GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1226 - 1250 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name ▲ UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Na+/Cl- dependent neurotransmitter transporters
  • B0AT1
  • B0AT2
  • B0AT3
  • BGT1
  • DAT1
  • GABATR
  • GABT1
  • GABT3
  • GAT1
  • GAT2
  • GAT3
  • GLYT2
  • NAT1
  • NET1
  • NTT73
  • OCT1
  • OCT2
  • PROT
  • SBAT1
  • SIT1
  • SLC18A1
  • SLC18A2
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC6A1
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A13
  • SLC6A14
  • SLC6A15
  • SLC6A18
  • SLC6A19
  • SLC6A2
  • SLC6A20
  • SLC6A3
  • SLC6A5
  • SLC6A6
  • SLC6A7
  • SLC6A9
  • SVMT
  • VAT1
  • VMAT1
  • VMAT2
  • XT3
  • XTRP2
  • XTRP3
Homo sapiens (human)
SUMOylation of DNA methylation proteins
  • AIM
  • BAP1
  • BMI1
  • CBX2
  • CBX4
  • CBX8
  • CXXC9
  • DING
  • DNMT
  • DNMT1
  • DNMT3A
  • DNMT3B
  • EDR1
  • EDR2
  • EDR3
  • HIPI3
  • MEL18
  • PC3
  • PCGF2
  • PCGF4
  • PH1
  • PH2
  • PH3
  • PHC1
  • PHC2
  • PHC3
  • RC1
  • RING1
  • RING1A
  • RING1B
  • RNF1
  • RNF110
  • RNF2
  • RNF51
  • SMT3C
  • SMT3H3
  • SUMO1
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UBL1
  • ZNF144
Homo sapiens (human)
Activation of rRNA Expression by ERCC6 (CSB) and EHMT2 (G9a)
  • BAT8
  • C6orf30
  • CBX3
  • CHD3
  • CHD4
  • CSB
  • EHMT2
  • ERCC6
  • G9A
  • GATAD2A
  • GATAD2B
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-3A
  • H3-3B
  • H3.3A
  • H3.3B
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3F3
  • H3F3A
  • H3F3B
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HDAC1
  • HDAC2
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • KIAA1150
  • KIAA1266
  • KMT1C
  • MBD3
  • MTA1
  • MTA1L1
  • MTA2
  • MTA3
  • NG36
  • PID
  • RBAP46
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBBP7
  • RPD3L1
  • TSH2B
  • TTF1
Homo sapiens (human)
Dual Incision in GG-NER
  • ADPRT
  • ADPRT2
  • ADPRTL2
  • ALC1
  • BTF2
  • BTF2P44
  • C6orf175
  • CHD1L
  • CHRAC17
  • CUL4A
  • CUL4B
  • DDB1
  • DDB2
  • DINB1
  • DPE2
  • ERCC1
  • ERCC11
  • ERCC2
  • ERCC3
  • ERCC4
  • ERCC5
  • ERCM2
  • GTF2H1
  • GTF2H2
  • GTF2H3
  • GTF2H4
  • GTF2H5
  • KIAA0039
  • KIAA0695
  • PARP1
  • PARP2
  • PCNA
  • POLD
  • POLD1
  • POLD2
  • POLD3
  • POLD4
  • POLDS
  • POLE
  • POLE1
  • POLE2
  • POLE3
  • POLE4
  • POLK
  • PPOL
  • RBX1
  • REPA1
  • REPA2
  • REPA3
  • RFC1
  • RFC140
  • RFC2
  • RFC3
  • RFC4
  • RFC5
  • RNF75
  • ROC1
  • RPA1
  • RPA14
  • RPA2
  • RPA3
  • RPA32
  • RPA34
  • RPA70
  • RPS27A
  • TTDA
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • XAP1
  • XPA
  • XPAC
  • XPB
  • XPBC
  • XPD
  • XPDC
  • XPF
  • XPG
  • XPGC
Homo sapiens (human)
