GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 326 - 350 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID
Cytosolic tRNA aminoacylation
  • AARS
  • AARS1
  • AIMP1
  • AIMP2
  • AIMP3
  • CARS
  • CARS1
  • DARS
  • DARS1
  • EEF1E1
  • EMAP2
  • EPRS
  • EPRS1
  • FARS
  • FARSA
  • FARSB
  • FARSL
  • FARSLA
  • FARSLB
  • FRSB
  • G7A
  • GARS
  • GARS1
  • GLNS
  • HARS
  • HARS1
  • HRS
  • IARS
  • IARS1
  • IFI53
  • IOPPP
  • JTV1
  • KARS
  • KARS1
  • KIAA0070
  • KIAA1352
  • LARS
  • LARS1
  • MARS
  • MARS1
  • NARS
  • NARS1
  • NRS
  • P18
  • PARS
  • PP
  • PPA1
  • QARS
  • QARS1
  • QPRS
  • RARS
  • RARS1
  • SARS
  • SARS1
  • SCYE1
  • SERS
  • TARS
  • TARS1
  • VARS
  • VARS1
  • VARS2
  • WARS
  • WARS1
  • WRS
  • YARS
  • YARS1
Homo sapiens (human)
Signaling by cytosolic PDGFRA and PDGFRB fusion proteins
  • FIP1
  • FIP1L1
  • KIAA1449
  • RHE
  • STRN
  • UAF1
  • WDR48
Homo sapiens (human)
Digestion
  • ALPI
  • GUC2C
  • GUCA2
  • GUCA2A
  • GUCA2B
  • GUCY2C
  • PIR
  • STAR
Homo sapiens (human)
Signaling by RNF43 mutants
  • C2orf31
  • FZD4
  • FZD5
  • FZD6
  • FZD8
  • LR3
  • LRP5
  • LRP6
  • LRP7
  • RNF43
  • WNT3A
Homo sapiens (human)
MET activates PI3K/AKT signaling
  • GAB1
  • GRB1
  • HGF
  • HPTA
  • MET
  • PIK3CA
  • PIK3R1
Homo sapiens (human)
COPI-mediated anterograde transport
  • ACTR10
  • ACTR11
  • ACTR1A
  • ANK
  • ANK1
  • ANK2
  • ANK3
  • ANKB
  • ARCN1
  • ARF1
  • ARF1GAP
  • ARF2
  • ARF3
  • ARF4
  • ARF5
  • ARFGAP1
  • ARFGAP2
  • ARFGAP3
  • ARP10
  • ARP11
  • BET1
  • BET1L
  • BSPECV
  • C15orf22
  • CAPAA3
  • CAPZA1
  • CAPZA2
  • CAPZA3
  • CAPZB
  • CD55
  • CD59
  • COG1
  • COG2
  • COG3
  • COG4
  • COG5
  • COG6
  • COG7
  • COG8
  • COPA
  • COPB
  • COPB1
  • COPB2
  • COPD
  • COPE
  • COPG
  • COPG1
  • COPG2
  • COPZ
  • COPZ1
  • COPZ2
  • CR
  • CTRN1
  • DAF
  • DCTN1
  • DCTN2
  • DCTN22
  • DCTN3
  • DCTN4
  • DCTN5
  • DCTN50
  • DCTN6
  • DHC1
  • DLC1
  • DLC2
  • DNCH1
  • DNCI1
  • DNCI2
  • DNCIC1
  • DNCIC2
  • DNCL
  • DNCL1
  • DNCLC1
  • DNCLI1
  • DNCLI2
  • DNECL
  • DYHC
  • DYNC1H1
  • DYNC1I1
  • DYNC1I2
  • DYNC1LI1
  • DYNC1LI2
  • DYNLL1
  • DYNLL2
  • ERD2.1
  • ERD2.2
  • ERD23
  • FOLR
  • FOLR1
  • GBF1
  • GOLGA2
  • GOLGB1
  • GOLPH5
  • GOLTC1
  • GORASP1
  • GOSR1
  • GOSR2
  • GP25L2
  • GRASP65
  • GS15
