GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 1751 - 1775 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism ▲ GlyTouCan ID
Regulation of RUNX2 expression and activity
  • BAPX1
  • BHLHA38
  • BMP2
  • BMP2A
  • C7orf76
  • CBFB
  • CHIP
  • CUL1
  • DLX5
  • DLX6
  • DSS1
  • EMC19
  • ERR1
  • ESR
  • ESR1
  • ESRL1
  • ESRRA
  • FBXL1
  • GRL
  • GSK3B
  • HC2
  • HC3
  • HC8
  • HC9
  • HIVEP3
  • HOX8
  • HSPC
  • IFI5111
  • KBP1
  • KIAA0072
  • KIAA0077
  • KIAA0107
  • KIAA1555
  • KIAA1625
  • KRC
  • LEM6
  • LMP10
  • LMP2
  • LMP7
  • LMPX
  • LMPY
  • MB1
  • MCB1
  • MECL1
  • MIP224
  • MOV34L
  • MSS1
  • MSX2
  • NKX3-2
  • NKX3B
  • NR3A1
  • NR3B1
  • NR3C1
  • NU
  • OCP2
  • PERC
  • PFAAP4
  • PGC1
  • PGC1A
  • PGC1B
  • POH1
  • PPARGC1
  • PPARGC1A
  • PPARGC1B
  • PROS26
  • PROS27
  • PROS30
  • PSC2
  • PSC3
  • PSC5
  • PSC8
  • PSC9
  • PSMA1
  • PSMA2
  • PSMA3
  • PSMA4
  • PSMA5
  • PSMA6
  • PSMA7
  • PSMA7L
  • PSMA8
  • PSMB1
  • PSMB10
  • PSMB11
  • PSMB2
  • PSMB3
  • PSMB4
  • PSMB5
  • PSMB5i
  • PSMB6
  • PSMB6i
  • PSMB7
  • PSMB8
  • PSMB9
  • PSMC1
  • PSMC2
  • PSMC3
  • PSMC4
  • PSMC5
  • PSMC6
  • PSMD1
  • PSMD10
  • PSMD11
  • PSMD12
  • PSMD13
  • PSMD14
  • PSMD2
  • PSMD3
  • PSMD4
  • PSMD5
  • PSMD6
  • PSMD7
  • PSMD8
  • PSMD9
  • PSME1
  • PSME2
  • PSME3
  • PSME4
  • PSMF1
  • RBX1
  • RING10
  • RING12
  • RNF75
  • ROC1
  • RPS27A
  • SEM1
  • SHFDG1
  • SHFM1
  • SKP1
  • SKP1A
  • SKP2
  • SMURF1
  • STAT1
  • STUB1
  • SUG1
  • SUG2
  • TBP1
  • TBP7
  • TCEB1L
  • TRAP2
  • TWIST
  • TWIST1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WWP1
  • X
  • Y
  • Y2
  • Z
  • ZAS3
Homo sapiens (human)
HS-GAG biosynthesis
  • 3OST
  • 3OST1
  • 3OST2
  • 3OST3A1
  • 3OST3B1
  • 3OST4
  • 3OST5
  • AGRIN
  • AGRN
  • EXT1
  • EXT2
  • GLCE
  • GPC1
  • GPC2
  • GPC3
  • GPC4
  • GPC5
  • GPC6
  • HFRC
  • HS2ST
  • HS2ST1
  • HS3OST5
  • HS3ST1
  • HS3ST2
  • HS3ST3A
  • HS3ST3A1
  • HS3ST3B
  • HS3ST3B1
  • HS3ST4
  • HS3ST5
  • HS3ST6
  • HS6ST
  • HS6ST1
  • HS6ST2
  • HS6ST3
  • HSPG1
  • HSPG2
  • HSST
  • HSST1
  • HSST2
  • HSST3
  • HSST4
  • KIAA0448
  • KIAA0468
  • KIAA0836
  • NDST1
  • NDST2
  • NDST3
  • NDST4
  • OCI5
  • SDC
  • SDC1
  • SDC2
  • SDC3
  • SDC4
  • SLC35D2
  • UGTREL8
Homo sapiens (human)
Hydroxycarboxylic acid-binding receptors
  • GPR104
  • GPR109A
  • GPR109B
  • GPR81
  • HCA1
  • HCA2
  • HCA3
  • HCAR1
  • HCAR2
  • HCAR3
  • HM74A
  • HM74B
  • NIACR1
  • NIACR2
Homo sapiens (human)
Beta oxidation of hexanoyl-CoA to butanoyl-CoA
  • ACADS
  • ECHS1
  • HAD
  • HAD1
  • HADH
  • HADHA
  • HADHB
  • HADHSC
  • SCHAD
Homo sapiens (human)
Suppression of apoptosis
  • ALO17
  • C17orf27
  • CTSG
