GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1201 - 1225 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
Regulation of TLR by endogenous ligand
  • APOB
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • DFNA5
  • DFNA5L
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • GSDMD
  • GSDMDC1
  • GSDME
  • HMG1
  • HMGB1
  • ICERE1
  • KIAA0012
  • LBP
  • LY96
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • TLR7
Homo sapiens (human)
LDL remodeling
  • APOB
  • APOF
  • CETP
  • ERBA2L
  • LPA
  • MTP
  • MTTP
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
Homo sapiens (human)
Platelet sensitization by LDL
  • APOB
  • APOER2
  • CPLA2
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • FGR
  • HCP
  • KIAA0044
  • LRP8
  • MAPK14
  • MXI2
  • PECAM1
  • PLA2G4
  • PLA2G4A
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • PTP1C
  • PTP2C
  • PTPN11
  • PTPN6
  • SAPK2A
  • SHPTP2
  • SRC2
Homo sapiens (human)
Chylomicron clearance
  • APOB
  • APOE
  • ARH
  • HTGL
  • LDLR
  • LDLRAP1
  • LIPC
Homo sapiens (human)
VLDL assembly
  • APOB
  • APOC1
  • APOC4
  • ERBA2L
  • MTP
  • MTTP
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
Homo sapiens (human)
VLDL clearance
  • APOB
  • APOB48R
  • APOBR
  • APOC1
  • APOC4
  • ILDR3
  • LISCH
  • LSR
  • VLDLR
Homo sapiens (human)
Scavenging by Class B Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • CD36
  • GP3B
  • GP4
  • SAA1
  • SSC5D
Homo sapiens (human)
Scavenging by Class A Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • APOE
  • CALR
  • CLP1
  • COL1A1
  • COL1A2
  • COL3A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COLEC11
  • COLEC12
  • CRARF
  • CRARF1
  • CRTC
  • FTH
  • FTH1
  • FTHL6
  • FTL
  • GRP94
  • HSP90B1
  • HSPC4
  • MARCO
  • MASP1
  • MSR1
  • NSR2
  • PNSP1
  • PRSS5
  • SCARA1
  • SCARA2
  • SCARA4
  • SCARA5
  • SCGB3A2
  • SRCL
  • TRA1
  • UGRP1
Homo sapiens (human)
TP53 Regulates Transcription of Death Receptors and Ligands
  • APO2
  • APT1
  • ASPP1
  • ASPP2
  • BBP
  • DCR1
  • DCR2
  • DR4
  • DR5
  • FAS
  • FAS1
  • IBP3
  • IGFBP3
  • KET
  • KIAA0771
  • KILLER
  • LIT
  • P53
  • P63
  • P73
  • P73H
  • P73L
  • PPP1R13B
  • TMEM219
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF10C
  • TNFRSF10D
  • TNFRSF6
  • TP53
  • TP53BP2
  • TP63
  • TP73
  • TP73L
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAILR3
  • TRAILR4
  • TRICK2
  • TRID
  • TRUNDD
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
TRAIL signaling
  • APO2
  • APO2L
  • CASH
  • CASP10
  • CASP8
  • CASP8AP1
  • CFLAR
  • CLARP
  • DCR2
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • KILLER
  • MCH4
  • MCH5
  • MORT1
  • MRIT
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF10D
  • TNFSF10
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAILR4
  • TRICK2
  • TRUNDD
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
CASP8 activity is inhibited
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Regulation by c-FLIP
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Dimerization of procaspase-8
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • MCH5
  • MORT1
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAP3
  • TRICK2
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Ligand-dependent caspase activation
  • APO2
  • APO2L
  • APT1
  • APT1LG1
  • CASP8
  • CD14
  • CD95L
  • DR4
  • DR5
  • ESOP1
  • FADD
  • FAS
  • FAS1
  • FASL
  • FASLG
  • KILLER
  • LY96
  • MC159L
  • MCH5
  • MD2
  • MORT1
