GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1451 - 1475 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol ▼ Organism GlyTouCan ID
RAB GEFs exchange GTP for GDP on RABs
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • ALS2
  • ALS2CL
  • ALS2CR6
  • ANKRD27
  • BET3
  • BET5
  • C1orf218
  • C4orf41
  • C5orf44
  • C7orf28A
  • C7orf28B
  • C9orf55
  • C9orf55B
  • CCZ1
  • CCZ1B
  • CHM
  • CHML
  • CIP150
  • CMT4B2
  • DENND1A
  • DENND1B
  • DENND1C
  • DENND2A
  • DENND2B
  • DENND2C
  • DENND2D
  • DENND3
  • DENND4A
  • DENND4B
  • DENND4C
  • DENND5A
  • DENND5B
  • DENND6A
  • DENND6B
  • EHOC1
  • FAM116A
  • FAM116B
  • FAM31A
  • FAM31B
  • FAM31C
  • GAPEX5
  • GAPVD1
  • GDI1
  • GDI2
  • GDIL
  • HPS
  • HPS1
  • HPS4
  • HSRG1
  • HTS1
  • IRLB
  • KIAA0066
  • KIAA0118
  • KIAA0258
  • KIAA0476
  • KIAA0722
  • KIAA0839
  • KIAA0870
  • KIAA0872
  • KIAA1012
  • KIAA1091
  • KIAA1277
  • KIAA1432
  • KIAA1521
  • KIAA1563
  • KIAA1608
  • KIAA1667
  • KIAA1766
  • KIAA1882
  • MEL
  • MON1A
  • MON1B
  • MTMR13
  • MTMR5
  • MUM2
  • MYCPBP
  • NIBP
  • OPHN2
  • PKB
  • PKBG
  • RAB1
  • RAB10
  • RAB12
  • RAB13
  • RAB14
  • RAB18
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RAB1C
  • RAB21
  • RAB22B
  • RAB27
  • RAB27A
  • RAB27B
  • RAB31
  • RAB32
  • RAB35
  • RAB38
  • RAB39
  • RAB39A
  • RAB39B
  • RAB3A
  • RAB3GAP
  • RAB3GAP1
  • RAB3GAP2
  • RAB3IL1
  • RAB3IP
  • RAB5
  • RAB5A
  • RAB5B
  • RAB5C
  • RAB6
  • RAB6A
  • RAB6B
  • RAB6IP1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RAB7B
  • RAB8
  • RAB8A
  • RAB8B
  • RAB9
  • RAB9A
  • RAB9B
  • RAB9L
  • RABEX5
  • RABGDIA
  • RABGDIB
  • RABGEF1
  • RABIN8
  • RABL
  • RAC
  • RAP6
  • RASSF4
  • RAY
  • REP1
  • REP2
  • RGP1
  • RIC1
  • RIN1
  • RIN2
  • RIN3
  • RINL
  • SAND1
  • SAND2
  • SBDN
  • SBF1
  • SBF2
  • SEDL
  • ST5
  • TCD
  • TMEM1
  • TRAMM
  • TRAPPC1
  • TRAPPC10
  • TRAPPC11
  • TRAPPC12
  • TRAPPC13
  • TRAPPC2
  • TRAPPC2L
  • TRAPPC3
  • TRAPPC4
  • TRAPPC5
  • TRAPPC6A
  • TRAPPC6B
  • TRAPPC8
  • TRAPPC9
  • TTC15
  • ULK1
  • XAP4
  • YWHAE
Homo sapiens (human)
MTOR signalling
  • AKT1
  • AKT1S1
  • C11orf59
  • C7orf59
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • GBL
  • HBXIP
  • KIAA1303
  • LAMTOR1
  • LAMTOR2
  • LAMTOR3
  • LAMTOR4
  • LAMTOR5
  • LST8
  • MAP2K1IP1
  • MAPBPIP
  • MAPKSP1
  • MLST8
  • MTOR
  • PDRO
  • PKB
  • PRAS40
  • RAC
