GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1426 - 1450 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▲ Organism GlyTouCan ID
Breakdown of the nuclear lamina
  • CASP6
  • LMN2
  • LMNB
  • LMNB1
  • MCH2
Homo sapiens (human)
TRIF-mediated programmed cell death
  • CASP8
  • CD14
  • ESOP1
  • FADD
  • LY96
  • MCH5
  • MD2
  • MORT1
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAM
  • TRIF
Homo sapiens (human)
Regulation of NF-kappa B signaling
  • CASP8
  • CHUK
  • FIP3
  • IKBIP
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKIP
  • IKKA
  • IKKB
  • ISG43
  • KIAA0014
  • KIAA0615
  • LRRC14
  • MCH5
  • N4BP1
  • NEMO
  • NLRC5
  • NLRX1
  • NOD27
  • NOD4
  • NOD5
  • NOD9
  • P53
  • RNF85
  • RPS27A
  • TCF16
  • TGT
  • TP53
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP14
  • USP18
Homo sapiens (human)
TLR3-mediated TICAM1-dependent programmed cell death
  • CASP8
  • FADD
  • MCH5
  • MORT1
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRIF
Homo sapiens (human)
Defective RIPK1-mediated regulated necrosis
  • CASP8
  • FADD
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAP3
Homo sapiens (human)
Class C/3 (Metabotropic glutamate/pheromone receptors)
  • CASR
  • GABBR1
  • GABBR2
  • GPR51
  • GPR59
  • GPR60
  • GPR70
  • GPR71
  • GPRC1A
  • GPRC1B
  • GPRC1C
  • GPRC1D
  • GPRC1E
  • GPRC1F
  • GPRC1G
  • GPRC1H
  • GPRC2A
  • GPRC3A
  • GPRC3B
  • GPRC6A
  • GRM1
  • GRM2
  • GRM3
  • GRM4
  • GRM5
  • GRM6
  • GRM7
  • GRM8
  • MGLUR1
  • MGLUR2
  • MGLUR3
  • MGLUR4
  • MGLUR5
  • MGLUR6
  • MGLUR7
  • MGLUR8
  • PCAR1
  • PTC
  • T1R1
  • T1R2
  • T1R3
  • TAS1R1
  • TAS1R2
  • TAS1R3
  • TAS2R1
  • TAS2R10
  • TAS2R13
  • TAS2R14
  • TAS2R16
  • TAS2R19
  • TAS2R20
  • TAS2R23
  • TAS2R3
  • TAS2R30
  • TAS2R31
  • TAS2R38
  • TAS2R39
  • TAS2R4
  • TAS2R40
  • TAS2R41
  • TAS2R42
  • TAS2R43
  • TAS2R44
  • TAS2R45
  • TAS2R46
  • TAS2R47
  • TAS2R48
  • TAS2R49
  • TAS2R5
  • TAS2R50
  • TAS2R55
  • TAS2R60
  • TAS2R7
  • TAS2R8
  • TAS2R9
  • TR1
  • TR2
  • TR3
Homo sapiens (human)
Trafficking and processing of endosomal TLR
  • CATL2
  • CNPY3
  • CPSB
  • CTG4A
  • CTSB
  • CTSK
  • CTSL
  • CTSL1
  • CTSL2
  • CTSO
  • CTSO2
  • CTSS
  • CTSU
  • CTSV
  • ERDA5
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • LGMN
  • PRAT4A
  • PRSC1
  • TLR3
  • TLR7
  • TLR8
  • TLR9
  • TNRC5
  • TRA1
  • UNC93
  • UNC93B
  • UNC93B1
Homo sapiens (human)
RAB geranylgeranylation
  • CATX8
  • CHM
  • CHML
  • GGTB
  • GOV
  • KIAA0118
  • MEL
  • PRL2
  • PTP4A2
  • PTPCAAX2
  • RAB1
  • RAB10
  • RAB11
  • RAB11A
  • RAB11B
  • RAB12
  • RAB13
  • RAB14
  • RAB15
  • RAB16
  • RAB17
  • RAB18
  • RAB19
  • RAB19B
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RAB1C
  • RAB2
  • RAB20
  • RAB21
  • RAB22
  • RAB22A
  • RAB22B
  • RAB23
  • RAB24
  • RAB25
  • RAB26
  • RAB27
  • RAB27A
  • RAB27B
  • RAB29
  • RAB2A
  • RAB2B
  • RAB30
  • RAB31
  • RAB32
  • RAB33A
  • RAB33B
  • RAB34
  • RAB35
  • RAB36
