GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 201 - 225 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Biotin transport and metabolism
  • ACAC
  • ACACA
  • ACACB
  • ACC1
  • ACC2
  • ACCA
  • ACCB
  • AIPP1
  • BTD
  • HLCS
  • MCCA
  • MCCB
  • MCCC1
  • MCCC2
  • PC
  • PCCA
  • PCCB
  • PDZD11
  • PDZK11
  • PISP
  • SLC5A6
  • SMVT
Homo sapiens (human)
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC
  • 8
  • ABCB2
  • ABCB3
  • APPILS
  • ARTS1
  • ATG14
  • ATG14L
  • B2M
  • BECN1
  • CALR
  • CANX
  • CRTC
  • D3S1231E
  • ERAP1
  • ERAP2
  • ERP57
  • ERP60
  • GRP58
  • GRP78
  • GT197
  • HLA-5.4
  • HLA-6.0
  • HLA-6.2
  • HLA-A
  • HLA-B
  • HLA-C
  • HLA-E
  • HLA-F
  • HLA-G
  • HLA-H
  • HLAA
  • HLAB
  • HLAC
  • HLAE
  • HLAF
  • HLAG
  • HLAH
  • HSPA5
  • KIAA0079
  • KIAA0525
  • KIAA0755
  • KIAA0831
  • KIAA0905
  • LRAP
  • NGS17
  • PDIA3
  • PIK3C3
  • PIK3R4
  • PSF1
  • PSF2
  • RING11
  • RING4
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SEC13
  • SEC13A
  • SEC13L1
  • SEC13R
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SEC31A
  • SEC31L1
  • TAP1
  • TAP2
  • TAPA
  • TAPBP
  • VPS15
  • VPS34
  • Y1
  • Y3
Homo sapiens (human)
Transcriptional Regulation by MECP2
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • C22orf12
  • CAGH26
  • DGCR8
  • DGCRK6
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • GAMT
  • IRAK
  • IRAK1
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • MMAC1
  • MOBP
  • MOV10
  • PTEN
  • PVALB
  • SGK
  • SGK1
  • SOX2
  • TEP1
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
Homo sapiens (human)
Drug-mediated inhibition of CDK4/CDK6 activity
  • BCL1
  • CCND1
  • CCND2
  • CCND3
  • CDK4
  • CDK6
  • CDKN6
  • PRAD1
Homo sapiens (human)
NVP-TAE684-resistant ALK mutants
  • ALK
Homo sapiens (human)
NFG and proNGF binds to p75NTR
  • NGF
  • NGFB
  • NGFR
  • SORCS3
  • TNFRSF16
Homo sapiens (human)
Phase 2 - plateau phase
  • AKAP350
  • AKAP450
  • AKAP9
  • AMMECR2
  • CACH2
  • CACN2
  • CACNA1C
  • CACNA2D2
  • CACNB1
  • CACNB2
  • CACNG4
  • CACNG6
  • CACNG7
  • CACNG8
  • CACNL1A1
  • CACNLB1
  • CACNLB2
  • CCHL1A1
  • KCNA8
  • KCNA9
  • KCNE1
  • KCNE1L
  • KCNE2
  • KCNE3
  • KCNE4
  • KCNE5
  • KCNQ1
  • KIAA0558
  • KIAA0803
  • KVLQT1
  • MYSB
Homo sapiens (human)
Interleukin receptor SHC signaling
  • CSF2
  • CSF2R
  • CSF2RA
  • CSF2RB
  • CSF2RY
  • GAB2
  • GMCSF
  • GRB1
  • HCP
  • IL15RB
  • IL2
  • IL2RA
  • IL2RB
  • IL2RG
  • IL3
  • IL3R
  • IL3RA
  • IL3RB
  • IL5
  • IL5R
  • IL5RA
  • IL5RB
  • INPP5D
  • INPPL1
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • JAK3