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RAPTOR
  • RHEB
  • RHEB2
  • ROBLD3
  • RPTOR
  • RRAGA
  • RRAGB
  • RRAGC
  • RRAGD
  • SLC38A9
  • URLC11
  • XIP
  • YWHAB
Homo sapiens (human)
AKT phosphorylates targets in the cytosol
  • AKT1
  • AKT1S1
  • AKT2
  • AKT3
  • BAD
  • BBC6
  • BCL2L8
  • CAP20
  • CASP9
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN1B
  • CHUK
  • CIP1
  • GSK3A
  • GSK3B
  • IKKA
  • KIP1
  • MCH6
  • MDA6
  • MDM2
  • MKRN1
  • PIC1
  • PKB
  • PKBG
  • PRAS40
  • RAC
  • RNF61
  • SDI1
  • TCF16
  • TSC2
  • TSC4
  • WAF1
  • p27
Homo sapiens (human)
Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX)
  • AKR1C3
  • C1orf93
  • C9orf15
  • CBR
  • CBR1
  • COX1
  • COX2
  • CRN
  • CYP12
  • CYP5
  • CYP5A1
  • CYP8
  • CYP8A1
  • CYP8B1
  • DDH1
  • FAM213B
  • GSTS
  • HPGD
  • HPGDS
  • HSD17B5
  • KIAA0119
  • MGST1L1
  • MPGES1
  • P23
  • PDS
  • PGDH1
  • PGDS
  • PGES
  • PGES2
  • PGFS
  • PIG12
  • PRXL2B
  • PTGDS
  • PTGDS2
  • PTGES
  • PTGES2
  • PTGES3
  • PTGIS
  • PTGR2
  • PTGS1
  • PTGS2
  • SDR21C1
  • SDR36C1
  • TBXAS1
  • TEBP
  • TXAS
  • ZADH1
Homo sapiens (human)
Synthesis of bile acids and bile salts via 27-hydroxycholesterol
  • AKR1C1
  • AKR1C2
  • AKR1C3
  • AKR1C4
  • AKR1D1
  • BAR
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • CHDR
  • CYP12
  • CYP27
  • CYP27A1
  • CYP7
  • CYP7A1
  • CYP7B1
  • CYP8
  • CYP8A1
  • CYP8B1
  • DDH
  • DDH1
  • DDH2
  • FXR
  • HRR1
  • HSD17B5
  • HSD3B7
  • KIAA0119
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NR1H4
  • NR2B1
  • PGFS
  • PTGIS
  • RIP14
  • RXRA
  • SRC1
  • SRC2
  • SRD5B1
  • TIF2
Homo sapiens (human)
Estrogen biosynthesis
  • AKR1B15
  • ARO1
  • CYAR
  • CYP19
  • CYP19A1
  • DHRS10
  • DHRS8
  • E17KSR
  • EDH17B1
  • EDH17B2
  • EDHB17
  • HSD17B1
  • HSD17B11
  • HSD17B14
  • HSD17B2
  • PAN1B
  • SDR16C2
  • SDR28C1
  • SDR3
  • SDR47C1
  • SDR9C2
Homo sapiens (human)
Fructose biosynthesis
  • AKR1B1
  • ALDR1
  • ALR2
  • SORD
Homo sapiens (human)
Glutathione conjugation
  • AKR1A1
  • ALDR1
  • ALR
  • ESD
  • FAEES3
  • GST1
  • GST12
  • GST2
  • GST3
  • GST4
  • GST5
  • GSTA1
  • GSTA2
  • GSTA3
  • GSTA4
  • GSTA5
  • GSTK1
  • GSTM1
  • GSTM2
  • GSTM3
  • GSTM4
  • GSTM5
  • GSTO1
  • GSTO2
  • GSTP1
  • GSTS
  • GSTT1
  • GSTT2
  • GSTT2B
  • GSTTLP28
  • GSTZ1
  • HPGDS
  • MAAI
  • MGST
  • MGST1
  • MGST2
  • MGST3
  • PGDS
  • PTGDS2
Homo sapiens (human)
