GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 151 - 175 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Transport of Ribonucleoproteins into the Host Nucleus
  • AAAS
  • ADRACALA
  • C7orf14
  • CAIN
  • CAN
  • CG1
  • D3S1231E
  • KIAA0023
  • KIAA0095
  • KIAA0169
  • KIAA0197
  • KIAA0225
  • KIAA0618
  • KIAA0791
  • KIAA0906
  • KPNA1
  • KPNB1
  • MP44
  • MRNP41
  • NDC1
  • NP
  • NPAP60L
  • NTF97
  • NUP107
  • NUP120
  • NUP121
  • NUP133
  • NUP153
  • NUP155
  • NUP160
  • NUP188
  • NUP205
  • NUP210
  • NUP214
  • NUP35
  • NUP358
  • NUP37
  • NUP42
  • NUP43
  • NUP50
  • NUP53
  • NUP54
  • NUP62
  • NUP75
  • NUP85
  • NUP88
  • NUP93
  • NUPL2
  • PA
  • PB1
  • PB2
  • PCNT1
  • POM121
  • POM121A
  • POM121C
  • RAE1
  • RANBP2
  • RCH2
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • TMEM48
  • TPR
Homo sapiens (human)
Regulation of RUNX1 Expression and Activity
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • AML1
  • BCL1
  • CAGH26
  • CBFA2
  • CBFB
  • CCND1
  • CCND2
  • CCND3
  • CDK6
  • CDKN6
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • MOV10
  • MYL
  • PML
  • PP8675
  • PRAD1
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RNF71
  • RUNX1
  • SHPTP2
  • SRC
  • SRC1
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • TRIM19
Homo sapiens (human)
Inhibition of membrane repair
  • HGS
  • HRS
  • cfp7
  • esxG
  • esxH
Homo sapiens (human)
Formation of lateral plate mesoderm
  • BMP2B
  • BMP4
  • DVR4
  • FKHL5
  • FOXF1
  • FREAC1
  • GATA4
  • IHH
  • SHH
Homo sapiens (human)
Establishment of Sister Chromatid Cohesion
  • APRIN
  • AS3
  • BAM
  • BMH
  • CDCA5
  • CSPG6
  • DXS423E
  • EFO1
  • ESCO1
  • ESCO2
  • FOE
  • HR21
  • KIAA0078
  • KIAA0178
  • KIAA0261
  • KIAA0648
  • KIAA0979
  • KIAA1911
  • NXP1
  • PDS5
  • PDS5A
  • PDS5B
  • RAD21
  • SA1
  • SA2
  • SB1.8
  • SCC1
  • SCC3
  • SMC1
  • SMC1A
  • SMC1L1
  • SMC3
  • SMC3L1
  • STAG1
  • STAG2
  • WAPAL
  • WAPL
Homo sapiens (human)
Opioid Signalling
  • MOR1
  • OPRM1
  • PDYN
  • POMC
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression to limit cholesterol uptake
  • BZF1
  • IDOL
  • LXRA
  • LXRB
  • MYLIP
  • NER
  • NR1H2
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • RXRA
  • RXRB
  • UNR
Homo sapiens (human)
MET activates RAP1 and RAC1
  • CRK
  • CRKL
  • DOCK7
  • GAB1
  • GRF2
  • HGF
  • HPTA
  • KIAA1771
  • KREV1
  • MET
  • RAC1
  • RAP1A
  • RAP1B
  • RAPGEF1
  • TC25
Homo sapiens (human)
Hyaluronan uptake and degradation
  • APNH1
  • CD44
  • CHP
  • CHP1
  • CRSBP1
  • FEEL2
  • FELL
  • FEX2
  • GUSB
  • HAR
  • HARE
  • HEXA
  • HEXB
  • HMMR
  • HYAL1
  • HYAL2
  • HYAL3
  • IHABP
  • LHR
  • LUCA1
  • LUCA2
  • LUCA3
  • LYVE1
  • MDU2
  • MDU3
  • MIC4
  • NHE1
  • RHAMM