  • ORF71
  • PRVTIRB
  • RIP
  • RIP1
  • RIPK1
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF6
  • TNFSF10
  • TNFSF6
  • TRADD
  • TRAF2
  • TRAIL
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAM
  • TRAP3
  • TRICK2
  • TRIF
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
Sodium/Proton exchangers
  • APNH1
  • KIAA0267
  • KIAA0939
  • NHE1
  • NHE2
  • NHE3
  • NHE4
  • NHE5
  • NHE6
  • NHE7
  • NHE8
  • NHE9
  • SLC9A1
  • SLC9A2
  • SLC9A3
  • SLC9A4
  • SLC9A5
  • SLC9A6
  • SLC9A7
  • SLC9A8
  • SLC9A9
Homo sapiens (human)
Hyaluronan uptake and degradation
  • APNH1
  • CD44
  • CHP
  • CHP1
  • CRSBP1
  • FEEL2
  • FELL
  • FEX2
  • GUSB
  • HAR
  • HARE
  • HEXA
  • HEXB
  • HMMR
  • HYAL1
  • HYAL2
  • HYAL3
  • IHABP
  • LHR
  • LUCA1
  • LUCA2
  • LUCA3
  • LYVE1
  • MDU2
  • MDU3
  • MIC4
  • NHE1
  • RHAMM
  • SLC9A1
  • STAB2
  • XLKD1
Homo sapiens (human)
Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere
  • APITD1
  • C14orf106
  • C16orf56
  • C16orf60
  • C1orf155
  • C21orf45
  • C21orf46
  • C22orf18
  • C6orf139
  • C6orf173
  • CASC5
  • CENPA
  • CENPC
  • CENPC1
  • CENPH
  • CENPI
  • CENPK
  • CENPL
  • CENPM
  • CENPN
  • CENPO
  • CENPP
  • CENPQ
  • CENPR
  • CENPS
  • CENPT
  • CENPU
  • CENPW
  • CENPX
  • CUG2
  • FAAP10
  • FAAP16
  • FAKTS
  • FASP1
  • FLEG1
  • FSHPRH1
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HBXAP
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST4H4
  • HJURP
  • ICEN19
  • ICEN22
  • ICEN24
  • ICEN32
  • ICEN33
  • ICEN35
  • ICEN36
  • ICEN37
  • ICEN39
  • ICEN7
  • INO80H
  • ITGB3BP
  • KIAA1570
  • KIAA1903
  • KLIP1
  • KNL1
  • KNL2
  • LRPR1
  • M18BP1
  • MCM21R
  • MHF1
  • MHF2
  • MIS18A
  • MIS18B
  • MIS18BP1
  • MLF1IP
  • NMP238
  • NPM
  • NPM1
  • NRIF3
  • OIP5
  • PANE1
  • PBIP1
  • RBAP46
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBBP7
  • RSF1
  • RUVBL1
  • SMARCA5
  • SNF2H
  • STRA13
  • TIP49
  • TIP49A
  • TSH2B
  • URLC9
  • WCRF135
  • XAP8
Homo sapiens (human)
TP53 regulates transcription of several additional cell death genes whose specific roles in p53-dependent apoptosis remain uncertain
  • API4
  • ASPP1
  • ASPP2
  • BBP
  • BCL2L14
  • BCL5
  • BCL6
  • BCLG
  • BIRC5
  • CAP43
  • CHM
  • DRG1
  • GGTB
  • IAP4
  • KCP1
  • KET
  • KIAA0771
  • KRTCAP1
  • LAZ3
  • NDRG1
  • P53
  • P63
  • P73
  • P73H
  • P73L
  • PERP
  • PIG3
  • PIGPC1
  • PPP1R13B
  • RABGGTA
  • RABGGTB
  • REP1
  • RTP
  • TCD
  • THW
  • TP53
  • TP53BP2
  • TP53I3
  • TP63
  • TP73
  • TP73L
  • ZBTB27
  • ZNF51
Homo sapiens (human)
Regulation of PTEN localization
  • API3
  • BIRC4
  • HAUSP
  • IAP3
  • KIAA0093
  • MMAC1
  • MYL
  • NEDD4
  • NEDD4-1
  • PML
  • PP8675
  • PTEN
  • RNF71
  • RPF1
  • RPS27A
  • TEP1
  • TRIM19
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • USP7
  • XIAP
Homo sapiens (human)
SMAC, XIAP-regulated apoptotic response
  • API3
  • BIRC4
  • CASP3
  • CASP7
  • CPP32
  • DIABLO
  • IAP3
  • MCH3
  • SMAC
  • XIAP
Homo sapiens (human)
TICAM1, RIP1-mediated IKK complex recruitment
  • API1
  • API2
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLU
  • CHUK
  • CROC1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • MIHB
  • MIHC
  • NEMO
  • PRVTIRB
  • PUBC1
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF85
  • RPS27A
  • SFT
  • TCF16
  • TICAM1
  • TLR3
  • TRAF6
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
IKK complex recruitment mediated by RIP1
  • API1
  • API2
