GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 426 - 450 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▼
Beta-catenin phosphorylation cascade
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • FRAT1
  • FRAT2
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
NRAGE signals death through JNK
  • AATF
  • ABR
  • AKAP13
  • ARHDH9
  • ARHGEF1
  • ARHGEF10
  • ARHGEF10L
  • ARHGEF11
  • ARHGEF12
  • ARHGEF15
  • ARHGEF16
  • ARHGEF17
  • ARHGEF18
  • ARHGEF19
  • ARHGEF2
  • ARHGEF26
  • ARHGEF3
  • ARHGEF33
  • ARHGEF35
  • ARHGEF37
  • ARHGEF38
  • ARHGEF39
  • ARHGEF4
  • ARHGEF40
  • ARHGEF5
  • ARHGEF5L
  • ARHGEF6
  • ARHGEF7
  • ARHGEF8
  • ARHGEF9
  • BAD
  • BBC6
  • BCL2L11
  • BCL2L8
  • BIM
  • BRX
  • C9orf100
  • CHE1
  • COOL1
  • COOL2
  • DBL
  • DED
  • DUET
  • DUO
  • ECT2
  • EPHEXIN4
  • FGD1
  • FGD2
  • FGD3
  • FGD4
  • FGDY
  • FRABP
  • GNA13
  • GRF2
  • GRINCHGEF
  • HAPIP
  • HT31
  • ITSN
  • ITSN1
  • JNK1
  • KALRN
  • KIAA0006
  • KIAA0142
  • KIAA0294
  • KIAA0337
  • KIAA0362
  • KIAA0380
  • KIAA0382
  • KIAA0424
  • KIAA0521
  • KIAA0651
  • KIAA0720
  • KIAA0915
  • KIAA1112
  • KIAA1415
  • KIAA1556
  • KIAA1626
  • KIAA1639
  • KIAA2016
  • LARG
  • LBC
  • LFP40
  • MAGED1
  • MAPK8
  • MCF2
  • MCF2L
  • NBR
  • NET1
  • NGEF
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • NRAGE
  • OBSCN
  • OST
  • P85SPR
  • PAK3BP
  • PIXA
  • PIXB
  • PLEKHG2
  • PLEKHG5
  • PREX1
  • PRKM8
  • RAC1
  • RASGRF2
  • SAPK1
  • SAPK1C
  • SGEF
  • SH3D1A
  • SOLO
  • SOS1
  • SOS2
  • STEF
  • TC25
  • TEM4
  • TIAM1
  • TIAM2
  • TIM
  • TNFRSF16
  • TRAD
  • TRIO
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • ZFYVE3
  • ZFYVE4
  • ZFYVE5
  • ZFYVE6
Homo sapiens (human)
Resolution of D-loop Structures through Synthesis-Dependent Strand Annealing (SDSA)
  • ATM
  • BACH1
  • BARD1
  • BLM
  • BRCA1
  • BRCA2
  • BRIP1
  • C16orf75
  • C20orf41
  • C7orf76
  • C9orf76
  • CTIP
  • DNA2
  • DNA2L
  • DSS1
  • EXO1
  • EXOI
  • FACD
  • FANCD1
  • FANCJ
  • FANCN
  • HEX1
  • HNGS1
  • HTATIP
  • KAT5
  • KIAA0083
  • KIAA1088
  • MRE11
  • MRE11A
  • NBN
  • NBS
  • NBS1
  • NHL
  • P95
  • PALB2
  • PIR51
  • RAD50
  • RAD51
  • RAD51A
  • RAD51AP1
  • RAD51B
  • RAD51C
  • RAD51D
  • RAD51L1
  • RAD51L2
  • RAD51L3
  • RBBP8
  • REC2
  • RECA
  • RECQ2
  • RECQ3
  • RECQL2
  • RECQL3
  • RMI1
  • RMI2
  • RNF53
  • RTEL1
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • TIP60
  • TOP3
  • TOP3A
  • WRN
  • XRCC2
  • XRCC3
Homo sapiens (human)
Deactivation of the beta-catenin transactivating complex
  • AKT1
  • AKT2
  • ALR
  • APC
  • API3
  • ARB1
  • ASH2L
  • ASH2L1
  • BCL9
  • BCL9L
  • BIRC4
  • BTRC
  • BTRCP
  • C22orf2
  • CBY
  • CBY1
  • CHD8
  • CRM1
  • CTBP
  • CTBP1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • CTNNBIP1
  • DLNB11
  • DP2.5
  • FBW1A
  • FBXW1A
  • GRG4
  • HDAC1
  • HELSNF1
  • IAP3
  • ICAT
  • KIAA1261
  • KIAA1547
  • KIAA1564
  • KMT2D
  • LEF1
  • MEN1
  • MLL2
  • MLL4
  • PGEA1
  • PKB
  • PYGO1
  • PYGO2
  • RAC
  • RBBP5
  • RBQ3
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SCG2
  • SOX13
  • SOX17
  • SOX2
  • SOX3
  • SOX4
  • SOX6
  • SOX7
  • SOX9
  • SRY
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TDF
  • TLE1
  • TLE2
  • TLE3
  • TLE4
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • XIAP
  • XPO1
  • YWHAZ
Homo sapiens (human)
Dopamine Neurotransmitter Release Cycle
  • APBA1
  • BZRAP1
  • CASK
  • CPLX1
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0897
  • LIN2
  • LIN7A
  • LIN7B