  • KIAA0571
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PTP1C
  • PTPN6
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SHIP
  • SHIP1
  • SHIP2
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Formation of the Editosome
  • A1CF
  • ACF
  • APOBEC1
  • APOBEC1L
  • APOBEC2
  • APOBEC3A
  • APOBEC3B
  • APOBEC3C
  • APOBEC3H
  • APOBEC4
  • ASP
  • C1orf169
  • PBI
Homo sapiens (human)
Uncoating of the HIV Virion
  • CYPA
  • PPIA
  • gag
  • gag-pol
  • nef
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
TNFR1-mediated ceramide production
  • FAN
  • GNB2L1
  • NSMAF
  • RACK1
  • SMPD2
  • SMPD3
  • TNF
  • TNFA
  • TNFAR
  • TNFR1
  • TNFRSF1A
  • TNFSF2
Homo sapiens (human)
Interleukin-35 Signalling
  • APRF
  • CANX
  • CRL1
  • EBI3
  • IL12A
  • IL12RB2
  • IL27B
  • IL27RA
  • IL6ST
  • JAK1
  • JAK1A
  • JAK1B
  • JAK2
  • NKSF1
  • STAT1
  • STAT3
  • STAT4
  • TCCR
  • TYK2
  • WSX1
Homo sapiens (human)
The retinoid cycle in cones (daylight vision)
  • AWAT2
  • BCP
  • CRALBP
  • DC4
  • DGAT2L4
  • DHRS3
  • GCP
  • MFAT
  • OPN1LW
  • OPN1MW
  • OPN1SW
  • RBP3
  • RCP
  • RDH17
  • RLBP1
  • SDR16C1
  • WS
Homo sapiens (human)
Synthesis of GDP-mannose
  • GMPPA
  • GMPPB
  • MPI
  • PMI1
  • PMM1
  • PMM2
  • PMMH22
Homo sapiens (human)
Constitutive Signaling by NOTCH1 PEST Domain Mutants
  • AD3
  • AD4
  • ADAM10
  • ADAM17
  • APH1A
  • APH1B
  • BHLHB31
  • BHLHB32
  • BHLHB33
  • BHLHB38
  • BHLHB39
  • BHLHE39
  • CBP
  • CCNC
  • CDK8
  • CG1
  • CHF1
  • CHF2
  • CREBBP
  • CSVP
  • CTG26
  • CUL1
  • CXorf6
  • DIP1
  • DLL1
  • DLL4
  • EMC19
  • EP300
  • GCN5
  • GCN5L2
  • GRL
  • HDAC1
  • HDAC10
  • HDAC11
  • HDAC2
  • HDAC3
  • HDAC4
  • HDAC5
  • HDAC6
  • HDAC7
  • HDAC7A
  • HDAC7B
  • HDAC8
  • HDAC9
  • HDACL1
  • HDRP
  • HERP
  • HERP1
  • HERP2
  • HES1
  • HES5
  • HESR1
  • HEY1
  • HEY2
  • HEYL
  • HL
  • HRT1
  • HRT2
  • HRT3
  • HRY
  • IGKJRB
  • IGKJRB1
  • IRA1
  • JAG1
  • JAG2
  • JAGL1
  • KAT2A
  • KAT2B
  • KIAA0200
  • KIAA0253
  • KIAA0288
  • KIAA0600
  • KIAA0744
  • KIAA0901
  • KIAA1047
  • KIAA1323
  • KIAA1816
  • KIAA1819
  • KUZ
  • MADM
  • MAML1
  • MAML2
  • MAML3
  • MAMLD1
  • MIB1
  • MIB2
  • MITR
  • MYC
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NCSTN
  • NEURL
  • NEURL1
  • NEURL1A
  • NEURL1B
  • NEURL3
  • NOTCH1
  • OCP2
  • P300
  • PCAF
  • PEN2
  • PS1
  • PS2
  • PSEN1
  • PSEN2
  • PSENEN
  • PSF
  • PSFL
  • PSNL1
  • PSNL2
  • RBPJ
  • RBPJK
  • RBPSUH
  • RBX1
  • RNF67
  • RNF75
  • ROC1
  • RPD3L1
  • RPS27A
  • SKD
  • SKIIP
  • SKIP
  • SKP1
  • SKP1A
  • SNW1
  • STM2