  • SLC9A1
  • STAB2
  • XLKD1
Homo sapiens (human)
Conversion from APC/C:Cdc20 to APC/C:Cdh1 in late anaphase
  • ANAPC1
  • ANAPC10
  • ANAPC11
  • ANAPC12
  • ANAPC15
  • ANAPC16
  • ANAPC2
  • ANAPC3
  • ANAPC4
  • ANAPC5
  • ANAPC6
  • ANAPC7
  • ANAPC8
  • APC10
  • APC2
  • APC4
  • APC5
  • APC7
  • C10orf104
  • C11orf51
  • C9orf17
  • CDC14A
  • CDC16
  • CDC20
  • CDC23
  • CDC26
  • CDC27
  • CDH1
  • CENP-27
  • D0S1430E
  • D17S978E
  • E2EPF
  • FYR
  • FZR
  • FZR1
  • KIAA1242
  • KIAA1406
  • SFT
  • TSG24
  • UBC5A
  • UBCH10
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH6
  • UBE2C
  • UBE2D1
  • UBE2E1
  • UBE2S
Homo sapiens (human)
DCC mediated attractive signaling
  • ABLIM
  • ABLIM1
  • ABLIM2
  • ABLIM3
  • CDC42
  • DCC
  • DOCK1
  • FAK
  • FAK1
  • IGDCC1
  • KIAA0059
  • KIAA0843
  • KIAA1808
  • LIMAB1
  • NCK
  • NCK1
  • NTN1
  • NTN1L
  • PTK2
  • RAC1
  • SRC
  • SRC1
  • TC25
  • TRIO
  • WASL
Homo sapiens (human)
MET Receptor Activation
  • HAI1
  • HAI2
  • HGF
  • HGFAC
  • HPN
  • HPTA
  • KOP
  • MET
  • SPINT1
  • SPINT2
  • TMPRSS1
Homo sapiens (human)
Glutathione conjugation
  • AKR1A1
  • ALDR1
  • ALR
  • ESD
  • FAEES3
  • GST1
  • GST12
  • GST2
  • GST3
  • GST4
  • GST5
  • GSTA1
  • GSTA2
  • GSTA3
  • GSTA4
  • GSTA5
  • GSTK1
  • GSTM1
  • GSTM2
  • GSTM3
  • GSTM4
  • GSTM5
  • GSTO1
  • GSTO2
  • GSTP1
  • GSTS
  • GSTT1
  • GSTT2
  • GSTT2B
  • GSTTLP28
  • GSTZ1
  • HPGDS
  • MAAI
  • MGST
  • MGST1
  • MGST2
  • MGST3
  • PGDS
  • PTGDS2
Homo sapiens (human)
NFE2L2 regulating TCA cycle genes
  • IDH1
  • ME1
  • NFE2L2
  • NRF2
  • PICD
Homo sapiens (human)
SEMA3A-Plexin repulsion signaling by inhibiting Integrin adhesion
  • FARP2
  • FES
  • FPS
  • FYN
  • KIAA0463
  • KIAA0589
  • KIAA0793
  • KIAA1027
  • KIAA1550
  • NOV
  • NRP
  • NRP1
  • OCT
  • PIP5K1C
  • PLEKHC3
  • PLXN1
  • PLXN2
  • PLXN4
  • PLXNA1
  • PLXNA2
  • PLXNA3
  • PLXNA4
  • PLXNA4A
  • PLXNA4B
  • RAC1
  • RHO6
  • RND1
  • RRAS
  • SEMA3A
  • SEMAD
  • SEX
  • TC25
  • TLN
  • TLN1
  • VEGF165R
Homo sapiens (human)
Variant SLC6A14 may confer susceptibility towards obesity
  • SLC6A14
Homo sapiens (human)
Integrin cell surface interactions
  • AGRIN
  • AGRN
  • BNSP
  • BSG
  • C21orf43
  • CD11A
  • CD11B
  • CD11C
  • CD18
  • CD44
  • CD47
  • CD49B
  • CD49D
  • CDH1
  • CDHE
  • COL13A1
  • COL16A1
  • COL18A1
  • COL23A1
  • COL4A1
  • COL4A2
  • COL4A3
  • COL4A4
  • COL9A1
  • COL9A2
  • COL9A3
  • COMP
  • CR3A
  • F11R
  • FBN
  • FBN1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • FLK1
  • FN
  • FN1
  • FNRA
  • FNRB
  • GP2B
  • GP3A
  • HSPG2
  • HXB
  • IBSP
  • ICAM1
  • ICAM2
  • ICAM3
  • ICAM4
  • ICAM5
  • ITGA1
  • ITGA10
  • ITGA11
  • ITGA2
  • ITGA2B
  • ITGA3
  • ITGA4
  • ITGA5
  • ITGA6
