GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome November 12, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1976 - 2000 of 2074 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
TGFBR3 PTM regulation
  • AD3
  • AD4
  • APH1A
  • APH1B
  • C8orf57
  • CLGI
  • KIAA0253
  • MMP14
  • MMP16
  • MMPX2
  • NCSTN
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • STM2
  • TGFBR3
  • TIMP
  • TIMP1
  • TIMP2
Homo sapiens (human)
MAP2K and MAPK activation
  • APBB1IP
  • ARAF
  • ARAF1
  • ARB2
  • ARR1
  • ARR2
  • ARRB1
  • ARRB2
  • BRAF
  • BRAF1
  • CNK1
  • CNK2
  • CNKSR1
  • CNKSR2
  • CSK
  • CTAK1
  • EMK2
  • ERK1
  • ERK2
  • F8VWF
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FN
  • FN1
  • GP2B
  • GP3A
  • HRAS
  • HRAS1
  • IL17RD
  • IL17RLM
  • IQGAP1
  • ITGA2B
  • ITGAB
  • ITGB3
  • KIAA0051
  • KIAA0902
  • KIAA1027
  • KREV1
  • KSR
  • KSR1
  • KSR2
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • MAP2K1
  • MAP2K1IP1
  • MAP2K2
  • MAPBPIP
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MAPKSP1
  • MARK3
  • MEK1
  • MEK2
  • MKK2
  • MORG1
  • NRAS
  • PBP
  • PEBP
  • PEBP1
  • PKS
  • PKS2
  • PREL1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PRKMK1
  • PRKMK2
  • RAF
  • RAF1
  • RAFB1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RARP1
  • RIAM
  • ROBLD3
  • SEF
  • SRC
  • SRC1
  • TLN
  • TLN1
  • VCL
  • VWF
  • WDR83
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
ESR-mediated signaling
  • AIG6
  • CYP40
  • CYPD
  • ERK1
  • ERK2
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESTRB
  • FKBP4
  • FKBP5
  • FKBP51
  • FKBP52
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • MAPK1
  • MAPK3
  • NR3A1
  • NR3A2
  • P23
  • PPID
  • PPP5
  • PPP5C
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTGES3
  • TEBP
Homo sapiens (human)
Glucocorticoid biosynthesis
  • 3BH
  • CBG
  • CYP11B1
  • CYP11B2
  • CYP17
  • CYP17A1
  • CYP21
  • CYP21A2
  • CYP21B
  • HSD11
  • HSD11B1
  • HSD11B2
  • HSD11K
  • HSD11L
  • HSD3B1
  • HSD3B2
  • HSDB3A
  • HSDB3B
  • POMC
  • S11BH
  • S17AH
  • SDR26C1
  • SDR9C3
  • SERPINA6
Homo sapiens (human)
Signaling by juxtamembrane domain KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • ACHRA
  • CHNRA
  • CHRNA1
  • CHRNA2
  • CHRNA3
  • CHRNA4
  • CHRNA5
  • CHRNA6
  • CHRNA7
  • CHRNA9
  • CHRNB2
  • CHRNB3
  • CHRNB4
  • NACHRA3
  • NACHRA5
  • NACHRA7
  • NACHRA9
  • NACRA4
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression linked to gluconeogenesis
  • LXRA
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • NRIP1
  • PCK1
  • PEPCK1
  • RXRA
  • RXRB
Homo sapiens (human)
Activation of AMPA receptors
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GLUR2
  • GLUR3
  • GLUR4
  • GLURC
  • GRIA1
  • GRIA2
  • GRIA3
  • GRIA4
  • GluA2
  • GluA3
  • GluA4
Homo sapiens (human)
FCGR3A-mediated phagocytosis
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL
  • ABL1
  • ACTB
  • ACTG
  • ACTG1
  • ACTR2
  • ACTR3
  • AF3P21
  • AGMX1
  • ARC16
  • ARC20
  • ARC21
  • ARC34
  • ARC41
  • ARGBPIA
  • ARP2
  • ARP3
  • ARPC1A
  • ARPC1B
  • ARPC2
  • ARPC3
  • ARPC4
  • ARPC5
  • ATK
  • BAIAP2
  • BPK
  • BRK1
  • BTK
  • C3orf10
  • CD16A
  • CD3G
  • CDC42
  • CED12A
  • CR16
  • CRK
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO1
  • ELMO2