  • RAB37
  • RAB38
  • RAB39
  • RAB39A
  • RAB39B
  • RAB3A
  • RAB3B
  • RAB3C
  • RAB3D
  • RAB4
  • RAB40A
  • RAB40B
  • RAB40C
  • RAB41
  • RAB42
  • RAB43
  • RAB44
  • RAB4A
  • RAB4B
  • RAB5
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RAB6
  • RAB6A
  • RAB6B
  • RAB7
  • RAB7A
  • RAB7B
  • RAB7L1
  • RAB8
  • RAB8A
  • RAB8B
  • RAB9
  • RAB9A
  • RAB9B
  • RAB9L
  • RABGGTA
  • RABGGTB
  • RABL
  • RABS10
  • RAH
  • RARL
  • RASL8C
  • RAY
  • REP1
  • REP2
  • SEC4L
  • TCD
  • YPT3
Homo sapiens (human)
NOSTRIN mediated eNOS trafficking
  • CAV
  • CAV1
  • DNM2
  • DYN2
  • NOS3
  • NOSTRIN
  • WASL
Homo sapiens (human)
Class A/1 (Rhodopsin-like receptors)
  • CB2A
  • CB2B
  • CHEMR23
  • CMKLR1
  • CNR
  • CNR1
  • CNR2
  • DEZ
  • EBI2
  • G2A
  • GPBAR1
  • GPCRW
  • GPR109A
  • GPR132
  • GPR18
  • GPR183
  • GPR35
  • GPR39
  • GPR4
  • GPR55
  • GPR65
  • GPR68
  • GPR80
  • GPR91
  • GPR99
  • HCA2
  • HCAR2
  • HM74A
  • MTNR1A
  • MTNR1B
  • NIACR1
  • OGR1
  • OXGR1
  • P2RY15
  • P2Y15
  • PAFR
  • PTAFR
  • SUCNR1
  • TDAG8
  • TGR5
Homo sapiens (human)
RUNX2 regulates chondrocyte maturation
  • CBFB
  • GLI2
  • HDAC4
  • IHH
  • KIAA0288
  • THP
Homo sapiens (human)
FLT3 signaling by CBL mutants
  • CBL
  • CBL2
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • RNF55
  • RPS27A
  • STK1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Constitutive Signaling by Ligand-Responsive EGFR Cancer Variants
  • CBL
  • CBL2
  • CDC37
  • CDC37A
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • GAB1
  • GRB1
  • HER1
  • HRAS
  • HRAS1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PLC1
  • PLCG1
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SOS1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Constitutive Signaling by EGFRvIII
  • CBL
  • CBL2
  • CDC37
  • CDC37A
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • GAB1
  • GRB1
  • HER1
  • HRAS
  • HRAS1
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • NRAS
  • PIK3CA
  • PIK3R1
  • PLC1
  • PLCG1
  • RNF55
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Negative regulation of FGFR2 signaling
  • CBL
  • CBL2
  • ERK1
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KS3
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Negative regulation of FGFR4 signaling
  • CBL
  • CBL2
  • ERK1
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • FRS2
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • JTK2
  • KLB
  • KS3
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • TKF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Negative regulation of FGFR3 signaling
  • CBL
  • CBL2
  • ERK1
  • ERK2
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FRS2
  • HST
  • HSTF1
  • HYPF
  • KS3
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF55
  • RPS27A
  • SHPTP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
Homo sapiens (human)
Defective CBLIF causes IFD
  • CBLIF
  • GIF
  • IFMH
Homo sapiens (human)
InlA-mediated entry of Listeria monocytogenes into host cells
