP1R12B
  • PPP1R14A
  • PRK1
  • PRK2
  • PRKCL1
  • PRKCL2
  • RAC1
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • SFN
  • TC25
  • YWHA1
  • YWHAB
  • YWHAE
  • YWHAG
  • YWHAH
  • YWHAQ
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Activated NTRK2 signals through RAS
  • BDNF
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • NTF4
  • NTF5
  • NTRK2
  • SOS1
  • TRKB
Homo sapiens (human)
Phase 1 - inactivation of fast Na+ channels
  • CALP
  • CSEN
  • DREAM
  • KCHIP1
  • KCHIP2
  • KCHIP3
  • KCHIP4
  • KCND1
  • KCND2
  • KCND3
  • KCNIP1
  • KCNIP2
  • KCNIP3
  • KCNIP4
  • KIAA1044
  • VABP
Homo sapiens (human)
Defective homologous recombination repair (HRR) due to BRCA1 loss of function
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
Homo sapiens (human)
Nef and signal transduction
  • DOCK2
  • ELMO1
  • FYN
  • HCK
  • KIAA0209
  • KIAA0281
  • LCK
  • PAK2
  • RAC1
  • TC25
  • nef
Homo sapiens (human)
Metal sequestration by antimicrobial proteins
  • CAGA
  • CAGB
  • CFAG
  • GIG12
  • HNL
  • LCN2
  • LF
  • LTF
  • MRP14
  • MRP8
  • NGAL
  • PSOR1
  • S100A15
  • S100A7
  • S100A7A
  • S100A7C
  • S100A7L1
  • S100A8
  • S100A9
Homo sapiens (human)
Defective LARGE causes MDDGA6 and MDDGB6
  • B3GNT1
  • B3GNT6
  • B4GAT1
  • KIAA0609
  • LARGE
  • LARGE1
Homo sapiens (human)
Switching of origins to a post-replicative state
  • BM28
  • CCNL1
  • CDC21
  • CDC46
  • CDC47
  • CDCL1
  • CDT1
  • GMNN
  • KIAA0030
  • MCM2
  • MCM3
  • MCM4
  • MCM5
  • MCM6
  • MCM7
Homo sapiens (human)
Cyclin E associated events during G1/S transition
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • BARA
  • BHLHD4
  • BHLHE39
  • C14orf46
  • CABLES
  • CABLES1
  • CAK
  • CAK1
  • CAP20
  • CAP35
  • CCNE
  • CCNE1
  • CCNE2
  • CCNH
  • CDC25A
  • CDK2
  • CDK7
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CDKN2
  • CDKN7
  • CIP1
  • CXCDC1
  • DP1
  • DP2
  • E2F1
  • E2F4
  • E2F5
  • KIAA2037
  • KIP1
  • LIN37
  • LIN52
  • LIN54
  • LIN9
  • MAT1
  • MAX
  • MDA6
  • MNAT1
  • MO15
  • MYC
  • PIC1
  • PKB
  • PKBG
  • RAC
  • RB1
  • RB2
  • RBAP48
  • RBBP3
  • RBBP4
  • RBL2
  • RNF66
  • SDI1
  • STK1
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGS
  • WAF1
  • WEE1
  • p27
Homo sapiens (human)
Metabolism of polyamines
  • AMD
  • AMD1
  • ODC1
  • SMS
  • SPS1
  • SRM
  • SRML1
Homo sapiens (human)
MET activates STAT3
  • APRF
  • HGF
  • HPTA
  • MET
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Defective SLC39A4 causes acrodermatitis enteropathica, zinc-deficiency type (AEZ)
  • SLC39A4
  • ZIP4
Homo sapiens (human)
Defective binding of VWF variant to GPIb:IX:V
  • F8VWF
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
  • VWF
Homo sapiens (human)
Defective ABCB6 causes MCOPCB7
  • ABCB6
  • MTABC3
  • PRP
  • UMAT
Homo sapiens (human)
Defective HDR through Homologous Recombination Repair (HRR) due to PALB2 loss of BRCA2/RAD51/RAD51C binding function
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
Homo sapiens (human)
Acetylcholine inhibits contraction of outer hair cells
  • CHRNA10
  • CHRNA9
  • KCNMA
  • KCNMA1
  • KCNMB1
  • KCNN2
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Last updated: August 19, 2024