  • ERK1
  • ERK2
  • GSK3A
  • KIAA1554
  • KIAA1618
  • MAPK1
  • MAPK3
  • MYSTR
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • PSF
  • RFP
  • RNF213
  • RNF76
  • Rv3364c
  • Rv3654c
  • Rv3655c
  • SFPQ
  • TRIM27
  • lprM
  • mce3E
  • mptpA
  • ptpA
Homo sapiens (human)
MTF1 activates gene expression
  • CSRP
  • CSRP1
  • CYRP
  • MTF1
  • SNCB
Homo sapiens (human)
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG repress genes related to differentiation
  • NANOG
  • OCT3
  • OCT4
  • OTF3
  • POU5F1
  • SOX2
Homo sapiens (human)
RMTs methylate histone arginines
  • ACTL6
  • ACTL6A
  • ACTL6B
  • ARID1A
  • ARID1B
  • ARID2
  • BAF155
  • BAF170
  • BAF180
  • BAF190A
  • BAF190B
  • BAF200
  • BAF250
  • BAF250A
  • BAF250B
  • BAF47
  • BAF53
  • BAF53A
  • BAF53B
  • BAF57
  • BAF60A
  • BAF60B
  • BAF60C
  • BCL1
  • BIG3
  • BRG1
  • BRM
  • C17orf79
  • C1orf4
  • CARM1
  • CCND1
  • CDK4
  • COPR5
  • COPRS
  • DAN15
  • DNMT3A
  • H2AB1
  • H2AC1
  • H2AC11
  • H2AC12
  • H2AC13
  • H2AC14
  • H2AC15
  • H2AC16
  • H2AC17
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC21
  • H2AC25
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFC
  • H2AFD
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFI
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFN
  • H2AFO
  • H2AFP
  • H2AFQ
  • H2AFR
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AW
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H3C1
  • H3C10
  • H3C11
  • H3C12
  • H3C13
  • H3C14
  • H3C15
  • H3C2
  • H3C3
  • H3C4
  • H3C6
  • H3C7
  • H3C8
  • H3F2
  • H3FA
  • H3FB
  • H3FC HIST1H3C
  • H3FD
  • H3FF
  • H3FH
  • H3FI
  • H3FJ
  • H3FK
  • H3FL
  • H3FM
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIST1H2AA
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AG
  • HIST1H2AH
  • HIST1H2AI
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2AK
  • HIST1H2AL
  • HIST1H2AM
  • HIST1H3A
  • HIST1H3B
  • HIST1H3D
  • HIST1H3E
  • HIST1H3F
  • HIST1H3G
  • HIST1H3H
  • HIST1H3I
  • HIST1H3J
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AB
  • HIST2H2AC
  • HIST2H3A
  • HIST2H3C
  • HIST2H3D
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2A
  • HIST4H4
  • HMT2
  • HRMT1L2
  • HRMT1L3
  • HRMT1L5
  • HRMT1L6
  • IBP72
  • INI1
  • INO80K
  • IR1B4
  • JAK2
  • JBP1
  • KIAA1235
  • KIAA1557
  • KIAA1933
  • MEP50
  • OSA1
  • OSA2
  • PB1
  • PBRM1
  • PRAD1
  • PRMT1
  • PRMT3
  • PRMT4
  • PRMT5
  • PRMT6
  • PRMT7
  • RBAP46
  • RBBP7
  • RPS2
  • RPS4
  • SKB1
  • SMARCA2
  • SMARCA4
  • SMARCB1
  • SMARCC1
  • SMARCC2
  • SMARCD1
  • SMARCD2
  • SMARCD3
  • SMARCE1
  • SMARCF1
  • SNF2A
  • SNF2B
  • SNF2L2
  • SNF2L4
  • SNF5L1
  • WD45
  • WDR5
  • WDR77
Homo sapiens (human)