Formation of xylulose-5-phosphate
  • AKR1A1
  • ALDR1
  • ALR
  • CRY
  • CRYL1
  • DCXR
  • SDR20C1
  • SORD
  • XYLB
Homo sapiens (human)
ROBO receptors bind AKAP5
  • AKAP5
  • AKAP79
  • CALNA2
  • CALNB
  • CNA2
  • KIAA1568
  • PKACA
  • PKCA
  • PKR2
  • PPP3CB
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKCA
  • ROBO2
Homo sapiens (human)
Trafficking of AMPA receptors
  • AKAP5
  • AKAP79
  • CACNG2
  • CACNG3
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG8
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • DLG1
  • DLG4
  • EPB41L1
  • GLUA1
  • GLUH1
  • GLUR1
  • GLUR3
  • GLUR4
  • GLURC
  • GRIA1
  • GRIA3
  • GRIA4
  • GluA3
  • GluA4
  • KIAA0338
  • KIAA0389
  • KIAA0968
  • MDM2
  • MYO6
  • PSD95
Homo sapiens (human)
Phase 3 - rapid repolarisation
  • AKAP350
  • AKAP450
  • AKAP9
  • AMMECR2
  • ERG
  • ERG1
  • HERG
  • KCNA5
  • KCNA8
  • KCNA9
  • KCNE1
  • KCNE1L
  • KCNE2
  • KCNE3
  • KCNE4
  • KCNE5
  • KCNH2
  • KCNQ1
  • KIAA0803
  • KVLQT1
Homo sapiens (human)
Phase 2 - plateau phase
  • AKAP350
  • AKAP450
  • AKAP9
  • AMMECR2
  • CACH2
  • CACN2
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • CACNL1A1
  • CACNLB1
  • CACNLB2
  • CCHL1A1
  • KCNA8
  • KCNA9
  • KCNE1
  • KCNE1L
  • KCNE2
  • KCNE3
  • KCNE4
  • KCNE5
  • KCNQ1
  • KIAA0558
  • KIAA0803
  • KVLQT1
  • MYSB
Homo sapiens (human)
Mitochondrial calcium ion transport
  • AKAP1
  • AKAP149
  • C10orf42
  • C22orf32
  • CALC
  • CBARA1
  • CCDC109A
  • CCDC109B
  • EFHA1
  • EFHA2
  • EMRE
  • LETM1
  • MCU
  • MCUB
  • MICU1
  • MICU2
  • MICU3
  • NCKX6
  • NCLX
  • NCX3
  • PRKA1
  • SLC24A6
  • SLC8A3
  • SLC8B1
  • SMDT1
  • VDAC
  • VDAC1
  • VDAC2
  • VDAC3
Homo sapiens (human)
Interleukin-20 family signaling
  • AK155
  • APRF
  • CRFB4
  • D21S58
  • D21S66
  • DIRS1
  • IFNL1
  • IFNL2
  • IFNL3
  • IFNLR1
  • IL10RB
  • IL19
  • IL20
  • IL20RA
  • IL20RB
  • IL22
  • IL22R
  • IL22RA1
  • IL22RA2
  • IL24
  • IL26
  • IL28A
  • IL28B
  • IL28C
  • IL28RA
  • IL29
  • ILTIF
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • JAK3
  • LICR2
  • MDA7
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
  • ST16
  • STAT1
  • STAT2
  • STAT3
  • STAT4
  • STAT5
  • STAT5A
  • STAT5B
  • TYK2
  • ZCYTO10
  • ZCYTO18
  • ZCYTO20
  • ZCYTO21
  • ZCYTO22
  • ZMDA1
Homo sapiens (human)
Oxygen-dependent proline hydroxylation of Hypoxia-inducible Factor Alpha
  • AJUBA
  • BHLHE17
  • BHLHE73
  • BHLHE78
  • C1orf12
  • C7orf76