  • GS27
  • GS28
  • GSG3
  • GTC90
  • HDLC1
  • HUBSPECV
  • HUSPECV
  • INS
  • KDELR1
  • KDELR2
  • KDELR3
  • KIAA0248
  • KIAA0302
  • KIAA0325
  • KIAA1134
  • KIAA1381
  • KIAA1642
  • LDLB
  • LDLC
  • LIC2
  • MIC11
  • MIN1
  • MIN2
  • MIN3
  • MSK21
  • NAPA
  • NAPB
  • NAPG
  • NEAS
  • NSF
  • PL6
  • RAB1
  • RAB1A
  • RAB1B
  • RNP24
  • SCA5
  • SEC34
  • SNAPA
  • SNAPB
  • SNAPG
  • SPTA
  • SPTA1
  • SPTA2
  • SPTAN1
  • SPTB
  • SPTB1
  • SPTB2
  • SPTBN1
  • SPTBN2
  • SPTBN3
  • SPTBN4
  • SPTBN5
  • STX5
  • STX5A
  • TMED10
  • TMED2
  • TMED3
  • TMED7
  • TMED9
  • TMEM115
  • TMP21
  • USO1
  • VDP
  • WS3
  • YKT6
  • ZNF289
Homo sapiens (human)
Defective SLC2A10 causes arterial tortuosity syndrome (ATS)
  • GLUT10
  • SLC2A10
Homo sapiens (human)
IRF3-mediated induction of type I IFN
  • ABS
  • DDX41
  • DTX4
  • ERIS
  • G22P1
  • G22P2
  • HNGS1
  • HYRC
  • HYRC1
  • IFI16
  • IFNGIP1
  • IRF3
  • KIAA0937
  • MITA
  • MRE11
  • MRE11A
  • NAK
  • NALP4
  • NLRC3
  • NLRP4
  • NOD3
  • PAN2
  • PRKDC
  • PYPAF4
  • RNF155
  • RNH2
  • STING
  • STING1
  • TBK1
  • TMEM173
  • TREX1
  • XRCC5
  • XRCC6
Homo sapiens (human)
Signaling by Activin
  • ACVR1B
  • ACVR1C
  • ACVR2
  • ACVR2A
  • ACVR2B
  • ACVRLK4
  • ALK4
  • ALK7
  • DPC4
  • DRAP1
  • ERK1
  • ERK2
  • FAST1
  • FAST2
  • FOXH1
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • MADH2
  • MADH3
  • MADH4
  • MADR2
  • MAPK1
  • MAPK3
  • PRKM1
  • PRKM2
  • PRKM3
  • SMAD2
  • SMAD3
  • SMAD4
  • TGFBR3
Homo sapiens (human)
Uptake and function of diphtheria toxin
  • CD9
  • DTR
  • DTS
  • EEF2
  • EF2
  • GRIM12
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HSP90A
  • HSP90AA1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC1
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCA
  • HSPCB
  • KDRF
  • MIC3
  • TSPAN29
  • TXNRD1
Homo sapiens (human)
L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression
  • BBC1
  • CCG2
  • D11S2243E
  • D6S218E
  • DDX2A
  • DDX2B
  • DXS648E
  • EC45
  • EIF1A
  • EIF1AX
  • EIF2A
  • EIF2B
  • EIF2G
  • EIF2S1
  • EIF2S2
  • EIF2S3
  • EIF3A
  • EIF3B
  • EIF3C
  • EIF3D
  • EIF3E
  • EIF3EIP
  • EIF3F
  • EIF3G
  • EIF3H
  • EIF3I
  • EIF3J
  • EIF3K
  • EIF3L
  • EIF3M
  • EIF3S1
  • EIF3S10
  • EIF3S12
  • EIF3S2
  • EIF3S3
  • EIF3S4
  • EIF3S5
  • EIF3S6
  • EIF3S6IP