  • LIN7C
  • LIP1
  • MALS1
  • MALS2
  • MALS3
  • MINT1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SLC18A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • STX1
  • STX1A
  • SVMT
  • SVP65
  • SYB2
  • SYN1
  • SYN2
  • SYN3
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VAMP2
  • VELI1
  • VELI2
  • VELI3
  • VMAT2
  • X11
Homo sapiens (human)
SMAC (DIABLO) binds to IAPs
  • APAF1
  • API3
  • BIRC4
  • CASP3
  • CASP7
  • CASP9
  • CPP32
  • CYC
  • CYCS
  • DIABLO
  • IAP3
  • KIAA0413
  • MCH3
  • MCH6
  • SMAC
  • XIAP
Homo sapiens (human)
RORA activates gene expression
  • AIB3
  • ARC205
  • BAF60C
  • BHLHD1
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • CARM1
  • CBP
  • CHD9
  • CPT1
  • CPT1A
  • CREBBP
  • CRSP1
  • CRSP200
  • DRIP205
  • DRIP230
  • EP300
  • HCA137
  • HELZ2
  • IRA1
  • KIAA0181
  • KIAA0308
  • KIAA1769
  • KISH2
  • MED1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOA6IP
  • NR1C1
  • NR1F1
  • NR2B1
  • P300
  • PBP
  • PIMT
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARBP
  • PPARGBP
  • PRIC285
  • PRIC320
  • PRMT4
  • RAP250
  • RB18A
  • RORA
  • RXRA
  • RZRA
  • SMARCD3
  • SRC1
  • SRC2
  • SREBF1
  • SREBP1
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TGS1
  • TIF2
  • TRAP220
  • TRBP
  • TRIP2
Homo sapiens (human)
Ubiquitin-dependent degradation of Cyclin D
  • BCL1
  • C7orf76
  • CCND1
  • CDK4
  • DSS1
  • GSK3B
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HSPC
  • IFI5111
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • NU
  • PFAAP4
  • POH1
  • PRAD1
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RING10
  • RING12
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TRAP2
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
Homo sapiens (human)
sunitinib-resistant FLT3 mutants
  • CD135
  • FLK2
  • FLT3
  • STK1
Homo sapiens (human)
APOBEC3G mediated resistance to HIV-1 infection
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CYPA
  • DFS70
  • HMGA1
  • HMGIY
  • LEDGF
  • PPIA
  • PSIP1
  • PSIP2
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Regulation of MITF-M-dependent genes involved in cell cycle and proliferation
  • BCL1
  • CAP20
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCND1
  • CDK2
  • CDKN1
  • CDKN1A
  • CDKN2
  • CDKN2A
  • CIP1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • LEF1
  • MDA6
  • MET
  • MTS1
  • PIC1
  • PLK
  • PLK1
  • PRAD1
  • SDI1
  • TBX2
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • WAF1
Homo sapiens (human)
RUNX2 regulates genes involved in differentiation of myeloid cells
  • AML1
  • CBFA2
  • CBFB
  • LGALS3
  • MAC2
  • RUNX1
Homo sapiens (human)
MyD88 deficiency (TLR5)
  • MYD88
  • TIL3
  • TLR5
  • flaF
  • fliC
  • hag
Homo sapiens (human)
Loss of function of TP53 in cancer due to loss of tetramerization ability
  • P53
  • TP53
Homo sapiens (human)
Vpr-mediated induction of apoptosis by mitochondrial outer membrane permeabilization
  • AAC1
  • AAC2
  • AAC3
  • ANT1
  • ANT2
  • ANT3
  • SLC25A4
  • SLC25A5
  • SLC25A6
  • vpr
Homo sapiens (human)
SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription
  • BHLHE39
  • CCNC
  • CCNK
  • CCNT1
  • CCNT2
  • CDC2L4
  • CDK8
  • CDK9
  • CDKN2B
  • COL1A2
  • CPR4
  • DP1
  • DP2
  • DPC4
  • E2F4
  • E2F5
  • EP300
  • ERK1
  • ERK2
  • FUR
  • FURIN
  • HDAC1
  • JUNB
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADH7
  • MADH8
  • MADR2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MEN1
  • MTS2
  • MYC
  • NSEP1
  • P300
  • PACE
  • PAI1
  • PCSK3
  • PLANH1