Signaling by SCF-KIT
  • APRF
  • CHEK1
  • CHK1
  • CLG4B
  • CMA1
  • CYH
  • CYM
  • FER
  • FES
  • FMI
  • FPS
  • FYN
  • GAB2
  • GADS
  • GRAP
  • GRAP2
  • GRB1
  • GRB10
  • GRB2L
  • GRB7
  • GRBIR
  • GRID
  • HRAS
  • HRAS1
  • JAK2
  • JTK8
  • KIAA0207
  • KIAA0571
  • KIT
  • LCK
  • LYN
  • MMP9
  • NRAS
  • PCP2
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKCA
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PSCTK4
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPRO
  • PTPRU
  • RAC1
  • SCFR
  • SHPTP2
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TC25
  • TEC
  • TYK3
  • VAV
  • VAV1
  • YES
  • YES1
Homo sapiens (human)
Uptake of dietary cobalamins into enterocytes
  • ABCD4
  • AMN
  • C6orf209
  • CBLIF
  • CTRB
  • CTRB1
  • CTRB2
  • CUBN
  • GIF
  • IFCR
  • IFMH
  • LMBRD1
  • NESI
  • PRSS1
  • PRSS3
  • PRSS4
  • PXMP1L
  • TC1
  • TCN1
  • TRP1
  • TRY1
  • TRY3
  • TRY4
  • TRYP1
Homo sapiens (human)
TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition)
  • ALK5
  • ARH12
  • ARHA
  • ARHGEF18
  • CGN
  • F11R
  • FKBP1
  • FKBP12
  • FKBP1A
  • JAM1
  • JCAM
  • KIAA0521
  • KIAA1319
  • KIAA1625
  • PAR3
  • PAR3A
  • PAR6A
  • PARD3
  • PARD6A
  • PKC2
  • PRKCZ
  • RHO12
  • RHOA
  • RPS27A
  • SKR4
  • SMURF1
  • TGFB
  • TGFB1
  • TGFBR1
  • TGFBR2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
RHO GTPases activate CIT
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • CDKN1B
  • CIT
  • CRIK
  • DLG4
  • KIAA0042
  • KIAA0866
  • KIAA0949
  • KIAA2034
  • KIF14
  • KIP1
  • MBS
  • MLC2
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYPT1
  • MYPT2
  • MYRL2
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • PPP1R12B
  • PRC1
  • PSD95
  • RAC1
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • STK21
  • TC25
  • p27
Homo sapiens (human)
Regulation of CDH11 gene transcription
  • BHLHB33
  • BHLHB5
  • BHLHE22
  • DRBF
  • FKHL5
  • FOXF1
  • FREAC1
  • HEYL
  • HOX3A
  • HOXC8
  • HRT3
  • ILF3
  • KIAA0569
  • MPHOSPH4
  • NF90
  • PFM5
  • PRDM8
  • SIP1
  • SNAH
  • SNAI1
  • SP1
  • TNRC20
  • TSFP1
  • ZEB2
  • ZFHX1B
  • ZFX1B
Homo sapiens (human)
Entry of Influenza Virion into Host Cell via Endocytosis
  • CLH17
  • CLTA
  • CLTC
  • CLTCL2
  • HA
  • KIAA0034
  • M
  • NA
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
Tight junction interactions
  • AWAL
  • C7orf1
  • CEPTRL2
  • CIPP
  • CLD1
  • CLDN1
  • CLDN10
  • CLDN11
  • CLDN12
  • CLDN14
  • CLDN15
  • CLDN16
  • CLDN17
  • CLDN18
  • CLDN19
  • CLDN2
  • CLDN20
  • CLDN22
  • CLDN23
  • CLDN3
  • CLDN4
  • CLDN5
  • CLDN6
  • CLDN7
  • CLDN8
  • CLDN9
  • CPER
  • CPETR1
  • CPETR2
  • CPETRL2
  • CRB3
  • DXS1179E
  • E
  • F11R
  • INADL