  • EIF3S7
  • EIF3S8
  • EIF3S9
  • EIF4A
  • EIF4A1
  • EIF4A2
  • EIF4B
  • EIF4C
  • EIF4E
  • EIF4EL1
  • EIF4F
  • EIF4G
  • EIF4G1
  • EIF4GI
  • EIF4H
  • FAU
  • FTE1
  • HFLB5
  • INT6
  • KIAA0038
  • KIAA0139
  • LAMBR
  • LAMR1
  • MFTL
  • MPS1
  • NEDD6
  • PAB1
  • PABP
  • PABP1
  • PABPC1
  • PABPC2
  • PCID1
  • QM
  • RIG
  • RPL1
  • RPL10
  • RPL10A
  • RPL10L
  • RPL11
  • RPL12
  • RPL13
  • RPL13A
  • RPL14
  • RPL15
  • RPL17
  • RPL18
  • RPL18A
  • RPL19
  • RPL21
  • RPL22
  • RPL22L1
  • RPL23
  • RPL23A
  • RPL24
  • RPL26
  • RPL26L1
  • RPL26P1
  • RPL27
  • RPL27A
  • RPL28
  • RPL29
  • RPL3
  • RPL30
  • RPL31
  • RPL32
  • RPL34
  • RPL35
  • RPL35A
  • RPL36
  • RPL36A
  • RPL36AL
  • RPL37
  • RPL37A
  • RPL38
  • RPL39
  • RPL39L
  • RPL39L1
  • RPL3L
  • RPL4
  • RPL41
  • RPL44
  • RPL5
  • RPL6
  • RPL7
  • RPL7A
  • RPL8
  • RPL9
  • RPL9P7
  • RPL9P8
  • RPL9P9
  • RPLP0
  • RPLP1
  • RPLP2
  • RPP2
  • RPS10
  • RPS11
  • RPS12
  • RPS13
  • RPS14
  • RPS15
  • RPS15A
  • RPS16
  • RPS17
  • RPS17L
  • RPS18
  • RPS19
  • RPS2
  • RPS20
  • RPS21
  • RPS23
  • RPS24
  • RPS25
  • RPS26
  • RPS27
  • RPS27A
  • RPS27L
  • RPS28
  • RPS29
  • RPS3
  • RPS3A
  • RPS4
  • RPS4X
  • RPS4Y
  • RPS4Y1
  • RPS4Y2
  • RPS4Y2P
  • RPS5
  • RPS6
  • RPS7
  • RPS8
  • RPS9
  • RPSA
  • RRP1
  • SCAR
  • SURF-3
  • SURF3
  • TRIP1
  • TXREB1
  • UBA52
  • UBA80
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • WBSCR1
  • WSCR1
Homo sapiens (human)
Packaging of Eight RNA Segments
  • HA
  • M
  • NA
  • NP
  • NS
  • PA
  • PB1
  • PB2
Homo sapiens (human)
TP53 Regulates Transcription of Death Receptors and Ligands
  • APO2
  • APT1
  • ASPP1
  • ASPP2
  • BBP
  • DCR1
  • DCR2
  • DR4
  • DR5
  • FAS
  • FAS1
  • IBP3
  • IGFBP3
  • KET
  • KIAA0771
  • KILLER
  • LIT
  • P53
  • P63
  • P73
  • P73H
  • P73L
  • PPP1R13B
  • TMEM219
  • TNFRSF10A
  • TNFRSF10B
  • TNFRSF10C
  • TNFRSF10D
  • TNFRSF6
  • TP53
  • TP53BP2
  • TP63
  • TP73
  • TP73L
  • TRAILR1
  • TRAILR2
  • TRAILR3
  • TRAILR4
  • TRICK2
  • TRID
  • TRUNDD
  • ZTNFR9
Homo sapiens (human)
PKA-mediated phosphorylation of key metabolic factors
  • BHLHD14
  • F6PK
  • MIO
  • MLXIPL
  • PFKFB1
  • PFRX
  • PKACA
  • PRKACA
  • PRKACB
  • PRKACG
  • WBSCR14
Homo sapiens (human)
Rhesus glycoproteins mediate ammonium transport.
