GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
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Pathway Name ▼ Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Glycosphingolipid transport
  • ARF1
  • BTS
  • CLN3
  • CPTP
  • ESYT1
  • ESYT2
  • ESYT3
  • FAM62A
  • FAM62B
  • FAM62C
  • FAPP2
  • GLTP
  • GLTPD1
  • KIAA0747
  • KIAA1228
  • MBC2
  • PLEKHA8
Homo sapiens (human)
Glycosphingolipid catabolism
  • ARSA
  • ARSB
  • ARSC1
  • ARSD
  • ARSE
  • ARSF
  • ARSG
  • ARSH
  • ARSI
  • ARSJ
  • ARSK
  • ARSL
  • ASAH
  • ASAH1
  • ASAH2
  • ASM
  • CBG
  • CBGL1
  • CTSA
  • ELNR1
  • ENPP7
  • GALC
  • GBA
  • GBA1
  • GBA2
  • GBA3
  • GC
  • GLA
  • GLB1
  • GLB1L
  • GLB1L2
  • GLB1L3
  • GLBA
  • GLUC
  • GM2A
  • HEXA
  • HEXB
  • HNAC1
  • KIAA1001
  • KIAA1418
  • KIAA1605
  • M6PR
  • MPR46
  • MPRD
  • NANH
  • NEU1
  • NEU2
  • NEU3
  • PPGB
  • PSAP
  • SAP1
  • SKNY
  • SMPD1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • SMPD4
  • SPG46
  • STS
  • SUMF1
  • SUMF2
  • TSULF
Homo sapiens (human)
Glycosphingolipid biosynthesis
  • A14GALT
  • A4GALT
  • A4GALT1
  • B3GALNT1
  • B3GALT3
  • B3GALT4
  • B3GNT5
  • B4GALNT1
  • B4GALT5
  • B4GALT6
  • CERK
  • CGT
  • CST
  • FUT1
  • FUT2
  • GAL3ST1
  • GALGT
  • GALT4
  • H
  • HSC
  • KIAA1646
  • SEC2
  • SIAT2
  • SIAT4B
  • SIAT6
  • SIAT7E
  • SIAT7F
  • SIAT8E
  • SIAT9
  • ST3GAL2
  • ST3GAL3
  • ST3GAL5
  • ST6GALNAC5
  • ST6GALNAC6
  • ST8SIA5
  • UGCG
  • UGT4
  • UGT8
Homo sapiens (human)
Glycoprotein hormones
  • CGA
  • CGB
  • CGB3
  • CGB5
  • CGB8
  • FSHB
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • INHBC
  • INHBE
  • LHB
  • TSHB
Homo sapiens (human)
Glycolysis
  • ADPGK
  • ALDA
  • ALDB
  • ALDC
  • ALDOA
  • ALDOB
  • ALDOC
  • BM32A
  • BPGM
  • C10orf134
  • ENO1
  • ENO1L1
  • ENO2
  • ENO3
  • ENO4
  • GAPD
  • GAPD2
  • GAPDH
  • GAPDH2
  • GAPDHS
  • GAPDS
  • GCK
  • GNP2
  • GNPDA1
  • GNPDA2
  • GNPI
  • GPI
  • HK1
  • HK2
  • HK3
  • HKDC1
  • HLN
  • KIAA0060
  • MBPB1
  • MPB1
  • PFKF
  • PFKL
  • PFKM
  • PFKP
  • PFKX
  • PGAM1
  • PGAM2
  • PGAMA
  • PGAMM
  • PGK1
  • PGK2
  • PGKA
  • PGKB
  • PGM2L1
  • PGP
  • TPI
  • TPI1
Homo sapiens (human)
Glycogen synthesis
  • EPM2A
  • EPM2B
  • GBE1
  • GYG
  • GYG1
  • GYG2
  • GYS
  • GYS1
  • GYS2
  • NHLRC1
  • PGM1
  • PPP1R3C
  • PPP1R5
  • RPS27A
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • UGP1
  • UGP2
Homo sapiens (human)
Glycogen breakdown (glycogenolysis)
  • AGL
  • CALM
  • CALM1