  • CUL2
  • DSS1
  • EGLN1
  • EGLN2
  • EGLN3
  • EIT6
  • ELOB
  • ELOC
  • EPAS1
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HIF1A
  • HIF2A
  • HIF3A
  • HSPC
  • IFI5111
  • JUB
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • LIMD1
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOP1
  • MOP2
  • MOP7
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PASD2
  • PASD7
  • PASD8
  • PFAAP4
  • POH1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • PUBC1
  • RBX1
  • RING10
  • RING12
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SFT
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1
  • TCEB2
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBC4
  • UBC5A
  • UBC5B
  • UBC5C
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UBCH4
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5B
  • UBCH5C
  • UBE2D1
  • UBE2D2
  • UBE2D3
  • VHL
  • WTIP
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
RUNX1 and FOXP3 control the development of regulatory T lymphocytes (Tregs)
  • AITR
  • AML1
  • C3BR
  • CBFA2
  • CBFB
  • CD152
  • CR1
  • CTLA4
  • FOXP3
  • GITR
  • IFNG
  • IL2
  • IL2RA
  • IPEX
  • NFAT1
  • NFATC2
  • NFATP
  • RUNX1
  • TNFRSF18
Homo sapiens (human)
TNFs bind their physiological receptors
  • AITR
  • AITRL
  • APO3
  • APRIL
  • BAFF
  • BCM
  • BCMA
  • BLYS
  • CD137
  • CD27
  • CD27L
  • CD27LG
  • CD30
  • CD30L
  • CD30LG
  • CD70
  • D1S166E
  • DCR3
  • DDR3
  • DL
  • DR3
  • ED1
  • EDA
  • EDA2
  • EDA2R
  • EDAR
  • EDARADD
  • FASLG
  • GITR
  • GITRL
  • HVEA
  • HVEM
  • HVEML
  • ILA
  • LIGHT
  • LTA
  • OCIF
  • OPG
  • OPGL
  • RANKL
  • TACI
  • TALL1
  • TALL2
  • TL1
  • TL6
  • TNFAR
  • TNFB
  • TNFBR
  • TNFR1
  • TNFR2
  • TNFRSF11B
  • TNFRSF12
  • TNFRSF13B
  • TNFRSF14
  • TNFRSF17
  • TNFRSF18
  • TNFRSF1A
  • TNFRSF1B
  • TNFRSF25
  • TNFRSF27
  • TNFRSF4
  • TNFRSF6B
  • TNFRSF7
  • TNFRSF8
  • TNFRSF9
  • TNFSF1
  • TNFSF11
  • TNFSF13
  • TNFSF13B
  • TNFSF14
  • TNFSF15
  • TNFSF18
  • TNFSF20
  • TNFSF4
  • TNFSF6
  • TNFSF7
  • TNFSF8
  • TNFSF9
  • TNLG1A
  • TR6
  • TRANCE
  • TXGP1
  • TXGP1L
  • VEGI
  • WSL
  • WSL1
  • XEDAR
  • ZTNF2
  • ZTNF4
Homo sapiens (human)
Organic anion transporters
  • AIT
  • BNPI
  • DIC
  • DNPI
  • GC1
  • GC2
  • NIS
  • NPT1
  • SLC17A1
  • SLC17A5
  • SLC17A6
  • SLC17A7
  • SLC17A8
  • SLC20A3
  • SLC20A4
  • SLC25A1
  • SLC25A10
  • SLC25A11
  • SLC25A18
  • SLC25A22
  • SLC5A5
