GlyCosmos Pathways

Integrated of pathway data, containing glycoproteins and glycans obtained from Reactome and the Metabolism of carbohydrates in Escherichia coli O-antigens obtained from ECODAB. Search by pathway name, species, and protein name.

Source Last Updated
Reactome March 20, 2024
ECODAB April 1, 2019
Displaying entries 426 - 450 of 2090 in total
Pathway Name Protein Name UniProt ID Gene Symbol Organism GlyTouCan ID ▲
GRB7 events in ERBB2 signaling
  • ERBB2
  • GGF
  • GRB7
  • HER2
  • HGL
  • HRGA
  • MLN19
  • NDF
  • NEU
  • NGL
  • NRG1
  • NRG2
  • NTAK
  • SMDF
Homo sapiens (human)
Synthesis of Prostaglandins (PG) and Thromboxanes (TX)
  • AKR1C3
  • C1orf93
  • C9orf15
  • CBR
  • CBR1
  • COX1
  • COX2
  • CRN
  • CYP12
  • CYP5
  • CYP5A1
  • CYP8
  • CYP8A1
  • CYP8B1
  • DDH1
  • FAM213B
  • GSTS
  • HPGD
  • HPGDS
  • HSD17B5
  • KIAA0119
  • MGST1L1
  • MPGES1
  • P23
  • PDS
  • PGDH1
  • PGDS
  • PGES
  • PGES2
  • PGFS
  • PIG12
  • PRXL2B
  • PTGDS
  • PTGDS2
  • PTGES
  • PTGES2
  • PTGES3
  • PTGIS
  • PTGR2
  • PTGS1
  • PTGS2
  • SDR21C1
  • SDR36C1
  • TBXAS1
  • TEBP
  • TXAS
  • ZADH1
Homo sapiens (human)
Biogenic amines are oxidatively deaminated to aldehydes by MAOA and MAOB
  • MAOA
  • MAOB
Homo sapiens (human)
FGFR4 mutant receptor activation
  • FGFR4
  • JTK2
  • TKF
Homo sapiens (human)
Initiation of Nuclear Envelope (NE) Reformation
  • ANKLE2
  • BAF
  • BANF1
  • BCRG1
  • CCNB
  • CCNB1
  • CCNB2
  • CDC2
  • CDC28A
  • CDK1
  • CDKN1
  • EDMD
  • EMD
  • KIAA0692
  • KPNB1
  • LBR
  • LEM4
  • LEMD2
  • LEMD3
  • LMN2
  • LMNB
  • LMNB1
  • MAN1
  • NTF97
  • P34CDC2
  • PPP2CA
  • PPP2R1A
  • PPP2R2A
  • SIR2L
  • SIR2L2
  • SIRT2
  • STA
  • VRK1
Homo sapiens (human)
Vitamin B1 (thiamin) metabolism
  • DNC
  • MUP1
  • SLC19A2
  • SLC19A3
  • SLC25A19
  • THT1
  • THTPA
  • TPK1
  • TRMA
Homo sapiens (human)
Abacavir transmembrane transport
  • ABCB1
  • ABCG2
  • ABCP
  • BCRP
  • BCRP1
  • EMTH
  • MDR1
  • MXR
  • OCT1
  • OCT2
  • OCT3
  • PGY1
  • SLC22A1
  • SLC22A2
  • SLC22A3
Homo sapiens (human)
Ca2+ pathway
  • AGO1
  • AGO2
  • AGO3
  • AGO4
  • C2orf31
  • CAGH26
  • CALM
  • CALM1
  • CALNA
  • CALNA2
  • CALNB
  • CAM
  • CAM1
  • CAMK2A
  • CAMKA
  • CNA
  • CNA2
  • CNB
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • EIF2C1
  • EIF2C2
  • EIF2C3
  • EIF2C4
  • FZD2
  • FZD3
  • FZD4
  • FZD5
  • FZD6
  • GNAO1
  • GNAT2
  • GNATC
  • GNB1
  • GNB2
  • GNB3
  • GNB4
  • GNB5
  • GNG10
  • GNG11
  • GNG12
  • GNG13
  • GNG2
  • GNG3
  • GNG4
  • GNG5
  • GNG7
  • GNG8
  • GNG9
  • GNGT1
  • GNGT10
  • GNGT11
  • GNGT2
  • GNGT3
  • GNGT4
