GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1701 - 1725 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Defective SLC35A1 causes congenital disorder of glycosylation 2F (CDG2F)
  • SLC35A1
Homo sapiens (human)
Antagonism of Activin by Follistatin
  • FLRG
  • FST
  • FSTL3
  • INHBA
  • INHBB
Homo sapiens (human)
Fatty acyl-CoA biosynthesis
  • ACAC
  • ACACA
  • ACC1
  • ACCA
  • ACLY
  • ACOD4
  • ACSVL1
  • CBR4
  • CLN1
  • FABGL
  • FACVL1
  • FADS5
  • FAS
  • FASN
  • FATP2
  • HKE6
  • HSD17B8
  • HTD2
  • KIAA0852
  • MORC2
  • OLAH
  • PPT
  • PPT1
  • PPT2
  • RING2
  • SCD
  • SCD1
  • SCD2
  • SCD4
  • SCD5
  • SCDOS
  • SDR30C1
  • SDR45C1
  • SLC27A2
  • THEDC1
  • VLACS
  • ZCWCC1
Homo sapiens (human)
Somitogenesis
  • BHLHB37
  • BHLHC6
  • C6orf159
  • C7orf76
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DLL1
  • DLL3
  • DSS1
  • EPHA4
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HEK8
  • HES7
  • HSPC
  • IFI5111
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • KIAA0072
  • KIAA0107
  • LEF1
  • LFNG
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MESP2
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSGN1
  • MSS1
  • NOTCH1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSMF1
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RING10
  • RING12
  • RIPPLY2
  • SCDO2
  • SEK
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TAN1
  • TBP1
  • TBP7
  • TBX6
  • TRAP2
  • TYRO1
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
Interferon gamma signaling
  • ATDC
  • B2M
  • BERP
  • C6orf13
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CD44
  • CES1
  • CIITA
  • CIS3
  • EFP
  • ERK1
  • ERK2
  • FCG1
  • FCGR1
  • FCGR1A
  • FCGR1B
  • FCGR1BP
  • FXY
  • GBP1
  • GBP2
  • GBP3
  • GBP4
  • GBP4L
  • GBP5
  • GBP6
  • GBP7
  • GC109
  • GERP
  • GILT
  • HCP
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-DP1A
  • HLA-DP1B
  • HLA-DPA1
  • HLA-DPB1
  • HLA-DQA1
  • HLA-DQA2
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HLA-DQB2
  • HLA-DRA
  • HLA-DRA1
  • HLA-DRB1
  • HLA-DRB3
  • HLA-DRB4
  • HLA-DRB5
  • HLA-DXA
  • HLA-DXB
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • HLASB
  • HLS5
  • ICAM1
  • ICSBP1
  • IFI30
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • IFNGT1
  • IFP1
  • IGFR1
  • IGFRB
  • IP30
  • IRF1
  • IRF2
  • IRF3
  • IRF4
  • IRF5
  • IRF6
  • IRF7
  • IRF8
  • IRF9
  • ISGF3G
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • KIAA0129
  • KIAA0517
  • KIAA0968
  • KIAA1098
  • LHR
  • MADH7
  • MADH8
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MDU2
  • MDU3
  • MHC2TA
  • MIC4
  • MID1
  • MT2
  • MT2A
  • MUM1
  • MYL
  • NCAM
  • NCAM1
  • NSEP1
  • OAS1
  • OAS2
  • OAS3
  • OASL
  • OIAS
  • PAFR
  • PKCD
  • PML
  • PP8675
  • PRKCD
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTAFR
  • PTP1C
  • PTPN6
  • RBCC
  • RFB30
  • RNF
  • RNF101
  • RNF137
  • RNF147
  • RNF15
  • RNF16
  • RNF21
  • RNF22
  • RNF27