  • JAM1
  • JCAM
  • MPP5
  • OSP
  • OTM
  • PALS1
  • PAR3
  • PAR3A
  • PAR6A
  • PAR6B
  • PAR6G
  • PARD3
  • PARD6A
  • PARD6B
  • PARD6G
  • PATJ
  • PCLN1
  • PRKCI
  • SEMP1
  • TMVCF
  • WBSCR8
Homo sapiens (human)
RUNX1 regulates expression of components of tight junctions
  • AML1
  • AWAL
  • CBFA2
  • CBFB
  • CLDN5
  • OCLN
  • RUNX1
  • TJP1
  • TMVCF
  • ZO1
Homo sapiens (human)
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA
  • ASF
  • AUF1
  • C1orf199
  • CBP20
  • CBP80
  • CFIM25
  • CLP1
  • CPSF1
  • CPSF100
  • CPSF160
  • CPSF2
  • CPSF25
  • CPSF3
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CPSF5
  • CPSF7
  • CPSF73
  • CSTF1
  • CSTF2
  • CSTF2T
  • CSTF3
  • DXS8237E
  • FIP1
  • FIP1L1
  • FTP3
  • FUS
  • FUSIP1
  • FUSIP2
  • GPATC9
  • GPATCH9
  • GTF2F1
  • GTF2F2
  • HEAB
  • HNRNPA1
  • HNRNPA2B1
  • HNRNPA3
  • HNRNPC
  • HNRNPD
  • HNRNPF
  • HNRNPH1
  • HNRNPH2
  • HNRNPK
  • HNRNPL
  • HNRNPM
  • HNRNPR
  • HNRNPU
  • HNRPA1
  • HNRPA2B1
  • HNRPA3
  • HNRPC
  • HNRPD
  • HNRPF
  • HNRPG
  • HNRPH
  • HNRPH1
  • HNRPH2
  • HNRPK
  • HNRPL
  • HNRPM
  • HNRPR
  • HNRPU
  • HRS
  • KIAA0105
  • KIAA0122
  • KIAA0689
  • KIAA0824
  • KIAA1367
  • KIAA1627
  • METTL14
  • METTL3
  • MTA70
  • NAGR1
  • NAR
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEB1
  • NSEP1
  • NUDT21
  • PAB2
  • PABP2
  • PABPN1
  • PAP
  • PAPOLA
  • PCBP1
  • PCBP2
  • PCF11
  • POLR2
  • POLR2A
  • POLR2B
  • POLR2C
  • POLR2D
  • POLR2E
  • POLR2F
  • POLR2G
  • POLR2H
  • POLR2I
  • POLR2J
  • POLR2J1
  • POLR2K
  • POLR2L
  • POLRF
  • PTB
  • PTBP1
  • RAP30
  • RAP74
  • RBM10
  • RBMX
  • RBMXP1
  • RHE
  • RPB7
  • SAFA
  • SF2
  • SF2P33
  • SFRS1
  • SFRS10
  • SFRS11
  • SFRS13A
  • SFRS13B
  • SFRS19
  • SFRS2
  • SFRS2B
  • SFRS3
  • SFRS4
  • SFRS5
  • SFRS6
  • SFRS7
  • SFRS9
  • SPK
  • SRP20
  • SRP30C
  • SRP40
  • SRP46
  • SRP55
  • SRP75
  • SRRP35
  • SRSF1
  • SRSF10
  • SRSF11
  • SRSF12
  • SRSF2
  • SRSF3
  • SRSF4
  • SRSF5
  • SRSF6
  • SRSF7
  • SRSF8
  • SRSF9
  • SYMPK
  • TASR
  • TLS
  • TRA2B
  • U21.1
  • WDC146
  • WDR33
  • WTAP
  • YB1
  • YBX1
Homo sapiens (human)
Processing of Intronless Pre-mRNAs
  • CBP20
  • CBP80
  • CFIM25
  • CLP1
  • CPSF1
  • CPSF100
  • CPSF160
  • CPSF2
  • CPSF25
  • CPSF3
  • CPSF30
  • CPSF4
  • CPSF5
  • CPSF7
  • CPSF73
  • CSTF1
  • CSTF2
  • CSTF2T
  • CSTF3
  • FIP1
  • FIP1L1
  • HEAB
  • KIAA0689
  • KIAA0824
  • KIAA1367
  • NAR
  • NCBP
  • NCBP1
  • NCBP2
  • NEB1
  • NUDT21
  • PAB2
  • PABP2
  • PABPN1
  • PAP
  • PAPOLA
  • PCF11
  • RHE
  • SPK
  • SYMPK
  • WDC146
  • WDR33
Homo sapiens (human)
Inhibition of Host mRNA Processing and RNA Silencing
  • CPSF30
  • CPSF4
  • NAR
  • NEB1
  • NS
