GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1251 - 1275 of 2090 in total
Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
IL-6-type cytokine receptor ligand interactions
  • BSF3
  • CLC
  • CLCF1
  • CNTF
  • CNTFR
  • CRL3
  • CRLF1
  • CTF1
  • GPL
  • HILDA
  • IL11
  • IL11RA
  • IL31
  • IL31RA
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • LIF
  • LIFR
  • NNT1
  • OSM
  • OSMR
  • OSMRB
  • TYK2
Homo sapiens (human)
IKK complex recruitment mediated by RIP1
  • API1
  • API2
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLU
  • CD14
  • CHUK
  • CROC1
  • ESOP1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • LY96
  • MD2
  • MIHB
  • MIHC
  • NEMO
  • PRVTIRB
  • PUBC1
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF85
  • RPS27A
  • SFT
  • TCF16
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAF6
  • TRAM
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
IKBKG deficiency causes anhidrotic ectodermal dysplasia with immunodeficiency (EDA-ID) (via TLR)
  • CHUK
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • NEMO
  • TCF16
Homo sapiens (human)
IKBKB deficiency causes SCID
  • CHUK
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • NEMO
  • TCF16
Homo sapiens (human)
IFNG signaling activates MAPKs
  • ERK1
  • ERK2
  • IFNG
  • IFNGR1
  • IFNGR2
  • IFNGT1
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RAF
  • RAF1
Homo sapiens (human)
Hypusinylation
  • DHPS
  • DOHH
  • DS
  • EIF5A
  • EIF5A2
  • HLRC1
Homo sapiens (human)
Hydroxycarboxylic acid-binding receptors
  • GPR104
  • GPR109A
  • GPR109B
  • GPR81
  • HCA1
  • HCA2
  • HCA3
  • HCAR1
  • HCAR2
  • HCAR3
  • HM74A
  • HM74B
  • NIACR1
  • NIACR2
Homo sapiens (human)
Hydrolysis of LPC
  • CPLA2
  • GDE5
  • GPCPD1
  • KIAA1434
  • LYPLA3
  • PLA2G15
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PLA2G4B
  • PLA2G4C
  • PLA2G4D
  • PLA2G4E
  • PLA2G4F
  • PLBD1
Homo sapiens (human)
Hyaluronan uptake and degradation
  • APNH1
  • CD44
  • CHP
  • CHP1
  • CRSBP1
  • FEEL2
  • FELL
  • FEX2
  • GUSB
  • HAR
  • HARE
  • HEXA
  • HEXB
  • HMMR
  • HYAL1
  • HYAL2
  • HYAL3
  • IHABP
  • LHR
  • LUCA1
  • LUCA2
  • LUCA3
  • LYVE1
  • MDU2
  • MDU3
  • MIC4
  • NHE1
  • RHAMM
  • SLC9A1
  • STAB2
  • XLKD1
Homo sapiens (human)
Hyaluronan biosynthesis and export
  • ABCC5
  • CEMIP
  • HAS
  • HAS1
  • HAS2
  • HAS3
  • HYBID
  • KIAA1199
  • MRP5
Homo sapiens (human)
HuR (ELAVL1) binds and stabilizes mRNA
  • ANP32A
  • APRIL
  • C15orf1
  • CAIN
  • CAN
  • CRM1
  • ELAVL1
  • HUR
  • KIAA0023
  • LANP
  • MAPM
  • NUP214
  • PHAP1
  • PKCA
  • PKCD
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKCD
  • SET
  • TALL2
  • TNFSF13
  • XPO1
  • ZTNF2
Homo sapiens (human)
Hormone ligand-binding receptors
  • CGA
  • FSHB
  • FSHR
  • GNRH
  • GNRH1
  • GNRH2
  • GNRHR
  • GNRHR2
  • GPA2
  • GPB5
  • GPHA2
  • GPHB5
  • GRH
  • GRHR
  • LCGR
  • LGR1
  • LGR2
  • LGR3
  • LHB
  • LHCGR
  • LHRH
  • LHRHR
  • TSHB
  • TSHR
  • ZLUT1
  • ZSIG51
Homo sapiens (human)
Homologous DNA Pairing and Strand Exchange
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
  • XRCC3
Homo sapiens (human)
Histidine catabolism
  • AMDHD1
  • ATPGD1
  • C9orf41
  • CARNMT1
  • CARNS1
  • FTCD
  • HAL
  • HDC
  • HIS
  • HNMT
  • KIAA1394
  • UROC1
Homo sapiens (human)
Histamine receptors
  • GPCR105
  • GPCR97
  • HRH1
  • HRH2
  • HRH3
  • HRH4
Homo sapiens (human)
Highly sodium permeable postsynaptic acetylcholine nicotinic receptors
  • ACHRD
  • ACHRE
  • ACHRG
  • CHRNA3
  • CHRNA4
  • CHRNB2
  • CHRNB4
  • CHRND
  • CHRNE
  • CHRNG
  • NACHRA3
  • NACRA4
Homo sapiens (human)
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • ACHRA
  • CHNRA
  • CHRNA1
  • CHRNA2
  • CHRNA3
  • CHRNA4
  • CHRNA5
  • CHRNA6
  • CHRNA7
  • CHRNA9
  • CHRNB2
  • CHRNB3
  • CHRNB4
  • NACHRA3
  • NACHRA5
  • NACHRA7
  • NACHRA9
  • NACRA4
Homo sapiens (human)
Highly calcium permeable nicotinic acetylcholine receptors
  • ACHRA
  • CHNRA
  • CHRNA1
  • CHRNA2
  • CHRNA3
  • CHRNA4
  • CHRNA5
  • CHRNA6
  • CHRNB2
  • CHRNB3
  • CHRNB4
  • NACHRA3
  • NACHRA5
  • NACRA4
Homo sapiens (human)
Hh mutants are degraded by ERAD
  • C2orf30
  • C7orf76
  • DER2
  • DERL2
  • DSS1
  • ERLEC1
  • FLANA
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HRD1
  • HSPC
  • IFI5111