  • ITGA7
  • ITGA8
  • ITGA9
  • ITGAB
  • ITGAD
  • ITGAE
  • ITGAL
  • ITGAM
  • ITGAV
  • ITGAX
  • ITGB1
  • ITGB2
  • ITGB3
  • ITGB5
  • ITGB6
  • ITGB7
  • ITGB8
  • JAM1
  • JAM2
  • JAM3
  • JCAM
  • KDR
  • LDC
  • LHR
  • LUM
  • LW
  • MDF2
  • MDU2
  • MDU3
  • MER6
  • MFI7
  • MIC4
  • MSK12
  • MSK18
  • MSK8
  • OPN
  • PECAM1
  • SLRR2D
  • SPP1
  • THBS1
  • TLCN
  • TLN
  • TNC
  • TSP
  • TSP1
  • UVO
  • VCAM1
  • VEGFR2
  • VEJAM
  • VNRA
  • VTN
  • VTNR
Homo sapiens (human)
Azathioprine ADME
  • ABCC4
  • ABCC5
  • CNT2
  • CNT3
  • DER12
  • ENT1
  • ENT2
  • GMK
  • GMPK
  • GMPS
  • GST1
  • GST2
  • GSTA1
  • GSTA2
  • GSTM1
  • GUK1
  • HNP36
  • HPRT
  • HPRT1
  • IMPD1
  • IMPD2
  • IMPDH1
  • IMPDH2
  • MOATB
  • MRP4
  • MRP5
  • MTH2
  • NDPKA
  • NM23
  • NM23B
  • NME1
  • NME2
  • NUDT15
  • RAC1
  • SLC28A2
  • SLC28A3
  • SLC29A1
  • SLC29A2
  • TC25
  • TPMT
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • XDH
  • XDHA
Homo sapiens (human)
Signaling by BMP
  • ACVR2
  • ACVR2A
  • ACVR2B
  • ACVRL1
  • ACVRLK1
  • ACVRLK3
  • ALK1
  • ALK3
  • AMH
  • AMHR
  • AMHR2
  • BMP10
  • BMP2
  • BMP2A
  • BMP9
  • BMPR1A
  • BMPR1B
  • BMPR2
  • BSP1
  • CER1
  • CHRDL1
  • CKTSF1B2
  • DAND3
  • DAND4
  • DPC4
  • FRP
  • FSTL1
  • GDF2
  • GREM2
  • INHA
  • INHBA
  • KIAA0305
  • KIAA1625
  • MADH1
  • MADH4
  • MADH5
  • MADH6
  • MADH7
  • MADH8
  • MADH9
  • MADR1
  • MIF
  • MISR2
  • NOG
  • NRLN1
  • PPH1
  • PRDC
  • SFT
  • SKI
  • SMAD1
  • SMAD4
  • SMAD5
  • SMAD6
  • SMAD7
  • SMAD8
  • SMAD9
  • SMURF1
  • SMURF2
  • TGFBR3
  • UBC5A
  • UBC5C
  • UBCH5
  • UBCH5A
  • UBCH5C
  • UBE2D1
  • UBE2D3
  • ZFYVE16
Homo sapiens (human)
Scavenging by Class B Receptors
  • APOA1
  • APOB
  • CD36
  • GP3B
  • GP4
  • SAA1
  • SSC5D
Homo sapiens (human)
Glycerophospholipid catabolism
  • C9orf111
  • ENPP6
  • GDE1
  • GDE2
  • GDE4
  • GDE7
  • GDPD1
  • GDPD3
  • GDPD5
  • MIR16
  • NTE
  • PNPLA6
  • PNPLA7
Homo sapiens (human)
Creatine metabolism
  • AGAT
  • BGT1
  • CKB
  • CKBB
  • CKM
  • CKMM
  • CKMT
  • CKMT1A
  • CKMT1B
  • CKMT2
  • GABT3
  • GAMT
  • GAT3
  • GATM
  • PROT
  • SLC6A11
  • SLC6A12
  • SLC6A7
  • SLC6A8
Homo sapiens (human)
SMAD4 MH2 Domain Mutants in Cancer
  • DPC4
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
Homo sapiens (human)
Impaired BRCA2 translocation to the nucleus
  • BRCA2
  • C7orf76
  • DSS1
  • FACD
  • FANCD1
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
Homo sapiens (human)
LXRs regulate gene expression linked to gluconeogenesis
  • LXRA
  • NR1H3
  • NR2B1
  • NR2B2
  • NRIP1
  • PCK1
  • PEPCK1
  • RXRA
  • RXRB
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

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Last updated: August 19, 2024