  • SLC5A8
  • SMCT
  • SMCT1
  • VGLUT1
  • VGLUT2
  • VGLUT3
Homo sapiens (human)
Purine catabolism
  • AIRP
  • C20orf37
  • C6orf108
  • DNPH1
  • DNT1
  • GDA
  • ITPA
  • KIAA1258
  • NP
  • NT5
  • NT5B
  • NT5C
  • NT5C1A
  • NT5C1B
  • NT5C2
  • NT5CP
  • NT5E
  • NTE
  • PNP
  • PNT5
  • RCL
  • UMPH2
  • XDH
  • XDHA
Homo sapiens (human)
Ion transport by P-type ATPases
  • AIPP1
  • ATP10A
  • ATP10B
  • ATP10C
  • ATP10D
  • ATP11A
  • ATP11B
  • ATP11C
  • ATP12A
  • ATP13A
  • ATP13A1
  • ATP13A2
  • ATP13A4
  • ATP13A5
  • ATP1A1
  • ATP1A2
  • ATP1A3
  • ATP1A4
  • ATP1AL1
  • ATP1AL2
  • ATP1B
  • ATP1B1
  • ATP1B2
  • ATP1B3
  • ATP1C
  • ATP1G1
  • ATP1K
  • ATP2A1
  • ATP2A2
  • ATP2A3
  • ATP2B
  • ATP2B1
  • ATP2B2
  • ATP2B3
  • ATP2B4
  • ATP2C1
  • ATP2C2
  • ATP4A
  • ATP4B
  • ATP7A
  • ATP7B
  • ATP8A1
  • ATP8A2
  • ATP8B1
  • ATP8B2
  • ATP8B3
  • ATP8B4
  • ATP9A
  • ATP9B
  • ATPIA
  • ATPIB
  • ATPIC
  • ATPID
  • ATPIF
  • ATPIG
  • ATPIH
  • ATPIIA
  • ATPIIB
  • ATPIQ
  • ATPIR
  • ATPIS
  • ATPVA
  • ATPVB
  • ATPVC
  • ATPVD
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • CAM2
  • CAMK
  • CAMK-II
  • CAMK2
  • CAMK2A
  • CAMK2B
  • CAMK2D
  • CAMK2G
  • CAMKA
  • CAMKB
  • CAMKD
  • CAMKG
  • CUTC
  • FIC1
  • FOS37502_2
  • FXYD1
  • FXYD2
  • FXYD3
  • FXYD4
  • FXYD6
  • FXYD7
  • KIAA0566
  • KIAA0611
  • KIAA0703
  • KIAA0715
  • KIAA0778
  • KIAA0956
  • KIAA0968
  • KIAA1021
  • KIAA1137
  • KIAA1347
  • KIAA1487
  • KIAA1825
  • KIAA1939
  • MAT8
  • MC1
  • MNK
  • MXRA1
  • NEO1L
  • PARK9
  • PDZD11
  • PDZK11
  • PFIC
  • PISP
  • PLB
  • PLM
  • PLML
  • PLN
  • PMCA1
  • PMCA2
  • PMR1L
  • PWD
  • SLN
  • SPCA2
  • SRI
  • WC1
  • WND
Homo sapiens (human)
Ion influx/efflux at host-pathogen interface
  • AIPP1
  • ATOX1
  • ATP7A
  • HAH1
  • LSH
  • MC1
  • MNK
  • NRAMP
  • NRAMP1
  • PDZD11
  • PDZK11
  • PISP
  • SLC11A1
Homo sapiens (human)
Uptake and function of anthrax toxins
  • AIP1
  • ALIX
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • FUR
  • FURIN
  • JNKK1
  • JNKK2
  • KIAA1375
  • MAP2K1
  • MAP2K2
  • MAP2K4
  • MAP2K7
  • MEK1
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Homo sapiens (human)
Budding and maturation of HIV virion
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Homo sapiens (human)
Regulation of necroptotic cell death
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Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024