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA1810
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • OS9
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RING10
  • RING12
  • RPS27A
  • SEL1L
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SHH
  • SUG1
  • SUG2
  • SYVN1
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • TSA305
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCP
  • X
  • XTP3TPB
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
Hereditary fructose intolerance
  • ALDB
  • ALDOB
Homo sapiens (human)
Heme signaling
  • AIB3
  • APOA1
  • APOB
  • ARC205
  • ARNTL
  • ATF2
  • BACH1
  • BAF60C
  • BHLHE5
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • BHLHE8
  • BHLHE9
  • BMAL1
  • CARM1
  • CBP
  • CHD9
  • CLEC1B
  • CLEC2
  • CLOCK
  • CREB2
  • CREBBP
  • CREBP1
  • CRM1
  • CRSP1
  • CRSP200
  • CRTC1
  • CRTC2
  • CRTC3
  • DG6
  • DRIP205
  • DRIP230
  • EAR1
  • EP300
  • ESOP1
  • G21
  • HBA1
  • HBA2
  • HBB
  • HCA137
  • HCP1
  • HDAC3
  • HELZ2
  • HMOX1
  • HO
  • HO1
  • HREV
  • IRA1
  • KIAA0181
  • KIAA0308
  • KIAA0334
  • KIAA0616
  • KIAA1047
  • KIAA1769
  • KIAA1820
  • KISH2
  • LEM6
  • LY96
  • MAFK
  • MD2
  • MECT1
  • MED1
  • MEF2C
  • MEF2D
  • MOP3
  • MOP4
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOA6IP
  • NCOR1
  • NFE2L2
  • NPAS2
  • NR1C1
  • NR1D1
  • NR1F1
  • NR2B1
  • NRF2
  • NRIP1
  • P300
  • PASD3
  • PASD4
  • PBP
  • PCFT
  • PGC1
  • PGC1A
  • PGRMC2
  • PIMT
  • PMBP
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARBP
  • PPARGBP
  • PPARGC1
  • PPARGC1A
  • PRIC285
  • PRIC320
  • PRMT4
  • RAI1
  • RAP250
  • RB18A
  • RORA
  • RXRA
  • RZRA
  • SIR2L1
  • SIRT1
  • SLC46A1
  • SMARCD3
  • SRC1
  • SRC2
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TGS1
  • THRAL
  • TIF2
  • TLR4
  • TORC1
  • TORC2
  • TORC3
  • TRAP220
  • TRBP
  • TRIP2
  • WAMTP1
  • XPO1
Homo sapiens (human)
Heme degradation
  • ABCC1
  • ABCC2
  • ABCG2
  • ABCP
  • ALB
  • BCRP
  • BCRP1
  • BLVR
  • BLVRA
  • BLVRB
  • BVR
  • CMOAT
  • CMOAT1
  • CMRP
  • FABP1
  • FABPL
  • FLR
  • GNT1
  • GSTA1
  • HMOX1
  • HMOX2
  • HO
  • HO1
  • HO2
  • LST1
  • LST2
  • MRP
  • MRP1
  • MRP2
  • MXR
  • OATP1B1
  • OATP1B3
  • OATP2
  • OATP8
  • OATPC
  • SCAN
  • SLC21A6
  • SLC21A8
  • SLCO1B1
  • SLCO1B3
  • UGT1
  • UGT1A1
  • UGT1A4
Homo sapiens (human)
Heme biosynthesis
  • ABCG2
  • ABCP
  • ALAD
  • ALAS1
  • ALAS2
  • ALAS3
  • ALASE
  • ALASH
  • ALB
  • ASB
  • BCRP
  • BCRP1
  • COX10
  • COX15
  • CPO
  • CPOX
  • CPX
  • FECH
  • HMBS
  • MXR
  • PBGD
  • PPOX
  • UPS
  • UROD
  • UROS
Homo sapiens (human)
Hedgehog ligand biogenesis
  • C2orf30
  • C7orf76
  • DER2
  • DERL2
  • DHH
  • DSS1
  • ERBA2L
  • ERLEC1
  • FLANA
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • HHAT
  • HRD1
  • HSPC
  • IFI5111
  • IHH
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA1810
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MART2
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • OS9
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PFAAP4
  • PO4DB
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RING10
  • RING12
  • RPS27A
  • SEL1L
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SHH
  • SKI1
  • SUG1
  • SUG2
  • SYVN1
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • TSA305
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCP
  • X
  • XTP3TPB
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
Hedgehog 'on' state
  • C14orf41
  • C1orf28
  • C7orf76
  • CDC73
  • CUL3
  • DHH
  • DSS1
  • DZIP
  • DZIP1
  • DZIP2
  • EVC
  • EVC2
  • GLI
  • GLI1
  • GLI2
  • GLI3
  • GPR161
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HRPT2
  • HSPC
  • IFI5111
  • IHH
  • ITCH
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA0617
  • KIAA0996
  • KIAA1625
  • KIF7
  • LBN
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • NUMB
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • PTCH
  • PTCH1
  • RBX1
  • RING10
  • RING12
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SHH
  • SMO
  • SMOH
  • SMURF1
  • SMURF2
  • SPOP
  • SPOPL
  • SUFU
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • THP
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ULK3
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024