  • PAB2
  • PABP2
  • PABPN1
Homo sapiens (human)
Terminal pathway of complement
  • APOJ
  • C5
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CLI
  • CLU
  • CPAMD4
  • KUB1
Homo sapiens (human)
Intraflagellar transport
  • BITH
  • C11orf2
  • C11orf60
  • C14orf179
  • C1orf41
  • C20orf9
  • CCDC2
  • CDV1
  • CEV14
  • CLUAP1
  • CMG1
  • D2LIC
  • DERP8
  • DHC1B
  • DHC2
  • DLC1
  • DLC2
  • DNCH2
  • DNCL1
  • DNCL2A
  • DNCL2B
  • DNCLC1
  • DNLC2A
  • DNLC2B
  • DYH1B
  • DYNC2H1
  • DYNC2I1
  • DYNC2I2
  • DYNC2LI1
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • DYNLRB1
  • DYNLRB2
  • DYNLT2
  • DYNLT2B
  • DYNLT5
  • ESRRBL1
  • HDLC1
  • HIPPI
  • HSPB11
  • IFT121
  • IFT122
  • IFT139
  • IFT140
  • IFT144
  • IFT172
  • IFT20
  • IFT22
  • IFT25
  • IFT27
  • IFT43
  • IFT46
  • IFT52
  • IFT54
  • IFT56
  • IFT57
  • IFT70A
  • IFT70B
  • IFT74
  • IFT80
  • IFT81
  • IFT88
  • KIAA0359
  • KIAA0590
  • KIAA0643
  • KIAA1179
  • KIAA1336
  • KIAA1374
  • KIAA1405
  • KIAA1638
  • KIAA1992
  • KIAA1997
  • KIF17
  • KIF3
  • KIF3A
  • KIF3AP
  • KIF3B
  • KIF3C
  • KIF3X
  • KIFAP3
  • KPNB2
  • LIC3
  • MIP1
  • MIPT3
  • NGD5
  • RABL4
  • RABL5
  • RAYL
  • ROBLD1
  • ROBLD2
  • SMAP
  • SPG
  • TCTE3
  • TCTEX1D1
  • TCTEX1D2
  • TCTEX1D3
  • TG737
  • TNPO1
  • TRAF3IP1
  • TRIP11
  • TRN
  • TTC10
  • TTC21B
  • TTC26
  • TTC30A
  • TTC30B
  • WDR10
  • WDR140
  • WDR19
  • WDR34
  • WDR35
  • WDR56
  • WDR60
  • WDTC2
Homo sapiens (human)
Removal of aminoterminal propeptides from gamma-carboxylated proteins
  • AXLLG
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • FUR
  • FURIN
  • GAS6
  • PACE
  • PCSK3
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • PROZ
Homo sapiens (human)
Gamma-carboxylation of protein precursors
  • AXLLG
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • GAS6
  • GC
  • GGCX
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • PROZ
Homo sapiens (human)
Transport of gamma-carboxylated protein precursors from the endoplasmic reticulum to the Golgi apparatus
  • AXLLG
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • GAS6
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • PROZ
Homo sapiens (human)
Extrinsic Pathway of Fibrin Clot Formation
  • F10
  • F3
  • F7
  • F9
  • LACI
  • TFPI
  • TFPI1
Homo sapiens (human)
Defective cofactor function of FVIIIa variant
  • F10
  • F8
  • F8C
  • F9
Homo sapiens (human)
Defective F9 variant does not activate FX
  • F10
  • F8
  • F8C
  • F9
Homo sapiens (human)
Defective factor IX causes thrombophilia
  • F10
  • F8
  • F8C
  • F9
Homo sapiens (human)
Defective F9 activation
  • F11
  • F9
  • GP1BA
  • GP1BB
  • GP5
  • GP9
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024