  • ERK1
  • ERK2
  • FAK
  • FAK1
  • FCG3
  • FCGR3
  • FCGR3A
  • FGR
  • FYN
  • HCK
  • HEM1
  • HEM2
  • IGFR3
  • IGHG1
  • IGHG2
  • IGHG3
  • IGHG4
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • IMD2
  • JTK7
  • JTK8
  • KIAA0068
  • KIAA0269
  • KIAA0281
  • KIAA0587
  • KIAA0799
  • KIAA0900
  • KIAA1168
  • KIAA1834
  • LPG1G
  • LPG1G2
  • LYN
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYH12
  • MYH2
  • MYH9
  • MYHSA2
  • MYO10
  • MYO1C
  • MYO5A
  • MYO9B
  • MYR5
  • NAP1
  • NCK
  • NCK1
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NCKIPSD
  • PIR121
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTK2
  • RAC1
  • SCAR1
  • SCAR3
  • SOP2L
  • SPIN90
  • SRC2
  • SSH3BP1
  • SYK
  • T3G
  • TC25
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • WAS
  • WASF1
  • WASF2
  • WASF3
  • WASL
  • WASPIP
  • WAVE1
  • WAVE2
  • WAVE3
  • WICH
  • WIP
  • WIPF1
  • WIPF2
  • WIPF3
  • WIRE
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Digestion of dietary lipid
  • BAL
  • CEL
  • CLPS
  • LIPF
  • PLRP1
  • PLRP2
  • PNLIP
  • PNLIPRP1
  • PNLIPRP2
  • PNLIPRP3
Homo sapiens (human)
SUMOylation of nuclear envelope proteins
  • KIAA1835
  • RANGAP1
  • SD
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
Homo sapiens (human)
Cytochrome P450 - arranged by substrate type
  • CYPOR
  • POR
Homo sapiens (human)
CD28 dependent PI3K/Akt signaling
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • C20orf97
  • CD28
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • COT
  • CTMP
  • ESTF
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • FYN
  • GBL
  • GRB1
  • KIAA1999
  • LAB7
  • LCK
  • LST8
  • M
  • MAP3K14
  • MAP3K8
  • MAPKAP1
  • MIP1
  • MLST8
  • MTOR
  • N
  • NIK
  • NIPK
  • PDK1
  • PDPK1
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKB
  • PKBG
  • PROTOR1
  • PRR5
  • RAC
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RICTOR
  • SIN1
  • SKIP3
  • THEM4
  • TRB3
  • TRIB3
Homo sapiens (human)
Axonal growth inhibition (RHOA activation)
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGDIA
  • DBL
  • GDIA1
  • GMA
  • KIAA0886
  • LERN1
  • LINGO1
  • LRRN6A
  • MAG
  • MCF2
  • NGFR
  • NOGO
  • OMG
  • OMGP
  • RHO12
  • RHOA
  • RTN4
  • TNFRSF16
Homo sapiens (human)
RNA Polymerase III Abortive And Retractive Initiation
  • BDP1
  • BN51
  • BN51T
  • BRF
  • BRF1
  • BRF2
  • BRFU
  • C6orf51
  • CRCP
  • GTF2D1
  • GTF3A
  • GTF3B
  • GTF3C1
  • GTF3C2
  • GTF3C3
  • GTF3C4
  • GTF3C5
  • GTF3C6
  • KIAA0011
  • KIAA1241
  • KIAA1439
  • KIAA1452
  • KIAA1665
  • KIAA1689
  • NFI
  • NFIA
  • NFIB
  • NFIC
  • NFIX
  • OCT1
  • OTF1
  • POLR1C
  • POLR1D
  • POLR1E
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2H
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLR3A
  • POLR3B
  • POLR3C
  • POLR3D
  • POLR3E
  • POLR3F
  • POLR3G
  • POLR3GL
  • POLR3H
  • POLR3K
  • POLRF
  • POU2F1
  • RPC11
  • RPC8
  • SBF
  • SNAP19
  • SNAP190
  • SNAP43
  • SNAP45
  • SNAP50
  • SNAPC1
  • SNAPC2
  • SNAPC3
  • SNAPC4
  • SNAPC5
  • SSB
  • STAF
  • TAF3B2
  • TAF3C
  • TBP
  • TF2D
  • TFIID
  • TFNR
  • ZNF143
Homo sapiens (human)
PI-3K cascade:FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • GAB1
  • GRB1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KS3
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