  • GNGT5
  • GNGT7
  • GNGT8
  • GNGT9
  • INSP3R1
  • ITPR1
  • ITPR2
  • ITPR3
  • KIAA0581
  • KIAA0968
  • KIAA1093
  • KIAA1460
  • KIAA1567
  • KIAA1582
  • KIAA1631
  • LAK1
  • LEF1
  • MAP3K7
  • MOV10
  • NFAT2
  • NFATC
  • NFATC1
  • NLK
  • PDE6A
  • PDE6B
  • PDE6G
  • PDEA
  • PDEB
  • PDEG
  • PKCA
  • PLCB1
  • PLCB2
  • PLCB3
  • PPP3CA
  • PPP3CB
  • PPP3R1
  • PRKACA
  • PRKCA
  • PRKG1
  • PRKG1B
  • PRKG2
  • PRKGR1A
  • PRKGR1B
  • PRKGR2
  • TAK1
  • TCF1
  • TCF3
  • TCF4
  • TCF7
  • TCF7L1
  • TCF7L2
  • TNRC6
  • TNRC6A
  • TNRC6B
  • TNRC6C
  • WNT11
  • WNT5A
Homo sapiens (human)
Removal of aminoterminal propeptides from gamma-carboxylated proteins
  • AXLLG
  • BGLAP
  • F10
  • F2
  • F7
  • F9
  • FUR
  • FURIN
  • GAS6
  • PACE
  • PCSK3
  • PROC
  • PROS
  • PROS1
  • PROZ
Homo sapiens (human)
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides
  • CTNS
  • EAAC1
  • EAAT1
  • EAAT2
  • EAAT3
  • EAAT4
  • EAAT5
  • GLAST
  • GLAST1
  • GLT1
  • HEAAC1
  • SAMC
  • SLC1A1
  • SLC1A2
  • SLC1A3
  • SLC1A6
  • SLC1A7
  • SLC25A26
  • SLC32A1
  • VGAT
  • VIAAT
Homo sapiens (human)
Defective SLC6A18 may confer susceptibility to iminoglycinuria and/or hyperglycinuria
  • B0AT3
  • SLC6A18
  • XTRP2
Homo sapiens (human)
Sunitinib-resistant PDGFR mutants
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • RHEPDGFRA
Homo sapiens (human)
Regulation of TP53 Expression
  • BLIMP1
  • P53
  • PRDM1
  • TP53
Homo sapiens (human)
Defective SLC24A1 causes congenital stationary night blindness 1D (CSNB1D)
  • KIAA0702
  • NCKX1
  • SLC24A1
Homo sapiens (human)
Recognition and association of DNA glycosylase with site containing an affected pyrimidine
  • ACD
  • DRIP5
  • H2AB1
  • H2AC14
  • H2AC18
  • H2AC19
  • H2AC20
  • H2AC4
  • H2AC6
  • H2AC7
  • H2AC8
  • H2AFA
  • H2AFB1
  • H2AFE
  • H2AFG
  • H2AFJ
  • H2AFL
  • H2AFM
  • H2AFO
  • H2AFQ
  • H2AFV
  • H2AFX
  • H2AJ
  • H2AV
  • H2AX
  • H2AZ2
  • H2BC1
  • H2BC10
  • H2BC11
  • H2BC12
  • H2BC12L
  • H2BC13
  • H2BC14
  • H2BC15
  • H2BC17
  • H2BC21
  • H2BC26
  • H2BC3
  • H2BC4
  • H2BC5
  • H2BC6
  • H2BC7
  • H2BC8
  • H2BC9
  • H2BFA
  • H2BFB
  • H2BFC
  • H2BFD
  • H2BFE
  • H2BFF
  • H2BFG
  • H2BFH
  • H2BFJ
  • H2BFK
  • H2BFL
  • H2BFN
  • H2BFQ
  • H2BFR
  • H2BFS
  • H2BFT
  • H2BS1
  • H2BU1
  • H3-4
  • H3FT
  • H4-16
  • H4/A
  • H4/B
  • H4/C
  • H4/D
  • H4/E
  • H4/G
  • H4/H
  • H4/I
  • H4/J
  • H4/K
  • H4/M
  • H4/N
  • H4/O
  • H4C1
  • H4C11
  • H4C12
  • H4C13
  • H4C14
  • H4C15
  • H4C16
  • H4C2
  • H4C3
  • H4C4
  • H4C5
  • H4C6
  • H4C8
  • H4C9
  • H4F2
  • H4FA
  • H4FB
  • H4FC