  • CAM
  • CAM1
  • GAA
  • GDE
  • GYG
  • GYG1
  • GYG2
  • PGM1
  • PHKA
  • PHKA1
  • PHKA2
  • PHKB
  • PHKG
  • PHKG1
  • PHKG2
  • PHKLA
  • PYGB
  • PYGL
  • PYGM
  • PYK
Homo sapiens (human)
Glycine degradation
  • AMT
  • DLD
  • DLST
  • DLTS
  • GCSH
  • GCSL
  • GCSP
  • GCST
  • GLDC
  • KGD4
  • LAD
  • MRPS36
  • OGDH
  • PHE3
Homo sapiens (human)
Glycerophospholipid catabolism
  • C9orf111
  • ENPP6
  • GDE1
  • GDE2
  • GDE4
  • GDE7
  • GDPD1
  • GDPD3
  • GDPD5
  • MIR16
  • NTE
  • PNPLA6
  • PNPLA7
Homo sapiens (human)
Glycerophospholipid biosynthesis
  • AGK
  • CPN1
  • CPN3
  • CPNE1
  • CPNE3
  • CPNE6
  • CPNE7
  • KIAA0636
  • MULK
Homo sapiens (human)
Glutathione synthesis and recycling
  • BOTCH
  • C7orf24
  • CHAC1
  • CHAC2
  • CN2
  • CNDP2
  • CPGL
  • CRF21
  • GCLC
  • GCLM
  • GGCT
  • GGT
  • GGT1
  • GGT3
  • GGT3P
  • GGT5
  • GGT6
  • GGT7
  • GGTL3
  • GGTL5
  • GGTLA1
  • GLCL
  • GLCLC
  • GLCLR
  • GSS
  • HEL-S-13
  • OPLAH
  • PEPA
Homo sapiens (human)
Glutathione conjugation
  • AKR1A1
  • ALDR1
  • ALR
  • ESD
  • FAEES3
  • GST1
  • GST12
  • GST2
  • GST3
  • GST4
  • GST5
  • GSTA1
  • GSTA2
  • GSTA3
  • GSTA4
  • GSTA5
  • GSTK1
  • GSTM1
  • GSTM2
  • GSTM3
  • GSTM4
  • GSTM5
  • GSTO1
  • GSTO2
  • GSTP1
  • GSTS
  • GSTT1
  • GSTT2
  • GSTT2B
  • GSTTLP28
  • GSTZ1
  • HPGDS
  • MAAI
  • MGST
  • MGST1
  • MGST2
  • MGST3
  • PGDS
  • PTGDS2
Homo sapiens (human)
Glutamate and glutamine metabolism
  • CCBL1
  • FAM80A
  • FAM80B
  • GA
  • GLNS
  • GLS
  • GLS1
  • GLS2
  • GLUD
  • GLUD1
  • GLUD2
  • GLUDP1
  • GLUL
  • GOT2
  • KIAA0838
  • KIAA1238
  • KYAT1
  • KYAT4
  • OAT
  • PYCR1
  • PYCR2
  • PYCR3
  • PYCRL
  • RIMKLA
  • RIMKLB
Homo sapiens (human)
Glutamate Neurotransmitter Release Cycle
  • ARL6IP5
  • ATA2
  • BNPI
  • BZRAP1
  • CPLX1
  • DERP11
  • EAAC1
  • EAAT1
  • EAAT2
  • EAAT3
  • EAAT4
  • EAAT5
  • GA
  • GLAST
  • GLAST1
  • GLS
  • GLS1
  • GLS2
  • GLT1
  • HEAAC1
  • JWA
  • KIAA0340
  • KIAA0612
  • KIAA0654
  • KIAA0838
  • KIAA0897
  • KIAA1382
  • LIP1
  • PPFIA1
  • PPFIA2
  • PPFIA3
  • PPFIA4
  • PRA2
  • PRAF3
  • RAB3A
  • RAB3IP2
  • RBP1
  • RIM1
  • RIMBP1
  • RIMS1
  • SAT2
  • SLC17A7
  • SLC1A1
  • SLC1A2
  • SLC1A3
  • SLC1A6
  • SLC1A7
  • SLC38A2
  • SNAP
  • SNAP25
  • SNAT2
  • STX1
  • STX1A
  • SVP65
  • SYB2
  • SYT
  • SYT1
  • TSPOAP1
  • UNC13
  • UNC13B
  • VAMP2
  • VGLUT1
Homo sapiens (human)
Glucuronidation
  • ABHD10
  • GNT1
  • UGT1
  • UGT1A1
  • UGT1A10