Minus-strand DNA synthesis
  • CYPA
  • PPIA
  • gag
  • gag-pol
  • rev
  • vif
  • vpr
  • vpu
Homo sapiens (human)
Regulation of Complement cascade
  • ACBP
  • APOJ
  • AZ3B
  • BF
  • BFD
  • C1IN
  • C1NH
  • C1QA
  • C1QB
  • C1QC
  • C1QG
  • C1R
  • C1S
  • C2
  • C3
  • C3AR1
  • C3BR
  • C3DR
  • C3R1
  • C4A
  • C4B
  • C4BP
  • C4BPA
  • C4BPB
  • C4B_2
  • C5
  • C5AR
  • C5AR1
  • C5AR2
  • C5L2
  • C5R1
  • C6
  • C7
  • C8A
  • C8B
  • C8G
  • C9
  • CD19
  • CD46
  • CD55
  • CD59
  • CD81
  • CFB
  • CFH
  • CFHL
  • CFHL1
  • CFHL1P
  • CFHL2
  • CFHL3
  • CFHL4
  • CFHL5
  • CFHR1
  • CFHR1P
  • CFHR2
  • CFHR3
  • CFHR4
  • CFHR5
  • CFI
  • CLI
  • CLU
  • CO4
  • CPAMD1
  • CPAMD2
  • CPAMD3
  • CPAMD4
  • CPB2
  • CPN1
  • CPN2
  • CR
  • CR1
  • CR2
  • DAF
  • ELA2
  • ELANE
  • F2
  • FHR1
  • FHR2
  • FHR3
  • FHR4
  • FHR5
  • GPR77
  • HF
  • HF1
  • HF2
  • HFL1
  • HFL2
  • HFL3
  • HNFAG09
  • IF
  • IGHG1
  • IGHG2
  • IGHG3
  • IGHG4
  • IGHV
  • IGHV1-2
  • IGHV1-46
  • IGHV1-69
  • IGHV2-5
  • IGHV2-70
  • IGHV3-11
  • IGHV3-13
  • IGHV3-23
  • IGHV3-30
  • IGHV3-33
  • IGHV3-48
  • IGHV3-53
  • IGHV3-7
  • IGHV3-9
  • IGHV4-34
  • IGHV4-39
  • IGHV4-59
  • IGHV7-81
  • IGKC
  • IGKV1-12
  • IGKV1-16
  • IGKV1-17
  • IGKV1-33
  • IGKV1-39
  • IGKV1-5
  • IGKV1D-12
  • IGKV1D-16
  • IGKV1D-33
  • IGKV1D-39
  • IGKV2-28
  • IGKV2-29
  • IGKV2-30
  • IGKV2D-28
  • IGKV2D-30
  • IGKV2D-40
  • IGKV3-11
  • IGKV3-15
  • IGKV3-20
  • IGKV3D-20
  • IGKV4-1
  • IGKV5-2
  • IGLC1
  • IGLC2
  • IGLC3
  • IGLC6
  • IGLC7
  • IGLV
  • IGLV1-40
  • IGLV1-44
  • IGLV1-47
  • IGLV1-51
  • IGLV2-11
  • IGLV2-14
  • IGLV2-23
  • IGLV2-8
  • IGLV3-1
  • IGLV3-19
  • IGLV3-21
  • IGLV3-25
  • IGLV3-27
  • IGLV6-57
  • IGLV7-43
  • KUB1
  • MCP
  • MIC10
  • MIC11
  • MIN1
  • MIN2
  • MIN3
  • MSK21
  • PROS
  • PROS1
  • SERPING1
  • TAPA1
  • TSPAN28
  • V1-11
  • V1-13
  • V1-16
  • V1-20
  • V1-3
  • V1-5
  • V1-7
  • V1-9
  • V2-11
  • V2-15
  • V2-17
  • V2-19
  • V2-8
  • V3-2
  • V3-3
  • V3-4
  • V4-1
  • V4-2
  • V4-6
  • V5-1
  • V5-4
  • V5-6
  • VTN
Homo sapiens (human)
Defective POMT2 causes MDDGA2, MDDGB2 and MDDGC2
  • DAG1
  • POMT1
  • POMT2
Homo sapiens (human)
Meiotic synapsis
  • ACD
  • ATR
  • BAM
  • BMH
  • BRCA1
  • C10orf94
  • C22orf41
  • C6orf98
  • CESC1
  • CSPG6
  • DRIP5
  • DXS423E
  • FKBP36
  • FKBP6
  • FRIGG
  • FRP1
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-4
  • H3FT
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST3H3
  • HIST4H4
  • HR21
  • HSPA2
  • KIAA0078
  • KIAA0178
  • KIAA0668
  • KIAA0796
  • KIAA0810
  • KIAA1011
  • KIAA1262
  • KIAA1756
  • LMN2
  • LMNB
  • LMNB1
  • MYNE1
  • NUA
  • NXP1
  • PIN2
  • PIP1
  • POT1