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • RBL1
  • RNF111
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SCG2
  • SERPINE1
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • SMAD7
  • SP1
  • TAK
  • TAZ
  • TFDP1
  • TFDP2
  • TGIF
  • TGIF1
  • TGIF2
  • TSFP1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WWTR1
  • YB1
  • YBX1
Homo sapiens (human)
Synthesis of PIPs at the early endosome membrane
  • CG2
  • FIG4
  • INPP4A
  • INPP4B
  • INPP5F
  • KIAA0274
  • KIAA0647
  • KIAA0966
  • KIAA0981
  • KIAA1073
  • KIAA1682
  • MTM1
  • MTMR10
  • MTMR12
  • MTMR2
  • MTMR4
  • PI4K2A
  • PI4K2B
  • PIK3C2A
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PIKFYVE
  • PIP3AP
  • PIP5K3
  • SAC2
  • SAC3
  • TAX1BP2
  • TRX
  • VAC14
  • VPS15
  • VPS34
  • ZFYVE11
Homo sapiens (human)
VEGFA-VEGFR2 Pathway
  • ABI1
  • ABI2
  • ARGBPIA
  • ARH12
  • ARHA
  • AXL
  • BAIAP2
  • BCAR1
  • BRK1
  • C3orf10
  • CAS
  • CASS1
  • CDC42
  • CED12A
  • CRK
  • CRKAS
  • CSBP
  • CSBP1
  • CSBP2
  • CSPB1
  • CYBA
  • CYBB
  • CYFIP1
  • CYFIP2
  • DOCK1
  • ELMO1
  • ELMO2
  • ERK6
  • FAK
  • FAK1
  • FAK2
  • FLK1
  • FYN
  • GP3A
  • GRB1
  • GRB4
  • HEM1
  • HEM2
  • HSP27
  • HSP28
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSPB1
  • HSPC1
  • HSPCA
  • ITGAV
  • ITGB3
  • KDR
  • KIAA0068
  • KIAA0269
  • KIAA0281
  • KIAA0587
  • KIAA0619
  • KIAA0900
  • KIAA1168
  • KIAA1834
  • MAPK11
  • MAPK12
  • MAPK13
  • MAPK14
  • MAPKAPK2
  • MAPKAPK3
  • MSK8
  • MXI2
  • NAP1
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCK
  • NCK1
  • NCK2
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NOX2
  • NOXA2
  • NOXO2
  • P67PHOX
  • PAK2
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIR121
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKM11
  • PRKM13
  • PTK2
  • PTK2B
  • PXN
  • PYK2
  • RAC1
  • RAFTK
  • RHO12
  • RHOA
  • ROCK1
  • ROCK2
  • SAPK2
  • SAPK2A
  • SAPK2B
  • SAPK3
  • SAPK4
  • SCAP
  • SCAR1
  • SCAR3
  • SCK
  • SH2D2A
  • SH3PXD1A
  • SH3PXD4
  • SHB
  • SHC2
  • SHCB
  • SSH3BP1
  • TC25
  • TSAD
  • UFO
  • VAV
  • VAV1
  • VAV2
  • VAV3
  • VEGFR2
  • VNRA
  • VRAP
  • VTNR
  • WASF1
  • WASF2
  • WASF3
  • WAVE1
  • WAVE2
  • WAVE3
Homo sapiens (human)
Defective SLC5A5 causes thyroid dyshormonogenesis 1 (TDH1)
  • NIS
  • SLC5A5
Homo sapiens (human)
IRAK4 deficiency (TLR2/4)
  • AGMX1
  • ATK
  • BPK
  • BTK
  • CAGA
  • CAGB
  • CD14
  • CD36
  • CFAG
  • ESOP1
  • FGA
  • FGB
  • FGG
  • GP3B
  • GP4
  • HMG1
  • HMGB1
  • IRAK4
  • KIAA0012
  • LY96
  • MAL
  • MD2
  • MRP14
  • MRP8
  • MYD88
  • S100A
  • S100A1
  • S100A8
  • S100A9
  • TIL4
  • TIRAP
  • TLR1
  • TLR2
  • TLR4
  • TLR6
  • mip
  • porB
Homo sapiens (human)
NTRK3 as a dependence receptor
  • BAX
  • BCL2L4
  • COBRA1
  • KIAA1182
  • NELFB
  • NTRK3
  • TRKC
Homo sapiens (human)
Ethanol oxidation
  • ACAS2
  • ACAS2L
  • ACSS1
  • ACSS2
  • ADH1
  • ADH1A
  • ADH1B
  • ADH1C
  • ADH2
  • ADH3
  • ADH4
  • ADH5
  • ADH6
  • ADH7
  • ADHX
  • ALDC
  • ALDH1
  • ALDH1A1
  • ALDH1B1
  • ALDH2
  • ALDH5
  • ALDHX
  • ALDM
  • FDH
  • KIAA1846
  • PUMB1
Homo sapiens (human)
MET activates PTPN11
  • GAB1
  • HGF
  • HPTA
  • MET
  • PTP2C
  • PTPN11
  • SHPTP2
Homo sapiens (human)
Defective ABCC9 causes CMD10, ATFB12 and Cantu syndrome
  • ABCC9
  • KCNJ11
  • SUR2
Homo sapiens (human)
trans-Golgi Network Vesicle Budding
  • ARF1
  • GBF1
  • KIAA0248
  • SNAP23
  • STX4
  • STX4A
  • SYB2
  • SYBL1
  • VAMP2
  • VAMP7
  • VAMP8
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024