  • H4FD
  • H4FE
  • H4FG
  • H4FH
  • H4FI
  • H4FJ
  • H4FK
  • H4FM
  • H4FN
  • H4FO
  • HIRIP1
  • HIRIP2
  • HIST1H2AB
  • HIST1H2AC
  • HIST1H2AD
  • HIST1H2AE
  • HIST1H2AJ
  • HIST1H2BA
  • HIST1H2BB
  • HIST1H2BC
  • HIST1H2BD
  • HIST1H2BE
  • HIST1H2BF
  • HIST1H2BG
  • HIST1H2BH
  • HIST1H2BI
  • HIST1H2BJ
  • HIST1H2BK
  • HIST1H2BL
  • HIST1H2BM
  • HIST1H2BN
  • HIST1H2BO
  • HIST1H4A
  • HIST1H4B
  • HIST1H4C
  • HIST1H4D
  • HIST1H4E
  • HIST1H4F
  • HIST1H4H
  • HIST1H4I
  • HIST1H4J
  • HIST1H4K
  • HIST1H4L
  • HIST2H2AA
  • HIST2H2AA3
  • HIST2H2AA4
  • HIST2H2AC
  • HIST2H2BE
  • HIST2H4
  • HIST2H4A
  • HIST2H4B
  • HIST3H2BB
  • HIST3H3
  • HIST4H4
  • MBD4
  • MED1
  • MMH
  • MUTM
  • NEIL1
  • NEIL2
  • NEIL3
  • NTH1
  • NTHL1
  • OCTS3
  • OGG1
  • OGH1
  • PIN2
  • PIP1
  • POT1
  • PTOP
  • RAP1
  • SMUG1
  • TDG
  • TERF1
  • TERF2
  • TERF2IP
  • TIN2
  • TINF2
  • TINT1
  • TPP1
  • TRBF1
  • TRBF2
  • TRF
  • TRF1
  • TRF2
  • TSH2B
Homo sapiens (human)
CTNNB1 T41 mutants aren't phosphorylated
  • AMER1
  • APC
  • AXIN
  • AXIN1
  • CSNK1A1
  • CTNNB
  • CTNNB1
  • DP2.5
  • FAM123B
  • GSK3B
  • KIAA0044
  • PPP2CA
  • PPP2CB
  • PPP2R1A
  • PPP2R1B
  • PPP2R5A
  • PPP2R5B
  • PPP2R5C
  • PPP2R5D
  • PPP2R5E
  • WTX
Homo sapiens (human)
TP53 Regulates Transcription of Genes Involved in Cytochrome C Release
  • 15E1.1
  • AIFM2
  • AMID
  • ASPP1
  • ASPP2
  • ATM
  • BAX
  • BBC3
  • BBP
  • BCL2L4
  • BID
  • BNIP3A
  • BNIP3H
  • BNIP3L
  • C18orf43
  • CBP
  • CREBBP
  • KET
  • KIAA0771
  • NIX
  • NOXA
  • P53
  • P53DINP1
  • P63
  • P73
  • P73H
  • P73L
  • PMAIP1
  • PPP1R13B
  • PRELI
  • PRELID1
  • PRELID3A
  • PRG3
  • PUMA
  • SIP
  • SLMO1
  • STEAP3
  • TP53
  • TP53AIP1
  • TP53BP2
  • TP53INP1
  • TP63
  • TP73
  • TP73L
  • TRIAP1
  • TSAP6
  • ZNF420
Homo sapiens (human)
Dasatinib-resistant KIT mutants
  • KIT
  • SCFR
Homo sapiens (human)
LTC4-CYSLTR mediated IL4 production
  • CYSLT1
  • CYSLT2
  • CYSLT2R
  • CYSLTR1
  • CYSLTR2
  • DPEP1
  • DPEP2
  • DPEP3
  • GGT
  • GGT1
  • GGT5
  • GGTLA1
  • MDP
  • RDP
Homo sapiens (human)
Highly calcium permeable postsynaptic nicotinic acetylcholine receptors
  • ACHRA
  • CHNRA
  • CHRNA1
  • CHRNA2
  • CHRNA3
  • CHRNA4
  • CHRNA5
  • CHRNA6
  • CHRNA7
  • CHRNA9
  • CHRNB2
  • CHRNB3
  • CHRNB4
  • NACHRA3
  • NACHRA5
  • NACHRA7
  • NACHRA9
  • NACRA4
Homo sapiens (human)
Glycoprotein hormones
  • CGA
  • CGB
  • CGB3
  • CGB5
  • CGB8
  • FSHB
  • INHA
  • INHBA
  • INHBB
  • INHBC
  • INHBE
  • LHB
  • TSHB
Homo sapiens (human)
Downstream signaling of activated FGFR1
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FLRT1