  • CBLL1
  • CDH1
  • CDHE
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNND1
  • HAKAI
  • KIAA0384
  • RNF188
  • RPS27A
  • SRC
  • SRC1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UVO
  • inlA
Homo sapiens (human)
NFE2L2 regulating inflammation associated genes
  • CBP
  • CCL2
  • CREBBP
  • EP300
  • MAFK
  • MCP1
  • NFE2L2
  • NRF2
  • P300
  • SCYA2
Homo sapiens (human)
CD209 (DC-SIGN) signaling
  • CBP
  • CD209
  • CLEC4L
  • CREBBP
  • EP300
  • FYN
  • HRAS
  • HRAS1
  • ICAM2
  • ICAM3
  • JTK8
  • LYN
  • MSK1
  • NFKB1
  • NFKB3
  • NRAS
  • OPHN3
  • P300
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK3
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • RAF
  • RAF1
  • RELA
  • RELB
  • RPS6KA5
Homo sapiens (human)
Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains
  • CBP
  • CD3D
  • CD3E
  • CD3G
  • CD4
  • CD45
  • CSK
  • DEP1
  • HLA-DP1A
  • HLA-DP1B
  • HLA-DPA1
  • HLA-DPB1
  • HLA-DQA1
  • HLA-DQA2
  • HLA-DQB
  • HLA-DQB1
  • HLA-DQB2
  • HLA-DRA
  • HLA-DRA1
  • HLA-DRB1
  • HLA-DRB3
  • HLA-DRB4
  • HLA-DRB5
  • HLA-DXA
  • HLA-DXB
  • HLASB
  • LCK
  • PAG
  • PAG1
  • PTPN22
  • PTPN8
  • PTPRC
  • PTPRJ
  • T3D
  • T3E
  • T3G
  • TCRA
  • TCRBV12S3
  • TCRBV8S1
  • TRAC
  • TRAV19
  • TRAV29DV5
  • TRAV8-4
  • TRBC1
  • TRBV12-3
  • TRBV7-9
Homo sapiens (human)
Notch-HLH transcription pathway
  • CBP
  • CG1
  • CREBBP
  • CTG26
  • CXorf6
  • GCN5
  • GCN5L2
  • HDAC1
  • HDAC10
  • HDAC11
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HDAC4
  • HDAC5
  • HDAC6
  • HDAC7
  • HDAC7A
  • HDAC7B
  • HDAC8
  • HDAC9
  • HDACL1
  • HDRP
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • INT3
  • IRA1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA0288
  • KIAA0600
  • KIAA0744
  • KIAA0901
  • KIAA1047
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MITR
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NOTCH1
  • NOTCH2
  • NOTCH3
  • NOTCH4
  • PCAF
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RPD3L1
  • SKIIP
  • SKIP
  • SNW1
  • TAN1
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
Homo sapiens (human)
LRR FLII-interacting protein 1 (LRRFIP1) activates type I IFN production
  • CBP
  • CREBBP
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • EP300
  • GCF2
  • IRF3
  • LRRFIP1
  • P300
  • TRIP
Homo sapiens (human)
TRAF6 mediated IRF7 activation
  • CBP
  • CREBBP
  • DDX58
  • EFP
  • EP300
  • IFB
  • IFIH1
  • IFNA1
  • IFNA10
  • IFNA13
  • IFNA14
  • IFNA16
  • IFNA17
  • IFNA2
  • IFNA21
  • IFNA2A
  • IFNA2B
  • IFNA2C
  • IFNA4
  • IFNA5
  • IFNA6
  • IFNA7
  • IFNA8
  • IFNB
  • IFNB1
  • IKBKE
  • IKKE
  • IKKI
  • IPS1
  • IRF3
  • IRF7
  • ITRAF
  • KIAA0151
  • KIAA1271
  • MAVS
  • MDA5
  • NAK
  • P300
  • RH116
  • RIGI
  • RNF135
  • RNF147
  • RNF85
  • RNF87
  • SIKE
  • SIKE1
  • TANK
  • TBK1
  • TRAF2
  • TRAF6
  • TRAP3
  • TRIM25
  • TRIM4
  • VISA
  • ZNF147
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024