  • C15orf6
  • CDRC2
  • PDRC2
  • RH50
  • RHAG
  • RHBG
  • RHCG
  • RHGK
Homo sapiens (human)
Regulation of MITF-M-dependent genes involved in apoptosis
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • BCL2
  • BCL2A1
  • BCL2L5
  • BFL1
  • BIRC7
  • BRN2
  • CAGH26
  • DICER
  • DICER1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • GRS
  • HBPA1
  • HDAC1
  • HERNA
  • HINT
  • HINT1
  • KIAA0928
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • KIAP
  • LIVIN
  • LTRPC1
  • MLIAP
  • MLSN
  • MLSN1
  • MOV10
  • OCT7
  • OTF7
  • PKCI1
  • POU3F2
  • PRKCNH1
  • RNF50
  • RPD3L1
  • SIN3A
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • TRPM1
Homo sapiens (human)
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF)
  • ARA24
  • BHLHD2
  • INSIG1
  • INSIG2
  • KIAA0079
  • KIAA0091
  • KIAA0199
  • KIAA0755
  • KPNB1
  • MBTPS1
  • MBTPS2
  • NTF97
  • RAN
  • S1P
  • S2P
  • SAR1B
  • SARA2
  • SARB
  • SCAP
  • SEC23A
  • SEC24A
  • SEC24B
  • SEC24C
  • SEC24D
  • SKI1
  • SREBF2
  • SREBP2
Homo sapiens (human)
RHO GTPases activate CIT
  • ARH12
  • ARH6
  • ARH9
  • ARHA
  • ARHB
  • ARHC
  • CDKN1B
  • CIT
  • CRIK
  • DLG4
  • KIAA0042
  • KIAA0866
  • KIAA0949
  • KIAA2034
  • KIF14
  • KIP1
  • MBS
  • MLC2
  • MRLC1
  • MRLC2
  • MYH10
  • MYH11
  • MYH14
  • MYH9
  • MYL12B
  • MYL6
  • MYL9
  • MYLC2B
  • MYPT1
  • MYPT2
  • MYRL2
  • PPP1CB
  • PPP1R12A
  • PPP1R12B
  • PRC1
  • PSD95
  • RAC1
  • RHO12
  • RHOA
  • RHOB
  • RHOC
  • STK21
  • TC25
  • p27
Homo sapiens (human)
RAC3 GTPase cycle
  • ABI1
  • ABI2
  • ABL2
  • ABLL
  • ABR
  • ALI1
  • AMIGO2
  • ARAP2
  • ARAP3
  • ARG
  • ARGBPIA
  • ARHGAP1
  • ARHGAP10
  • ARHGAP15
  • ARHGAP17
  • ARHGAP21
  • ARHGAP26
  • ARHGAP32
  • ARHGAP34
  • ARHGAP35
  • ARHGAP39
  • ARHGAP42
  • ARHGAP5
  • ARHGAP6
  • ARHGDIB
  • ASCT2
  • BAIAP2
  • BAIAP2L1
  • BCR
  • BCR1
  • BORG5
  • BRK1
  • C11orf59
  • C3orf10
  • CAV
  • CAV1
  • CDC42
  • CDC42EP1
  • CDC42GAP
  • CDHF5
  • CENTD1
  • CENTD3
  • CEP1
  • CYBA
  • CYBB
  • CYFIP1
  • D22S11
  • DBL
  • DEPDC1B
  • DG6
  • DIAP3
  • DIAPH3
  • DOCK10
  • DPK
  • DSG2
  • ECK
  • EDMD
  • EMD
  • EPHA2
  • ERBB2IP
  • ERBIN
  • ERGIC53
  • ESYT1
  • F5F8D
  • FAM62A
  • FERMT2
  • FNBP2
  • FNRB
  • GARRE1
  • GDIA2
  • GDID4
  • GIT1
  • GIT2
  • GRAF
  • GRAF3
  • GRB1
  • GRF1
  • GRF2
  • GRIT
  • GRLF1
  • HEM1
  • HEM2
  • IL32
  • IRTKS
  • ITGB1
  • JAG1
  • JAGL1
  • JIK
  • KDS
  • KIAA0068
  • KIAA0148
  • KIAA0269
  • KIAA0355
  • KIAA0456
  • KIAA0580
  • KIAA0587
  • KIAA0621
  • KIAA0640
  • KIAA0694
  • KIAA0712
  • KIAA0747
  • KIAA0848
  • KIAA0918
  • KIAA1142
  • KIAA1225
  • KIAA1415
  • KIAA1424
  • KIAA1478
  • KIAA1688
  • KIAA1722
  • KIND2
  • LAMTOR1
  • LAP2
  • LBR
  • LEMD3
  • LMAN1
  • LRRC11
  • M7V1
  • MAN1
  • MAP3K18
  • MBC2
  • MCAM
  • MCF2
  • MDF2
  • MGCRACGAP
  • MIG2
  • MOX1
  • MOX2