  • PTOP
  • RAB5IP
  • RAD21
  • RAP1
  • REC8
  • REC8L1
  • RNF53
  • SA1
  • SA2
  • SB1.8
  • SCC1
  • SCC3
  • SCP1
  • SCP2
  • SCP3
  • SMC1
  • SMC1A
  • SMC1B
  • SMC1L1
  • SMC1L2
  • SMC3
  • SMC3L1
  • STAG1
  • STAG2
  • STAG3
  • SUN1
  • SUN2
  • SYCE1
  • SYCE2
  • SYCE3
  • SYCP1
  • SYCP2
  • SYCP3
  • SYNE1
  • SYNE2
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TEX12
  • THEG2
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
  • TSH2B
  • UBC9
  • UBCE9
  • UBE2I
  • UNC84A
  • UNC84B
Homo sapiens (human)
Alkylating DNA damage induced by chemotherapeutic drugs
Homo sapiens (human)
Regulation of TP53 Activity through Acetylation
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • BP75
  • BR140
  • BRD1
  • BRD7
  • BRL
  • BRPF1
  • BRPF2
  • BRPF3
  • C1orf149
  • CELTIX1
  • CENP-28
  • CHD3
  • CHD4
  • EAF6
  • EP300
  • GATAD2A
  • GATAD2B
  • HDAC1
  • HDAC2
  • ING5
  • KAT6A
  • KIAA1150
  • KIAA1286
  • MBD3
  • MEAF6
  • MOZ
  • MTA1L1
  • MTA2
  • MYL
  • MYST3
  • P300
  • P53
  • PID
  • PKB
  • PKBG
  • PML
  • PP8675
  • RAC
  • RBAP46
  • RBAP48
  • RBBP4
  • RBBP7
  • RNF71
  • RPD3L1
  • RUNXBP2
  • TP53
  • TRIM19
  • ZNF220
Homo sapiens (human)
AUF1 (hnRNP D0) binds and destabilizes mRNA
  • C7orf76
  • DSS1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • HC2
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Homo sapiens (human)
Mitotic Prometaphase
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Homo sapiens (human)
Defective ABCD1 causes ALD
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Homo sapiens (human)
Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity
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Homo sapiens (human)
Triglyceride biosynthesis
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Homo sapiens (human)
RNA Polymerase II HIV Promoter Escape
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  • XPDC
Homo sapiens (human)
GLI3 is processed to GLI3R by the proteasome
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Homo sapiens (human)
Late Phase of HIV Life Cycle
  • NMT
  • NMT1
  • nef
Homo sapiens (human)
Cargo concentration in the ER
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Homo sapiens (human)
Relaxin receptors
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Homo sapiens (human)
Cardiogenesis
  • AFX
  • AFX1
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  • BHLHA27
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  • NKX2.5
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  • SMYD1
  • SRF
  • T
  • TBR2
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  • TBXT
  • TIP60
  • WDR5
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Last updated: August 19, 2024