Homo sapiens (human)
Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C
  • ADRM1
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C7orf76
  • C9orf17
  • CDC16
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • DSS1
  • E2EPF
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • GP110
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • KIAA0107
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMB1
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB6
  • PSMB7
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • RPS27A
  • SEM1
  • SFT
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • TSG24
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC5A
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
  • X
  • Y
  • Z
Homo sapiens (human)
Rev-mediated nuclear export of HIV RNA
  • AAAS
  • ADRACALA
  • ARA24
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • CHC1
  • CRM1
  • D3S1231E
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KIAA1835
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NPAP60L
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RAN
  • RANBP1
  • RANBP2
  • RANGAP1
  • RCC1
  • SD
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
  • XPO1
  • rev
Homo sapiens (human)
SDK interactions
  • KIAA1514
  • SDK1
  • SDK2
Homo sapiens (human)
Beta oxidation of butanoyl-CoA to acetyl-CoA
  • ACADS
  • ACSM3
  • ACSM6
  • C10orf129
  • ECHS1
  • HAD
  • HAD1
  • HADH
  • HADHSC
  • SAH
  • SCHAD
Homo sapiens (human)
activated TAK1 mediates p38 MAPK activation
  • BLU
  • CARD15
  • CARD4
  • CARDIAK
  • CROC1
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • FIP3
  • IKBKG
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK2
  • KIAA0733
  • MAP2K3
  • MAP2K6
  • MAP3K7
  • MAP3K7IP1
  • MAP3K7IP2
  • MAP3K7IP3
  • MAPK11
  • MAPK14
  • MAPKAPK2
  • MAPKAPK3
  • MEK3
  • MEK6
  • MKK3
  • MKK6
  • MXI2
  • NEMO
  • NOD1
  • NOD2
  • PRKM11
  • PRKMK3
  • PRKMK6
  • RICK
  • RIP2
  • RIPK2
  • RNF85
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SKK2
  • SKK3
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TRAF6
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
PLC-gamma1 signalling
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NTRK1
  • PLC1
  • PLCG1
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Effects of PIP2 hydrolysis
  • CDC25L
  • DAGK
  • DAGK1
  • DAGK2
  • DAGK3
  • DAGK4
  • DAGK5
  • DAGK6
  • DGKA
  • DGKB
  • DGKD
  • DGKE
  • DGKG
  • DGKH
  • DGKI
  • DGKK
  • DGKQ
  • DGKZ
  • INSP3R1
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KIAA0145
  • KIAA0718
  • MCG7
  • PKCD
  • PKCE
  • PKCL
  • PRKCD
  • PRKCE
  • PRKCH
  • PRKCL
  • PRKCQ
  • PRKCT
  • RASGRP
  • RASGRP1
  • RASGRP2
  • TRP3
  • TRP6
  • TRP7
  • TRPC3
  • TRPC6
  • TRPC7
Homo sapiens (human)
SARS-CoV-1-host interactions
  • HNRNPA1
  • HNRPA1
  • N
  • NPM
  • NPM1
Homo sapiens (human)
Regulation of TBK1, IKKε (IKBKE)-mediated activation of IRF3, IRF7
  • CAP-1
  • CD14
  • CRAF1
  • ESOP1
  • FIP2
  • GLC1E
  • HIP7
  • HYPL
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • LY96
  • MD2
  • NAK
  • NRP
  • OPTN
  • PRVTIRB
  • RPS27A
  • TANK
  • TBK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRAM
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.1.1

Last updated: February 17, 2025