  • UGT1A3
  • UGT1A4
  • UGT1A5
  • UGT1A6
  • UGT1A7
  • UGT1A8
  • UGT1A9
  • UGT2A1
  • UGT2A2
  • UGT2A3
  • UGT2B10
  • UGT2B11
  • UGT2B15
  • UGT2B17
  • UGT2B28
  • UGT2B4
  • UGT2B7
  • UGT2B8
  • UGT3A1
  • UGT3A2
  • UGTB2B9
Homo sapiens (human)
Gluconeogenesis
  • ALDA
  • ALDB
  • ALDC
  • ALDOA
  • ALDOB
  • ALDOC
  • C10orf134
  • ENO1
  • ENO1L1
  • ENO2
  • ENO3
  • ENO4
  • FBP
  • FBP1
  • FBP2
  • G3PP
  • G6PC
  • G6PC1
  • G6PC2
  • G6PC3
  • G6PT
  • G6PT1
  • GAPD
  • GAPD2
  • GAPDH
  • GAPDH2
  • GAPDHS
  • GAPDS
  • GPI
  • IGRP
  • MBPB1
  • MPB1
  • PC
  • PCK1
  • PCK2
  • PEPCK1
  • PEPCK2
  • PGAM1
  • PGAM2
  • PGAMA
  • PGAMM
  • PGK1
  • PGK2
  • PGKA
  • PGKB
  • SLC37A1
  • SLC37A4
  • TPI
  • TPI1
  • UGRP
Homo sapiens (human)
Glucocorticoid biosynthesis
  • 3BH
  • CBG
  • CYP11B1
  • CYP11B2
  • CYP17
  • CYP17A1
  • CYP21
  • CYP21A2
  • CYP21B
  • HSD11
  • HSD11B1
  • HSD11B2
  • HSD11K
  • HSD11L
  • HSD3B1
  • HSD3B2
  • HSDB3A
  • HSDB3B
  • POMC
  • S11BH
  • S17AH
  • SDR26C1
  • SDR9C3
  • SERPINA6
Homo sapiens (human)
Glucagon-type ligand receptors
  • ADCYAP1
  • ADCYAP1R1
  • GCG
  • GCGR
  • GHRF
  • GHRH
  • GHRHR
  • GIP
  • GIPR
  • GLP1R
  • GLP2R
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GSP
  • SCT
  • SCTR
  • VIP
  • VIP2R
  • VIPR1
  • VIPR2
Homo sapiens (human)
Glucagon-like Peptide-1 (GLP1) regulates insulin secretion
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY8
  • AKAP5
  • AKAP79
  • CGEF1
  • CGEF2
  • EPAC
  • EPAC1
  • EPAC2
  • GCG
  • GLP1R
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • GSP
  • INSP3R1
  • IQGAP1
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KCNB1
  • KCNC2
  • KCNF2
  • KCNG2
  • KCNS3
  • KIAA0051
  • KIAA0422
  • KREV1
  • PKACA
  • PKR1
  • PKR2
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • PRKAR1
  • PRKAR1A
  • PRKAR1B
  • PRKAR2
  • PRKAR2A
  • PRKAR2B
  • RAP1A
  • RAPGEF3
  • RAPGEF4
  • TSE1
Homo sapiens (human)
Glucagon signaling in metabolic regulation
  • ADCY1
  • ADCY2
  • ADCY3
  • ADCY4
  • ADCY5
  • ADCY6
  • ADCY7
  • ADCY8
  • ADCY9
  • GCG
  • GCGR
  • GNAS
  • GNAS1
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT9
  • GSP
  • KIAA0037
  • KIAA0422
  • KIAA0511
  • KIAA0520
  • KIAA1060
Homo sapiens (human)
Generic Transcription Pathway
  • ACID1
  • ARC100
  • ARC105
  • ARC130
  • ARC150
  • ARC205
  • ARC240
  • ARC250
  • ARC33
  • ARC34
  • ARC36
  • ARC70
  • ARC77
  • ARC92
  • AREBP
  • BAZ1
  • BAZ2
  • BMZF1
  • BMZF2