  • TACE
  • TAN1
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TCEB1L
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • ZZANK1
  • ZZANK2
Homo sapiens (human)
ATF4 activates genes in response to endoplasmic reticulum stress
  • ASNS
  • ATF3
  • ATF4
  • ATF6
  • CCL2
  • CEBPB
  • CEBPG
  • CHOP
  • CHOP10
  • CML28
  • CREB2
  • CSL4
  • CXCL8
  • DAN
  • DCP2
  • DDIT3
  • DIS3
  • EXOSC1
  • EXOSC2
  • EXOSC3
  • EXOSC4
  • EXOSC5
  • EXOSC6
  • EXOSC7
  • EXOSC8
  • EXOSC9
  • FUBP2
  • GADD153
  • HAP3
  • HERP
  • HERPUD1
  • IBP1
  • IGFBP1
  • IL8
  • KHSRP
  • KIAA0025
  • KIAA0116
  • KIAA1008
  • MCP1
  • MIF1
  • MTR3
  • NFYA
  • NFYB
  • NFYC
  • NUDT20
  • OIP2
  • PARN
  • PMSCL1
  • RRP4
  • RRP40
  • RRP41
  • RRP42
  • RRP43
  • RRP44
  • RRP46
  • SCYA2
  • SKI6
  • TCF5
  • TS11
  • TXREB
Homo sapiens (human)
SHC-mediated cascade:FGFR2
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • HRAS
  • HRAS1
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KGF
  • KS3
  • NRAS
  • SOS1
Homo sapiens (human)
Phospholipase C-mediated cascade; FGFR4
  • FGF1
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF23
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • JTK2
  • KLB
  • KS3
  • PLC1
  • PLCG1
  • TKF
Homo sapiens (human)
Interleukin-23 signaling
  • APRF
  • ERBA2L
  • IL12B
  • IL12R
  • IL12RB
  • IL12RB1
  • IL23A
  • IL23R
  • JAK2
  • NKSF2
  • P4HB
  • PDI
  • PDIA1
  • PO4DB
  • SGRF
  • STAT3
  • STAT4
  • TYK2
Homo sapiens (human)
Signaling by PDGFRA extracellular domain mutants
  • APRF
  • GRB1
  • HRAS
  • HRAS1
  • NRAS
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • RHEPDGFRA
  • SOS1
  • STAT1
  • STAT3
Homo sapiens (human)
Signalling to RAS
  • HRAS
  • HRAS1
  • MTC
  • NGF
  • NGFB
  • NRAS
  • NSHC
  • NTRK1
  • SCK
  • SHC
  • SHC1
  • SHC2
  • SHC3
  • SHCA
  • SHCB
  • SHCC
  • SOS1
  • TRK
  • TRKA
Homo sapiens (human)
Activation of BIM and translocation to mitochondria
  • BCL2L11
  • BIM
  • DLC1
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DYNLL1
  • HDLC1
  • JNK1
  • MAPK8
  • PRKM8
  • SAPK1
  • SAPK1C
Homo sapiens (human)
Defective CHSY1 causes TPBS
  • BCAN
  • BEHAB
  • BGN
  • CALEB
  • CHSY
  • CHSY1
  • CSPG2
  • CSPG3
  • CSPG4
  • CSPG5
  • CSPG7
  • CSS1
  • DCN
  • KIAA0990
  • MCSP
  • NCAN
  • NEUR
  • NGC
  • SLRR1A
  • SLRR1B
  • VCAN
Homo sapiens (human)
Defective MTR causes HMAG
  • MTR
  • MTRR
Homo sapiens (human)
Formation of editosomes by ADAR proteins
  • ADAR
  • ADAR1
  • ADAR2
  • ADARB1
  • DRADA2
  • DSRAD
  • G1P1
  • IFI4
  • RED1
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024