  • RNF59
  • RNF71
  • RNF81
  • RNF86
  • RNF88
  • RNF89
  • RNF9
  • RNF94
  • RNF95
  • RNF97
  • RNF99
  • RO52
  • RORET
  • SMAD7
  • SOCS1
  • SOCS3
  • SP100
  • SS56
  • SSA1
  • SSI1
  • SSI3
  • STAF50
  • TERF
  • TIP3
  • TRIFIC
  • TRIM10
  • TRIM14
  • TRIM17
  • TRIM18
  • TRIM19
  • TRIM2
  • TRIM21
  • TRIM22
  • TRIM25
  • TRIM26
  • TRIM29
  • TRIM3
  • TRIM31
  • TRIM34
  • TRIM35
  • TRIM38
  • TRIM45
  • TRIM46
  • TRIM48
  • TRIM5
  • TRIM6
  • TRIM62
  • TRIM68
  • TRIM8
  • TRIP14
  • VCAM1
  • XPRF
  • YB1
  • YBX1
  • ZNF147
  • ZNF173
Homo sapiens (human)
mRNA Editing: C to U Conversion
  • A1CF
  • ACF
  • APOBEC1
  • APOBEC1L
  • APOBEC2
  • APOBEC3A
  • APOBEC3B
  • APOBEC3C
  • APOBEC3H
  • APOBEC4
  • ASP
  • C1orf169
  • PBI
Homo sapiens (human)
Defective F9 activation
  • F11
  • F9
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
Homo sapiens (human)
Golgi Cisternae Pericentriolar Stack Reorganization
  • BLZF1
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • ERK2
  • GOLGA2
  • GOLPH5
  • GOLPH6
  • GORASP1
  • GORASP2
  • GRASP65
  • JEM1
  • MAPK1
  • P34CDC2
  • PLK
  • PLK1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • RAB1
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RAB2
  • RAB2A
  • USO1
  • VDP
Homo sapiens (human)
Signaling by high-kinase activity BRAF mutants
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA1027
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RIAM
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
Metabolism of serotonin
  • ALDH2
  • ALDM
  • MAOA
Homo sapiens (human)
Insertion of tail-anchored proteins into the endoplasmic reticulum membrane
  • A4
  • AD1
  • ALTPRP
  • APP
  • ARSA
  • ASNA1
  • BAG6
  • BAT3
  • C7orf20
  • CAML
  • CAMLG
  • CEE
  • CHD5
  • DXS254E
  • EDMD
  • EMD
  • FER1L2
  • G3
  • GDX
  • GET1
  • GET2
  • GET3
  • GET4
  • HMOX1
  • HO
  • HO1
  • OTOF
  • PRIP
  • PRNP
  • PRP
  • RAMP4
  • SEC61B
  • SEC61G
  • SERP1
  • SGT
  • SGT1
  • SGTA
  • STA
  • STX1
  • STX1A
  • STX5
  • STX5A
  • SYB2
  • TRC35
  • TRC40
  • UBL4
  • UBL4A
  • VAMP2
  • VAP33
  • VAPA
  • WRB
Homo sapiens (human)
Transport of bile salts and organic acids, metal ions and amine compounds
  • C6orf29
  • CD92
  • CDW92
  • CHT1
  • CTL1
  • CTL2
  • CTL3
  • CTL4
  • CTL5
  • HUT11
  • HUT2
  • JK
  • MATE1
  • MATE2
  • NG22
  • RACH1
  • SLC10A6
  • SLC14A1
  • SLC14A2
  • SLC44A1
  • SLC44A2
  • SLC44A3
  • SLC44A4
  • SLC44A5
  • SLC47A1
  • SLC47A2
  • SLC5A7
  • SOAT
  • TPPT1
  • UT1
  • UT2
  • UTE
Homo sapiens (human)
semaxanib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
Molybdenum cofactor biosynthesis
  • GPH
  • GPHN
  • KIAA1385
  • MCBPE
  • MOCO1
  • MOCOS
  • MOCS2
  • MOCS3
  • UBA4
Homo sapiens (human)
HS-GAG degradation
  • AGRIN
  • AGRN
  • ELNR1
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • GUSB
  • HEP
  • HPA
  • HPA1
  • HPA2
  • HPR1
  • HPSE
  • HPSE1
  • HPSE2
  • HSE1
  • HSPG1
  • HSPG2
  • HSS
  • IDS