  • BMZF3
  • BMZF4
  • BMZF5
  • C14orf131
  • C19orf9
  • C20orf157
  • CAGH45
  • CCNC
  • CDK8
  • CMPX1
  • CRSP1
  • CRSP2
  • CRSP200
  • CRSP3
  • CRSP34
  • CRSP4
  • CRSP6
  • CRSP7
  • CRSP8
  • CRSP9
  • CTG7A
  • CXorf4
  • CZF1
  • D4S90
  • DRIP100
  • DRIP130
  • DRIP150
  • DRIP205
  • DRIP230
  • DRIP36
  • DRIP77
  • DRIP80
  • DRIP92
  • ERP1
  • EXLM1
  • EZFIT
  • EZNF
  • FDZF2
  • FPM315
  • GIOT1
  • GIOT3
  • GIOT4
  • HDSG1
  • HKL1
  • HKR1
  • HOPA
  • HUB1
  • KAP1
  • KIAA0065
  • KIAA0130
  • KIAA0192
  • KIAA0412
  • KIAA0557
  • KIAA0593
  • KIAA0798
  • KIAA0961
  • KIAA0972
  • KIAA1015
  • KIAA1141
  • KIAA1198
  • KIAA1216
  • KIAA1285
  • KIAA1339
  • KIAA1349
  • KIAA1396
  • KIAA1431
  • KIAA1473
  • KIAA1508
  • KIAA1559
  • KIAA1588
  • KIAA1611
  • KIAA1615
  • KIAA1710
  • KIAA1806
  • KIAA1827
  • KIAA1852
  • KIAA1862
  • KIAA1874
  • KIAA1947
  • KIAA1954
  • KIAA1956
  • KIAA1962
  • KIAA1969
  • KIAA1982
  • KIAA2003
  • KIAA2007
  • KIAA2033
  • KID3
  • KOX1
  • KOX10
  • KOX11
  • KOX12
  • KOX13
  • KOX16
  • KOX18
  • KOX19
  • KOX2
  • KOX20
  • KOX21
  • KOX22
  • KOX23
  • KOX24
  • KOX25
  • KOX27
  • KOX28
  • KOX3
  • KOX31
  • KOX32
  • KOX5
  • KOX6
  • KOX8
  • KRBA1
  • KRBO2
  • KRBOX4
  • KRBOX5
  • MED1
  • MED10
  • MED12
  • MED13
  • MED14
  • MED15
  • MED16
  • MED17
  • MED20
  • MED23
  • MED24
  • MED25
  • MED26
  • MED27
  • MED30
  • MED31
  • MED4
  • MED6
  • MED7
  • MED8
  • PARIS
  • PBP
  • PCQAP
  • PFM4
  • PPARBP
  • PPARGBP
  • PRDM7
  • PTOV2
  • RB18A
  • RGR1
  • RHIT
  • RITA
  • RNF96
  • SOH1
  • SUR2
  • SZF1
  • TB7
  • TCF17
  • THRAP1
  • THRAP4
  • THRAP5
  • THRAP6
  • TIF1B
  • TIG1
  • TIZ
  • TNRC11
  • TNRC7
  • TRAP100
  • TRAP170
  • TRAP220
  • TRAP230
  • TRAP240
  • TRAP25
  • TRAP80
  • TRFP
  • TRIM28
  • TRIP2
  • VDRIP
  • VIK
  • ZBRK1
  • ZEPPO1
  • ZER6
  • ZFOC1
  • ZFP1
  • ZFP100
  • ZFP112
  • ZFP14
  • ZFP160L
  • ZFP2
  • ZFP28
  • ZFP30
  • ZFP31
  • ZFP37
  • ZFP445
  • ZFP47
  • ZFP69
  • ZFP692
  • ZFP69B
  • ZFP90
  • ZFP93
  • ZFP95
  • ZIK1
  • ZIM2
  • ZIM3
  • ZKSCAN1
  • ZKSCAN10
  • ZKSCAN11
  • ZKSCAN12
  • ZKSCAN13
  • ZKSCAN14
  • ZKSCAN15
  • ZKSCAN16
  • ZKSCAN17
  • ZKSCAN18
  • ZKSCAN19
  • ZKSCAN20
  • ZKSCAN21
  • ZKSCAN3
  • ZKSCAN4
  • ZKSCAN5
  • ZKSCAN6
  • ZKSCAN7
  • ZKSCAN8
  • ZKSCAN9
  • ZNF10
  • ZNF100
  • ZNF101
  • ZNF102
  • ZNF11
  • ZNF1111
  • ZNF112
  • ZNF114
  • ZNF115
  • ZNF11A
  • ZNF11B
  • ZNF12
  • ZNF124
  • ZNF13