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLU
  • CD14
  • CHUK
  • CROC1
  • ESOP1
  • FIP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • LY96
  • MD2
  • MIHB
  • MIHC
  • NEMO
  • PRVTIRB
  • PUBC1
  • RIP
  • RIP1
  • RIP3
  • RIPK1
  • RIPK3
  • RNF48
  • RNF49
  • RNF85
  • RPS27A
  • SFT
  • TCF16
  • TICAM1
  • TICAM2
  • TIRAP3
  • TIRP
  • TLR4
  • TRAF6
  • TRAM
  • TRIF
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • UBE2N
  • UBE2V
  • UBE2V1
  • UEV1
Homo sapiens (human)
TNF receptor superfamily (TNFSF) members mediating non-canonical NF-kB pathway
  • API1
  • API2
  • APO3L
  • BAFF
  • BAFFR
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLYS
  • BR3
  • CAP-1
  • CD40L
  • CD40LG
  • CRAF1
  • D12S370
  • DR3LG
  • FN14
  • HVEML
  • LIGHT
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • MIHB
  • MIHC
  • NIK
  • OPGL
  • RANK
  • RANKL
  • RNF48
  • RNF49
  • TALL1
  • TNFB
  • TNFC
  • TNFCR
  • TNFR3
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFRSF3
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF20
  • TNFSF3
  • TNFSF5
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRANCE
  • TRAP
  • TRAP3
  • ZTNF4
Homo sapiens (human)
TNFR2 non-canonical NF-kB pathway
  • API1
  • API2
  • APO3L
  • BAFF
  • BAFFR
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BLYS
  • BR3
  • C7orf76
  • CAP-1
  • CD40L
  • CD40LG
  • CRAF1
  • D12S370
  • DR3LG
  • DSS1
  • FN14
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • HVEML
  • IFI5111
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • LIGHT
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • LTA
  • LTB
  • LTBR
  • MAP3K14
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIHB
  • MIHC
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NIK
  • NU
  • OPGL
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RANK
  • RANKL
  • RING10
  • RING12
  • RNF48
  • RNF49
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TALL1
  • TBP1
  • TBP7
  • TNF
  • TNFA
  • TNFB
  • TNFBR
  • TNFC
  • TNFCR
  • TNFR2
  • TNFR3
  • TNFRSF11A
  • TNFRSF12A
  • TNFRSF13C
  • TNFRSF1B
  • TNFRSF3
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF12
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF2
  • TNFSF20
  • TNFSF3
  • TNFSF5
  • TRAF2
  • TRAF3
  • TRAFAMN
  • TRANCE
  • TRAP
  • TRAP2
  • TRAP3
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
  • ZTNF4
Homo sapiens (human)
TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway
  • API1
  • API2
  • API3
  • BIRC2
  • BIRC3
  • BIRC4
  • C20orf18
  • CHUK
  • CYLD
  • CYLD1
  • DUBA7
  • EBI6
  • FIP2
  • FIP3
  • GLC1E
  • GNB2L1
  • HIP7
  • HYPL
  • IAP3
  • IKBKB
  • IKBKG
  • IKKA
  • IKKB
  • KIAA0733
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  • MAP3K7
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  • MIHB
  • MIHC
  • NEMO
  • NRP
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  • PD1
  • RACK1
  • RBCK1
  • RIP
  • RIP1
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  • RNF31
  • RNF48
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  • RNF54
  • SHARPIN
  • SIPL1
  • SPATA2
  • TAB1
  • TAB2
  • TAB3
  • TAK1
  • TCF16
  • TNF
  • TNFA
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  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
  • TRADD
  • TRAF1
  • TRAF2
  • TRAP3
  • UBCE7IP3
  • UBP41
  • UNP
  • UNPH
  • USP2
  • USP21
  • USP23
  • USP4
  • XAP3
  • XAP4
  • XIAP
  • ZA20D1
  • ZIBRA
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024