  • IDUA
  • KIAA0468
  • NAGLU
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SGSH
  • SIDS
  • UFHSD1
Homo sapiens (human)
Integration of provirus
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • KPNA1
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • RCH2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Fusion of the Influenza Virion to the Host Cell Endosome
  • HA
  • M
  • NA
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Synthesis of IP2, IP, and Ins in the cytosol
  • 5PTASE
  • ALDRL6
  • C8orf9
  • IMP.18P
  • IMPA
  • IMPA1
  • IMPA2
  • INO1
  • INPP1
  • INPP4A
  • INPP4B
  • INPP5A
  • INPP5B
  • INPP5J
  • ISYNA1
  • KIAA0910
  • KSP32
  • MIOX
  • MTMR7
  • MTMR8
  • MTMR9
  • OCRL
  • OCRL1
  • OCRL2
  • PIB5PA
  • PIPP
  • RSOR
  • SYNJ1
Homo sapiens (human)
Cholesterol biosynthesis
  • 17HSD7
  • ACAT2
  • ACTL
  • ANG1
  • ARV1
  • BHLHD1
  • BHLHD2
  • CYP51
  • CYP51A1
  • DESP4
  • DHCR24
  • ERG1
  • ERG25
  • FDFT1
  • FDPS
  • FPS
  • GGPS1
  • H105E3
  • HMGCS
  • HMGCS1
  • HSD17B7
  • IDI1
  • IDI2
  • KIAA0018
  • KIAA1293
  • LBR
  • LSS
  • MPD
  • MSMO1
  • MVD
  • MVK
  • NSDHL
  • OSC
  • PDP1
  • PLPP6
  • PMKI
  • PMVK
  • PPAPDC2
  • SC4MOL
  • SDR37C1
  • SQLE
  • SREBF1
  • SREBF2
  • SREBP1
  • SREBP2
  • TM7SF2
Homo sapiens (human)
GPER1 signaling
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • CEPR
  • CMKRL2
  • DRY12
  • FNRA
  • FNRB
  • GNAI1
  • GNAI2
  • GNAI2B
  • GNAI3
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNAT3
  • GNAZ
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GPER
  • GPER1
  • GPR30
  • GSP
  • ITGA5
  • ITGB1
  • KIAA0037
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA1060
  • MDF2
  • MSK12
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • SRC
  • SRC1
  • TSE1
Homo sapiens (human)
Degradation of GABA
  • ABAT
  • ALDH5A1
  • GABAT
  • SSADH
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-2 modulates autophagy
  • 3a
  • 7a
  • KIAA0770
  • KIAA1475
  • M
  • MAP1ALC3
  • MAP1LC3B
  • RNF108
  • TLP
  • TUFM
  • UVRAG
  • VAM6
  • VPS11
  • VPS16
  • VPS18
  • VPS33A
  • VPS33B
  • VPS39
  • VPS41
  • VPS45
  • VPS45A
  • VPS45B
Homo sapiens (human)
MAP2K and MAPK activation
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IL17RD
  • IL17RLM
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA1027
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • MAP2K1
  • MAP2K1IP1
  • MAP2K2
  • MAPBPIP
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPKSP1
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MORG1
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RIAM
  • ROBLD3
  • SEF
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • WDR83
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
GABA B receptor activation
  • GABBR1
  • GABBR2
  • GPR51
  • GPRC3A
  • GPRC3B
Homo sapiens (human)
IRS-mediated signalling
  • GRB1
  • IRS1
  • IRS2
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Last updated: August 19, 2024