  • ZNF133
  • ZNF135
  • ZNF135L
  • ZNF136
  • ZNF138
  • ZNF139
  • ZNF14
  • ZNF140
  • ZNF140L
  • ZNF141
  • ZNF15
  • ZNF150
  • ZNF154
  • ZNF155
  • ZNF157
  • ZNF15L1
  • ZNF160
  • ZNF166
  • ZNF167
  • ZNF168
  • ZNF169
  • ZNF17
  • ZNF175
  • ZNF176
  • ZNF18
  • ZNF180
  • ZNF184
  • ZNF189
  • ZNF19
  • ZNF192
  • ZNF195
  • ZNF197
  • ZNF2
  • ZNF20
  • ZNF200
  • ZNF202
  • ZNF205
  • ZNF208
  • ZNF210
  • ZNF211
  • ZNF212
  • ZNF213
  • ZNF214
  • ZNF215
  • ZNF221
  • ZNF222
  • ZNF223
  • ZNF224
  • ZNF225
  • ZNF226
  • ZNF227
  • ZNF228
  • ZNF23
  • ZNF230
  • ZNF233
  • ZNF234
  • ZNF235
  • ZNF248
  • ZNF25
  • ZNF250
  • ZNF253
  • ZNF254
  • ZNF255
  • ZNF256
  • ZNF257
  • ZNF26
  • ZNF263
  • ZNF264
  • ZNF266
  • ZNF267
  • ZNF268
  • ZNF269
  • ZNF27
  • ZNF270
  • ZNF272
  • ZNF273
  • ZNF274
  • ZNF28
  • ZNF282
  • ZNF285
  • ZNF285A
  • ZNF286
  • ZNF286A
  • ZNF287
  • ZNF3
  • ZNF30
  • ZNF300
  • ZNF302
  • ZNF304
  • ZNF306
  • ZNF307
  • ZNF309
  • ZNF311
  • ZNF317
  • ZNF320
  • ZNF324
  • ZNF324A
  • ZNF324B
  • ZNF325
  • ZNF327
  • ZNF328
  • ZNF33
  • ZNF331
  • ZNF333
  • ZNF334
  • ZNF337
  • ZNF33A
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Homo sapiens (human)
Generation of second messenger molecules
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  • ZAP70
Homo sapiens (human)
Gene and protein expression by JAK-STAT signaling after Interleukin-12 stimulation
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  • MMIF
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  • RALA
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  • SOD2
  • STAT4
  • TAL
  • TALDO
  • TALDO1
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  • mt-HSP70
Homo sapiens (human)
Gastrin-CREB signalling pathway via PKC and MAPK
  • BMK1
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  • PRKM7
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  • RSK2
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Homo sapiens (human)
Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER
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  • BTF2P44
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  • CSB
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  • CUL4B
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  • UBCEP2
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  • XPB
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  • XPDC
  • XRCC1
  • ZNF830
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024