  • FLRT2
  • FLRT3
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • INT2
  • KIAA0405
  • KIAA1469
  • KS3
Homo sapiens (human)
PI3K/AKT Signaling
  • AKT1
  • AKT2
  • AKT3
  • AREG
  • AREGB
  • ARHG
  • BCAP
  • BTC
  • C20orf97
  • C9orf26
  • CD135
  • CD19
  • CD28
  • CD28LG
  • CD28LG1
  • CD28LG2
  • CD80
  • CD86
  • CTMP
  • DER4
  • DTR
  • DTS
  • EGF
  • EGFR
  • EPGN
  • ERBB
  • ERBB1
  • ERBB2
  • EREG
  • ESR
  • ESR1
  • ESR2
  • ESTRB
  • FGF1
  • FGF10
  • FGF16
  • FGF18
  • FGF19
  • FGF2
  • FGF20
  • FGF22
  • FGF23
  • FGF3
  • FGF4
  • FGF6
  • FGF7
  • FGF9
  • FGFA
  • FGFB
  • FGFR4
  • FLK2
  • FLT3
  • FLT3LG
  • FRAP
  • FRAP1
  • FRAP2
  • FRS2
  • FYN
  • GAB1
  • GAB2
  • GBL
  • GGF
  • GRB1
  • HBEGF
  • HEGFL
  • HER1
  • HER2
  • HGF
  • HGL
  • HPTA
  • HRGA
  • HST
  • HST2
  • HSTF1
  • HSTF2
  • HYPF
  • IL1F11
  • IL1RL1
  • IL33
  • INT2
  • IRAK
  • IRAK1
  • IRAK4
  • IRS1
  • IRS2
  • JTK2
  • KGF
  • KIAA0571
  • KIAA1999
  • KIT
  • KLB
  • KS3
  • LAB7
  • LCK
  • LST8
  • M
  • MAPKAP1
  • MET
  • MIP1
  • MLN19
  • MLST8
  • MTOR
  • MYD88
  • N
  • NDF
  • NEU
  • NFHEV
  • NGL
  • NIPK
  • NR3A1
  • NR3A2
  • NRG1
  • NRG2
  • NRG3
  • NRG4
  • NTAK
  • PDGF2
  • PDGFB
  • PDGFR
  • PDGFR1
  • PDGFR2
  • PDGFRA
  • PDGFRB
  • PDK1
  • PDPK1
  • PIK3AP1
  • PIK3C1
  • PIK3CA
  • PIK3CB
  • PIK3CD
  • PIK3R1
  • PIK3R2
  • PIK3R3
  • PKB
  • PKBG
  • PROTOR1
  • PRR5
  • PTP2C
  • PTPN11
  • RAC
  • RAC1
  • RAC2
  • RAFT1
  • RAPT1
  • RHEPDGFRA
  • RHOG
  • RICTOR
  • RNF85
  • SCFR
  • SDGF
  • SGK
  • SGK1
  • SHPTP2
  • SIN1
  • SIS
  • SKIP3
  • SMDF
  • SRC
  • SRC1
  • ST2
  • STK1
  • STRN
  • T1
  • TC25
  • TCRIM
  • TGFA
  • THEM4
  • TKF
  • TRAF6
  • TRAT1
  • TRB3
  • TRIB3
  • VAV
  • VAV1
Homo sapiens (human)
Erythropoietin activates RAS
  • CRKL
  • EPO
  • EPOR
  • GRF2
  • HRAS
  • HRAS1
  • IRS2
  • JAK2
  • JTK8
  • LYN
  • NRAS
  • RAPGEF1
  • SHC
  • SHC1
  • SHCA
  • SOS1
  • VAV
  • VAV1
Homo sapiens (human)
Defective SLC3A1 causes cystinuria (CSNU)
  • BAT1
  • NBAT
  • SLC3A1
  • SLC7A9
Homo sapiens (human)

About Release Notes Help Feedback

International Collaboration

GlyCosmos is a member of the GlySpace Alliance together with GlyGen and Glycomics@ExPASy.

Acknowledgements

Supported by JST NBDC Grant Number JPMJND2204

Partly supported by NIH Common Fund Grant #1U01GM125267-01


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Contact: support@glycosmos.org

This work is licensed under Creative Commons Attribution 4.0 International


GlyCosmos Portal v4.0.0

Last updated: August 19, 2024