  • MPP7
  • MSE55
  • MSK12
  • MUC18
  • NAP1
  • NCF1
  • NCF2
  • NCF4
  • NCKAP1
  • NCKAP1L
  • NHS
  • NK4
  • NOH1
  • NOX1
  • NOX2
  • NOX3
  • NOXA1
  • NOXA2
  • NOXO1
  • NOXO2
  • OCRL
  • OCRL1
  • OPHN1
  • OPHN1L
  • P190A
  • P41NOX
  • P51NOX
  • P67PHOX
  • PAK1
  • PAK2
  • PAK4
  • PDRO
  • PGRMC2
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PLEKHC1
  • PMBP
  • PREX1
  • RAB7
  • RAB7A
  • RAC3
  • RACGAP1
  • RAP1GN1
  • RAPGEF1
  • RDR
  • RDRC
  • RHOGAP1
  • RHOGAP5
  • RHOGAP6
  • RICH1
  • RICS
  • SCAR1
  • SH3PXD1A
  • SH3PXD4
  • SH3PXD5
  • SLC1A5
  • SLITRK3
  • SLITRK5
  • SNAP23
  • SRGAP2
  • SRGAP2A
  • SSH3BP1
  • STA
  • STB2
  • STBD1
  • SWAP70
  • SYB3
  • SYDE1
  • TAIF
  • TAOK3
  • TFRC
  • TIAM1
  • TMEM133
  • TMPO
  • TRIO
  • VAMP3
  • VANGL1
  • VAV2
  • VRK2
  • WASF1
  • WASF2
  • WAVE1
  • WAVE2
  • XTP8
  • YKT6
  • ZIZ3
  • p190ARHOGAP
Homo sapiens (human)
The NLRP3 inflammasome
  • A4
  • AD1
  • APP
  • ASC
  • C1orf7
  • CARD5
  • CASP1
  • CD2BP1
  • CIAS1
  • HMOX1
  • HO
  • HO1
  • HSP90AB1
  • HSP90B
  • HSPC2
  • HSPC3
  • HSPCB
  • IL1BC
  • IL1BCE
  • LYT10
  • MEF
  • MEFV
  • MRS1
  • NALP3
  • NFKB1
  • NFKB2
  • NFKB3
  • NLRP3
  • P2RX7
  • PANX1
  • PSTPIP1
  • PYCARD
  • PYPAF1
  • RELA
  • SUGT1
  • TMS1
  • TRDX
  • TRIM20
  • TRX
  • TRX1
  • TXN
  • TXNIP
  • VDUP1
  • hla
  • hly
Homo sapiens (human)
Regulation of lipid metabolism by PPARalpha
  • AIB3
  • ARC205
  • BAF60C
  • BHLHE74
  • BHLHE75
  • CARM1
  • CBP
  • CHD9
  • CREBBP
  • CRSP1
  • CRSP200
  • CTG26
  • DRIP205
  • DRIP230
  • FABP1
  • FABPL
  • HCA137
  • HDAC3
  • HELZ2
  • IRA1
  • KIAA0181
  • KIAA0308
  • KIAA1047
  • KIAA1769
  • KISH2
  • MED1
  • NCOA1
  • NCOA2
  • NCOA6
  • NCOA6IP
  • NCOR1
  • NCOR2
  • NR1C1
  • NR2B1
  • PBP
  • PIMT
  • PPAR
  • PPARA
  • PPARBP
  • PPARGBP
  • PRIC285
  • PRIC320
  • PRMT4
  • RAP250
  • RB18A
  • RXRA
  • SIN3A
  • SMARCD3
  • SRC1
  • SRC2
  • TBL1
  • TBL1X
  • TBL1XR1
  • TBLR1
  • TGS1
  • TIF2
  • TRAP220
  • TRBP
  • TRIP2
Homo sapiens (human)
vRNA Synthesis
  • ADPRT
  • NP
  • PA
  • PARP1
  • PB1
  • PB2
  • PPOL
Homo sapiens (human)
Josephin domain DUBs
  • ATX3
  • ATX3L
  • ATXN3
  • ATXN3L
  • HEL-220
  • HEL-S-70
  • JOSD1
  • JOSD2
  • JSPH1
  • KIAA0063
  • MJD
  • MJD1
  • MJDL
  • PARK2
  • PRKN
  • RAD23A
  • RAD23B
  • RPS27A
  • SCA3
  • UBA52
  • UBA80
  • UBB
  • UBC
  • UBCEP1
  • UBCEP2
  • VCP
Homo sapiens (human)
ERBB2 Activates PTK6 Signaling
  • BRK
  • BTC
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • EREG
  • GGF
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGL
  • HRGA
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PTK6
  • SMDF
Homo sapiens (human)
Translation of Structural Proteins
  • 3a
  • E
  • M
  • N
  • S
Homo sapiens (human)

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Last updated: August 19, 2024